| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0063593.1 histone H1-like [Cucumis melo var. makuwa] | 1.5e-90 | 85.02 | Show/hide |
Query: MSSAADPVASSDAPATV-AAVAQPVENDSKSKKAAASKASKAKKPSGAKRTRSSPTHPPFFEMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKKLPSNFRKL
MSSAADPV SSDAPA AAVAQP ENDSKSKKAAASKASKAKKPSGAK+ RSSPTHPPF +MISEAIVSLKERTGSSQYAITKF+EEKHK+LPSNFRKL
Subjt: MSSAADPVASSDAPATV-AAVAQPVENDSKSKKAAASKASKAKKPSGAKRTRSSPTHPPFFEMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKKLPSNFRKL
Query: LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARS----KAAAAPVVAKKPASSKLKAAVSVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKAVA--KPKSAAKSKVVAKPKAVAPAK
LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARS AAAAPV KKP SSKLKA S+KK AVAKPKAKTA KPKPKAVA KPK+ KSK VAKPK AK
Subjt: LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARS----KAAAAPVVAKKPASSKLKAAVSVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKAVA--KPKSAAKSKVVAKPKAVAPAK
Query: RKAAEKVKKVAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKKAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
KAAEKVKKVAPKPK AK KVAKTLSRTSPGK+AAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt: RKAAEKVKKVAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKKAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
|
|
| KAG6599320.1 Histone H1.2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 2.4e-112 | 99.23 | Show/hide |
Query: MSSAADPVASSDAPATVAAVAQPVENDSKSKKAAASKASKAKKPSGAKRTRSSPTHPPFFEMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKKLPSNFRKLL
MSSAADPVASSDAPATVAAVAQPVENDSKSKKAAASKASKAKKPSGAKRTRSSPTHPPFFEMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHK+LPSNFRKLL
Subjt: MSSAADPVASSDAPATVAAVAQPVENDSKSKKAAASKASKAKKPSGAKRTRSSPTHPPFFEMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKKLPSNFRKLL
Query: LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSKAAAAPVVAKKPASSKLKAAVSVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKAVAKPKSAAKSKVVAKPKAVAPAKRKAAEKV
LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSKAAAAPVVAKKPASSKLKAAVSVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKAVAKPK+AAKSKVVAKPKAVAPAKRKAAEKV
Subjt: LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSKAAAAPVVAKKPASSKLKAAVSVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKAVAKPKSAAKSKVVAKPKAVAPAKRKAAEKV
Query: KKVAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKKAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
KKVAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKKAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt: KKVAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKKAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
|
|
| XP_022946127.1 histone H1-like [Cucurbita moschata] | 3.7e-113 | 100 | Show/hide |
Query: MSSAADPVASSDAPATVAAVAQPVENDSKSKKAAASKASKAKKPSGAKRTRSSPTHPPFFEMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKKLPSNFRKLL
MSSAADPVASSDAPATVAAVAQPVENDSKSKKAAASKASKAKKPSGAKRTRSSPTHPPFFEMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKKLPSNFRKLL
Subjt: MSSAADPVASSDAPATVAAVAQPVENDSKSKKAAASKASKAKKPSGAKRTRSSPTHPPFFEMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKKLPSNFRKLL
Query: LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSKAAAAPVVAKKPASSKLKAAVSVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKAVAKPKSAAKSKVVAKPKAVAPAKRKAAEKV
LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSKAAAAPVVAKKPASSKLKAAVSVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKAVAKPKSAAKSKVVAKPKAVAPAKRKAAEKV
Subjt: LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSKAAAAPVVAKKPASSKLKAAVSVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKAVAKPKSAAKSKVVAKPKAVAPAKRKAAEKV
