; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg23615 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg23615
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionProtein of unknown function (DUF1645)
Genome locationCarg_Chr20:4522598..4523690
RNA-Seq ExpressionCarg23615
SyntenyCarg23615
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR012442 - Protein of unknown function DUF1645, plant


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6571155.1 hypothetical protein SDJN03_30070, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.6e-18097.94Show/hide
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KAG7010965.1 hypothetical protein SDJN02_27763, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.9e-187100Show/hide
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XP_022944215.1 uncharacterized protein LOC111448731 [Cucurbita moschata]2.4e-18197.93Show/hide
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XP_022986568.1 uncharacterized protein LOC111484268 [Cucurbita maxima]9.2e-17394.67Show/hide
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XP_023513132.1 uncharacterized protein LOC111777661 [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.8e-17997.34Show/hide
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        SPYRISSRTPIHGDGD CT AGKSKSLSFLSAISFSKANRKWRLRDLLFRSTSEGRAT+KADKLRSTYVVMSERMENDVKISSFRSADSVGPRRHFTAAN
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LII3 Uncharacterized protein2.1e-12271.19Show/hide
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        MEV V   PAG D+FNFGSPCSSHYLSAPSTPFSSLSAPTSPSSL  NFFR  HD DVPIGSPSAVPF WEEKPGIPKS +C+A   +  FEF  SR S 
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         +K SLSADELF  GKI+PLKPPPGF+SN+SSP+SPHN R+SPRKTK++ D  NINDDPFEAAL+KET   R NYEL D  + N   RGR T++I+YISS
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        NFARK TRS+SP+R+SS + +H D        KSKS SFLSAISFSK NRKWRLRDLLFRS SEGRAT+KAD LRSTYVVMSE++++D+KISSFRS DS 
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        G R  FTAANR V EE  KK       SFLGRCLRFNRSGMQEISR IGSLTRG
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A0A1S3CA74 uncharacterized protein LOC1034984031.6e-12271.59Show/hide
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        V V V P G D+FNFGSPCSSHYLSAPSTPFSSLSAPTSP+SL  NFFR  +D DVPIGSPSAVPF WEEKPGIPKS  NC++  + DFEF  SR S  +
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        K S+SADELF  GKI+PLKPPPGF+SNMSSPRSPHN R+SPRK+K++ D  NINDDPFEAAL+KET  HR NYEL D    N   RGR T++ISYI SNF
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        +RK TRS+SP+R+SS + +HGD     GA KSKS SFLSAISFSK NRKWRLRDLLFRS SEGRAT+KADKLRSTYVVMSE++++DVKISSFRS DS GP
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        R  +TAANR V EE  KK        FLGRCLRFNRSG+QEISR IGSLTRG
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A0A6J1D4I9 uncharacterized protein LOC111017234 isoform X25.4e-9462.32Show/hide
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        MEV + + PAGD FNF +P SSHY +APSTP       +S+SAPTSPS +A NFF   D D+PI SPS VPFRWEE+PGIPKS  CS E DFEFDFS QS
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           KASLSADELFDGGKI+PLKPPPGF+S++SSPRSP   ++SPR   N +D  I++DPFEAAL+KET +H +NYEL D   +NRGR   +ISYISSNFA
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        RK TRS+SP+RIS +T    DG     A K KS    SAISF KANR KWRLRD LFRS SEGRAT+K     + YVVMS+++++DVK SSFRSAD  G 
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           HF   NR V EE  KK        FLGRCLRFNRSG+QE+SR IGSLTRG
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A0A6J1FYJ1 uncharacterized protein LOC1114487311.2e-18197.93Show/hide
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        RTV EEFMKKRSFLGRCLRFNRSGMQEISRDIGSLTRG
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A0A6J1JGW7 uncharacterized protein LOC1114842684.4e-17394.67Show/hide
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        SADELFDGGKIRPLKPPPGFKSN+SSPRSPHNSRISPRKTKNSSDMNINDDPFEAALMKETL+HRTN ELADKQSKNRGR TEEISYISS+FARKPTRS+
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        SPYRISSRTPIHGD D  TGAGKSKSLSFLSAISFSKANRKWRLRDLLFRSTSEGRAT+KADKLRSTYVVMSERMENDVKISSFRSADSV PRRHFTAAN
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        RTV EE MKK+SFLGRCLRFNRSGMQEISRDIGSLTRG
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G15760.1 Protein of unknown function (DUF1645)1.1e-2533.69Show/hide
Query:  MEVAVGVSPAGDLFNFGSPCSSHYLSAPSTPF----SSLSAPTSPSSLAVNFFRHDDDVPIGSPSAVPFRWEEKPGIPKSLNC-SAEQDFEFDFSRQSLC
        ME+ V  + A +L NF S  SS Y++APS+P     +  SAPTSPS                + S +PF W+++P  PK  +    E DFEF+FS Q   
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Query:  TKASLSADELFDGGKIRPLKPPPGFKSNMSSPRSPHNSRISPRKTKNSSDMNINDDPFEAALMKETLNHRTNYELADKQSKNRGRTTEEISYISSNFARK
        T  S +ADELFDGGKIRPL+ P      +SSPRS               ++  +DD                        K+RGR     S  SS + RK
Subjt:  TKASLSADELFDGGKIRPLKPPPGFKSNMSSPRSPHNSRISPRKTKNSSDMNINDDPFEAALMKETLNHRTNYELADKQSKNRGRTTEEISYISSNFARK

