; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg23982 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg23982
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionNon-specific lipid-transfer protein-like protein
Genome locationCarg_Chr11:9711940..9712700
RNA-Seq ExpressionCarg23982
SyntenyCarg23982
Gene Ontology termsGO:0006869 - lipid transport (biological process)
GO:0005886 - plasma membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0031225 - anchored component of membrane (cellular component)
GO:0008289 - lipid binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000528 - Plant non-specific lipid-transfer protein/Par allergen
IPR016140 - Bifunctional inhibitor/plant lipid transfer protein/seed storage helical domain
IPR036312 - Bifunctional inhibitor/plant lipid transfer protein/seed storage helical domain superfamily
IPR043325 - Alpha-Amylase Inhibitors (AAI), Lipid Transfer (LT) and Seed Storage (SS) Protein


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7022552.1 Non-specific lipid-transfer protein-like protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.2e-107100Show/hide
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XP_022927861.1 non-specific lipid-transfer protein-like protein At5g64080 isoform X1 [Cucurbita moschata]5.5e-7578.67Show/hide
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XP_022927863.1 non-specific lipid-transfer protein-like protein At5g64080 isoform X2 [Cucurbita moschata]1.2e-7478.67Show/hide
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XP_022988971.1 non-specific lipid-transfer protein-like protein At5g64080 isoform X1 [Cucurbita maxima]4.8e-7174.41Show/hide
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XP_022988972.1 non-specific lipid-transfer protein-like protein At5g64080 isoform X2 [Cucurbita maxima]1.1e-7074.41Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1EIQ5 non-specific lipid-transfer protein-like protein At5g64080 isoform X12.7e-7578.67Show/hide
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A0A6J1EM83 non-specific lipid-transfer protein-like protein At5g64080 isoform X25.9e-7578.67Show/hide
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A0A6J1HSQ0 non-specific lipid-transfer protein-like protein At5g640803.2e-3650Show/hide
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        PAAC +S PA S CK           +S+S                              A+ PA SPK     AP  NE T AP P  SAATG +VS+G
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        S+I AIGV +  SF
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A0A6J1JEH5 non-specific lipid-transfer protein-like protein At5g64080 isoform X25.2e-7174.41Show/hide
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A0A6J1JIP6 non-specific lipid-transfer protein-like protein At5g64080 isoform X12.3e-7174.41Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q2PE60 Non-specific lipid transfer protein GPI-anchored 231.5e-1140.7Show/hide
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        DCS +I ++ DCL F++  ST  +P K CC+G+K V   +  CLC   ++S  +G VL+ TKAL++P          CD+S PA S
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Q2PE70 Non-specific lipid transfer protein GPI-anchored 48.4e-1039.73Show/hide
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Q8VYI9 Non-specific lipid transfer protein GPI-anchored 318.4e-1832.06Show/hide
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        LS+S  ++     +++T   A  P  DCS LIL +ADCL FVS   T   P   CC GLK V KA++ CLC  FK+SASLG+ LN+TKA +LPAAC +  
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        P+++ C                                              +V P+ +P L+PG A    ET     P P+  N  ++ +  S  ++++
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        A+   +F+S
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Q9FY78 Non-specific lipid transfer protein GPI-anchored 296.2e-1341.35Show/hide
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        +L  LV++ S+ Y  +    DC  L++TL  CLPF+S   T  TP  +CC  LK +      CLC   K  A LGI LNVTK+ +LP AC ++ P +S C
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           P
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Q9ZQI8 Non-specific lipid transfer protein GPI-anchored 111.5e-1431.49Show/hide