Query: KKVAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKKAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
KKVAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKKAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt: KKVAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKKAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
|
|
| XP_022999095.1 histone H1-like [Cucurbita maxima] | 1.1e-109 | 97.31 | Show/hide |
Query: MSSAADPVASSDAPATVAAVAQPVENDSKSKKAAASKASKAKKPSGAKRTRSSPTHPPFFEMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKKLPSNFRKLL
MSSAADPVASSDAPATVA VA PVENDSKSKKAAASKASKAKKPSGAKRTRSSPTHPPFFEMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHK+LPSNFRKLL
Subjt: MSSAADPVASSDAPATVAAVAQPVENDSKSKKAAASKASKAKKPSGAKRTRSSPTHPPFFEMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKKLPSNFRKLL
Query: LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSKAAAAPVVAKKPASSKLKAAVSVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKAVAKPKSAAKSKVVAKPKAVAPAKRKAAEKV
LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSKAAAAPVVAKKPASSKLKAAVSVKKAAVAKPKAKTAVKPKPK VAKPK+AAKSKVV KPKAVAPAKRKAAEKV
Subjt: LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSKAAAAPVVAKKPASSKLKAAVSVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKAVAKPKSAAKSKVVAKPKAVAPAKRKAAEKV
Query: KKVAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKKAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
KKVAPKPKPAAKPAKVAKTLSR SPGKKAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt: KKVAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKKAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
|
|
| XP_023521173.1 histone H1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 5.9e-111 | 98.08 | Show/hide |
Query: MSSAADPVASSDAPATVAAVAQPVENDSKSKKAAASKASKAKKPSGAKRTRSSPTHPPFFEMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKKLPSNFRKLL
MSSAADPVASSDAPATVA VAQP ENDSKSKKAAASKASKAKKPSGAKRTRSSPTHPPFFEMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHK+LPSNFRKLL
Subjt: MSSAADPVASSDAPATVAAVAQPVENDSKSKKAAASKASKAKKPSGAKRTRSSPTHPPFFEMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKKLPSNFRKLL
Query: LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSKAAAAPVVAKKPASSKLKAAVSVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKAVAKPKSAAKSKVVAKPKAVAPAKRKAAEKV
LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSKAAAAPVVAKKPASSKLKAAVSVKKAAVAKPKAKTAVKPKPK VAKPK+AAKSKVVAKPKAVAPAKRKAAEKV
Subjt: LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSKAAAAPVVAKKPASSKLKAAVSVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKAVAKPKSAAKSKVVAKPKAVAPAKRKAAEKV
Query: KKVAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKKAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
KKVAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKKAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt: KKVAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKKAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A1S3C278 histone H1-like | 6.2e-90 | 84.64 | Show/hide |
Query: MSSAADPVASSDAPATV-AAVAQPVENDSKSKKAAASKASKAKKPSGAKRTRSSPTHPPFFEMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKKLPSNFRKL
MSSAADPV SSDAPA AAVAQP ENDSKSKKAAASKASKAKKPSGAK+ RSSPTHPPF +MISEAIVSLKERTGSSQYAITKF+EEKHK+LPSNFRKL
Subjt: MSSAADPVASSDAPATV-AAVAQPVENDSKSKKAAASKASKAKKPSGAKRTRSSPTHPPFFEMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKKLPSNFRKL
Query: LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARS----KAAAAPVVAKKPASSKLKAAVSVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKAVA--KPKSAAKSKVVAKPKAVAPAK
LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARS AAAAPV KKP SSKLKA S+KK AVAKPKAKTA K KPKAVA KPK+ KSK VAKPK AK
