; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg22413 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg22413
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionsperm mitochondrial-associated cysteine-rich protein-like
Genome locationCarg_Chr01:9128995..9129393
RNA-Seq ExpressionCarg22413
SyntenyCarg22413
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6607747.1 hypothetical protein SDJN03_01089, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.2e-6499.24Show/hide
Query:  MSPAKFLALVIVFHLKSAITAADDASMPTPTSCENCALCQSACRPPPDAQPLLPPPPPPPIAEPEPLPVPVPPANCPPTIVQCCQFMPPPAPPPPPNGNN
        MSPAKFLALVIVFHLKSAITAADDASMPTPTSCENCALCQSACRPPPDAQPLLPPPPPPPIAEPEPLPVPVPP NCPPTIVQCCQFMPPPAPPPPPNGNN
Subjt:  MSPAKFLALVIVFHLKSAITAADDASMPTPTSCENCALCQSACRPPPDAQPLLPPPPPPPIAEPEPLPVPVPPANCPPTIVQCCQFMPPPAPPPPPNGNN

Query:  IYTPFYNESCSSFLKRGLVSVLAPVFGVAAIF
        IYTPFYNESCSSFLKRGLVSVLAPVFGVAAIF
Subjt:  IYTPFYNESCSSFLKRGLVSVLAPVFGVAAIF

KAG7037325.1 hypothetical protein SDJN02_00950, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.2e-65100Show/hide
Query:  MSPAKFLALVIVFHLKSAITAADDASMPTPTSCENCALCQSACRPPPDAQPLLPPPPPPPIAEPEPLPVPVPPANCPPTIVQCCQFMPPPAPPPPPNGNN
        MSPAKFLALVIVFHLKSAITAADDASMPTPTSCENCALCQSACRPPPDAQPLLPPPPPPPIAEPEPLPVPVPPANCPPTIVQCCQFMPPPAPPPPPNGNN
Subjt:  MSPAKFLALVIVFHLKSAITAADDASMPTPTSCENCALCQSACRPPPDAQPLLPPPPPPPIAEPEPLPVPVPPANCPPTIVQCCQFMPPPAPPPPPNGNN

Query:  IYTPFYNESCSSFLKRGLVSVLAPVFGVAAIF
        IYTPFYNESCSSFLKRGLVSVLAPVFGVAAIF
Subjt:  IYTPFYNESCSSFLKRGLVSVLAPVFGVAAIF

KGN44024.1 hypothetical protein Csa_011878 [Cucumis sativus]2.0e-3566.42Show/hide
Query:  MSPAKFLALVIVFHLKSAITAADDASMPTPTSCENCALCQSACRPPPDAQPL---LPPPPPPPIAEPEPLPVPVPPANCPPTIVQCCQFMPPPAPPPPPN
        M PAK LALV+VF+L +A++A DDA+MPTP SC+NC +CQS C PPP ++PL   L PPPP P AEPEPLP PV PANCPPTIVQCCQF+PPP PPP   
Subjt:  MSPAKFLALVIVFHLKSAITAADDASMPTPTSCENCALCQSACRPPPDAQPL---LPPPPPPPIAEPEPLPVPVPPANCPPTIVQCCQFMPPPAPPPPPN

Query:  --GNNIYTPFYNESCSSFLKRGLVSVLAPVFGVAAIF
            N+YTP YN S SSFL+ GL S LAPVFG+ AIF
Subjt:  --GNNIYTPFYNESCSSFLKRGLVSVLAPVFGVAAIF

XP_008463043.1 PREDICTED: sperm mitochondrial-associated cysteine-rich protein-like [Cucumis melo]6.8e-3970.8Show/hide
Query:  MSPAKFLALVIVFHLKSAITAADDASMPTPTSCENCALCQSACRPP-PDAQPLLPPPPPP--PIAEPEPLPVPVPPANCPPTIVQCCQFMPPPAPPPPPN
        M PAK LALV+VF+L SA++A DDA+M TP SC+NC +CQS CRPP  +  PLLPPPPPP  P AEPEPLP+PV PANCPPTIVQCCQF+PPP PPP   
Subjt:  MSPAKFLALVIVFHLKSAITAADDASMPTPTSCENCALCQSACRPP-PDAQPLLPPPPPP--PIAEPEPLPVPVPPANCPPTIVQCCQFMPPPAPPPPPN