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        DCS LIL +ADCL FV+  ST   P   CC GLK V +   +CLC  FKNS SLG+ L+++KA SLP+ C ++ P  +                      
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                        C +S+     A  P  SP    G   +    N  TP  +P +S A+ + VS   +I    +  FY
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G13820.1 Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein1.1e-1531.49Show/hide
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        DCS LIL +ADCL FV+  ST   P   CC GLK V +   +CLC  FKNS SLG+ L+++KA SLP+ C ++ P  +                      
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                        C +S+     A  P  SP    G   +    N  TP  +P +S A+ + VS   +I    +  FY
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AT2G13820.2 Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein3.9e-1850Show/hide
Query:  DCSKLILTLADCLPFVSKDSTTTTPAKACCLGLKIVAKANADCLCHTFKNSASLGIVLNVTKALSLPAACDISDPALSEC
        DCS LIL +ADCL FV+  ST   P   CC GLK V +   +CLC  FKNS SLG+ L+++KA SLP+ C ++ P  + C
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AT5G09370.2 Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein4.4e-1441.35Show/hide
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        +L  LV++ S+ Y  +    DC  L++TL  CLPF+S   T  TP  +CC  LK +      CLC   K  A LGI LNVTK+ +LP AC ++ P +S C
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Query:  KCKP
           P
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AT5G64080.1 Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein6.0e-1932.06Show/hide
Query:  LSISLFALFALVVNYSTVYAALVPEGDCSKLILTLADCLPFVSKDSTTTTPAKACCLGLKIVAKANADCLCHTFKNSASLGIVLNVTKALSLPAACDISD
        LS+S  ++     +++T   A  P  DCS LIL +ADCL FVS   T   P   CC GLK V KA++ CLC  FK+SASLG+ LN+TKA +LPAAC +  
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        P+++ C                                              +V P+ +P L+PG A    ET     P P+  N  ++ +  S  ++++
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Query:  AIGVGVFYS
        A+   +F+S
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AT5G64080.2 Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein1.4e-2048.11Show/hide
Query:  LSISLFALFALVVNYSTVYAALVPEGDCSKLILTLADCLPFVSKDSTTTTPAKACCLGLKIVAKANADCLCHTFKNSASLGIVLNVTKALSLPAACDISD
        LS+S  ++     +++T   A  P  DCS LIL +ADCL FVS   T   P   CC GLK V KA++ CLC  FK+SASLG+ LN+TKA +LPAAC +  
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Query:  PALSEC
        P+++ C
Subjt:  PALSEC


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTACCGCCAAGCTTTCTATCTCTCTTTTCGCTCTTTTCGCTCTGGTCGTGAATTACTCCACCGTATACGCCGCCCTTGTGCCGGAGGGGGACTGTTCCAAACTCAT
CCTCACTTTGGCCGACTGTCTCCCCTTCGTCTCCAAAGACAGCACCACCACCACTCCCGCTAAAGCCTGCTGTCTCGGCCTTAAAATCGTCGCCAAGGCTAACGCCGATT
GCCTCTGCCATACCTTCAAGAACAGCGCTTCTTTAGGTATCGTCCTCAATGTCACCAAGGCTCTTTCTCTCCCTGCCGCTTGCGACATATCCGATCCTGCTCTTTCTGAG
TGTAAATGTAAGCCTAATTTCTTCAGAATCGCTCTCTTAATTTCCGATTCGTCTTACTCTGTTGATTTCGATCTGGATTTTGGAATGTTTGTGATAAAATTCCTGAGCGA
TTGTTCTGTTTCGATTGTTGTTTTTGATGCAGCGGTTACGCCGGCTGCCTCACCGAAATTGTCGCCGGGAGAAGCGCCAGTGAAGAACGAGACGACGCCGGCTCCGACAC
CTGAAAATTCGGCGGCGACAGGCGTTGTGGTGTCCGTCGGATCCATAATCGCCGCCATTGGAGTAGGTGTGTTCTACAGTTTTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTACCGCCAAGCTTTCTATCTCTCTTTTCGCTCTTTTCGCTCTGGTCGTGAATTACTCCACCGTATACGCCGCCCTTGTGCCGGAGGGGGACTGTTCCAAACTCAT
CCTCACTTTGGCCGACTGTCTCCCCTTCGTCTCCAAAGACAGCACCACCACCACTCCCGCTAAAGCCTGCTGTCTCGGCCTTAAAATCGTCGCCAAGGCTAACGCCGATT
GCCTCTGCCATACCTTCAAGAACAGCGCTTCTTTAGGTATCGTCCTCAATGTCACCAAGGCTCTTTCTCTCCCTGCCGCTTGCGACATATCCGATCCTGCTCTTTCTGAG
TGTAAATGTAAGCCTAATTTCTTCAGAATCGCTCTCTTAATTTCCGATTCGTCTTACTCTGTTGATTTCGATCTGGATTTTGGAATGTTTGTGATAAAATTCCTGAGCGA
TTGTTCTGTTTCGATTGTTGTTTTTGATGCAGCGGTTACGCCGGCTGCCTCACCGAAATTGTCGCCGGGAGAAGCGCCAGTGAAGAACGAGACGACGCCGGCTCCGACAC
CTGAAAATTCGGCGGCGACAGGCGTTGTGGTGTCCGTCGGATCCATAATCGCCGCCATTGGAGTAGGTGTGTTCTACAGTTTTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MATAKLSISLFALFALVVNYSTVYAALVPEGDCSKLILTLADCLPFVSKDSTTTTPAKACCLGLKIVAKANADCLCHTFKNSASLGIVLNVTKALSLPAACDISDPALSE
CKCKPNFFRIALLISDSSYSVDFDLDFGMFVIKFLSDCSVSIVVFDAAVTPAASPKLSPGEAPVKNETTPAPTPENSAATGVVVSVGSIIAAIGVGVFYSF