; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg23253 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg23253
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionRAB GTPase homolog 1A
Genome locationCarg_Chr16:9014071..9018085
RNA-Seq ExpressionCarg23253
SyntenyCarg23253
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0012505 - endomembrane system (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7015700.1 GTP-binding protein YPTM2 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]7.2e-115100Show/hide
Query:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADLLSFSLYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV
        MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADLLSFSLYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV
Subjt:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADLLSFSLYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV

Query:  YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQ
        YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQ
Subjt:  YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQ

Query:  IRGQPVNQKSGCCSS
        IRGQPVNQKSGCCSS
Subjt:  IRGQPVNQKSGCCSS

XP_004147230.1 GTP-binding protein YPTM2 [Cucumis sativus]8.9e-10593.49Show/hide
Query:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADLLSFSLYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV
        MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFA             DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV
Subjt:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADLLSFSLYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV

Query:  YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQ
        YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYE+AKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQ
Subjt:  YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQ

Query:  IRGQPVNQKSGCCSS
        IRGQPVNQKSGCCSS
Subjt:  IRGQPVNQKSGCCSS

XP_022923371.1 GTP-binding protein YPTM2-like [Cucurbita moschata]5.2e-10593.49Show/hide
Query:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADLLSFSLYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV
        MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFA             DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV
Subjt:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADLLSFSLYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV

Query:  YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQ
        YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK+VSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQ
Subjt:  YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQ

Query:  IRGQPVNQKSGCCSS
        IRGQPVNQKSGCCSS
Subjt:  IRGQPVNQKSGCCSS

XP_022948506.1 GTP-binding protein YPTM2-like [Cucurbita moschata]3.4e-10493.02Show/hide
Query:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADLLSFSLYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV
        MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFA             DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV
Subjt:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADLLSFSLYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV

Query:  YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQ
        YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVS+E+AKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQ
Subjt:  YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQ

Query:  IRGQPVNQKSGCCSS
        IRGQPVNQKSGCCSS
Subjt:  IRGQPVNQKSGCCSS

XP_022965188.1 GTP-binding protein YPTM2-like [Cucurbita maxima]4.0e-10593.95Show/hide
Query:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADLLSFSLYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV
        MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFA             DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV
Subjt:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADLLSFSLYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV

Query:  YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQ
        YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQ
Subjt:  YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQ

Query:  IRGQPVNQKSGCCSS
        IRGQPVNQKSGCCSS
Subjt:  IRGQPVNQKSGCCSS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L5E9 Uncharacterized protein4.3e-10593.49Show/hide
Query:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADLLSFSLYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV
        MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFA             DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV
Subjt:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADLLSFSLYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV

Query:  YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQ
        YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYE+AKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQ
Subjt:  YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQ

Query:  IRGQPVNQKSGCCSS
        IRGQPVNQKSGCCSS
Subjt:  IRGQPVNQKSGCCSS

A0A1S3BJX6 GTP-binding protein YPTM2-like4.3e-10593.49Show/hide
Query:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADLLSFSLYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV
        MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFA             DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV
Subjt:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADLLSFSLYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV

Query:  YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQ
        YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYE+AKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQ
Subjt:  YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQ

Query:  IRGQPVNQKSGCCSS
        IRGQPVNQKSGCCSS
Subjt:  IRGQPVNQKSGCCSS

A0A6J1E6M6 GTP-binding protein YPTM2-like2.5e-10593.49Show/hide
Query:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADLLSFSLYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV
        MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFA             DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV
Subjt:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADLLSFSLYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV

Query:  YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQ
        YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK+VSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQ
Subjt:  YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQ

Query:  IRGQPVNQKSGCCSS
        IRGQPVNQKSGCCSS
Subjt:  IRGQPVNQKSGCCSS

A0A6J1HN53 GTP-binding protein YPTM2-like1.9e-10593.95Show/hide
Query:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADLLSFSLYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV
        MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFA             DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV
Subjt:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADLLSFSLYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV

Query:  YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQ
        YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQ
Subjt:  YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQ

Query:  IRGQPVNQKSGCCSS
        IRGQPVNQKSGCCSS
Subjt:  IRGQPVNQKSGCCSS

A0A6J1KZK2 GTP-binding protein YPTM21.6e-10493.02Show/hide
Query:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADLLSFSLYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV
        MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFA             DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV
Subjt:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADLLSFSLYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV

Query:  YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQ
        YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVS+E+AKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQ
Subjt:  YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQ

Query:  IRGQPVNQKSGCCSS
        IRGQPVNQKSGCCSS
Subjt:  IRGQPVNQKSGCCSS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P28188 Ras-related protein RABD2a5.1e-9581.94Show/hide
Query:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADLLSFSLYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV
        M PEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRF+             DDSY++SYISTIGVDFKIRTVE DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+V
Subjt:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADLLSFSLYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV

Query:  YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPM-NNARPPTV
        YDVTD++SFNNVKQWL+EIDRYAS+NVNKLLVGNKSDLT N+ + YE+AKAFADEIGIPFMETSAK ATNVEQAFMAM+A IK RMA+QP  NNARPPTV
Subjt:  YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPM-NNARPPTV

Query:  QIRGQPVNQKSGCCSS
        QIRGQPV QK+GCCS+
Subjt:  QIRGQPVNQKSGCCSS

P40392 Ras-related protein RIC11.4e-9281.86Show/hide
Query:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADLLSFSLYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV
        M PEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFA             DDSYL+SYISTIGVDFKIRTVE DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV
Subjt:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADLLSFSLYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV

Query:  YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNA-RPPTV
        YDVTDQ+SFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNK DL  N+VVSYE+ KA ADEIGIPF+ETSAK ATNVE+AFM MA EIKNRMA+QP  NA +P TV
Subjt:  YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNA-RPPTV

Query:  QIRGQPVNQKSGCCS
        Q+RGQPV Q+S CCS
Subjt:  QIRGQPVNQKSGCCS

Q05737 GTP-binding protein YPTM22.1e-9684.72Show/hide
Query:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADLLSFSLYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV
        M PEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFA             DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVE DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+V
Subjt:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADLLSFSLYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV

Query:  YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQP-MNNARPPTV
        YDVTDQ+SFNNVKQWLNEIDRYAS+NVNKLLVGNKSDLTANKVV+ E+AKAFADE+GIPFMETSAK+ATNV+QAFMAMAA IK+RMA+QP   NARP TV
Subjt:  YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQP-MNNARPPTV

Query:  QIRGQPVNQKSGCCSS
        QIRGQPVNQK+ CCSS
Subjt:  QIRGQPVNQKSGCCSS

Q9FPJ4 Ras-related protein RABD2b1.0e-9583.26Show/hide
Query:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADLLSFSLYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV
        M PEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFA             DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVE DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIV 
Subjt:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADLLSFSLYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV

Query:  YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQ
        YDVTD +SFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNK+DLT+ KVVS E+AKAFADE+GIPF+ETSAK+ATNVE+AFMAM A IK RMA+QP   A+PPTVQ
Subjt:  YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQ

Query:  IRGQPVNQKSGCCSS
        IRGQPVNQ+SGCCSS
Subjt:  IRGQPVNQKSGCCSS

Q9SEH3 Ras-related protein RABD2c3.9e-9582.79Show/hide
Query:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADLLSFSLYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV
        M PEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFA             DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVE DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIV 
Subjt:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADLLSFSLYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV

Query:  YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQ
        YDVTD +SFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNK DLT+ KVVS E+AKAFADE+GIPF+ETSAK+ATNVE+AFMAM A IK RMA+QP   ++PPTVQ
Subjt:  YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQ

Query:  IRGQPVNQKSGCCSS
        IRGQPVNQ+SGCCSS
Subjt:  IRGQPVNQKSGCCSS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02130.1 RAS 53.6e-9681.94Show/hide
Query:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADLLSFSLYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV
        M PEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRF+             DDSY++SYISTIGVDFKIRTVE DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+V
Subjt:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADLLSFSLYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV

Query:  YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPM-NNARPPTV
        YDVTD++SFNNVKQWL+EIDRYAS+NVNKLLVGNKSDLT N+ + YE+AKAFADEIGIPFMETSAK ATNVEQAFMAM+A IK RMA+QP  NNARPPTV
Subjt:  YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPM-NNARPPTV

Query:  QIRGQPVNQKSGCCSS
        QIRGQPV QK+GCCS+
Subjt:  QIRGQPVNQKSGCCSS

AT3G09900.1 RAB GTPase homolog E1E4.4e-6256.36Show/hide
Query:  EYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADLLSFSLYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDV
        +YDYL KLLLIGDSGVGKSCLLLRF+             DD++  S+I+TIG+DFKIRTVELDGK IKLQIWDTAGQERFRTIT++YYRGA GI++VYDV
Subjt:  EYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADLLSFSLYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDV

Query:  TDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK-VVSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIR
        TD+ SFNN++ W+  I+++AS++VNK+LVGNK+D+  +K  V     +A ADE GI F ETSAK+  NVEQ F+++A +IK R+ T+    A P  ++I 
Subjt:  TDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK-VVSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIR

Query:  GQ--------PVNQKSGCCS
         Q          N+KS CCS
Subjt:  GQ--------PVNQKSGCCS

AT3G11730.1 Ras-related small GTP-binding family protein1.5e-7868.37Show/hide
Query:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADLLSFSLYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV
        M+ EYDYLFKLLLIGDS VGKSCLLLRFA             DD+Y+DSYISTIGVDFKIRT+E DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+V
Subjt:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADLLSFSLYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV

Query:  YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNN--ARPPT
        YD T+ +SFNNVKQWL+EIDRYA+E+V KLL+GNK+D+  +KVVS E+ +A ADE+GIPF+ETSAK + NVEQAF+ +A EIK +M +Q   N  + P T
Subjt:  YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNN--ARPPT