Query:  PTRSVSPYRIS-----SRTPIHGDGDGCTGAGKSKSLSFLSAISF-SKANRKWRLRD-LLFRSTSEGRATDKADKLRSTYVVMSERMENDVKISSFRSAD
         +RS+SP R+S         +       +     KS  FLSAI F  +A +KW+L+D LLFRS S+GR     + L + Y +++++   +V+ SS RS +
Subjt:  PTRSVSPYRIS-----SRTPIHGDGDGCTGAGKSKSLSFLSAISF-SKANRKWRLRD-LLFRSTSEGRATDKADKLRSTYVVMSERMENDVKISSFRSAD

Query:  SV----------------GPRRHFTAANRTVPEEFMKKRSFLG------RCLRFNRSGMQEISRDIGSLTR
        S                     H+T  NR V EE +K+++FL        CL FN   + EI+R +GSL+R
Subjt:  SV----------------GPRRHFTAANRTVPEEFMKKRSFLG------RCLRFNRSGMQEISRDIGSLTR

AT2G26530.1 Protein of unknown function (DUF1645)1.1e-2232.62Show/hide
Query:  LSAPSTPFS----SLSAPTSPSSLAVNFFRHDDDVPIGSPS---AVPFRWEEKPGIPKSLNCSAEQDFEFDFSRQSLCTKASLSADELFDGGKIRPLKPP
        L+APS+P       LSAPTSP      F+R  ++    + S    VPF WEE PG P+ +    + D +F F         SL A+ELFDGGKI+PLKPP
Subjt:  LSAPSTPFS----SLSAPTSPSSLAVNFFRHDDDVPIGSPS---AVPFRWEEKPGIPKSLNCSAEQDFEFDFSRQSLCTKASLSADELFDGGKIRPLKPP

Query:  P------GFKSNMSSPRSP-----HNSRI-----SPRKTKNSSDMNINDDPFEAALMKETLNHRTNYELADKQSKNRGRTTEEISYISSNFARKPTRSVS
        P        +  + SPRSP     H   I     SPRK  +      N DPFE A+ K            +   + RGR   +      N  R+  RS+S
Subjt:  P------GFKSNMSSPRSP-----HNSRI-----SPRKTKNSSDMNINDDPFEAALMKETLNHRTNYELADKQSKNRGRTTEEISYISSNFARKPTRSVS

Query:  PYRISS-------------RTPIHGDGDGCTGAGKSKSLSFLSAISFSKANRKWRLRD-LLFRSTSEGRATDKADKLRSTYVVMSERMENDVKISSFRSA
        P+R+S+             +  +     G   +  S S S   +   S +++KWRL+D LLFRS SEGRA    D +++   +   R + D K SS R  
Subjt:  PYRISS-------------RTPIHGDGDGCTGAGKSKSLSFLSAISFSKANRKWRLRD-LLFRSTSEGRATDKADKLRSTYVVMSERMENDVKISSFRSA

Query:  DSVGPRRH-FTAANRTVPEEFMKKRSFL
         S     H F   ++    + +KK++FL
Subjt:  DSVGPRRH-FTAANRTVPEEFMKKRSFL

AT2G26530.2 Protein of unknown function (DUF1645)1.2e-1830.19Show/hide
Query:  LSAPSTPFS----SLSAPTSPSSLAVNFFRHDDDVPIGSPS---AVPFRWEEKPGIPKSLNCSAEQDFEFDFSRQSLCTKASLSADELFDGGKIRPLKPP
        L+APS+P       LSAPTSP      F+R  ++    + S    VPF WEE PG P+ +    + D +F F         SL A+ELFDGGKI+PLKPP
Subjt:  LSAPSTPFS----SLSAPTSPSSLAVNFFRHDDDVPIGSPS---AVPFRWEEKPGIPKSLNCSAEQDFEFDFSRQSLCTKASLSADELFDGGKIRPLKPP

Query:  P------GFKSNMSSPRSPHNSRISPRKTKNSSDMNINDDPFEAALMKETLNHRTNYELADKQSKNRGRTTEEISYISSNFARKPTRSVSPYRISS----
        P        +  + SPRSP                            +  + H  N      + + RGR          N  R+  RS+SP+R+S+    
Subjt:  P------GFKSNMSSPRSPHNSRISPRKTKNSSDMNINDDPFEAALMKETLNHRTNYELADKQSKNRGRTTEEISYISSNFARKPTRSVSPYRISS----

Query:  ---------RTPIHGDGDGCTGAGKSKSLSFLSAISFSKANRKWRLRD-LLFRSTSEGRATDKADKLRSTYVVMSERMENDVKISSFRSADSVGPRRH-F
                 +  +     G   +  S S S   +   S +++KWRL+D LLFRS SEGRA    D +++   +   R + D K SS R   S     H F
Subjt:  ---------RTPIHGDGDGCTGAGKSKSLSFLSAISFSKANRKWRLRD-LLFRSTSEGRATDKADKLRSTYVVMSERMENDVKISSFRSADSVGPRRH-F

Query:  TAANRTVPEEFMKKRSFL
           ++    + +KK++FL
Subjt:  TAANRTVPEEFMKKRSFL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CCAAATCCCTCAATTGCTCCGCCGAGCAGGATTTTGAATTTGATTTCAGCCGCCAGTCGCTCTGCACTAAAGCTTCTCTCTCCGCCGATGAGCTCTTCGACGGCGGTAAA
ATCCGGCCGCTCAAACCCCCTCCCGGATTCAAGTCGAACATGTCGTCGCCGAGATCGCCGCACAATTCGAGGATTTCCCCTCGTAAAACGAAGAACAGCTCCGACATGAA
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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DIGSLTRG