| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG7015550.1 Serine/arginine-rich splicing factor RS40, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 1.2e-188 | 100 | Show/hide |
Query: MEKTLSICRPTMRHPVLDYCSLTPLNSQHKQERGIRRPGGGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYE
MEKTLSICRPTMRHPVLDYCSLTPLNSQHKQERGIRRPGGGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYE
Subjt: MEKTLSICRPTMRHPVLDYCSLTPLNSQHKQERGIRRPGGGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYE
Query: LQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVRDDDEKRNGYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSRSPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQRVRER
LQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVRDDDEKRNGYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSRSPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQRVRER
Subjt: LQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVRDDDEKRNGYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSRSPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQRVRER
Query: GSPEYGRGRSPNQSPYRRERERSSDHARAPSHSPYRRERERERSSDHARAPSHSPPPPHQRERPNGDRAHSGIHSPYGRERGSPTDERRTSYSPRDRERS
GSPEYGRGRSPNQSPYRRERERSSDHARAPSHSPYRRERERERSSDHARAPSHSPPPPHQRERPNGDRAHSGIHSPYGRERGSPTDERRTSYSPRDRERS
Subjt: GSPEYGRGRSPNQSPYRRERERSSDHARAPSHSPYRRERERERSSDHARAPSHSPPPPHQRERPNGDRAHSGIHSPYGRERGSPTDERRTSYSPRDRERS
Query: NPENGHDQRPNTIAEPGDSPSYGGTQSPKHRGYKSRSPQAEE
NPENGHDQRPNTIAEPGDSPSYGGTQSPKHRGYKSRSPQAEE
Subjt: NPENGHDQRPNTIAEPGDSPSYGGTQSPKHRGYKSRSPQAEE
|
|
| XP_022932229.1 serine/arginine-rich splicing factor RS40-like isoform X1 [Cucurbita moschata] | 5.3e-168 | 99.05 | Show/hide |
Query: KQERGIRRPGGGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVR
KQERGIRRPGGGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVR
Subjt: KQERGIRRPGGGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVR
Query: DDDEKRNGYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSRSPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQRVRERGSPEYGRGRSPNQSPYR--RERERSSDHA
DDDEKRNGYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSRSPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQRVRERGSPEYGRGRSPNQSPYR RERERSSDHA
Subjt: DDDEKRNGYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSRSPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQRVRERGSPEYGRGRSPNQSPYR--RERERSSDHA
Query: RAPSHSPYRRERERERSSDHARAPSHSPPPPHQRERPNGDRAHSGIHSPYGRERGSPTDERRTSYSPRDRERSNPENGHDQRPNTIAEPGDSPSYGGTQS
RAPSHSPYRRERERERSSDHARAPSHSPPPPHQRERPNGDRAHSGIHSPYGRERGSPTDERRTSYSPRDRERSNP+NGHDQRPNTIAEPGDSPSYGGTQS
Subjt: RAPSHSPYRRERERERSSDHARAPSHSPPPPHQRERPNGDRAHSGIHSPYGRERGSPTDERRTSYSPRDRERSNPENGHDQRPNTIAEPGDSPSYGGTQS
Query: PKHRGYKSRSPQAEE
PKHRGYKSRSPQAEE
Subjt: PKHRGYKSRSPQAEE
|
|
| XP_022965075.1 serine/arginine-rich splicing factor RS40-like isoform X1 [Cucurbita maxima] | 5.6e-162 | 97.14 | Show/hide |
Query: KQERGIRRPGGGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVR
KQERGIRRPGGGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVR
Subjt: KQERGIRRPGGGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVR
Query: DDDEKRNGYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSRSPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQRVRERGSPEYGRGRSPNQSPYR--RERERSSDHA
DDDEKRNGYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSRSPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQRVRERGSPEYGRGRSPNQSPYR RERERSSDHA
Subjt: DDDEKRNGYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSRSPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQRVRERGSPEYGRGRSPNQSPYR--RERERSSDHA
Query: RAPSHSPYRRERERERSSDHARAPSHSPPPPHQRERPNGDRAHSGIHSPYGRERGSPTDERRTSYSPRDRERSNPENGHDQRPNTIAEPGDSPSYGGTQS
RAPSHSPYR RERERSSDH RAPSHS PPPHQRERPNGDRAHSGIHSPYGRERGSPT+E RTSYSPRDRERSNP+NGHDQRPNTIAEPGDSPSYGGTQS
Subjt: RAPSHSPYRRERERERSSDHARAPSHSPPPPHQRERPNGDRAHSGIHSPYGRERGSPTDERRTSYSPRDRERSNPENGHDQRPNTIAEPGDSPSYGGTQS
Query: PKHRGYKSRSPQAEE
PKHRGYKSRSPQAEE
Subjt: PKHRGYKSRSPQAEE
|
|
| XP_023553364.1 serine/arginine-rich splicing factor RS40-like isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 1.0e-163 | 96.83 | Show/hide |
Query: KQERGIRRPGGGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVR
KQERGIRRPGGGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVR
Subjt: KQERGIRRPGGGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVR
Query: DDDEKRNGYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSRSPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQRVRERGSPEYGRGRSPNQSPYR--RERERSSDHA
DDDEKRNGYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSRSPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQRVRERGSPEYGRGRSPNQSPYR RERERSSDHA
Subjt: DDDEKRNGYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSRSPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQRVRERGSPEYGRGRSPNQSPYR--RERERSSDHA
Query: RAPSHSPYRRERERERSSDHARAPSHSPPPPHQRERPNGDRAHSGIHSPYGRERGSPTDERRTSYSPRDRERSNPENGHDQRPNTIAEPGDSPSYGGTQS
RAPSHSPYRRERERERSSDHARAPSHSPP PHQRER NG+RAHSGIHSPYGRERGSP++ERRTSYSPRDRERSNP+NGHDQRP TIAEPGDSPSYGGTQS
Subjt: RAPSHSPYRRERERERSSDHARAPSHSPPPPHQRERPNGDRAHSGIHSPYGRERGSPTDERRTSYSPRDRERSNPENGHDQRPNTIAEPGDSPSYGGTQS
Query: PKHRGYKSRSPQAEE
PKHRGYKSRSP+AEE
Subjt: PKHRGYKSRSPQAEE
|
|
| XP_023553365.1 serine/arginine-rich splicing factor RS40-like isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 1.0e-163 | 96.83 | Show/hide |
Query: KQERGIRRPGGGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVR
KQERGIRRPGGGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVR
Subjt: KQERGIRRPGGGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVR
Query: DDDEKRNGYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSRSPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQRVRERGSPEYGRGRSPNQSPYR--RERERSSDHA
DDDEKRNGYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSRSPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQRVRERGSPEYGRGRSPNQSPYR RERERSSDHA
Subjt: DDDEKRNGYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSRSPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQRVRERGSPEYGRGRSPNQSPYR--RERERSSDHA
Query: RAPSHSPYRRERERERSSDHARAPSHSPPPPHQRERPNGDRAHSGIHSPYGRERGSPTDERRTSYSPRDRERSNPENGHDQRPNTIAEPGDSPSYGGTQS
RAPSHSPYRRERERERSSDHARAPSHSPP PHQRER NG+RAHSGIHSPYGRERGSP++ERRTSYSPRDRERSNP+NGHDQRP TIAEPGDSPSYGGTQS
Subjt: RAPSHSPYRRERERERSSDHARAPSHSPPPPHQRERPNGDRAHSGIHSPYGRERGSPTDERRTSYSPRDRERSNPENGHDQRPNTIAEPGDSPSYGGTQS
Query: PKHRGYKSRSPQAEE
PKHRGYKSRSP+AEE
Subjt: PKHRGYKSRSPQAEE
