; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg24422 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg24422
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionWEB family protein At3g51220
Genome locationCarg_Chr04:10823149..10824262
RNA-Seq ExpressionCarg24422
SyntenyCarg24422
Gene Ontology termsGO:0009903 - chloroplast avoidance movement (biological process)
GO:0009904 - chloroplast accumulation movement (biological process)
GO:0016226 - iron-sulfur cluster assembly (biological process)
GO:0005829 - cytosol (cellular component)
GO:0005506 - iron ion binding (molecular function)
GO:0051536 - iron-sulfur cluster binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6601626.1 WEB family protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.4e-9999.03Show/hide
Query:  MEDPEMPNQSSASIVDTSRPFRSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCPNAPLAETGTWDSLLSSTTTLKEEKEHEVLDTLKKLEAELEETKEELRLLKE
        MEDPEMPNQSSASIVDTSRPFRSVKEAVAVFGERLLV EAYSS PKPCPNAPLAETGTWDSLLSSTTTLKEEKEHEVLDTLKKLEAELEETKEELRLLKE
Subjt:  MEDPEMPNQSSASIVDTSRPFRSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCPNAPLAETGTWDSLLSSTTTLKEEKEHEVLDTLKKLEAELEETKEELRLLKE

Query:  REEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAEAAAAAKAVATRRITMGCESGRIEEEMRRTEPLAQILRFGGKKEKKKVKKKPIIPLVGDLLMRLRRKGSLTS
        REEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAEAAAAAKAVATRRITMGCESGRIEEEMRRTEPLAQILRFGGKKEKKKVKKKPIIPLVGDLLMRLRRKGSLTS
Subjt:  REEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAEAAAAAKAVATRRITMGCESGRIEEEMRRTEPLAQILRFGGKKEKKKVKKKPIIPLVGDLLMRLRRKGSLTS

Query:  SFKSFD
        SFKSFD
Subjt:  SFKSFD

KAG7032386.1 WEB family protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]5.7e-101100Show/hide
Query:  MEDPEMPNQSSASIVDTSRPFRSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCPNAPLAETGTWDSLLSSTTTLKEEKEHEVLDTLKKLEAELEETKEELRLLKE
        MEDPEMPNQSSASIVDTSRPFRSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCPNAPLAETGTWDSLLSSTTTLKEEKEHEVLDTLKKLEAELEETKEELRLLKE
Subjt:  MEDPEMPNQSSASIVDTSRPFRSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCPNAPLAETGTWDSLLSSTTTLKEEKEHEVLDTLKKLEAELEETKEELRLLKE

Query:  REEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAEAAAAAKAVATRRITMGCESGRIEEEMRRTEPLAQILRFGGKKEKKKVKKKPIIPLVGDLLMRLRRKGSLTS
        REEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAEAAAAAKAVATRRITMGCESGRIEEEMRRTEPLAQILRFGGKKEKKKVKKKPIIPLVGDLLMRLRRKGSLTS
Subjt:  REEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAEAAAAAKAVATRRITMGCESGRIEEEMRRTEPLAQILRFGGKKEKKKVKKKPIIPLVGDLLMRLRRKGSLTS

Query:  SFKSFD
        SFKSFD
Subjt:  SFKSFD

XP_022957117.1 WEB family protein At3g51220 [Cucurbita moschata]3.5e-9898.06Show/hide
Query:  MEDPEMPNQSSASIVDTSRPFRSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCPNAPLAETGTWDSLLSSTTTLKEEKEHEVLDTLKKLEAELEETKEELRLLKE
        MEDPEMPNQSSASIVDTSRPFRSVKEAVAVFGERLLV EAYSS PKPCPNAPLAETGTWDSLLSSTTTLKEEKEHEVLDTLKKLEAELEETKEELRLLKE
Subjt:  MEDPEMPNQSSASIVDTSRPFRSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCPNAPLAETGTWDSLLSSTTTLKEEKEHEVLDTLKKLEAELEETKEELRLLKE

Query:  REEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAEAAAAAKAVATRRITMGCESGRIEEEMRRTEPLAQILRFGGKKEKKKVKKKPIIPLVGDLLMRLRRKGSLTS
        REEDTEVALASLNAELHKNMS LAEAEAEAAAAAKAVATRRITMGCESGRIEEEMRRTEPLAQILRFGGKKEKKKVKKKPIIPLVGDLLMRLRRKGSLTS
Subjt:  REEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAEAAAAAKAVATRRITMGCESGRIEEEMRRTEPLAQILRFGGKKEKKKVKKKPIIPLVGDLLMRLRRKGSLTS

