; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg22646 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg22646
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionProtein of unknown function (DUF668)
Genome locationCarg_Chr12:9015138..9016606
RNA-Seq ExpressionCarg22646
SyntenyCarg22646
Gene Ontology termsGO:0045927 - positive regulation of growth (biological process)
InterPro domainsIPR021864 - Domain of unknown function DUF3475
IPR045021 - Protein PSK SIMULATOR


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6592234.1 Protein PSK SIMULATOR 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.5e-12999.19Show/hide
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KAG7020973.1 hypothetical protein SDJN02_17661, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.0e-132100Show/hide
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XP_022976913.1 uncharacterized protein LOC111477140 [Cucurbita maxima]1.5e-11199.09Show/hide
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XP_023535280.1 uncharacterized protein LOC111796758 [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.3e-11198.64Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K402 Uncharacterized protein5.8e-9388.64Show/hide
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A0A1S3CG34 uncharacterized protein LOC1035000626.1e-9590Show/hide
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A0A5A7V213 Uncharacterized protein6.1e-9590Show/hide
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A0A6J1F2G1 uncharacterized protein LOC1114390298.5e-113100Show/hide
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A0A6J1INI6 uncharacterized protein LOC1114771407.2e-11299.09Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P0DO24 Protein PSK SIMULATOR 39.0e-3548.44Show/hide
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Q9SA91 Protein PSK SIMULATOR 24.6e-2351.72Show/hide
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        S D  EL  +AA+DKR
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Q9XID5 Protein PSK SIMULATOR 13.8e-5762.5Show/hide
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        MGG+CSR+    +A         GG+  H NGH  N +     S    S + D  PS V + V  NK   E FSFP V+   +   +I DGIPRLSR LS
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G30755.1 Protein of unknown function (DUF668)3.3e-2451.72Show/hide
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        S D  EL  +AA+DKR
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AT1G34320.1 Protein of unknown function (DUF668)2.7e-5862.5Show/hide
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AT3G23160.1 Protein of unknown function (DUF668)6.9e-0647.37Show/hide
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AT5G08660.1 Protein of unknown function (DUF668)6.4e-3648.44Show/hide
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         SEGVQNL+S D DELLR+ AADKR
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
TTGAAAGGCTATAATGGAGAGATTGAAGCTTCAAAATTTGTCGACATATGTTTTGTGGAGAATTATAATTTGTTTTTGTACACAATGGGTGGAGTTTGTTCAAGAACGAG
AAGAACTACTTCAGCTGTTATTGGTGGGCATACTGGTGTAGTAGGGGGTTCCACGCATGAAAATGGTCATTCTAACAATGAGTCGGGGATGGTTTATCGGTCTCGTGAAC
TGCCATCGAAAATTAGTGACTCCATACCGTCTGCTGTTGACGATGGCGTCAATAAGCCGTTGCGAGAACCGTTTTCGTTCCCTGAGGTGAATGTGGTTCCATATGGACTG
GATGATATCAATGATGGAATTCCTCGCTTGTCTAGAACGTTATCTCAGAAATCTAGATCAACGAAGTCCAGACAAGCTGTTGCGAAGGTATCAGAAATGAGCTCTCTTAT
AGGCAGAGCAGGTACCGTTGGGCTTGGAAAGGCTGTTGATGTTTTGGATACACTTGGTAGTAGTGTGACGAGTTTGAACCTTGGTAGTGGTTTCACCTCGGGGGTGGCAA
CGAAAGGGAACAAAATTTTAATCTTAGCTTTTGAAGTTGCCAACACCATTGTGAAGGGTTCTAGTCTAATGCATTCTCTCTCAGAGCATAACATTAGAGTTTTAAAGGAG
GAAGTGCTTCCATCAGAAGGGGTCCAAAATTTAATATCAAGAGACATGGATGAACTCTTGAGAATTGCAGCAGCAGACAAGAGGTGGATAGTTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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EVLPSEGVQNLISRDMDELLRIAAADKRWIV