Query:  VQIRGQPVNQKSGCC
        VQ++GQP+ Q +G C
Subjt:  VQIRGQPVNQKSGCC

AT4G17530.1 RAB GTPase homolog 1C2.8e-9682.79Show/hide
Query:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADLLSFSLYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV
        M PEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFA             DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVE DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIV 
Subjt:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADLLSFSLYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV

Query:  YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQ
        YDVTD +SFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNK DLT+ KVVS E+AKAFADE+GIPF+ETSAK+ATNVE+AFMAM A IK RMA+QP   ++PPTVQ
Subjt:  YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQ

Query:  IRGQPVNQKSGCCSS
        IRGQPVNQ+SGCCSS
Subjt:  IRGQPVNQKSGCCSS

AT5G47200.1 RAB GTPase homolog 1A7.3e-9783.26Show/hide
Query:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADLLSFSLYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV
        M PEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFA             DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVE DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIV 
Subjt:  MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADLLSFSLYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVV

Query:  YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQ
        YDVTD +SFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNK+DLT+ KVVS E+AKAFADE+GIPF+ETSAK+ATNVE+AFMAM A IK RMA+QP   A+PPTVQ
Subjt:  YDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQ

Query:  IRGQPVNQKSGCCSS
        IRGQPVNQ+SGCCSS
Subjt:  IRGQPVNQKSGCCSS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACGCCTGAATATGATTATTTGTTTAAGCTTCTGCTTATTGGAGATTCTGGTGTTGGAAAATCCTGTCTCCTTCTGAGGTTTGCAGATTTACTTTCTTTTTCTCTCTA
TTTTCTTGCTCAACAGGATGATTCATATTTGGATAGCTACATTAGCACTATCGGGGTTGACTTTAAAATCCGCACAGTGGAGCTCGATGGGAAGACTATTAAGCTCCAAA
TATGGGATACTGCTGGCCAAGAACGTTTTAGAACAATAACCAGCAGCTACTACCGTGGTGCTCACGGCATTATTGTTGTTTATGATGTTACAGACCAAGATAGTTTCAAT
AATGTTAAGCAATGGTTAAATGAAATCGATCGTTATGCAAGTGAAAACGTGAACAAGCTTCTTGTGGGCAACAAATCTGACCTGACAGCTAACAAAGTCGTGTCCTATGA
GTCAGCCAAGGCCTTTGCGGATGAAATTGGGATTCCATTTATGGAAACAAGTGCTAAAAGTGCCACGAACGTTGAACAGGCTTTCATGGCCATGGCTGCTGAAATCAAGA
ATAGGATGGCAACTCAACCAATGAACAATGCGCGGCCGCCAACTGTGCAAATTCGAGGACAGCCTGTGAACCAAAAGTCTGGTTGCTGCTCATCTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTTTCAAATTTATTTCCCTGCAGATTTCTCGGTTCTGCAGAAACGCAAATACAAATCGTTCTTCTTCTTGTTTTCCTTCTACCTTCGTTCAACAATTCCGTTTTCCGCGG
CAAATTCCTCCGCATTCCGATCGAAACTCGCCGGCGTAATTTACGTCTCTCGAGCACCGTGCGGAATTCTCTGTGTTCCATCGATCTCCACCGCTTGTCGCCATGACGCC
TGAATATGATTATTTGTTTAAGCTTCTGCTTATTGGAGATTCTGGTGTTGGAAAATCCTGTCTCCTTCTGAGGTTTGCAGATTTACTTTCTTTTTCTCTCTATTTTCTTG
CTCAACAGGATGATTCATATTTGGATAGCTACATTAGCACTATCGGGGTTGACTTTAAAATCCGCACAGTGGAGCTCGATGGGAAGACTATTAAGCTCCAAATATGGGAT
ACTGCTGGCCAAGAACGTTTTAGAACAATAACCAGCAGCTACTACCGTGGTGCTCACGGCATTATTGTTGTTTATGATGTTACAGACCAAGATAGTTTCAATAATGTTAA
GCAATGGTTAAATGAAATCGATCGTTATGCAAGTGAAAACGTGAACAAGCTTCTTGTGGGCAACAAATCTGACCTGACAGCTAACAAAGTCGTGTCCTATGAGTCAGCCA
AGGCCTTTGCGGATGAAATTGGGATTCCATTTATGGAAACAAGTGCTAAAAGTGCCACGAACGTTGAACAGGCTTTCATGGCCATGGCTGCTGAAATCAAGAATAGGATG
GCAACTCAACCAATGAACAATGCGCGGCCGCCAACTGTGCAAATTCGAGGACAGCCTGTGAACCAAAAGTCTGGTTGCTGCTCATCTTAAGGAAAAAGGGGAGATCTCTA
TGATTAGCACTGTACCCGTATGGTCTGGTCGGTCCTTCACATGTAAAACTCTTTCCTTGGCTTAGCTTTTCTTCTAAAGCTTTGTTTTGTTTTGTTTTCTTCTTTCCACC
CTTTACTTTGTTTAAAATTCCCATTCTTTTCAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MTPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADLLSFSLYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFN
NVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSYESAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS