; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg22495 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg22495
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionUnknown protein
Genome locationCarg_Chr12:1257164..1257776
RNA-Seq ExpressionCarg22495
SyntenyCarg22495
Gene Ontology termsGO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7020268.1 hypothetical protein SDJN02_16951, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.6e-85100Show/hide
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XP_023002810.1 uncharacterized protein LOC111496564 [Cucurbita maxima]1.5e-7589.2Show/hide
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XP_023537720.1 uncharacterized protein LOC111798664 [Cucurbita pepo subsp. pepo]9.8e-8091.48Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LLR8 Uncharacterized protein1.8e-4263.03Show/hide
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        S S+ ECCMCGDFGFS ELF           RYCSNLYPKADCY ICNWCLT  +ES  KSPNSS           SSI N  N DQ   F     +PIK
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A0A1S3BCA2 uncharacterized protein LOC1034881034.4e-4160.84Show/hide
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        S S+ ECC CGDFG S ELF           RYCSNLYPKADCY ICNWCLTQ +ES  KSPNSS+S  +             N DQ   F     +PIK
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        KQ S       P PPPPPPPRR+ I+V+D LRRTRSEEISHR+GI+RPVIFRNKVRRYKLLDEVSS
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A0A6J1BR47 uncharacterized protein LOC1110050071.1e-5569.89Show/hide
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A0A6J1GHL7 uncharacterized protein LOC1114540135.6e-8192Show/hide
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A0A6J1KQ08 uncharacterized protein LOC1114965647.1e-7689.2Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02070.1 unknown protein3.2e-0434.65Show/hide
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        E  CCMCGD GFSD+LF            YCSN Y + A+   IC+WC +   +         S +K P+SS    +  + R ++S    IK+  N+ DQ
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        +
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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ATCACTCCTCGATCAAAAACCCCCGAAACAAGGATCAAATTCGCACTTTTCTACCCCTACAAACCAGACCCATCAAAAAACAGAGGTCGCCGGAAGCTTCTGAACGTCCA
CAACCACCGCCGCCTCCGCCGCCTCGGAGAAAACCAATCGCCGTGGAGGACAATCTCCGGCGGACGAGATCGGAGGAGATTTCTCACCGGAGTGGAATCCAACGGCCGGT
GATTTTCCGGAACAAGGTGAGAAGGTACAAACTTCTTGACGAGGTTTCCAGCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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CCCAAAAGCCGATTGTTACACAATATGCAATTGGTGTCTAACTCAAAAGGAGGAATCCAAAGCCAAATCCCCAAATTCTTCCAATTCTTCTTCCTTAACCACTCGAGATG
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GATTTTCCGGAACAAGGTGAGAAGGTACAAACTTCTTGACGAGGTTTCCAGCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MTSTGAAPASSPSEPECCMCGDFGFSDELFRYCSNLYPKADCYTICNWCLTQKEESKAKSPNSSNSSSLTTRDDHSSIKNPRNKDQIRTFLPLQTRPIKKQRSPEASERP
QPPPPPPPRRKPIAVEDNLRRTRSEEISHRSGIQRPVIFRNKVRRYKLLDEVSS