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A6J1EWF6 serine/arginine-rich splicing factor RS40-like isoform X1 | 2.6e-168 | 99.05 | Show/hide |
Query: KQERGIRRPGGGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVR
KQERGIRRPGGGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVR
Subjt: KQERGIRRPGGGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVR
Query: DDDEKRNGYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSRSPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQRVRERGSPEYGRGRSPNQSPYR--RERERSSDHA
DDDEKRNGYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSRSPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQRVRERGSPEYGRGRSPNQSPYR RERERSSDHA
Subjt: DDDEKRNGYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSRSPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQRVRERGSPEYGRGRSPNQSPYR--RERERSSDHA
Query: RAPSHSPYRRERERERSSDHARAPSHSPPPPHQRERPNGDRAHSGIHSPYGRERGSPTDERRTSYSPRDRERSNPENGHDQRPNTIAEPGDSPSYGGTQS
RAPSHSPYRRERERERSSDHARAPSHSPPPPHQRERPNGDRAHSGIHSPYGRERGSPTDERRTSYSPRDRERSNP+NGHDQRPNTIAEPGDSPSYGGTQS
Subjt: RAPSHSPYRRERERERSSDHARAPSHSPPPPHQRERPNGDRAHSGIHSPYGRERGSPTDERRTSYSPRDRERSNPENGHDQRPNTIAEPGDSPSYGGTQS
Query: PKHRGYKSRSPQAEE
PKHRGYKSRSPQAEE
Subjt: PKHRGYKSRSPQAEE
|
|
| A0A6J1F1N4 serine/arginine-rich splicing factor RS40-like isoform X2 | 5.0e-156 | 93.61 | Show/hide |
Query: KQERGIRRPGGGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVR
KQERGIRRPGGGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVR
Subjt: KQERGIRRPGGGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVR
Query: DDDEKRNGYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSRSPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQRVRERGSPEYGRGRSPNQSPYRRERERSSDHARA
DDDEKRNGYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSRSPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQRVRERGSPEYGRGRSPNQ
Subjt: DDDEKRNGYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSRSPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQRVRERGSPEYGRGRSPNQSPYRRERERSSDHARA
Query: PSHSPYRRERERERSSDHARAPSHSPPPPHQRERPNGDRAHSGIHSPYGRERGSPTDERRTSYSPRDRERSNPENGHDQRPNTIAEPGDSPSYGGTQSPK
SPYRRERERERSSDHARAPSHSPPPPHQRERPNGDRAHSGIHSPYGRERGSPTDERRTSYSPRDRERSNP+NGHDQRPNTIAEPGDSPSYGGTQSPK
Subjt: PSHSPYRRERERERSSDHARAPSHSPPPPHQRERPNGDRAHSGIHSPYGRERGSPTDERRTSYSPRDRERSNPENGHDQRPNTIAEPGDSPSYGGTQSPK
Query: HRGYKSRSPQAEE
HRGYKSRSPQAEE
Subjt: HRGYKSRSPQAEE
|
|
| A0A6J1HKQ4 serine/arginine-rich splicing factor RS40-like isoform X2 | 5.5e-155 | 92.97 | Show/hide |
Query: KQERGIRRPGGGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVR
KQERGIRRPGGGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVR
Subjt: KQERGIRRPGGGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVR
Query: DDDEKRNGYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSRSPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQRVRERGSPEYGRGRSPNQSPYRRERERSSDHARA
DDDEKRNGYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSRSPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQRVRERGSPEYGRGRSPNQ
Subjt: DDDEKRNGYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSRSPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQRVRERGSPEYGRGRSPNQSPYRRERERSSDHARA