Query:  SFKSFD
        SFKSF+
Subjt:  SFKSFD

XP_022998394.1 WEB family protein At3g51220 [Cucurbita maxima]2.9e-9796.6Show/hide
Query:  MEDPEMPNQSSASIVDTSRPFRSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCPNAPLAETGTWDSLLSSTTTLKEEKEHEVLDTLKKLEAELEETKEELRLLKE
        MEDPEMPNQSSASIVDTSRPFRSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPC NAPL+ETGTWDSLLSSTTT+KEEKEHEVLDTLKKLEAELEETKEELRLLKE
Subjt:  MEDPEMPNQSSASIVDTSRPFRSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCPNAPLAETGTWDSLLSSTTTLKEEKEHEVLDTLKKLEAELEETKEELRLLKE

Query:  REEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAEAAAAAKAVATRRITMGCESGRIEEEMRRTEPLAQILRFGGKKEKKKVKKKPIIPLVGDLLMRLRRKGSLTS
        REEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAEAAAAAKAVATRRITMGCE+GRIEEEM+RTE LAQILRFGGKKEKKKVKKKPIIPLVGDLLMRLRRKGSL+S
Subjt:  REEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAEAAAAAKAVATRRITMGCESGRIEEEMRRTEPLAQILRFGGKKEKKKVKKKPIIPLVGDLLMRLRRKGSLTS

Query:  SFKSFD
        SFKSFD
Subjt:  SFKSFD

XP_023544273.1 WEB family protein At3g51220 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.9e-9797.09Show/hide
Query:  MEDPEMPNQSSASIVDTSRPFRSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCPNAPLAETGTWDSLLSSTTTLKEEKEHEVLDTLKKLEAELEETKEELRLLKE
        MEDPEMPNQSSASIVDTSRPFRSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPC NAPLAETGTWDSLLSSTTTLKEEKEHEVLDTLKKLEAELEETKEELRLLKE
Subjt:  MEDPEMPNQSSASIVDTSRPFRSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCPNAPLAETGTWDSLLSSTTTLKEEKEHEVLDTLKKLEAELEETKEELRLLKE

Query:  REEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAEAAAAAKAVATRRITMGCESGRIEEEMRRTEPLAQILRFGGKKEKKKVKKKPIIPLVGDLLMRLRRKGSLTS
        REEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAEAAAAAKAVATRRITMGCESGRIEEEM+RTE L QILRFGGKKEKKKVKKKPIIPLVGDLLMRLRRKGSL+S
Subjt:  REEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAEAAAAAKAVATRRITMGCESGRIEEEMRRTEPLAQILRFGGKKEKKKVKKKPIIPLVGDLLMRLRRKGSLTS

Query:  SFKSFD
        SFKSF+
Subjt:  SFKSFD

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KPW0 Uncharacterized protein9.9e-6772.65Show/hide
Query:  MEDPEMPNQSSASIVDTSRPFRSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCPNAPLAETGTWDSLLSSTTTLKEEKEHEVLDTLKKLEAELEETKEELRLLKE
        MEDPE+P+Q+SAS VDTSRPFRSVKEAVAVFGERLLVG+AYSSSPKP  +APL E GTW+++ SSTTT+KEEKEH VL +LKKLEAELEETKEELRLLKE
Subjt:  MEDPEMPNQSSASIVDTSRPFRSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCPNAPLAETGTWDSLLSSTTTLKEEKEHEVLDTLKKLEAELEETKEELRLLKE

Query:  REEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAEAAAAAKAVATRRITMGCESGRIEEEMRRTE------------PLAQILR-------FGGKKEKKKVKKKPI
        REEDTEVALASLNAELHKNMSKL  AEAEAAAA KA A RRI     SGRIEEEM+R+E             LAQIL        FGGKKEKKK+KKKPI
Subjt:  REEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAEAAAAAKAVATRRITMGCESGRIEEEMRRTE------------PLAQILR-------FGGKKEKKKVKKKPI

