; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg23292 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg23292
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionprotein RALF-like 33
Genome locationCarg_Chr12:10120404..10121786
RNA-Seq ExpressionCarg23292
SyntenyCarg23292
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6586247.1 Protein RALF-like 33, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.3e-60100Show/hide
Query:  MAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQP
        MAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQP
Subjt:  MAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQP

Query:  GAQANPYSRGCSAITR
        GAQANPYSRGCSAITR
Subjt:  GAQANPYSRGCSAITR

KAG7021083.1 Protein RALF-like 33, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.8e-69100Show/hide
Query:  MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITREKRFCKEIEEQERL
        QPGAQANPYSRGCSAITREKRFCKEIEEQERL
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITREKRFCKEIEEQERL

XP_022937540.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita moschata]6.3e-61100Show/hide
Query:  MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITR
        QPGAQANPYSRGCSAITR
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITR

XP_022966015.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita maxima]2.4e-6099.15Show/hide
Query:  MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGI HSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITR
        QPGAQANPYSRGCSAITR
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITR

XP_038889183.1 protein RALF-like 33 [Benincasa hispida]1.9e-5794.07Show/hide
Query:  MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGFNS TFFLICAAVFV+FSCSSTAVH GLGI HSL WIPNQSTCKG+IAECFGGEEFEFDSEI+RRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITR
        QPGAQANPYSRGCSAITR
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITR

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LFW9 Uncharacterized protein1.3e-5691.53Show/hide
Query:  MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGFNS TFFLICAAVF++FSCSST VH GLGIQHSL WIPNQSTCKG+IAECFGGEEFEFDSEI+RRILATSQYISYGALRRN VPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITR
        QPGAQANPYSRGC+AITR
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITR

A0A5A7TYI2 Rapid ALkalinization Factor7.3e-5589.83Show/hide
Query:  MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGFNS TFFLI AAVF++FSCSSTAVH G+GIQ+SL WIPNQSTCKG+IAECFGGEEFEFDSEI+RRILATSQYISYGALRRN VPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITR
        QPGAQANPYSRGC+AITR
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITR

A0A6J1DA82 protein RALF-like 333.6e-5490.68Show/hide
Query:  MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGF+S T FLICAAVFVVF+CSSTAVHGGLGI HSL WIP+QS+CKG+IAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGAL+RNTVPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITR
        QPGAQANPY RGCSAITR
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITR

A0A6J1FH12 protein RALF-like 333.1e-61100Show/hide
Query:  MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITR
        QPGAQANPYSRGCSAITR
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITR

A0A6J1HQE4 protein RALF-like 331.2e-6099.15Show/hide
Query:  MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGI HSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITR
        QPGAQANPYSRGCSAITR
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9P8 Protein RALF-like 331.7e-2959.02Show/hide
Query:  MAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAEC---FGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYN
        M G ++    +I A + V F      +   +  Q S  ++P +S C GTIAEC      EEFE DSEI+RRILAT++YISYGALRRNTVPCSRRGASYYN
Subjt:  MAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAEC---FGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYN

Query:  CQPGAQANPYSRGCSAITREKR
        C+ GAQANPYSRGCSAITR +R
Subjt:  CQPGAQANPYSRGCSAITREKR

Q945T0 Rapid alkalinization factor6.2e-2779.17Show/hide
Query:  CKGTIAECFG-GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITR
        CKG+I EC    EEFE DSE +RRILAT +YISYGAL++N+VPCSRRGASYYNC+PGAQANPYSRGCSAITR
Subjt:  CKGTIAECFG-GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITR

Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 234.3e-2866.67Show/hide
Query:  PNQSTCKGTIAEC-------------FG----GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITREKR
        P ++ C+GTIAEC             +G    GEEFE DSEI+RRILAT +YISYGALRRNT+PCSRRGASYYNC+ GAQANPYSRGCSAITR +R
Subjt:  PNQSTCKGTIAEC-------------FG----GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITREKR

Q9MA62 Protein RALF-like 228.1e-2776.62Show/hide
Query:  STCKGTIAECFG-GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITREKR
        S C G+IAEC    EE EFDS+ISRRILA  +YISYGA+RRN+VPCSRRGASYYNCQ GAQANPYSRGCS ITR +R
Subjt:  STCKGTIAECFG-GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITREKR

Q9SRY3 Protein RALF-like 15.6e-2859.83Show/hide
Query:  SSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWI------PNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQ
        S T FL    + VVF  SS  V  G    + LG +       N S C G+IAEC G EE E DSEI+RRILAT++YISY +L+RN+VPCSRRGASYYNCQ
Subjt:  SSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWI------PNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQ

Query:  PGAQANPYSRGCSAITR
         GAQANPYSRGCS I R
Subjt:  PGAQANPYSRGCSAITR

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02900.1 rapid alkalinization factor 14.0e-2959.83Show/hide
Query:  SSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWI------PNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQ
        S T FL    + VVF  SS  V  G    + LG +       N S C G+IAEC G EE E DSEI+RRILAT++YISY +L+RN+VPCSRRGASYYNCQ
Subjt:  SSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWI------PNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQ

Query:  PGAQANPYSRGCSAITR
         GAQANPYSRGCS I R
Subjt:  PGAQANPYSRGCSAITR

AT2G33775.1 ralf-like 195.6e-1561.29Show/hide
Query:  GGEEFEFDSEISRRILATSQ-YISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAIT
        G  ++  DSE +RR LA  + YISYGALR+N VPCSRRG SYY+C+   +ANPY RGCS IT
Subjt:  GGEEFEFDSEISRRILATSQ-YISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAIT

AT3G05490.1 ralf-like 225.7e-2876.62Show/hide
Query:  STCKGTIAECFG-GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITREKR
        S C G+IAEC    EE EFDS+ISRRILA  +YISYGA+RRN+VPCSRRGASYYNCQ GAQANPYSRGCS ITR +R
Subjt:  STCKGTIAECFG-GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITREKR

AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 233.0e-2966.67Show/hide
Query:  PNQSTCKGTIAEC-------------FG----GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITREKR
        P ++ C+GTIAEC             +G    GEEFE DSEI+RRILAT +YISYGALRRNT+PCSRRGASYYNC+ GAQANPYSRGCSAITR +R
Subjt:  PNQSTCKGTIAEC-------------FG----GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITREKR

AT4G15800.1 ralf-like 331.2e-3059.02Show/hide
Query:  MAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAEC---FGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYN
        M G ++    +I A + V F      +   +  Q S  ++P +S C GTIAEC      EEFE DSEI+RRILAT++YISYGALRRNTVPCSRRGASYYN
Subjt:  MAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAEC---FGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYN

Query:  CQPGAQANPYSRGCSAITREKR
        C+ GAQANPYSRGCSAITR +R
Subjt:  CQPGAQANPYSRGCSAITREKR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAATGGCCGGATTCAATTCCTCGACATTCTTCCTGATCTGCGCCGCTGTGTTTGTGGTCTTCAGCTGCTCCTCAACCGCCGTTCACGGAGGCCTCGGGATCCAACA
CAGCCTCGGATGGATTCCTAACCAATCGACCTGCAAAGGCACAATAGCGGAGTGTTTCGGCGGAGAGGAGTTCGAATTCGATTCGGAAATCAGCCGACGTATCTTGGCCA
CCAGTCAGTACATCAGTTACGGCGCTCTGCGGAGGAACACCGTGCCGTGCTCGAGACGCGGTGCATCATACTACAACTGCCAGCCCGGAGCTCAGGCCAACCCTTACAGC
CGTGGATGCAGCGCCATTACAAGGGAAAAGAGATTCTGCAAAGAGATTGAAGAACAAGAAAGGCTGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCAATGGCCGGATTCAATTCCTCGACATTCTTCCTGATCTGCGCCGCTGTGTTTGTGGTCTTCAGCTGCTCCTCAACCGCCGTTCACGGAGGCCTCGGGATCCAACA
CAGCCTCGGATGGATTCCTAACCAATCGACCTGCAAAGGCACAATAGCGGAGTGTTTCGGCGGAGAGGAGTTCGAATTCGATTCGGAAATCAGCCGACGTATCTTGGCCA
CCAGTCAGTACATCAGTTACGGCGCTCTGCGGAGGAACACCGTGCCGTGCTCGAGACGCGGTGCATCATACTACAACTGCCAGCCCGGAGCTCAGGCCAACCCTTACAGC
CGTGGATGCAGCGCCATTACAAGGGAAAAGAGATTCTGCAAAGAGATTGAAGAACAAGAAAGGCTGTAATGGCTGGAATTAAGGAGAATTATGGCTCCCATCATGAGATA
AGAGTAAGAACAAATTCATCAGTTGTTATAATTAGTATATTTCTCTTATAGAAACTGTGAAAGATTGTGTTTCTGATGCTGTTTTTGGGTTTAGATTAACTTTACAATGC
CAATTTCTTTCCATTTTGGGTTTTGATCGGCTGACCAAACCATTTCCTTTCGTTTACTTGTTTTTTCTCTCTCTGTTCTCATCTGTTTATGGTAAAGAATCTTGAACTCT
TTAGGAAAAATATTTAGAGAGGGAAGTTTTCCTTGAGAAATCATACCATACTACTGATTTGATTCTTGGTGCTCTTGAATTGGCTATCATGTTGAGGTTGGGTACTTTTC
TTAGAACTTTCATTATGTTGACAAGAGAAGTAAATATCAAATATTTGTAACCATATGTATATGTGTGTGCATTGATTATGGTTTTACTTAGTTTTAGTATCATATTGAGG
ATAATTATGCATTCTAGAAGTAAAACTACTTCCATGGATTGCCCTAATGATCGAAAGGGCGAACCAGATGTTCTTGAGATGTATATGTCTGTGCATTGATTATGGTTTCA
AGCTATGGTGTTGGTGGCTATCTATCTAGGATTTCCCGTTGTTATCTGAGGTTTGTTGAGATGTACATGATGTGGATGGGACTCATATTATATATTAGTATA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYS
RGCSAITREKRFCKEIEEQERL