Query: PSHSPYRRERERERSSDHARAPSHSPPPPHQRERPNGDRAHSGIHSPYGRERGSPTDERRTSYSPRDRERSNPENGHDQRPNTIAEPGDSPSYGGTQSPK
SPYRRERERERSSDHARAPSHSPPPPHQRERPNGDRAHSGIHSPYGRERGSPT+E RTSYSPRDRERSNP+NGHDQRPNTIAEPGDSPSYGGTQSPK
Subjt: PSHSPYRRERERERSSDHARAPSHSPPPPHQRERPNGDRAHSGIHSPYGRERGSPTDERRTSYSPRDRERSNPENGHDQRPNTIAEPGDSPSYGGTQSPK
Query: HRGYKSRSPQAEE
HRGYKSRSPQAEE
Subjt: HRGYKSRSPQAEE
|
|
| A0A6J1HMM7 serine/arginine-rich splicing factor RS40-like isoform X2 | 2.8e-135 | 80.76 | Show/hide |
Query: KQERGIRRP--GGGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYA
KQERGIRRP GGG GGG SRRSSTNT+PSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKIL+VRIRRNFAFVQYELQ+DATRALE+TNMSKLMDRVISVEYA
Subjt: KQERGIRRP--GGGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYA
Query: VRDDDEKRNGYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSRSPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQ--RVRERGSPEYGRGRSPNQSPYRRERERSSD
VRDDDEKRNG+SPDR RDRSPDRKRRSPSPYR+ERGSPDYGNG+S SPYR+ RASPDYGSRRSPSPYQ R RERGSP+YGRGRSPNQSPYRRERERSSD
Subjt: VRDDDEKRNGYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSRSPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQ--RVRERGSPEYGRGRSPNQSPYRRERERSSD
Query: H--ARAPSHSPYRRE-------------------RERERSSDHARAPSHSPPPPHQRERPNGDRAHSGIHSPYGRERGSP-TDERRTSYSPRDRERSNPE
H R+P+ SPYRRE RERERSSDHARAPSHS PPHQRERPN DR SPYGRERGSP TD R +SYSPRDRERSNP+
Subjt: H--ARAPSHSPYRRE-------------------RERERSSDHARAPSHSPPPPHQRERPNGDRAHSGIHSPYGRERGSP-TDERRTSYSPRDRERSNPE
Query: NGHDQRPNTIA---EPGDSPSYGG-TQSPKHRGYKSRSPQAEE
NGHDQR NT+ EPGDSPSYGG TQSPKHRGY SRSPQAEE
Subjt: NGHDQRPNTIA---EPGDSPSYGG-TQSPKHRGYKSRSPQAEE
|
|
| A0A6J1HMP1 serine/arginine-rich splicing factor RS40-like isoform X1 | 2.7e-162 | 97.14 | Show/hide |
Query: KQERGIRRPGGGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVR
KQERGIRRPGGGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVR
Subjt: KQERGIRRPGGGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVR
Query: DDDEKRNGYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSRSPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQRVRERGSPEYGRGRSPNQSPYR--RERERSSDHA
DDDEKRNGYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSRSPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQRVRERGSPEYGRGRSPNQSPYR RERERSSDHA
Subjt: DDDEKRNGYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSRSPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQRVRERGSPEYGRGRSPNQSPYR--RERERSSDHA
Query: RAPSHSPYRRERERERSSDHARAPSHSPPPPHQRERPNGDRAHSGIHSPYGRERGSPTDERRTSYSPRDRERSNPENGHDQRPNTIAEPGDSPSYGGTQS
RAPSHSPYR RERERSSDH RAPSHS PPPHQRERPNGDRAHSGIHSPYGRERGSPT+E RTSYSPRDRERSNP+NGHDQRPNTIAEPGDSPSYGGTQS
Subjt: RAPSHSPYRRERERERSSDHARAPSHSPPPPHQRERPNGDRAHSGIHSPYGRERGSPTDERRTSYSPRDRERSNPENGHDQRPNTIAEPGDSPSYGGTQS
Query: PKHRGYKSRSPQAEE
PKHRGYKSRSPQAEE
Subjt: PKHRGYKSRSPQAEE
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P92964 Serine/arginine-rich splicing factor RS31 | 1.2e-37 | 52.71 | Show/hide |
Query: GRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVRDDDEKRNGYSP
GR GD++ S N KP+KTLFVINFDP T+ D+E+HF+PYGK+ NVRIRRNF+FVQ+E QEDAT+ALE T SK++DRV+SVEYA++DDDE+
Subjt: GRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVRDDDEKRNGYSP
Query: DRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSRSPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQRVR------ERGSPEYGRGRSPNQSPYRRERERSSDHARAPSHSP
DR RSP RRS SP R R SPDYG SP + R SPDYG RSP Y R + R SP+YGR S Y R+R D R+ S P
Subjt: DRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSRSPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQRVR------ERGSPEYGRGRSPNQSPYRRERERSSDHARAPSHSP
Query: YRR
R
Subjt: YRR
|
|
| P92965 Serine/arginine-rich splicing factor RS40 | 4.8e-71 | 54.92 | Show/hide |
Query: KQERGIRRPGGGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVR
K ERG G R GG SRRSS++ +PSKTLFVINFD +TRTRDLE+HF+PYGKI+NVRIRRNFAF+QYE QEDATRAL+ +N SKLMD+VISVEYAV+
Subjt: KQERGIRRPGGGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVR
Query: DDDEKRNGYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSR-SPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQRVRERGSPEYGRGRSPNQSPYRRERERS-SDHA
DDD + NG+SP+R RDRSP+R+RRSPSPY+RERGSPDYG G S + YRK R SPDYG RRSPSPY++ R RGSPEYGR R N SP RRER S + ++
Subjt: DDDEKRNGYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSR-SPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQRVRERGSPEYGRGRSPNQSPYRRERERS-SDHA
Query: RAPSHSPYRRERERERSSDHARAPSHSPPPPHQRERPNGDRAHSGIHSPYGRERGSPTDERRTSYSPRDRERSNPENGHDQRPNTIAEPGDSPSYGGTQS
R+P++ +RER S P+HS P ++E P + SP R R+R RS+PENG + P +I Y G +S
Subjt: RAPSHSPYRRERERERSSDHARAPSHSPPPPHQRERPNGDRAHSGIHSPYGRERGSPTDERRTSYSPRDRERSNPENGHDQRPNTIAEPGDSPSYGGTQS
Query: PKHRGYKSRSPQAEE
P + RSP A+E
Subjt: PKHRGYKSRSPQAEE
|
|
| P92966 Serine/arginine-rich splicing factor RS41 | 7.9e-66 | 54.07 | Show/hide |
Query: RPGGGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVRDDDEKRN
R G GR GG SRRSS+ +PSKTLFVINFD +TRTRDLERHF+PYGKI+NVRIRRNFAF+QYE QEDATRAL+ TN SKLMD+VISVEYAV+DDD + N
Subjt: RPGGGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVRDDDEKRN
Query: GYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSRSPYRKVRASPDYG-SRRSPSPYQRVRERGSPEYGRGRSPNQSPYRRERERSSDHARAPSHSPY
GYSP+R RDRSPDR+RRSPSPYRRERGSPDYG G S +++ R SPDYG RRSPSPY+R R SP+Y R RRER S ++ + SP
Subjt: GYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSRSPYRKVRASPDYG-SRRSPSPYQRVRERGSPEYGRGRSPNQSPYRRERERSSDHARAPSHSPY
Query: RRERERERSSDHARAPSHSPPPPHQRERPNGDRAHSGIHSPYGRERGSPTDERRTSYSPRDRERSNPENGHDQRPNTIAEPGDSPSYGGTQSPKHRGYKS
+ E + + PPP+++ R R P E+R S R R +S+PENG + P I E Y G SP R S
Subjt: RRERERERSSDHARAPSHSPPPPHQRERPNGDRAHSGIHSPYGRERGSPTDERRTSYSPRDRERSNPENGHDQRPNTIAEPGDSPSYGGTQSPKHRGYKS
Query: RSPQAEE
RSP AEE
Subjt: RSPQAEE
|
|
| Q10021 Probable splicing factor, arginine/serine-rich 5 | 3.5e-05 | 32.17 | Show/hide |
Query: PYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQ---EDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVRDDDEKRNGYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYR----
PY+ R RD+ER YGKI N+ ++ FAFV +E EDA L+ M R++ + R+G R R RSP R+ R+P R
Subjt: PYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQ---EDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVRDDDEKRNGYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYR----
Query: ---RERGSPDYGNGVSRSPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQRVRERGSPEYGRGRSPNQSPYRRERERSSDHARAPSHSPYRRERERERSSDHARAPSHSPP
R R S + SRSP R+ R + RSPSP + ++ S R RSP + D +R S SP + +R+RS R SHS