Subjt: LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARS----KAAAAPVVAKKPASSKLKAAVSVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKAVA--KPKSAAKSKVVAKPKAVAPAK
Query: RKAAEKVKKVAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKKAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
KAAEKVKKVAPKPK AK KVAKTLSRTSPGK+AAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt: RKAAEKVKKVAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKKAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
|
|
| A0A5D3D4H1 Histone H1-like | 7.3e-91 | 85.02 | Show/hide |
Query: MSSAADPVASSDAPATV-AAVAQPVENDSKSKKAAASKASKAKKPSGAKRTRSSPTHPPFFEMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKKLPSNFRKL
MSSAADPV SSDAPA AAVAQP ENDSKSKKAAASKASKAKKPSGAK+ RSSPTHPPF +MISEAIVSLKERTGSSQYAITKF+EEKHK+LPSNFRKL
Subjt: MSSAADPVASSDAPATV-AAVAQPVENDSKSKKAAASKASKAKKPSGAKRTRSSPTHPPFFEMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKKLPSNFRKL
Query: LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARS----KAAAAPVVAKKPASSKLKAAVSVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKAVA--KPKSAAKSKVVAKPKAVAPAK
LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARS AAAAPV KKP SSKLKA S+KK AVAKPKAKTA KPKPKAVA KPK+ KSK VAKPK AK
Subjt: LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARS----KAAAAPVVAKKPASSKLKAAVSVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKAVA--KPKSAAKSKVVAKPKAVAPAK
Query: RKAAEKVKKVAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKKAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
KAAEKVKKVAPKPK AK KVAKTLSRTSPGK+AAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt: RKAAEKVKKVAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKKAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
|
|
| A0A6J1CNP7 histone H1-like | 1.1e-86 | 83.71 | Show/hide |
Query: MSSAADPVASSDAPATVAAVAQPVENDSKSKKAAASKASKAKKPSGAKRTRSSPTHPPFFEMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKKLPSNFRKLL
M+SAADP+ SDAPA AA V ND+K KKAA+SKASKAKKPSGAKR +SSPTHPPFF+MISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHK+LPSNFRKLL
Subjt: MSSAADPVASSDAPATVAAVAQPVENDSKSKKAAASKASKAKKPSGAKRTRSSPTHPPFFEMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKKLPSNFRKLL
Query: LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARS--KAAAAPVVAKKPASSKLKAAVSV-KKAAVAKPKAKTAVKPKPKAVAKPKSAAKSKVVAKPK-AVAPAKRKA
LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARS AAAPV AKKPASSKLKAA SV KKAAV KPKAKTAVKPKPKAV KPK+ +KSKVVAKPK A A AK KA
Subjt: LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARS--KAAAAPVVAKKPASSKLKAAVSV-KKAAVAKPKAKTAVKPKPKAVAKPKSAAKSKVVAKPK-AVAPAKRKA
Query: AEKVKKVAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKKAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
A KV K A K KPAA+PAKVAKTL++TSPGK+AAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt: AEKVKKVAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKKAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
|
|
| A0A6J1G2W2 histone H1-like | 1.8e-113 | 100 | Show/hide |
Query: MSSAADPVASSDAPATVAAVAQPVENDSKSKKAAASKASKAKKPSGAKRTRSSPTHPPFFEMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKKLPSNFRKLL
MSSAADPVASSDAPATVAAVAQPVENDSKSKKAAASKASKAKKPSGAKRTRSSPTHPPFFEMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKKLPSNFRKLL
Subjt: MSSAADPVASSDAPATVAAVAQPVENDSKSKKAAASKASKAKKPSGAKRTRSSPTHPPFFEMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKKLPSNFRKLL
Query: LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSKAAAAPVVAKKPASSKLKAAVSVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKAVAKPKSAAKSKVVAKPKAVAPAKRKAAEKV
LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSKAAAAPVVAKKPASSKLKAAVSVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKAVAKPKSAAKSKVVAKPKAVAPAKRKAAEKV
