; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg24437 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg24437
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionchlorophyllide a oxygenase, chloroplastic-like
Genome locationCarg_Chr04:18404341..18405747
RNA-Seq ExpressionCarg24437
SyntenyCarg24437
Gene Ontology termsGO:0015995 - chlorophyll biosynthetic process (biological process)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0031967 - organelle envelope (cellular component)
GO:0005506 - iron ion binding (molecular function)
GO:0010277 - chlorophyllide a oxygenase [overall] activity (molecular function)
GO:0051537 - 2 iron, 2 sulfur cluster binding (molecular function)
InterPro domainsIPR013626 - Pheophorbide a oxygenase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6602096.1 Chlorophyllide a oxygenase, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.1e-87100Show/hide
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KAG7032801.1 Chlorophyllide a oxygenase, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.6e-90100Show/hide
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XP_022962444.1 chlorophyllide a oxygenase, chloroplastic-like [Cucurbita moschata]1.8e-8699.35Show/hide
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XP_022990515.1 chlorophyllide a oxygenase, chloroplastic-like [Cucurbita maxima]1.8e-8699.35Show/hide
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XP_023541912.1 chlorophyllide a oxygenase, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.8e-8699.35Show/hide
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A0A6J1CIW5 chlorophyllide a oxygenase, chloroplastic isoform X23.1e-8496.13Show/hide
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A0A6J1CKQ4 chlorophyllide a oxygenase, chloroplastic isoform X13.1e-8496.13Show/hide
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A0A6J1HH36 chlorophyllide a oxygenase, chloroplastic-like8.7e-8799.35Show/hide
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A0A6J1JQB0 chlorophyllide a oxygenase, chloroplastic-like8.7e-8799.35Show/hide
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A0A6J1JXA2 chlorophyllide a oxygenase, chloroplastic-like3.7e-8597.42Show/hide
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Q8S7E1 Chlorophyllide a oxygenase, chloroplastic4.6e-7781.29Show/hide
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Q9MBA1 Chlorophyllide a oxygenase, chloroplastic1.3e-7684.21Show/hide
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Q9XJ38 Chlorophyllide a oxygenase, chloroplastic6.7e-4460.74Show/hide
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Q9ZWM5 Chlorophyllide a oxygenase, chloroplastic1.9e-4662.12Show/hide
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        QQ+RML G + W+ P  YDKL VRYR WRN V
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G44446.1 Pheophorbide a oxygenase family protein with Rieske [2Fe-2S] domain9.5e-7884.21Show/hide
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AT1G44446.2 Pheophorbide a oxygenase family protein with Rieske [2Fe-2S] domain1.4e-4985Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GACTACTCTATAGAATGTCACTGGATTTCGCTCCCATATTGAAGCATATTCCTTTCATGCACTATCTCTGGAGACATTTCGCAGAACAGGTATTGAATGAGGACTTGAGG
CTTGTCATTGGACAGCAAGAAAGAATGCTCAACGGAGAAAACATCTGGAACATGCCAGTTTCTTATGATAAGCTAGGTGTAAGATATAGGCTATGGAGAAATGCAGTAGA
GGAAGGAGCAAAACAACTACCCTTCAGCAAATCAAATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCAACCCAACAGCTTGGTGAAATTTTTGACCCCTGCATCTGGTCTCCAAGGATACTGGGACCCATATCCAATCGACATGGAGTTTCGACCACCTTGTATGGTACTATC
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CTTGTCATTGGACAGCAAGAAAGAATGCTCAACGGAGAAAACATCTGGAACATGCCAGTTTCTTATGATAAGCTAGGTGTAAGATATAGGCTATGGAGAAATGCAGTAGA
GGAAGGAGCAAAACAACTACCCTTCAGCAAATCAAATTGAACAGTATCCAATCGTAATTAACTTGAAACACTTCTTAGGACCCATAAACAAGCCAAGCCCCCTTCATTTT
TAGAACTCAAAATTGCAGATGAAAGACCCATGAGGCTGAGATAAGACCAACCTACCTCCCTTTCAGCTTCCACTTTTGATAAGAACACTTACAATCAAAACTCTACAGAA
GCTGAAGAAGAAAATCATCTGAAAACAGAGAGAAGCCAGCTCTTGCCCCCTACAGAATCCCCTTGTAAATTAGAAACTGCTATATAAATTAAATCGGCTTTGTAAAAGTA
TTCGAGTACTCTTTGTTGTAAGCATCTTCTTCAATGATAAAGTAATGTTCAAAATTCATTCTCAATCAGATACCATTTCGATTACTTGCAAACAAAAACCATAAAAGATC
ACCGGACGATTTGAAACAAAAGTAAATTTACAGAGAAGAGCCACAGAAAGGGCAGAAGCTGAAATCGGGCTCCACTACTTTGTTACAGGAATGGCAACGAAGGGCCCTCA
AAAGAGCGGTGGACGGCGGCAATTGATCGGAAATAGGCCGCGGTGAGAATGACCGAGGGAAAAACAGCTTACAGTTGTTGCAGTGCATCAACGGCTCTTTTCCCGGCCAC
CGCCACACTGGAACAAAGAAGAGCTTCAGAACTTTTTCGTAGTCTACGAGATCGGCCGGTGAGTTGCAGCTTATGCATCGGCCGGCACCGGCTTTCAAGAGATGGCGGAC
TTGTTGCTCTAACCCTCCGACCAAGAAGAAGAACATTTTGTTTCGCGATTTGAGATTTTGGTAAAACGATGGGTCTCTGTTTATTTG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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