Subjt: ---RERGSPDYGNGVSRSPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQRVRERGSPEYGRGRSPNQSPYRRERERSSDHARAPSHSPYRRERERERSSDHARAPSHSPP
Query: PPHQRERPNGDRAHSGIHSPYGRERGSPTD
R +R+ S SP GSP D
Subjt: PPHQRERPNGDRAHSGIHSPYGRERGSPTD
|
|
| Q9ZPX8 Serine/arginine-rich splicing factor RS31A | 1.7e-36 | 49.5 | Show/hide |
Query: GGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVRDDDEKRNGYS
G RG ++ +N +P+KTLFVINFDP TR RD+ERHF+PYGK+LNVR+RRNFAFVQ+ QEDAT+AL+ T+ SKL+D+V+SVEYA+R+ E+ + Y
Subjt: GGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVRDDDEKRNGYS
Query: PDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSRSPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQRVRERGSPEYGRGRSPNQSPYRRERERSSDHARAPSHSPYRRER
+ R+RRSPSP R R SPDY R SP+Y + P+PY+R R SP+YGR S Y R R RS + R S SP +R R
Subjt: PDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSRSPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQRVRERGSPEYGRGRSPNQSPYRRERERSSDHARAPSHSPYRRER
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT4G25500.1 arginine/serine-rich splicing factor 35 | 3.4e-72 | 54.92 | Show/hide |
Query: KQERGIRRPGGGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVR
K ERG G R GG SRRSS++ +PSKTLFVINFD +TRTRDLE+HF+PYGKI+NVRIRRNFAF+QYE QEDATRAL+ +N SKLMD+VISVEYAV+
Subjt: KQERGIRRPGGGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVR
Query: DDDEKRNGYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSR-SPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQRVRERGSPEYGRGRSPNQSPYRRERERS-SDHA
DDD + NG+SP+R RDRSP+R+RRSPSPY+RERGSPDYG G S + YRK R SPDYG RRSPSPY++ R RGSPEYGR R N SP RRER S + ++
Subjt: DDDEKRNGYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSR-SPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQRVRERGSPEYGRGRSPNQSPYRRERERS-SDHA
Query: RAPSHSPYRRERERERSSDHARAPSHSPPPPHQRERPNGDRAHSGIHSPYGRERGSPTDERRTSYSPRDRERSNPENGHDQRPNTIAEPGDSPSYGGTQS
R+P++ +RER S P+HS P ++E P + SP R R+R RS+PENG + P +I Y G +S
Subjt: RAPSHSPYRRERERERSSDHARAPSHSPPPPHQRERPNGDRAHSGIHSPYGRERGSPTDERRTSYSPRDRERSNPENGHDQRPNTIAEPGDSPSYGGTQS
Query: PKHRGYKSRSPQAEE
P + RSP A+E
Subjt: PKHRGYKSRSPQAEE
|
|
| AT4G25500.2 arginine/serine-rich splicing factor 35 | 3.4e-72 | 54.92 | Show/hide |
Query: KQERGIRRPGGGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVR
K ERG G R GG SRRSS++ +PSKTLFVINFD +TRTRDLE+HF+PYGKI+NVRIRRNFAF+QYE QEDATRAL+ +N SKLMD+VISVEYAV+
Subjt: KQERGIRRPGGGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVR
Query: DDDEKRNGYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSR-SPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQRVRERGSPEYGRGRSPNQSPYRRERERS-SDHA
DDD + NG+SP+R RDRSP+R+RRSPSPY+RERGSPDYG G S + YRK R SPDYG RRSPSPY++ R RGSPEYGR R N SP RRER S + ++
Subjt: DDDEKRNGYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSR-SPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQRVRERGSPEYGRGRSPNQSPYRRERERS-SDHA
Query: RAPSHSPYRRERERERSSDHARAPSHSPPPPHQRERPNGDRAHSGIHSPYGRERGSPTDERRTSYSPRDRERSNPENGHDQRPNTIAEPGDSPSYGGTQS
R+P++ +RER S P+HS P ++E P + SP R R+R RS+PENG + P +I Y G +S
Subjt: RAPSHSPYRRERERERSSDHARAPSHSPPPPHQRERPNGDRAHSGIHSPYGRERGSPTDERRTSYSPRDRERSNPENGHDQRPNTIAEPGDSPSYGGTQS
Query: PKHRGYKSRSPQAEE
