; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg24506 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg24506
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionTropomyosin-like
Genome locationCarg_Chr19:2025959..2029453
RNA-Seq ExpressionCarg24506
SyntenyCarg24506
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022142007.1 uncharacterized protein LOC111012242 [Momordica charantia]1.6e-6595.89Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVAN+TEMASNLESLQK+L+KKAVYVDDETFA+ASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHV+
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGA
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEI+KRDKDIKLLEAIIQTLGA
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGA
XP_022963475.1 uncharacterized protein LOC111463800 isoform X1 [Cucurbita moschata]2.9e-67100Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLG
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLG
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLG
XP_022963476.1 uncharacterized protein LOC111463800 isoform X2 [Cucurbita moschata]1.0e-67100Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGA
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGA
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGA
XP_022967634.1 uncharacterized protein LOC111467076 isoform X1 [Cucurbita maxima]1.9e-6699.31Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
        MEDKGKGTDRWS AVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLG
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLG
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLG
XP_022967635.1 uncharacterized protein LOC111467076 isoform X2 [Cucurbita maxima]6.5e-6799.32Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
        MEDKGKGTDRWS AVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGA
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGA
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGA
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1CLE5 uncharacterized protein LOC1110122427.8e-6695.89Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVAN+TEMASNLESLQK+L+KKAVYVDDETFA+ASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHV+
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGA
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEI+KRDKDIKLLEAIIQTLGA
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGA
A0A6J1HG82 uncharacterized protein LOC111463800 isoform X24.9e-68100Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGA
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGA
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGA
A0A6J1HI40 uncharacterized protein LOC111463800 isoform X11.4e-67100Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLG
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLG
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLG
A0A6J1HV17 uncharacterized protein LOC111467076 isoform X23.2e-6799.32Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
        MEDKGKGTDRWS AVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGA
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGA
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGA
A0A6J1HXA5 uncharacterized protein LOC111467076 isoform X19.2e-6799.31Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
        MEDKGKGTDRWS AVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLG
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLG
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLG
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G64180.1 unknown protein7.5e-5376.03Show/hide
Query:  MEDKGKGTD-RWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHV
        ME++  G+D RW G++ NITEMASNL+SLQK+L+KKAV+V+++TF+RASL SEQARTIKVLEQRV+TLERELDAAITAAAHARSEKRQAE++QKAAE   
Subjt:  MEDKGKGTD-RWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHV

Query:  QEVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLG
        Q+VT+ELENTTKVF+LHM+ELR  QE+I+KRD +IKLLEAIIQTLG
Subjt:  QEVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLG

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGGACAAGGGCAAAGGAACGGACAGATGGAGCGGTGCCGTAGCCAATATCACGGAGATGGCCTCCAACCTAGAATCACTCCAGAAGATTTTAGTAAAGAAAGCCGT
CTATGTAGACGACGAGACGTTTGCCAGAGCTTCATTGTGCTCCGAACAGGCAAGGACGATCAAGGTTCTTGAACAAAGGGTTGAGACTTTGGAAAGAGAACTTGATGCTG
CTATCACTGCTGCTGCTCATGCTCGTTCAGAAAAACGTCAGGCTGAGGCAGCACAAAAAGCTGCTGAACTACATGTGCAGGAGGTCACTAGAGAGCTCGAGAACACGACA
AAGGTATTTCAACTGCACATGGATGAATTGCGTGCAAAGCAAGAGGAAATCAACAAGCGTGATAAGGATATCAAGCTCTTGGAAGCAATAATTCAAACTCTCGGTGCATA
G
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAATCTAAGAACAGTATCGCGGAAACATCGAATGCAACGGATGATCGGGTGAGTTCTTAGCTCCCTCGCTAAGTCTCTACACAGATCATGAAGTTGAACAATAATTGAAT
TGCGAATTCGCAAAAGTGCAATCGTCGAGGAAGGTTTGGATCATGGAGGACAAGGGCAAAGGAACGGACAGATGGAGCGGTGCCGTAGCCAATATCACGGAGATGGCCTC
CAACCTAGAATCACTCCAGAAGATTTTAGTAAAGAAAGCCGTCTATGTAGACGACGAGACGTTTGCCAGAGCTTCATTGTGCTCCGAACAGGCAAGGACGATCAAGGTTC
TTGAACAAAGGGTTGAGACTTTGGAAAGAGAACTTGATGCTGCTATCACTGCTGCTGCTCATGCTCGTTCAGAAAAACGTCAGGCTGAGGCAGCACAAAAAGCTGCTGAA
CTACATGTGCAGGAGGTCACTAGAGAGCTCGAGAACACGACAAAGGTATTTCAACTGCACATGGATGAATTGCGTGCAAAGCAAGAGGAAATCAACAAGCGTGATAAGGA
TATCAAGCTCTTGGAAGCAATAATTCAAACTCTCGGTGCATAGTTAGCCAATTTCACATGCTTCAAAGTTCAACTCAACTTCAAGCAGCAAAAGGATCTTCACTGTCTGA
AGAGCAGAATTTCACTTGGCTTTAAGGTTTTTTCTTCACCCTATCACTGACACTTGTTATACTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQEVTRELENTT
KVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGA