CuGenDBv2

Gene ID	Carg23264
Organism	Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Description	Antigenic heat-stable 120 kDa protein
Genome location	Carg_Chr12:9947682..9949336
RNA-Seq Expression	Carg23264
Synteny	Carg23264
Gene Ontology terms	GO:0006415 - translational termination (biological process) GO:0005737 - cytoplasm (cellular component) GO:0016149 - translation release factor activity, codon specific (molecular function)
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG7021055.1 hypothetical protein SDJN02_17743, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

2.9e-99

100

Show/hide

Query:  MSSSSVITPEDVLESLMNDGTIDSLRLKIINQLKANVSLASSEELKNTTIKMVEQSKVLNTPGAEKQTKRELFDALRQELEAPVLEKASKSVWELILDNG
        MSSSSVITPEDVLESLMNDGTIDSLRLKIINQLKANVSLASSEELKNTTIKMVEQSKVLNTPGAEKQTKRELFDALRQELEAPVLEKASKSVWELILDNG
Subjt:  MSSSSVITPEDVLESLMNDGTIDSLRLKIINQLKANVSLASSEELKNTTIKMVEQSKVLNTPGAEKQTKRELFDALRQELEAPVLEKASKSVWELILDNG

Query:  GLGKEINDTVEKVFCRLSGKEPPLFPPENGDIPSVKETENDKGKGKEPEDDYHKEKSQPVRKRSFIDMNGKDENNVVDGAGENLAATEEHSRSP
        GLGKEINDTVEKVFCRLSGKEPPLFPPENGDIPSVKETENDKGKGKEPEDDYHKEKSQPVRKRSFIDMNGKDENNVVDGAGENLAATEEHSRSP
Subjt:  GLGKEINDTVEKVFCRLSGKEPPLFPPENGDIPSVKETENDKGKGKEPEDDYHKEKSQPVRKRSFIDMNGKDENNVVDGAGENLAATEEHSRSP

XP_022938214.1 uncharacterized protein LOC111444361 [Cucurbita moschata]

1.3e-94

96.91

Show/hide

Query:  MSSSSVITPEDVLESLMNDGTIDSLRLKIINQLKANVSLASSEELKNTTIKMVEQSKVLNTPGAEKQTKRELFDALRQELEAPVLEKASKSVWELILDNG
        MSSSSVITPEDVLESLMNDGTIDSLRLKIINQLKAN      EELKNTTIKMVEQSKVLNTPGAEKQTKRELFDALRQELEAPVLEKASKSVWELILDNG
Subjt:  MSSSSVITPEDVLESLMNDGTIDSLRLKIINQLKANVSLASSEELKNTTIKMVEQSKVLNTPGAEKQTKRELFDALRQELEAPVLEKASKSVWELILDNG

Query:  GLGKEINDTVEKVFCRLSGKEPPLFPPENGDIPSVKETENDKGKGKEPEDDYHKEKSQPVRKRSFIDMNGKDENNVVDGAGENLAATEEHSRSP
        GLGKEINDTVEKVFCRLSGKEPPLFPPENGDIPSVKETENDKGKGKEPEDDYHKEKSQPVRKRSFIDMNGKDENNVVDGAGENLAATEEHSRSP
Subjt:  GLGKEINDTVEKVFCRLSGKEPPLFPPENGDIPSVKETENDKGKGKEPEDDYHKEKSQPVRKRSFIDMNGKDENNVVDGAGENLAATEEHSRSP

XP_022965964.1 uncharacterized protein LOC111465686 [Cucurbita maxima]

1.2e-92

95.36

Show/hide

Query:  MSSSSVITPEDVLESLMNDGTIDSLRLKIINQLKANVSLASSEELKNTTIKMVEQSKVLNTPGAEKQTKRELFDALRQELEAPVLEKASKSVWELILDNG
        MSSSSVITPEDVLESLMNDGTIDSLRLKIINQLKAN      EELKNTTIKMVEQSKVLNTPGAEKQTKRELFDALRQELEAPVLEKASKSVWELILDN 
Subjt:  MSSSSVITPEDVLESLMNDGTIDSLRLKIINQLKANVSLASSEELKNTTIKMVEQSKVLNTPGAEKQTKRELFDALRQELEAPVLEKASKSVWELILDNG

Query:  GLGKEINDTVEKVFCRLSGKEPPLFPPENGDIPSVKETENDKGKGKEPEDDYHKEKSQPVRKRSFIDMNGKDENNVVDGAGENLAATEEHSRSP
        GLGKEINDTVEKVFCRLSGKEPPLFPPENGDIPSVKETENDKGK KEPEDDYHKEKSQP+RKRSFIDMNGKDENNVVDGAGENLAATEEHSRSP
Subjt:  GLGKEINDTVEKVFCRLSGKEPPLFPPENGDIPSVKETENDKGKGKEPEDDYHKEKSQPVRKRSFIDMNGKDENNVVDGAGENLAATEEHSRSP

XP_023536782.1 uncharacterized protein LOC111798060 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

2.9e-94

96.39

Show/hide

Query:  MSSSSVITPEDVLESLMNDGTIDSLRLKIINQLKANVSLASSEELKNTTIKMVEQSKVLNTPGAEKQTKRELFDALRQELEAPVLEKASKSVWELILDNG
        MSSSSVITPEDVLESLMNDGTIDSLRLKIINQLKAN      EELKNTTIKMVEQSKVLNTPGAEKQTKRELFDALRQELEAPVLEKASKSVWELILDNG
Subjt:  MSSSSVITPEDVLESLMNDGTIDSLRLKIINQLKANVSLASSEELKNTTIKMVEQSKVLNTPGAEKQTKRELFDALRQELEAPVLEKASKSVWELILDNG

Query:  GLGKEINDTVEKVFCRLSGKEPPLFPPENGDIPSVKETENDKGKGKEPEDDYHKEKSQPVRKRSFIDMNGKDENNVVDGAGENLAATEEHSRSP
        GLGKEINDTVEKVFCRLSGKEPPLFPPENGDIPSVKETENDKGKGKEPEDDYHKEKSQP+RKRSFIDMNGKDENNVVDGAGENLAATEEHSRSP
Subjt:  GLGKEINDTVEKVFCRLSGKEPPLFPPENGDIPSVKETENDKGKGKEPEDDYHKEKSQPVRKRSFIDMNGKDENNVVDGAGENLAATEEHSRSP

XP_038890481.1 uncharacterized protein LOC120080024 isoform X1 [Benincasa hispida]

1.7e-86

89.18

Show/hide

Query:  MSSSSVITPEDVLESLMNDGTIDSLRLKIINQLKANVSLASSEELKNTTIKMVEQSKVLNTPGAEKQTKRELFDALRQELEAPVLEKASKSVWELILDNG
        M SSSVITPEDVLESLMNDGTIDSLRLKIINQLKAN      EELKNTTIKMVEQSKVLNTPGAEKQTKRELFDALRQELEAPVLEKASKSVWELILDN 
Subjt:  MSSSSVITPEDVLESLMNDGTIDSLRLKIINQLKANVSLASSEELKNTTIKMVEQSKVLNTPGAEKQTKRELFDALRQELEAPVLEKASKSVWELILDNG

Query:  GLGKEINDTVEKVFCRLSGKEPPLFPPENGDIPSVKETENDKGKGKEPEDDYHKEKSQPVRKRSFIDMNGKDENNVVDGAGENLAATEEHSRSP
        GLGKEINDTVEKVFCRLSGKEPPLFPP+NGD+PSVKETEN+KGKGKEPED+YHKEKS P+RKRSF DMNGK+EN V DGAGE+LA  EEHSRSP
Subjt:  GLGKEINDTVEKVFCRLSGKEPPLFPPENGDIPSVKETENDKGKGKEPEDDYHKEKSQPVRKRSFIDMNGKDENNVVDGAGENLAATEEHSRSP

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0LGM0 Uncharacterized protein

5.8e-85

87.63

Show/hide

Query:  MSSSSVITPEDVLESLMNDGTIDSLRLKIINQLKANVSLASSEELKNTTIKMVEQSKVLNTPGAEKQTKRELFDALRQELEAPVLEKASKSVWELILDNG
        MSSSSVITPEDVLESLMNDGTIDSLRLKIINQLKAN      EELKNTTIKMVEQSKVLNTPGAEKQTKRELFDALRQELEAPVLEKASKSVWELILDN 
Subjt:  MSSSSVITPEDVLESLMNDGTIDSLRLKIINQLKANVSLASSEELKNTTIKMVEQSKVLNTPGAEKQTKRELFDALRQELEAPVLEKASKSVWELILDNG

Query:  GLGKEINDTVEKVFCRLSGKEPPLFPPENGDIPSVKETENDKGKGKEPEDDYHKEKSQPVRKRSFIDMNGKDENNVVDGAGENLAATEEHSRSP
        GLGKEINDTVEKVFCRLSGKEPPLF P+NGD+P VKETE++KGKGKEPED+YHKEKSQP+RKRSF DMNGK+E+ + DGAGE+LA  EEHSRSP
Subjt:  GLGKEINDTVEKVFCRLSGKEPPLFPPENGDIPSVKETENDKGKGKEPEDDYHKEKSQPVRKRSFIDMNGKDENNVVDGAGENLAATEEHSRSP

A0A1S3BWQ6 uncharacterized protein LOC103494285

2.6e-85

89.18

Show/hide

Query:  MSSSSVITPEDVLESLMNDGTIDSLRLKIINQLKANVSLASSEELKNTTIKMVEQSKVLNTPGAEKQTKRELFDALRQELEAPVLEKASKSVWELILDNG
        MSSSSVITPEDVLESLMNDGTIDSLRLKIINQLKAN      EELKNTTIKMVEQSKVLNTPGAEKQTKRELFDALRQELEAPVLEKASKSVWELILDN 
Subjt:  MSSSSVITPEDVLESLMNDGTIDSLRLKIINQLKANVSLASSEELKNTTIKMVEQSKVLNTPGAEKQTKRELFDALRQELEAPVLEKASKSVWELILDNG

Query:  GLGKEINDTVEKVFCRLSGKEPPLFPPENGDIPSVKETENDKGKGKEPEDDYHKEKSQPVRKRSFIDMNGKDENNVVDGAGENLAATEEHSRSP
        GLGKEINDTVEKVFCRLSGKEPPLF P+NGD+P VKETE +KGKGKEPED+YHKEKSQPVRKRSF DMNGK+EN V DGAGE+LA  EEHSRSP
Subjt:  GLGKEINDTVEKVFCRLSGKEPPLFPPENGDIPSVKETENDKGKGKEPEDDYHKEKSQPVRKRSFIDMNGKDENNVVDGAGENLAATEEHSRSP

A0A5D3BAZ9 Uncharacterized protein

2.6e-85

89.18

Show/hide

Query:  MSSSSVITPEDVLESLMNDGTIDSLRLKIINQLKANVSLASSEELKNTTIKMVEQSKVLNTPGAEKQTKRELFDALRQELEAPVLEKASKSVWELILDNG
        MSSSSVITPEDVLESLMNDGTIDSLRLKIINQLKAN      EELKNTTIKMVEQSKVLNTPGAEKQTKRELFDALRQELEAPVLEKASKSVWELILDN 
Subjt:  MSSSSVITPEDVLESLMNDGTIDSLRLKIINQLKANVSLASSEELKNTTIKMVEQSKVLNTPGAEKQTKRELFDALRQELEAPVLEKASKSVWELILDNG