P + RSP A+E
Subjt: PKHRGYKSRSPQAEE
|
|
| AT4G25500.3 arginine/serine-rich splicing factor 35 | 3.4e-72 | 54.92 | Show/hide |
Query: KQERGIRRPGGGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVR
K ERG G R GG SRRSS++ +PSKTLFVINFD +TRTRDLE+HF+PYGKI+NVRIRRNFAF+QYE QEDATRAL+ +N SKLMD+VISVEYAV+
Subjt: KQERGIRRPGGGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVR
Query: DDDEKRNGYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSR-SPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQRVRERGSPEYGRGRSPNQSPYRRERERS-SDHA
DDD + NG+SP+R RDRSP+R+RRSPSPY+RERGSPDYG G S + YRK R SPDYG RRSPSPY++ R RGSPEYGR R N SP RRER S + ++
Subjt: DDDEKRNGYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSR-SPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQRVRERGSPEYGRGRSPNQSPYRRERERS-SDHA
Query: RAPSHSPYRRERERERSSDHARAPSHSPPPPHQRERPNGDRAHSGIHSPYGRERGSPTDERRTSYSPRDRERSNPENGHDQRPNTIAEPGDSPSYGGTQS
R+P++ +RER S P+HS P ++E P + SP R R+R RS+PENG + P +I Y G +S
Subjt: RAPSHSPYRRERERERSSDHARAPSHSPPPPHQRERPNGDRAHSGIHSPYGRERGSPTDERRTSYSPRDRERSNPENGHDQRPNTIAEPGDSPSYGGTQS
Query: PKHRGYKSRSPQAEE
P + RSP A+E
Subjt: PKHRGYKSRSPQAEE
|
|
| AT4G25500.4 arginine/serine-rich splicing factor 35 | 3.4e-72 | 54.92 | Show/hide |
Query: KQERGIRRPGGGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVR
K ERG G R GG SRRSS++ +PSKTLFVINFD +TRTRDLE+HF+PYGKI+NVRIRRNFAF+QYE QEDATRAL+ +N SKLMD+VISVEYAV+
Subjt: KQERGIRRPGGGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVR
Query: DDDEKRNGYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSR-SPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQRVRERGSPEYGRGRSPNQSPYRRERERS-SDHA
DDD + NG+SP+R RDRSP+R+RRSPSPY+RERGSPDYG G S + YRK R SPDYG RRSPSPY++ R RGSPEYGR R N SP RRER S + ++
Subjt: DDDEKRNGYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSR-SPYRKVRASPDYGSRRSPSPYQRVRERGSPEYGRGRSPNQSPYRRERERS-SDHA
Query: RAPSHSPYRRERERERSSDHARAPSHSPPPPHQRERPNGDRAHSGIHSPYGRERGSPTDERRTSYSPRDRERSNPENGHDQRPNTIAEPGDSPSYGGTQS
R+P++ +RER S P+HS P ++E P + SP R R+R RS+PENG + P +I Y G +S
Subjt: RAPSHSPYRRERERERSSDHARAPSHSPPPPHQRERPNGDRAHSGIHSPYGRERGSPTDERRTSYSPRDRERSNPENGHDQRPNTIAEPGDSPSYGGTQS
Query: PKHRGYKSRSPQAEE
P + RSP A+E
Subjt: PKHRGYKSRSPQAEE
|
|
| AT5G52040.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 5.1e-68 | 53.75 | Show/hide |
Query: RPGGGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVRDDDEKRN
R G GR GG SRRSS+ +PSKTLFVINFD +TRTRDLERHF+PYGKI+NVRIRRNFAF+QYE QEDATRAL+ TN SKLMD+VISVEYAV+DDD + N
Subjt: RPGGGRGGGDSRRSSTNTKPSKTLFVINFDPYHTRTRDLERHFDPYGKILNVRIRRNFAFVQYELQEDATRALEITNMSKLMDRVISVEYAVRDDDEKRN
Query: GYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSRSPYRKVRASPDYG-SRRSPSPYQRVRERGSPEYGRGRSPNQSPYRRERERSSDHARAPSHSPY
GYSP+R RDRSPDR+RRSPSPYRRERGSPDYG G S +++ R SPDYG RRSPSPY+R R SP+Y R RRER S ++ + SP
Subjt: GYSPDRTRDRSPDRKRRSPSPYRRERGSPDYGNGVSRSPYRKVRASPDYG-SRRSPSPYQRVRERGSPEYGRGRSPNQSPYRRERERSSDHARAPSHSPY
Query: RRERERERSSDHARAPSHSPPPPHQRERPNGDRAHSGIHSPYGRERGSPTDERRTSYSPRDRERSNPENGHDQRPNTIAEPGDSPSYGGTQSPKHRGYKS
+ E + + PPP+++ R R P E+R S R R +S+PENG + P I E Y G SP S
Subjt: RRERERERSSDHARAPSHSPPPPHQRERPNGDRAHSGIHSPYGRERGSPTDERRTSYSPRDRERSNPENGHDQRPNTIAEPGDSPSYGGTQSPKHRGYKS
Query: RSPQAEE
RSP AEE
Subjt: RSPQAEE
|
|