Query:  -GN-NIYTPFYNESCSSFLKRGLVSVLAPVFGVAAIF
         GN NIYTP YNES SSFL+ GL S LAPVFG+ AIF
Subjt:  -GN-NIYTPFYNESCSSFLKRGLVSVLAPVFGVAAIF

XP_011659730.1 leucine-rich repeat extensin-like protein 3 [Cucumis sativus]2.0e-3566.42Show/hide
Query:  MSPAKFLALVIVFHLKSAITAADDASMPTPTSCENCALCQSACRPPPDAQPL---LPPPPPPPIAEPEPLPVPVPPANCPPTIVQCCQFMPPPAPPPPPN
        M PAK LALV+VF+L +A++A DDA+MPTP SC+NC +CQS C PPP ++PL   L PPPP P AEPEPLP PV PANCPPTIVQCCQF+PPP PPP   
Subjt:  MSPAKFLALVIVFHLKSAITAADDASMPTPTSCENCALCQSACRPPPDAQPL---LPPPPPPPIAEPEPLPVPVPPANCPPTIVQCCQFMPPPAPPPPPN

Query:  --GNNIYTPFYNESCSSFLKRGLVSVLAPVFGVAAIF
            N+YTP YN S SSFL+ GL S LAPVFG+ AIF
Subjt:  --GNNIYTPFYNESCSSFLKRGLVSVLAPVFGVAAIF

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K536 Uncharacterized protein9.9e-3666.42Show/hide
Query:  MSPAKFLALVIVFHLKSAITAADDASMPTPTSCENCALCQSACRPPPDAQPL---LPPPPPPPIAEPEPLPVPVPPANCPPTIVQCCQFMPPPAPPPPPN
        M PAK LALV+VF+L +A++A DDA+MPTP SC+NC +CQS C PPP ++PL   L PPPP P AEPEPLP PV PANCPPTIVQCCQF+PPP PPP   
Subjt:  MSPAKFLALVIVFHLKSAITAADDASMPTPTSCENCALCQSACRPPPDAQPL---LPPPPPPPIAEPEPLPVPVPPANCPPTIVQCCQFMPPPAPPPPPN

Query:  --GNNIYTPFYNESCSSFLKRGLVSVLAPVFGVAAIF
            N+YTP YN S SSFL+ GL S LAPVFG+ AIF
Subjt:  --GNNIYTPFYNESCSSFLKRGLVSVLAPVFGVAAIF

A0A1S3CI95 sperm mitochondrial-associated cysteine-rich protein-like3.3e-3970.8Show/hide
Query:  MSPAKFLALVIVFHLKSAITAADDASMPTPTSCENCALCQSACRPP-PDAQPLLPPPPPP--PIAEPEPLPVPVPPANCPPTIVQCCQFMPPPAPPPPPN
        M PAK LALV+VF+L SA++A DDA+M TP SC+NC +CQS CRPP  +  PLLPPPPPP  P AEPEPLP+PV PANCPPTIVQCCQF+PPP PPP   
Subjt:  MSPAKFLALVIVFHLKSAITAADDASMPTPTSCENCALCQSACRPP-PDAQPLLPPPPPP--PIAEPEPLPVPVPPANCPPTIVQCCQFMPPPAPPPPPN

Query:  -GN-NIYTPFYNESCSSFLKRGLVSVLAPVFGVAAIF
         GN NIYTP YNES SSFL+ GL S LAPVFG+ AIF
Subjt:  -GN-NIYTPFYNESCSSFLKRGLVSVLAPVFGVAAIF

A0A443NET1 Nitrile-specifier protein 51.4e-0541.32Show/hide
Query:  MSPAKFLALVIVFHLKSAITAAD-----DASMPTPTSCENCALCQSACRPPPDAQPLLPPPPPPPIAEPEPLPVPVPPANCPPT-IVQCCQFMPPPAPPP
        MS  K + LV +    S+I  A+     D ++P+P +C NC+LCQ  C P P A P   P  PPP   P P P    P+NCPP+   QCCQ  PP  P P
Subjt:  MSPAKFLALVIVFHLKSAITAAD-----DASMPTPTSCENCALCQSACRPPPDAQPLLPPPPPPPIAEPEPLPVPVPPANCPPT-IVQCCQFMPPPAPPP

Query:  PPNGNNIYTPFYNESCSSFLK
        PPN      P+YN   S  L+
Subjt:  PPNGNNIYTPFYNESCSSFLK

A0A6A1VX00 4Fe-4S ferredoxin-type domain-containing protein2.0e-0438.69Show/hide
Query:  SAITAADDASMPTPTSCENCALCQSACRPP----PD----AQPLLPPPPPPPIAE------PEPLPVPVPP-------ANCPP-TIVQCCQFMPPPAPPP
        SA   A    +P+P++C NC LCQ  C  P    PD      P LPPPPPP +AE        P P P PP        NCPP T+VQCCQ+     PPP
Subjt:  SAITAADDASMPTPTSCENCALCQSACRPP----PD----AQPLLPPPPPPPIAE------PEPLPVPVPP-------ANCPP-TIVQCCQFMPPPAPPP

Query:  PPNGNNIYTPFYNESCSSFLKRGLVSVLAPVFGVAAI
           G   Y P+ N S S       + V+  VF  A +
Subjt:  PPNGNNIYTPFYNESCSSFLKRGLVSVLAPVFGVAAI

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCTCCGGCGAAATTTCTGGCTCTGGTTATCGTCTTCCACCTCAAATCCGCCATCACCGCCGCCGACGACGCCTCCATGCCCACACCCACCTCCTGCGAGAACTGCGC
CCTTTGTCAATCCGCCTGCCGTCCGCCTCCTGATGCACAACCGCTATTGCCGCCTCCACCACCGCCGCCAATTGCAGAGCCAGAGCCACTTCCAGTGCCGGTTCCCCCGG
CGAACTGTCCTCCCACTATTGTCCAGTGCTGCCAGTTTATGCCGCCACCGGCACCGCCGCCGCCGCCGAATGGTAATAATATATATACGCCGTTTTATAATGAGTCGTGT
TCTTCATTTTTGAAACGTGGGTTGGTCTCTGTTTTGGCCCCTGTTTTTGGGGTGGCCGCCATTTTCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCTCCGGCGAAATTTCTGGCTCTGGTTATCGTCTTCCACCTCAAATCCGCCATCACCGCCGCCGACGACGCCTCCATGCCCACACCCACCTCCTGCGAGAACTGCGC
CCTTTGTCAATCCGCCTGCCGTCCGCCTCCTGATGCACAACCGCTATTGCCGCCTCCACCACCGCCGCCAATTGCAGAGCCAGAGCCACTTCCAGTGCCGGTTCCCCCGG
CGAACTGTCCTCCCACTATTGTCCAGTGCTGCCAGTTTATGCCGCCACCGGCACCGCCGCCGCCGCCGAATGGTAATAATATATATACGCCGTTTTATAATGAGTCGTGT
TCTTCATTTTTGAAACGTGGGTTGGTCTCTGTTTTGGCCCCTGTTTTTGGGGTGGCCGCCATTTTCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSPAKFLALVIVFHLKSAITAADDASMPTPTSCENCALCQSACRPPPDAQPLLPPPPPPPIAEPEPLPVPVPPANCPPTIVQCCQFMPPPAPPPPPNGNNIYTPFYNESC
SSFLKRGLVSVLAPVFGVAAIF