Query:  GLGKEINDTVEKVFCRLSGKEPPLFPPENGDIPSVKETENDKGKGKEPEDDYHKEKSQPVRKRSFIDMNGKDENNVVDGAGENLAATEEHSRSP
        GLGKEINDTVEKVFCRLSGKEPPLF P+NGD+P VKETE +KGKGKEPED+YHKEKSQPVRKRSF DMNGK+EN V DGAGE+LA  EEHSRSP
Subjt:  GLGKEINDTVEKVFCRLSGKEPPLFPPENGDIPSVKETENDKGKGKEPEDDYHKEKSQPVRKRSFIDMNGKDENNVVDGAGENLAATEEHSRSP

A0A6J1FDE9 uncharacterized protein LOC111444361

6.2e-95

96.91

Show/hide

Query:  MSSSSVITPEDVLESLMNDGTIDSLRLKIINQLKANVSLASSEELKNTTIKMVEQSKVLNTPGAEKQTKRELFDALRQELEAPVLEKASKSVWELILDNG
        MSSSSVITPEDVLESLMNDGTIDSLRLKIINQLKAN      EELKNTTIKMVEQSKVLNTPGAEKQTKRELFDALRQELEAPVLEKASKSVWELILDNG
Subjt:  MSSSSVITPEDVLESLMNDGTIDSLRLKIINQLKANVSLASSEELKNTTIKMVEQSKVLNTPGAEKQTKRELFDALRQELEAPVLEKASKSVWELILDNG

Query:  GLGKEINDTVEKVFCRLSGKEPPLFPPENGDIPSVKETENDKGKGKEPEDDYHKEKSQPVRKRSFIDMNGKDENNVVDGAGENLAATEEHSRSP
        GLGKEINDTVEKVFCRLSGKEPPLFPPENGDIPSVKETENDKGKGKEPEDDYHKEKSQPVRKRSFIDMNGKDENNVVDGAGENLAATEEHSRSP
Subjt:  GLGKEINDTVEKVFCRLSGKEPPLFPPENGDIPSVKETENDKGKGKEPEDDYHKEKSQPVRKRSFIDMNGKDENNVVDGAGENLAATEEHSRSP

A0A6J1HSD3 uncharacterized protein LOC111465686

5.8e-93

95.36

Show/hide

Query:  MSSSSVITPEDVLESLMNDGTIDSLRLKIINQLKANVSLASSEELKNTTIKMVEQSKVLNTPGAEKQTKRELFDALRQELEAPVLEKASKSVWELILDNG
        MSSSSVITPEDVLESLMNDGTIDSLRLKIINQLKAN      EELKNTTIKMVEQSKVLNTPGAEKQTKRELFDALRQELEAPVLEKASKSVWELILDN 
Subjt:  MSSSSVITPEDVLESLMNDGTIDSLRLKIINQLKANVSLASSEELKNTTIKMVEQSKVLNTPGAEKQTKRELFDALRQELEAPVLEKASKSVWELILDNG

Query:  GLGKEINDTVEKVFCRLSGKEPPLFPPENGDIPSVKETENDKGKGKEPEDDYHKEKSQPVRKRSFIDMNGKDENNVVDGAGENLAATEEHSRSP
        GLGKEINDTVEKVFCRLSGKEPPLFPPENGDIPSVKETENDKGK KEPEDDYHKEKSQP+RKRSFIDMNGKDENNVVDGAGENLAATEEHSRSP
Subjt:  GLGKEINDTVEKVFCRLSGKEPPLFPPENGDIPSVKETENDKGKGKEPEDDYHKEKSQPVRKRSFIDMNGKDENNVVDGAGENLAATEEHSRSP

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G12530.1 unknown protein

2.9e-12

Show/hide

Query:  MSSSSVITPEDVLESLMNDGTIDSLRLKIINQLKANVSLASSEELKNTTIKMVEQSKVLNTPGAEKQTKRELFDALRQELEAPVLEKASKSVWELILDNG
        M  +  I+ E+V+E L +DG  D LRLKII +LK N      E+L+N  I +V++S  L   GA+    R+L DA+ +E+ + +L + S  +W +I    
Subjt:  MSSSSVITPEDVLESLMNDGTIDSLRLKIINQLKANVSLASSEELKNTTIKMVEQSKVLNTPGAEKQTKRELFDALRQELEAPVLEKASKSVWELILDNG

Query:  GLGKEINDTVEKVFCRLSGKEPPLFPPENGDIPSVKETEND-KGKGKEPEDDYH----KEKSQPVRKRSFIDMNGKD-ENNVVDGAGENLAATEEHSRSP
        G+  EI +TV+ V+  LS       P       S +E E+      KE   D++     ++ Q + K +  D  G+   ++V D  GE     EE    P
Subjt:  GLGKEINDTVEKVFCRLSGKEPPLFPPENGDIPSVKETEND-KGKGKEPEDDYH----KEKSQPVRKRSFIDMNGKD-ENNVVDGAGENLAATEEHSRSP

AT1G56420.1 unknown protein

5.1e-49

59.09

Show/hide

Query:  MSSSSVITPEDVLESLMNDGTIDSLRLKIINQLKANVSLASSEELKNTTIKMVEQSKVLNTPGAEKQTKRELFDALRQELEAPVLEKASKSVWELILDNG
        MSSSSVI PEDVLE LMNDGTID+LRL+IINQLKAN      EELK+TTIKM E+SKVLNTPGAEKQTKRELFDALRQELE PVLEKASKSVW+LI++  
Subjt:  MSSSSVITPEDVLESLMNDGTIDSLRLKIINQLKANVSLASSEELKNTTIKMVEQSKVLNTPGAEKQTKRELFDALRQELEAPVLEKASKSVWELILDNG

Query:  GLGKEINDTVEKVFCRLSGKEPPLFPPENGDIPSVKETENDKGKGKEPEDDYHKEKSQPVRKRSFIDMNGKDENNVV----DGAGENLAATEEHSRSP
        GLGKEIN+TVE+VFC LSG+EPP +   N     V++T  +  K  E +D     K++P +KRS  ++N  +  + V       G++   T E  ++P
Subjt:  GLGKEINDTVEKVFCRLSGKEPPLFPPENGDIPSVKETENDKGKGKEPEDDYHKEKSQPVRKRSFIDMNGKDENNVV----DGAGENLAATEEHSRSP

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGAGTTCGTCTTCAGTAATCACTCCAGAAGATGTGTTGGAGTCGCTGATGAATGATGGTACTATCGATTCTCTTAGGTTGAAGATCATCAACCAGCTCAAAGCCAATGT
TAGTCTCGCTTCCTCCGAGGAGCTTAAGAACACCACAATTAAAATGGTAGAACAGAGCAAAGTCCTCAACACGCCTGGGGCAGAGAAACAGACCAAAAGAGAGTTATTTG
ATGCTCTTCGACAGGAACTCGAAGCACCCGTGCTTGAGAAAGCCTCTAAATCTGTTTGGGAATTGATTTTGGACAACGGTGGATTGGGCAAAGAAATAAACGACACAGTC
GAAAAAGTATTTTGTCGACTGAGTGGCAAGGAACCTCCATTGTTTCCTCCCGAAAATGGGGATATCCCATCGGTCAAAGAAACTGAGAACGACAAAGGGAAAGGAAAAGA
ACCTGAAGATGATTATCACAAGGAGAAATCACAACCTGTTAGGAAAAGGAGTTTCATTGACATGAATGGCAAAGACGAAAACAATGTCGTAGATGGAGCTGGAGAAAACC
TAGCTGCAACTGAGGAACATAGTAGGTCACCTTAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MSSSSVITPEDVLESLMNDGTIDSLRLKIINQLKANVSLASSEELKNTTIKMVEQSKVLNTPGAEKQTKRELFDALRQELEAPVLEKASKSVWELILDNGGLGKEINDTV
EKVFCRLSGKEPPLFPPENGDIPSVKETENDKGKGKEPEDDYHKEKSQPVRKRSFIDMNGKDENNVVDGAGENLAATEEHSRSP

Carg23264 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome