; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg23574 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg23574
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionprotein LOW PSII ACCUMULATION 3, chloroplastic
Genome locationCarg_Chr16:9700462..9704837
RNA-Seq ExpressionCarg23574
SyntenyCarg23574
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR018962 - Domain of unknown function DUF1995
IPR044687 - Protein LOW PSII ACCUMULATION 3


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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KAG7015785.1 hypothetical protein SDJN02_23423, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.7e-143100Show/hide
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XP_022923333.1 protein LOW PSII ACCUMULATION 3, chloroplastic [Cucurbita moschata]4.2e-10484.55Show/hide
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XP_022965338.1 protein LOW PSII ACCUMULATION 3, chloroplastic [Cucurbita maxima]2.3e-10283.33Show/hide
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XP_023553103.1 protein LOW PSII ACCUMULATION 3, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.6e-10383.74Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5D3CIQ2 Protein LOW PSII ACCUMULATION 38.6e-9572.49Show/hide
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A0A6J1CWD3 protein LOW PSII ACCUMULATION 3, chloroplastic isoform X11.1e-8672.87Show/hide
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A0A6J1CWN5 uncharacterized protein LOC111014905 isoform X21.9e-8973.41Show/hide
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A0A6J1E988 protein LOW PSII ACCUMULATION 3, chloroplastic2.0e-10484.55Show/hide
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A0A6J1HNL5 protein LOW PSII ACCUMULATION 3, chloroplastic1.1e-10283.33Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G48790.1 Domain of unknown function (DUF1995)1.7e-5554.69Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
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GAACGAAGAGTGGGCTCGGGATCAACTTTTAAAACGGTAA
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TTCATCGGAGTTTGCTTTCTAGTTCAGTGTTGGAGTTTATGGCGGGAAGAAATCTCAGAGTTCTGTCGAATTCGAGTAATCGCGAGAGTAGCGATACTTCGACTGATTTT
GACGTTCCGTTTCCACGAGATTATTTTGATCTTCTTGATCAGGCGAAAAAAGCAACTGAAGCGGCTTTAAGAGACAACAAACAGTTGATGGAGATTGAATTTCCAACTGC
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GAACGAAGAGTGGGCTCGGGATCAACTTTTAAAACGGTAAAAATGACATTATGTGGTTTCTGAAATTTAATAACAATGTCAAAATCTTAATTTTTTTTTCATTTAATTGG
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TTTACTTCATAAAATGAGATGAATTTTCCGATGACAGGTTGTTGGGTTGTAATTCCACAGTTCTCTTTCATTATTATTATTATTTTGTGTTTGTTATGTGACTGGACCTT
AATAGAGTAAAGATTATCCGCCATTTTTCTACCCAAAGCTGGCGGCACTTACGAAGACTCTCTTCCCCAAGATGGAGACTGTATATTACATCCACAACTTCAAGGGACAG
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