; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg22716 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg22716
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionycf20-like protein
Genome locationCarg_Chr11:4939626..4941437
RNA-Seq ExpressionCarg22716
SyntenyCarg22716
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR007572 - Uncharacterised protein family Ycf20


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_022973215.1 ycf20-like protein [Cucurbita maxima]4.8e-10899.51Show/hide
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XP_023520636.1 ycf20-like protein [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.2e-10899.51Show/hide
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XP_038878602.1 ycf20-like protein [Benincasa hispida]4.8e-9285.85Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LXR2 Uncharacterized protein4.9e-9083.9Show/hide
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A0A5A7T5T0 Ycf20-like protein3.3e-7091.28Show/hide
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A0A6J1D763 ycf20-like protein4.9e-8279.23Show/hide
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A0A6J1EGC6 ycf20-like protein3.6e-109100Show/hide
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A0A6J1ICF7 ycf20-like protein2.3e-10899.51Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80813 Ycf20-like protein5.6e-5164.63Show/hide
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P51214 Uncharacterized protein ycf201.8e-1239.64Show/hide
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P72983 Ycf20-like protein1.3e-0729.73Show/hide
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Q1XDS2 Uncharacterized protein ycf201.0e-1239.64Show/hide
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Q9MUL5 Uncharacterized protein ycf201.6e-1850.43Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G65420.1 Protein of unknown function (DUF565)4.0e-5264.63Show/hide
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AT3G56830.1 Protein of unknown function (DUF565)7.1e-2540.69Show/hide
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AT3G56830.2 Protein of unknown function (DUF565)7.1e-2540.69Show/hide
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AT3G56830.3 Protein of unknown function (DUF565)7.1e-2540.69Show/hide
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AT5G43050.1 Protein of unknown function (DUF565)4.0e-0435.44Show/hide
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        LL GFY A  ++   G  G  DV+ A + V   E++    Y +            I L+N +K G   GLF+DAFKL S
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TATCCTTAATGGACACAATTCAACTCTTTGCTTGAAGTCTGCACCTTTTCCTCGCAAAAGTTTCCGGACGAGTAGACATCTACAACAATTAGCCTTTGCATTAGACACAG
GTGGGGTATCTAGTAACGGTGGGGGAGACAACCTTGATGATGGTAATGAGTCGAATCTGGGTCGTACTCGATTAGGCAGGCTAGTTAGCGCAGGTGCCAGACAGTTGCTG
GAAAAACTAAACTCAGCTAGAAAGAACTTTCCTACAAAGATATTTTTGCTTCTTTTGGGTTTCTATACAGCCAATGCTCTTGCTACAATTCTTGGGCAGACGGGTGACTG
GGATGTTTTGGTTGCTGGTGTGGTGGTTGCTGCCATTGAATGGATTGGTATACTCATGTACAAGAAGCCACCACCTCTATTAACTAGGAGGTTGAAATCATTAATAGTAC
TGATAAACTATTGGAAAGCCGGCGTATGCTTAGGCCTCTTCGTCGATGCGTTCAAATTGGGGAGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AACAGATTTTGTGAACAATTTCCTCCAATGGACAACGATTTTCGAGGATGAGGGTAACCACATCGCCCTTCGTTTGACGCATTTCGCCGCTAGGGTTTCGTCTCGGCGCT
ATCAATTCCAGCGGCATTTGAAGTTTCCGGCAAGAACTTTACTGTACAGAGGCGGTCTCTTTTGATTCGAAGATTGTGTAATAAATGGCAATATCAGTATGCAGATAACC
ACCTGCTCGAATGGAAGCTATGATTATGCAGTCCAGATTATTGACAATAGCGAATTATATCTCCAAAGGATTATGTCTTACGTATATGCCTTGCCTAATCCATAACATGG
GCTATGTGGCTATCCTTAATGGACACAATTCAACTCTTTGCTTGAAGTCTGCACCTTTTCCTCGCAAAAGTTTCCGGACGAGTAGACATCTACAACAATTAGCCTTTGCA
TTAGACACAGGTGGGGTATCTAGTAACGGTGGGGGAGACAACCTTGATGATGGTAATGAGTCGAATCTGGGTCGTACTCGATTAGGCAGGCTAGTTAGCGCAGGTGCCAG
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TTAATAGTACTGATAAACTATTGGAAAGCCGGCGTATGCTTAGGCCTCTTCGTCGATGCGTTCAAATTGGGGAGTTGAAAGATGTTGCTTCCTGGTTTGAAATAAAACAA
AAGGTAGTTCTTTTTATCTTAGAGGAAAGTTATTTTTGTACGAGGCACGAGTTCTTATTCCATCTTGTGTTACATTTGTAACTGTATAATCTTATAGATACCTATTATAG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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