Subjt: LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSKAAAAPVVAKKPASSKLKAAVSVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKAVAKPKSAAKSKVVAKPKAVAPAKRKAAEKV
Query: KKVAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKKAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
KKVAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKKAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt: KKVAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKKAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
|
|
| A0A6J1KEC3 histone H1-like | 5.4e-110 | 97.31 | Show/hide |
Query: MSSAADPVASSDAPATVAAVAQPVENDSKSKKAAASKASKAKKPSGAKRTRSSPTHPPFFEMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKKLPSNFRKLL
MSSAADPVASSDAPATVA VA PVENDSKSKKAAASKASKAKKPSGAKRTRSSPTHPPFFEMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHK+LPSNFRKLL
Subjt: MSSAADPVASSDAPATVAAVAQPVENDSKSKKAAASKASKAKKPSGAKRTRSSPTHPPFFEMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKKLPSNFRKLL
Query: LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSKAAAAPVVAKKPASSKLKAAVSVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKAVAKPKSAAKSKVVAKPKAVAPAKRKAAEKV
LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSKAAAAPVVAKKPASSKLKAAVSVKKAAVAKPKAKTAVKPKPK VAKPK+AAKSKVV KPKAVAPAKRKAAEKV
Subjt: LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSKAAAAPVVAKKPASSKLKAAVSVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKAVAKPKSAAKSKVVAKPKAVAPAKRKAAEKV
Query: KKVAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKKAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
KKVAPKPKPAAKPAKVAKTLSR SPGKKAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt: KKVAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKKAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P08283 Histone H1 | 3.7e-31 | 48.28 | Show/hide |
Query: MSSAADPVASSDAPATVAAVAQPVENDSKSKKAAASKASKAKKPSGAKRTRSSPTHPPFFEMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKKLPSNFRKLL
+ + +P+ + P T+ P + + K++ KA K KP A + R+ +HP + EMI +AIVSLKE+ GSSQYAI KF EEK K+LP+NF+KLL
Subjt: MSSAADPVASSDAPATVAAVAQPVENDSKSKKAAASKASKAKKPSGAKRTRSSPTHPPFFEMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKKLPSNFRKLL
Query: LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSKAAAAPVVAKKPASSKLKAAVSVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKAVAKPKSAAKSKVVAKPKAVAPAKRKAAEKV
L +LKK VA+ KL+KVK S+KL S AA P VAK A + KA SVK AKPKAK VKPK + AK +A K AKPK VA + A K
Subjt: LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSKAAAAPVVAKKPASSKLKAAVSVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKAVAKPKSAAKSKVVAKPKAVAPAKRKAAEKV
Query: KKVAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKKAAPAAK--AKKVAAK--KPKTVKSPARKVQARK
K V KPK KPAKVAKT +T+PGKK A K AKKV K K K+VKSP +KV ++
Subjt: KKVAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKKAAPAAK--AKKVAAK--KPKTVKSPARKVQARK
|
|
| P23444 Histone H1 | 1.3e-31 | 51.56 | Show/hide |
Query: SDAPATVAAVAQPVENDSKSKKAAASKASKAKKPSGAKRTRSSPTHPPFFEMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHK-KLPSNFRKLLLVHLKKLVA
++ PA + A D+ + AA + A+KAKK + K+ R+SPTH P+ EM+SEAI SLKERTGSS YAI KF E+KHK KLP NFRKLL V LKKLVA
Subjt: SDAPATVAAVAQPVENDSKSKKAAASKASKAKKPSGAKRTRSSPTHPPFFEMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHK-KLPSNFRKLLLVHLKKLVA
Query: ADKLVKVKNSYKLPSARSKAAAAPVVAKKPASSKLKAAVSVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKAVAKPKSAAKSKVVAKPKAVAPAKRKAAEKV--KKVAPKP
KL KVKNSYKL SA KKP + + K A AKPKAKT K KP KPK AAK K V KPK A K K A K K KP
Subjt: ADKLVKVKNSYKLPSARSKAAAAPVVAKKPASSKLKAAVSVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKAVAKPKSAAKSKVVAKPKAVAPAKRKAAEKV--KKVAPKP
Query: KPAAKP---AKVAKTLSRTSPGKKAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
KP AK AK AKT ++ +PGKK APA KA +KK T P RK +RK KK
