; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg23297 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg23297
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionextensin-3-like isoform X1
Genome locationCarg_Chr09:6585588..6586127
RNA-Seq ExpressionCarg23297
SyntenyCarg23297
Gene Ontology termsGO:0006334 - nucleosome assembly (biological process)
GO:0000786 - nucleosome (cellular component)
GO:0016020 - membrane (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6592192.1 hypothetical protein SDJN03_14538, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.2e-5191.02Show/hide
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KAG6592193.1 hypothetical protein SDJN03_14539, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.0e-5991.06Show/hide
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KAG7025048.1 hypothetical protein SDJN02_13871, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]5.9e-64100Show/hide
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XP_022936365.1 extensin-3-like isoform X1 [Cucurbita moschata]9.5e-4684.27Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1F841 extensin-like isoform X29.0e-4284.02Show/hide
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A0A6J1FDF6 extensin-3-like isoform X14.6e-4684.27Show/hide
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A0A6J1FDF9 extensin-1-like isoform X32.1e-3879.64Show/hide
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A0A6J1IK20 extensin-3-like3.2e-3172.67Show/hide
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A0A6J1IP49 extensin-3-like2.1e-2276.87Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G13340.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein9.6e-0455.94Show/hide
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        SPPPPVY  PPPP     PP VY  PPPP         SPPPPPP   PPPP  SPPPP+P   PPPPPP    PPPP   PPPPPPP  SPPPPP   S
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        PPPPP  +P       P   P  SPPPP    ++ PPPP PYY
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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