Query:  IPLVGDLLMRLRRKGSLTSSFKS
        IPLVGDLL+ LR+KGS  +  +S
Subjt:  IPLVGDLLMRLRRKGSLTSSFKS

A0A1S3BDZ1 LOW QUALITY PROTEIN: WEB family protein At1g757201.7e-7175.11Show/hide
Query:  MEDPEMPNQSSASIVDTSRPFRSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCPNAPLAETGTWDSLLSSTTTLKEEKEHEVLDTLKKLEAELEETKEELRLLKE
        MEDPE+P+QSSAS VDTSRPFRSVKEAVAVFGERLLVG+AYSSSPKP  +APL E GTW+++ SSTTT+KEEKEH VLD+LKKLEAELEETKEELRLLKE
Subjt:  MEDPEMPNQSSASIVDTSRPFRSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCPNAPLAETGTWDSLLSSTTTLKEEKEHEVLDTLKKLEAELEETKEELRLLKE

Query:  REEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAEAAAAAKAVATRRITMGCESGRIEEEMRRTE------------PLAQILR-------FGGKKEKKKVKKKPI
        REEDTEVALASLNAELHKNMSKL  AEAEAAAAAKA ATRRI  GCE GRIEEEM+R+E             LAQIL        FGGKKEKKK K+KPI
Subjt:  REEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAEAAAAAKAVATRRITMGCESGRIEEEMRRTE------------PLAQILR-------FGGKKEKKKVKKKPI

Query:  IPLVGDLLMRLRRKGS----LTSSFKSFD
        IPLVGDLL+ LR+KGS    L SSF SF+
Subjt:  IPLVGDLLMRLRRKGS----LTSSFKSFD

A0A5A7SSG4 NifU-like protein 21.7e-6672.85Show/hide
Query:  MEDPEMPNQSSASIVDTSRPFRSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCPNAPLAETGTWDSLLSSTTTLKEEKEHEVLDTLKKLEAELEETKEELRLLKE
        MEDPE+P+QSSAS VDTSRPFRSVKEAVAVFGERLLVG+AYSSSPKP  +APL E GTW+++ SSTTT+KEEKEH VLD+LKKLEAELEETKEELRLLKE
Subjt:  MEDPEMPNQSSASIVDTSRPFRSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCPNAPLAETGTWDSLLSSTTTLKEEKEHEVLDTLKKLEAELEETKEELRLLKE

Query:  REEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAEAAAAAKAVATRRITMGCESGRIEEEMRRTE------------PLAQILR-------FGGKKEKKKVKKKPI
        REEDTEVALASLNAELHKNMSKL  AEAEAAAAAKA ATRRI  GCE GRIEEEM+R+E             LAQIL        FGGKKEKKK+KKKPI
Subjt:  REEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAEAAAAAKAVATRRITMGCESGRIEEEMRRTE------------PLAQILR-------FGGKKEKKKVKKKPI

Query:  IPLVGDLLMRLRRKGSLTSSF
        IPL     ++ ++K SL + F
Subjt:  IPLVGDLLMRLRRKGSLTSSF

A0A6J1GY99 WEB family protein At3g512201.7e-9898.06Show/hide
Query:  MEDPEMPNQSSASIVDTSRPFRSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCPNAPLAETGTWDSLLSSTTTLKEEKEHEVLDTLKKLEAELEETKEELRLLKE
        MEDPEMPNQSSASIVDTSRPFRSVKEAVAVFGERLLV EAYSS PKPCPNAPLAETGTWDSLLSSTTTLKEEKEHEVLDTLKKLEAELEETKEELRLLKE
Subjt:  MEDPEMPNQSSASIVDTSRPFRSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCPNAPLAETGTWDSLLSSTTTLKEEKEHEVLDTLKKLEAELEETKEELRLLKE

Query:  REEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAEAAAAAKAVATRRITMGCESGRIEEEMRRTEPLAQILRFGGKKEKKKVKKKPIIPLVGDLLMRLRRKGSLTS
        REEDTEVALASLNAELHKNMS LAEAEAEAAAAAKAVATRRITMGCESGRIEEEMRRTEPLAQILRFGGKKEKKKVKKKPIIPLVGDLLMRLRRKGSLTS
Subjt:  REEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAEAAAAAKAVATRRITMGCESGRIEEEMRRTEPLAQILRFGGKKEKKKVKKKPIIPLVGDLLMRLRRKGSLTS