Subjt: KPAAKP---AKVAKTLSRTSPGKKAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
|
|
| P26569 Histone H1.2 | 2.5e-32 | 52.24 | Show/hide |
Query: VASSDAPATV-AAVAQPVENDSKSKKAAASKASKAK-KPSGAKRTRSSPTHPPFFEMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKKLPSNFRKLLLVHLK
V S A TV + +P KSKK +KA+K K + + +++ +HP + EMI +AIV+LKERTGSSQYAI KF EEKHK LP FRKLLLV+LK
Subjt: VASSDAPATV-AAVAQPVENDSKSKKAAASKASKAK-KPSGAKRTRSSPTHPPFFEMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKKLPSNFRKLLLVHLK
Query: KLVAADKLVKVKNSYKLPSARSKAA---AAPVVAKKPASSKLKAAVSVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKAVAKPKSAAKSKVVAKPKA-VAPAKRK-----A
+LVA++KLVKVK S+K+PSARS A AAPV K +K K V+ AAVA KAK A K K A K AK+KV AKPKA V AK K A
Subjt: KLVAADKLVKVKNSYKLPSARSKAA---AAPVVAKKPASSKLKAAVSVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKAVAKPKSAAKSKVVAKPKA-VAPAKRK-----A
Query: AEKVKKVAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKK-AAPAAK---AKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
K K VA KPK +PAK ++T +RTSPGKK AAPA K KK AK K VKSPA++ RK KK
Subjt: AEKVKKVAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKK-AAPAAK---AKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
|
|
| P37218 Histone H1 | 1.5e-40 | 52.5 | Show/hide |
Query: VASSDAPATVAAVAQPVENDSKSKKAAASKASKAKKPSGAKRTRSSPTHPPFFEMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKKLPSNFRKLLLVHLKKL
V AP TV A P +K A K +KAKKP+ ++ ++PTHPP+FEMI +AIV+LKERTGSSQ+AITKF EEK K LPSNF+KLLL LKK
Subjt: VASSDAPATVAAVAQPVENDSKSKKAAASKASKAKKPSGAKRTRSSPTHPPFFEMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKKLPSNFRKLLLVHLKKL
Query: VAADKLVKVKNSYKLPSARSKAAAAPVVAKKPASS--------------KLKAAVSVKKAAVAKP--KAKTAVKPKPKAVAKPKSAAKSKVVAKPKAVAP
VA++KLVKVKNSYKLPS AAAA KKPA++ K K A K AA AKP KAK A K KP A AKP + AK AKPKA A
Subjt: VAADKLVKVKNSYKLPSARSKAAAAPVVAKKPASS--------------KLKAAVSVKKAAVAKP--KAKTAVKPKPKAVAKPKSAAKSKVVAKPKAVAP
Query: AKRKAAEKVKKVAPKPKPAAKP--------AKVAKTLSRTSPGKKAAP-AAKAKKVAAKK--PKTVKSPARKVQARKVKK
AK KAA K K K K A KP AKVAKT +RT+P +KAAP A AKK KK K VKSPA+K ++ +K
Subjt: AKRKAAEKVKKVAPKPKPAAKP--------AKVAKTLSRTSPGKKAAP-AAKAKKVAAKK--PKTVKSPARKVQARKVKK
|
|
| Q9M5W4 Histone H1 | 1.7e-36 | 56.45 | Show/hide |
Query: SDAPATVAAVAQPVENDSK-SKKAAASKASKAKKP-SGAKRTRSSPT--HPPFFEMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKKLPSNFRKLLLVHLKK
+D P + V + E SK KAAA K K KK AK+ +S T HP FFEMIS+AI +LKERTGSSQYAI KF E+KHK+LPSNFRKLLL HLKK
Subjt: SDAPATVAAVAQPVENDSK-SKKAAASKASKAKKP-SGAKRTRSSPT--HPPFFEMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKKLPSNFRKLLLVHLKK
Query: LVAADKLVKVKNSYKLPSARSKAAAAPVVAKKPASSKLKAAVSVKKAAV-AKPKAKTAVKPKPKAVAKPKSAAKSKVVAKPKAVAPAKRKAAEKVKKVAP
LVA+ KLVKVKNS+KLPSAR AA AP +AKKP K K A K A + AKPKAK V K KA K+ AK AKPKA K A
Subjt: LVAADKLVKVKNSYKLPSARSKAAAAPVVAKKPASSKLKAAVSVKKAAV-AKPKAKTAVKPKPKAVAKPKSAAKSKVVAKPKAVAPAKRKAAEKVKKVAP
Query: KPKP-AAKPAKVAKTLSRTSPGKKAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARK
KPK AAKPAKVAKT + SPGKK K V KK KTVKSPA K
Subjt: KPKP-AAKPAKVAKTLSRTSPGKKAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARK
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G06760.1 winged-helix DNA-binding transcription factor family protein | 3.4e-32 | 51.52 | Show/hide |
Query: SSDAPATVAAV-AQPVENDSKSKKAAASKASKAKKPSGAKRTRSSPTHPPFFEMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKKLPSNFRKLLLVHLKKLV
++DAP T AAV +P K+K K K + KRT SS HP + EMI +AIV+LKERTGSSQYAI KF EEK K+LP FRKLLL++LK+LV
Subjt: SSDAPATVAAV-AQPVENDSKSKKAAASKASKAKKPSGAKRTRSSPTHPPFFEMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKKLPSNFRKLLLVHLKKLV
Query: AADKLVKVKNSYKLPSARSKAAAAPVVAKKPASSKLK-AAVSVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKAVAKPKSAAKSKVVAKPKA-VAPAKRKAAEKVKKVAPK
