; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg23978 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg23978
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptiontranscription factor MYB36-like
Genome locationCarg_Chr12:3817385..3817743
RNA-Seq ExpressionCarg23978
SyntenyCarg23978
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR001005 - SANT/Myb domain
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017930 - Myb domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6585729.1 Clathrin interactor EPSIN 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.0e-50100Show/hide
Query:  MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSRQVW
        MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSRQVW
Subjt:  MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSRQVW

KAG7020636.1 Transcription factor RAX2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.0e-50100Show/hide
Query:  MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSRQVW
        MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSRQVW
Subjt:  MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSRQVW

XP_022951223.1 transcription factor MYB36-like [Cucurbita moschata]5.6e-48100Show/hide
Query:  MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSR
        MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSR
Subjt:  MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSR

XP_023002574.1 transcription factor MYB36-like [Cucurbita maxima]2.1e-4798.88Show/hide
Query:  MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSR
        MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQ+GSR
Subjt:  MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSR

XP_023537883.1 transcription factor MYB36-like isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.6e-4798.88Show/hide
Query:  MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSR
        MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTE+EDNLIFNLYNQYGSR
Subjt:  MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSR

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LR01 Uncharacterized protein7.6e-4388.76Show/hide
Query:  MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSR
        MGRAPCC+K  VKKGPWSPDEDA LK YVETHG AGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHG+FTE+EDN+IFNL+NQYGSR
Subjt:  MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSR

A0A1S3BB79 transcription factor RAX3-like2.6e-4389.89Show/hide
Query:  MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSR
        MGRAPCC+K  VKKGPWSPDEDA LK YVETHG AGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHG+FTE+EDN+IFNLYNQYGSR
Subjt:  MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSR

A0A2P5DTP6 Octamer-binding transcription factor2.4e-4182.61Show/hide
Query:  MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSRQVW
        MGRAPCCDKANVK+GPWSP+EDATLK Y+ETHGT G WIALP KAGL+RCGKSCRLRWLNYLRP+IKHG FTE+ED++I NLYNQ GSRQV+
Subjt:  MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSRQVW

A0A6J1GH52 transcription factor MYB36-like2.7e-48100Show/hide
Query:  MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSR
        MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSR
Subjt:  MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSR

A0A6J1KQU4 transcription factor MYB36-like1.0e-4798.88Show/hide
Query:  MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSR
        MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQ+GSR
Subjt:  MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
F4JSU0 Transcription factor MYB879.6e-3569.66Show/hide
Query:  MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSR
        MGRAPCCDK  VKKGPWS +EDA LK Y+E HGT   WI+LP + G+KRCGKSCRLRWLNYLRPN+KHG FT++ED +I +LY   GSR
Subjt:  MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSR

Q9FG68 Transcription factor RAX13.9e-3669.66Show/hide
Query:  MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSR
        MGRAPCCDK  VK+GPWSP+ED+ L+ Y+E +G  G WI+ P KAGL+RCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDF+E+ED +IF+L+   GSR
Subjt:  MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSR

Q9FKL2 Transcription factor MYB361.2e-3775.28Show/hide
Query:  MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSR
        MGRAPCCDKANVKKGPWSP+ED  LK Y++ +GT G WIALP K GLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHG F+E+ED +I +LY   GSR
Subjt:  MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSR

Q9M2Y9 Transcription factor RAX32.4e-3877.53Show/hide
Query:  MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSR
        MGRAPCCDKANVKKGPWSP+EDA LK Y+E  GT G WIALP K GLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHG F+E+E+N+I +LY   GSR
Subjt:  MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSR

Q9SJL7 Transcription factor RAX21.3e-3977.53Show/hide
Query:  MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSR
        MGRAPCCDKANVK+GPWSP+EDA LK Y+E  GT G WIALP KAGL+RCGKSCRLRWLNYLRPNI+HGDFTE+EDN+I++L+   GSR
Subjt:  MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSR

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G36890.1 Duplicated homeodomain-like superfamily protein9.2e-4177.53Show/hide
Query:  MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSR
        MGRAPCCDKANVK+GPWSP+EDA LK Y+E  GT G WIALP KAGL+RCGKSCRLRWLNYLRPNI+HGDFTE+EDN+I++L+   GSR
Subjt:  MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSR

AT3G49690.1 myb domain protein 841.7e-3977.53Show/hide
Query:  MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSR
        MGRAPCCDKANVKKGPWSP+EDA LK Y+E  GT G WIALP K GLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHG F+E+E+N+I +LY   GSR
Subjt:  MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSR

AT5G23000.1 myb domain protein 372.8e-3769.66Show/hide
Query:  MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSR
        MGRAPCCDK  VK+GPWSP+ED+ L+ Y+E +G  G WI+ P KAGL+RCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDF+E+ED +IF+L+   GSR
Subjt:  MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSR

AT5G57620.1 myb domain protein 368.6e-3975.28Show/hide
Query:  MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSR
        MGRAPCCDKANVKKGPWSP+ED  LK Y++ +GT G WIALP K GLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHG F+E+ED +I +LY   GSR
Subjt:  MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSR

AT5G65790.1 myb domain protein 686.0e-4078.65Show/hide
Query:  MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSR
        MGRAPCCDKANVKKGPWSP+EDA LK Y+E  GT G WIALP K GL+RCGKSCRLRWLNYLRPNIKHG F+E+EDN+I NLY   GSR
Subjt:  MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGAAGAGCTCCATGTTGTGACAAAGCCAATGTAAAGAAAGGTCCTTGGTCCCCTGATGAGGATGCCACTCTCAAACTCTATGTGGAAACTCATGGCACTGCAGGCAC
CTGGATTGCTCTGCCCACAAAAGCTGGGCTAAAGAGATGTGGCAAGAGCTGCAGGTTACGGTGGCTAAACTATCTTAGACCCAACATCAAGCATGGAGACTTTACAGAGG
ATGAAGACAATCTCATCTTTAATCTCTATAATCAATATGGAAGCAGGCAAGTTTGGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGAAGAGCTCCATGTTGTGACAAAGCCAATGTAAAGAAAGGTCCTTGGTCCCCTGATGAGGATGCCACTCTCAAACTCTATGTGGAAACTCATGGCACTGCAGGCAC
CTGGATTGCTCTGCCCACAAAAGCTGGGCTAAAGAGATGTGGCAAGAGCTGCAGGTTACGGTGGCTAAACTATCTTAGACCCAACATCAAGCATGGAGACTTTACAGAGG
ATGAAGACAATCTCATCTTTAATCTCTATAATCAATATGGAAGCAGGCAAGTTTGGTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGRAPCCDKANVKKGPWSPDEDATLKLYVETHGTAGTWIALPTKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFTEDEDNLIFNLYNQYGSRQVW