Query:  SFKSFD
        SFKSF+
Subjt:  SFKSFD

A0A6J1KE80 WEB family protein At3g512201.4e-9796.6Show/hide
Query:  MEDPEMPNQSSASIVDTSRPFRSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCPNAPLAETGTWDSLLSSTTTLKEEKEHEVLDTLKKLEAELEETKEELRLLKE
        MEDPEMPNQSSASIVDTSRPFRSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPC NAPL+ETGTWDSLLSSTTT+KEEKEHEVLDTLKKLEAELEETKEELRLLKE
Subjt:  MEDPEMPNQSSASIVDTSRPFRSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCPNAPLAETGTWDSLLSSTTTLKEEKEHEVLDTLKKLEAELEETKEELRLLKE

Query:  REEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAEAAAAAKAVATRRITMGCESGRIEEEMRRTEPLAQILRFGGKKEKKKVKKKPIIPLVGDLLMRLRRKGSLTS
        REEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAEAAAAAKAVATRRITMGCE+GRIEEEM+RTE LAQILRFGGKKEKKKVKKKPIIPLVGDLLMRLRRKGSL+S
Subjt:  REEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAEAAAAAKAVATRRITMGCESGRIEEEMRRTEPLAQILRFGGKKEKKKVKKKPIIPLVGDLLMRLRRKGSLTS

Query:  SFKSFD
        SFKSFD
Subjt:  SFKSFD

SwissProt top hitse value%identityAlignment
F4I0N3 WEB family protein At1g757208.0e-0539.77Show/hide
Query:  VDTSRPFRSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCPNAPLAE-TGTWDSLLSSTTTLKEEKEH--EVLDTLKKLEAELEETKEELRLLK
        +DT+ PFR+VKEAVA+FGER+L  + YS+  K   +    + +G    L  +   LK  KE   ++ ++L  L+ ELE TK+EL+ L+
Subjt:  VDTSRPFRSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCPNAPLAE-TGTWDSLLSSTTTLKEEKEH--EVLDTLKKLEAELEETKEELRLLK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G58070.1 unknown protein9.3e-2537.97Show/hide
Query:  MEDPEMPNQSSASIVDTSRPFRSVKEAVAVFGERLLVG------EAYSSSP-----------KP------------CPNA------------PLAETGTW
        +E+ E  NQ     VDTSRPF SVKEAVA+FG+R+++        + S+SP           KP             P A            P+A     
Subjt:  MEDPEMPNQSSASIVDTSRPFRSVKEAVAVFGERLLVG------EAYSSSP-----------KP------------CPNA------------PLAETGTW

Query:  DSLLSSTTTLKEEK---------EHEVLDTLKKLEAELEETKEELRLLKEREEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAEAAAAAKAVATRRITM------
         +  SS++  K+           + E++D LKKLEAE+ ETK E+++LKERE +TEVALA+LNAELHKN SK+A+AEA+AA  + A  T+ ++       
Subjt:  DSLLSSTTTLKEEK---------EHEVLDTLKKLEAELEETKEELRLLKEREEDTEVALASLNAELHKNMSKLAEAEAEAAAAAKAVATRRITM------

Query:  -GCESGRIEEEMRRTE----PLAQIL--------RFGGKKEKKKVKKKPIIPLVGDLLMRLRRKGS
           E  R +E MR+ +     LAQIL         +    +K K KKKPIIPLVGD     ++KGS
Subjt:  -GCESGRIEEEMRRTE----PLAQIL--------RFGGKKEKKKVKKKPIIPLVGDLLMRLRRKGS

AT1G75720.1 Plant protein of unknown function (DUF827)9.6e-0637.63Show/hide
Query:  VDTSRPFRSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCPNAPLAE------TGTWDSLLSSTTTLKEEKEH--EVLDTLKKLEAELEETKEELRLLK
        +DT+ PFR+VKEAVA+FGER+L  + YS+  K      + +      +G    L  +   LK  KE   ++ ++L  L+ ELE TK+EL+ L+
Subjt:  VDTSRPFRSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCPNAPLAE------TGTWDSLLSSTTTLKEEKEH--EVLDTLKKLEAELEETKEELRLLK

AT1G75720.2 Plant protein of unknown function (DUF827)5.7e-0639.77Show/hide
Query:  VDTSRPFRSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCPNAPLAE-TGTWDSLLSSTTTLKEEKEH--EVLDTLKKLEAELEETKEELRLLK
        +DT+ PFR+VKEAVA+FGER+L  + YS+  K   +    + +G    L  +   LK  KE   ++ ++L  L+ ELE TK+EL+ L+
Subjt:  VDTSRPFRSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCPNAPLAE-TGTWDSLLSSTTTLKEEKEH--EVLDTLKKLEAELEETKEELRLLK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAGACCCTGAAATGCCTAATCAAAGCTCTGCCTCCATTGTTGACACCTCCCGCCCCTTCCGCTCTGTCAAAGAAGCCGTTGCAGTGTTTGGCGAACGTCTTCTAGT
CGGAGAAGCTTACTCGTCGTCGCCAAAGCCATGTCCCAATGCCCCATTGGCTGAAACAGGCACATGGGATTCTTTGTTAAGCTCCACAACAACACTAAAGGAAGAGAAAG
AACATGAAGTGTTGGATACACTGAAGAAACTTGAGGCAGAGCTGGAGGAGACTAAGGAAGAGTTGAGGTTGTTGAAGGAAAGGGAAGAAGATACAGAAGTGGCATTGGCT
TCACTGAATGCAGAGCTGCATAAGAACATGTCGAAGTTGGCTGAGGCGGAAGCGGAGGCGGCGGCGGCGGCGAAAGCTGTGGCGACGAGAAGAATCACAATGGGATGTGA
GAGTGGAAGGATAGAAGAAGAAATGAGGAGAACAGAGCCATTGGCTCAGATATTGAGATTTGGAGGGAAAAAGGAGAAGAAAAAGGTAAAGAAAAAGCCAATAATTCCAC
TGGTTGGAGATTTGTTGATGAGATTAAGGAGAAAAGGGAGTCTCACTTCTTCATTCAAATCCTTCGAT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTGGAGTTCCCATATAAAGATGGAGCCATTACTTGATGTAGAAGGCAAGAAAGAGTATACATTTAAGCTACAGTGGAGATTGGACCTGCTGCTGTACCAGAAAATCAAAT
ATTTGGAGATTCAACTACAACCAACCAAAAGCAGCTGCTTAATGAACTGCTAAATCCGTTGCAGCCATGGAGAGAGCTAAAGCAAAGACCTCAATTCTCCCACCTAACCA
ATCATCAAATACACCATATCCTCCCACACCCTCTCCCCACACGTCCCATGGAAGACCCTGAAATGCCTAATCAAAGCTCTGCCTCCATTGTTGACACCTCCCGCCCCTTC
CGCTCTGTCAAAGAAGCCGTTGCAGTGTTTGGCGAACGTCTTCTAGTCGGAGAAGCTTACTCGTCGTCGCCAAAGCCATGTCCCAATGCCCCATTGGCTGAAACAGGCAC
ATGGGATTCTTTGTTAAGCTCCACAACAACACTAAAGGAAGAGAAAGAACATGAAGTGTTGGATACACTGAAGAAACTTGAGGCAGAGCTGGAGGAGACTAAGGAAGAGT
TGAGGTTGTTGAAGGAAAGGGAAGAAGATACAGAAGTGGCATTGGCTTCACTGAATGCAGAGCTGCATAAGAACATGTCGAAGTTGGCTGAGGCGGAAGCGGAGGCGGCG
GCGGCGGCGAAAGCTGTGGCGACGAGAAGAATCACAATGGGATGTGAGAGTGGAAGGATAGAAGAAGAAATGAGGAGAACAGAGCCATTGGCTCAGATATTGAGATTTGG
AGGGAAAAAGGAGAAGAAAAAGGTAAAGAAAAAGCCAATAATTCCACTGGTTGGAGATTTGTTGATGAGATTAAGGAGAAAAGGGAGTCTCACTTCTTCATTCAAATCCT
TCGAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEDPEMPNQSSASIVDTSRPFRSVKEAVAVFGERLLVGEAYSSSPKPCPNAPLAETGTWDSLLSSTTTLKEEKEHEVLDTLKKLEAELEETKEELRLLKEREEDTEVALA
SLNAELHKNMSKLAEAEAEAAAAAKAVATRRITMGCESGRIEEEMRRTEPLAQILRFGGKKEKKKVKKKPIIPLVGDLLMRLRRKGSLTSSFKSFD