A+ KLVKVK S+KLPSA +KA++ A+K A +K K A V+V K AK K A K K KPK+AA KV AK KA P AA K K V K
Subjt: AADKLVKVKNSYKLPSARSKAAAAPVVAKKPASSKLK-AAVSVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKAVAKPKSAAKSKVVAKPKA-VAPAKRKAAEKVKKVAPK
Query: PKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKKAAPAAK-------AKKVAAK---KPKTVKSPARKVQARKVKK
PK A+PAK AKT TSP KKA A K KK K KPKTVKSPA++ +R VKK
Subjt: PKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKKAAPAAK-------AKKVAAK---KPKTVKSPARKVQARKVKK
|
|
| AT2G18050.1 histone H1-3 | 1.1e-09 | 38.41 | Show/hide |
Query: KASKAKKPSGAKRTRSSPTHPPFFEMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKK-LPSNFRKLLLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSKAAAAPVV
K AKKP K T THPP+F+MI EA++ LKE+ GSS YAI K EEKHK LP +FRK L + LK VA KLVK++ SYKL +
Subjt: KASKAKKPSGAKRTRSSPTHPPFFEMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKK-LPSNFRKLLLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSKAAAAPVV
Query: AKKPASSKLKAAVSVKKAAVAKPKAKTAVKPKPK-AVAKPKSAAKSKVVAKPKAV--APAKRKA
+ K K + + + K ++ +PK +V K + K K +PK++ + K+KA
Subjt: AKKPASSKLKAAVSVKKAAVAKPKAKTAVKPKPK-AVAKPKSAAKSKVVAKPKAV--APAKRKA
|
|
| AT2G18050.2 histone H1-3 | 7.9e-05 | 36.69 | Show/hide |
Query: MISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKK-LPSNFRKLLLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSKAAAAPVVAKKPASSKLKAAVSVKKAAVAKPKA
MI EA++ LKE+ GSS YAI K EEKHK LP +FRK L + LK VA KLVK++ SYKL + + K K + + + K
Subjt: MISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKK-LPSNFRKLLLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSKAAAAPVVAKKPASSKLKAAVSVKKAAVAKPKA
Query: KTAVKPKPK-AVAKPKSAAKSKVVAKPKAV--APAKRKA
++ +PK +V K + K K +PK++ + K+KA
Subjt: KTAVKPKPK-AVAKPKSAAKSKVVAKPKAV--APAKRKA
|
|
| AT2G30620.1 winged-helix DNA-binding transcription factor family protein | 1.8e-33 | 52.24 | Show/hide |
Query: VASSDAPATV-AAVAQPVENDSKSKKAAASKASKAK-KPSGAKRTRSSPTHPPFFEMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKKLPSNFRKLLLVHLK
V S A TV + +P KSKK +KA+K K + + +++ +HP + EMI +AIV+LKERTGSSQYAI KF EEKHK LP FRKLLLV+LK
Subjt: VASSDAPATV-AAVAQPVENDSKSKKAAASKASKAK-KPSGAKRTRSSPTHPPFFEMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKKLPSNFRKLLLVHLK
Query: KLVAADKLVKVKNSYKLPSARSKAA---AAPVVAKKPASSKLKAAVSVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKAVAKPKSAAKSKVVAKPKA-VAPAKRK-----A
+LVA++KLVKVK S+K+PSARS A AAPV K +K K V+ AAVA KAK A K K A K AK+KV AKPKA V AK K A
Subjt: KLVAADKLVKVKNSYKLPSARSKAA---AAPVVAKKPASSKLKAAVSVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKAVAKPKSAAKSKVVAKPKA-VAPAKRK-----A
Query: AEKVKKVAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKK-AAPAAK---AKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
K K VA KPK +PAK ++T +RTSPGKK AAPA K KK AK K VKSPA++ RK KK
Subjt: AEKVKKVAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKK-AAPAAK---AKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
|
|
| AT2G30620.2 winged-helix DNA-binding transcription factor family protein | 6.4e-23 | 50.5 | Show/hide |
Query: VASSDAPATV-AAVAQPVENDSKSKKAAASKASKAK-KPSGAKRTRSSPTHPPFFEMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKKLPSNFRKLLLVHLK
V S A TV + +P KSKK +KA+K K + + +++ +HP + EMI +AIV+LKERTGSSQYAI KF EEKHK LP FRKLLLV+LK
Subjt: VASSDAPATV-AAVAQPVENDSKSKKAAASKASKAK-KPSGAKRTRSSPTHPPFFEMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKKLPSNFRKLLLVHLK
Query: KLVAADKLVKVKNSYKLPSARSKAAAAPVVAKKPASSKLKAAVSVKKAAVAKPKA-KTAVKPKP-KAVAKP--KSAAKSKVVAKP-KAVAPAKRKAAEKV
+LVA++KLVKVK S+K+PSARS AA P KPA A V K VAKPKA +T+ + P K VA P K A K AK K +PAKR + K
Subjt: KLVAADKLVKVKNSYKLPSARSKAAAAPVVAKKPASSKLKAAVSVKKAAVAKPKA-KTAVKPKP-KAVAKP--KSAAKSKVVAKP-KAVAPAKRKAAEKV
Query: KK
KK
Subjt: KK
|
|
