| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6571679.1 Serine/arginine-rich splicing factor SC35, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 1.5e-145 | 100 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKVSESFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYIDERRSRSR
IHKGKVSESFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYIDERRSRSR
Subjt: IHKGKVSESFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYIDERRSRSR
Query: SRSRSHSHSHSQSRGRGRGRSVDSASPGRQSPSPRSASPQRSPSPRGESPERNGDGGRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSQPNSDVD
SRSRSHSHSHSQSRGRGRGRSVDSASPGRQSPSPRSASPQRSPSPRGESPERNGDGGRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSQPNSDVD
Subjt: SRSRSHSHSHSQSRGRGRGRSVDSASPGRQSPSPRSASPQRSPSPRGESPERNGDGGRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSQPNSDVD
|
|
| KAG7011405.1 Serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 4.1e-156 | 100 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKVSESFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYIDERRSRSR
IHKGKVSESFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYIDERRSRSR
Subjt: IHKGKVSESFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYIDERRSRSR
Query: SRSRSHSHSHSQSRGRGRGRSVDSASPGRQSPSPRSASPQRSPSPRGESPERNGDGGRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSQPNSDVDFIVVYYPNMTVIIIG
SRSRSHSHSHSQSRGRGRGRSVDSASPGRQSPSPRSASPQRSPSPRGESPERNGDGGRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSQPNSDVDFIVVYYPNMTVIIIG
Subjt: SRSRSHSHSHSQSRGRGRGRSVDSASPGRQSPSPRSASPQRSPSPRGESPERNGDGGRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSQPNSDVDFIVVYYPNMTVIIIG
Query: VED
VED
Subjt: VED
|
|
| XP_022963471.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like isoform X1 [Cucurbita moschata] | 4.4e-142 | 98.6 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKVSESFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYIDERRSRSR
IHKGKVSESFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYIDERRSRSR
Subjt: IHKGKVSESFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYIDERRSRSR
Query: SRSRSHSHSHSQSRGRGRGRSVDS-ASPGRQSPSPRSASPQRSPSPRGESPERNGDGGRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSQPNSDVD
SRSRS SHSHSQSRGRGRGRSVD ASPGRQSPSPRSASP RSPSPRGESPERNGDGGRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSQPNSDVD
Subjt: SRSRSHSHSHSQSRGRGRGRSVDS-ASPGRQSPSPRSASPQRSPSPRGESPERNGDGGRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSQPNSDVD
|
|
| XP_022963472.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like isoform X2 [Cucurbita moschata] | 4.7e-144 | 99.3 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKVSESFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYIDERRSRSR
IHKGKVSESFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYIDERRSRSR
Subjt: IHKGKVSESFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYIDERRSRSR
Query: SRSRSHSHSHSQSRGRGRGRSVDSASPGRQSPSPRSASPQRSPSPRGESPERNGDGGRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSQPNSDVD
SRSRS SHSHSQSRGRGRGRSVDSASPGRQSPSPRSASP RSPSPRGESPERNGDGGRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSQPNSDVD
Subjt: SRSRSHSHSHSQSRGRGRGRSVDSASPGRQSPSPRSASPQRSPSPRGESPERNGDGGRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSQPNSDVD
|
|
| XP_022963473.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like isoform X3 [Cucurbita moschata] | 4.4e-142 | 98.6 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKVSESFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYIDERRSRSR
IHKGKVSESFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYIDERRSRSR
Subjt: IHKGKVSESFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYIDERRSRSR
Query: SRSRSHSHSHSQSRGRGRGRSVDS-ASPGRQSPSPRSASPQRSPSPRGESPERNGDGGRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSQPNSDVD
SRSRS SHSHSQSRGRGRGRSVD ASPGRQSPSPRSASP RSPSPRGESPERNGDGGRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSQPNSDVD
Subjt: SRSRSHSHSHSQSRGRGRGRSVDS-ASPGRQSPSPRSASPQRSPSPRGESPERNGDGGRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSQPNSDVD
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A6J1HFC7 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like isoform X2 | 2.3e-144 | 99.3 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKVSESFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYIDERRSRSR
IHKGKVSESFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYIDERRSRSR
Subjt: IHKGKVSESFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYIDERRSRSR
Query: SRSRSHSHSHSQSRGRGRGRSVDSASPGRQSPSPRSASPQRSPSPRGESPERNGDGGRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSQPNSDVD
SRSRS SHSHSQSRGRGRGRSVDSASPGRQSPSPRSASP RSPSPRGESPERNGDGGRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSQPNSDVD
Subjt: SRSRSHSHSHSQSRGRGRGRSVDSASPGRQSPSPRSASPQRSPSPRGESPERNGDGGRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSQPNSDVD
|
|
| A0A6J1HG77 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like isoform X1 | 2.1e-142 | 98.6 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKVSESFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYIDERRSRSR
IHKGKVSESFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYIDERRSRSR
Subjt: IHKGKVSESFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYIDERRSRSR
Query: SRSRSHSHSHSQSRGRGRGRSVDS-ASPGRQSPSPRSASPQRSPSPRGESPERNGDGGRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSQPNSDVD
SRSRS SHSHSQSRGRGRGRSVD ASPGRQSPSPRSASP RSPSPRGESPERNGDGGRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSQPNSDVD
Subjt: SRSRSHSHSHSQSRGRGRGRSVDS-ASPGRQSPSPRSASPQRSPSPRGESPERNGDGGRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSQPNSDVD
|
|
| A0A6J1HHW9 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like isoform X3 | 2.1e-142 | 98.6 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKVSESFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYIDERRSRSR
IHKGKVSESFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYIDERRSRSR
Subjt: IHKGKVSESFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYIDERRSRSR
Query: SRSRSHSHSHSQSRGRGRGRSVDS-ASPGRQSPSPRSASPQRSPSPRGESPERNGDGGRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSQPNSDVD
SRSRS SHSHSQSRGRGRGRSVD ASPGRQSPSPRSASP RSPSPRGESPERNGDGGRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSQPNSDVD
Subjt: SRSRSHSHSHSQSRGRGRGRSVDS-ASPGRQSPSPRSASPQRSPSPRGESPERNGDGGRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSQPNSDVD
|
|
| A0A6J1HVK2 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like isoform X2 | 1.2e-137 | 96.5 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKVSESFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYIDERRSRSR
IHKGKVSESFPKSR RSRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY+DERRSRSR
Subjt: IHKGKVSESFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYIDERRSRSR
Query: SRSRSHSHSHSQSRGRGRGRSVDSASPGRQSPSP-RSASPQRSPSPRGESPERNGDGGRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSQPNSDVD
SR SHS+SQ+RGRGRGRSVDSASPGRQSPSP RSASPQRSPSPRGES ERNGDGGRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSQPNSDVD
Subjt: SRSRSHSHSHSQSRGRGRGRSVDSASPGRQSPSP-RSASPQRSPSPRGESPERNGDGGRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSQPNSDVD
|
|
| A0A6J1HX79 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like isoform X3 | 1.1e-135 | 95.82 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKVSESFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYIDERRSRSR
IHKGKVSESFPKSR RSRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY+DERRSRSR
Subjt: IHKGKVSESFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYIDERRSRSR
Query: SRSRSHSHSHSQSRGRGRGRSVDS-ASPGRQSPSP-RSASPQRSPSPRGESPERNGDGGRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSQPNSDVD
SR SHS+SQ+RGRGRGRSVD ASPGRQSPSP RSASPQRSPSPRGES ERNGDGGRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSQPNSDVD
Subjt: SRSRSHSHSHSQSRGRGRGRSVDS-ASPGRQSPSP-RSASPQRSPSPRGESPERNGDGGRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSQPNSDVD
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P30352 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 1.7e-27 | 42.74 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A++ +DG V+DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKVSESFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYIDERRS--RS
+G + S Y RSRSPRR RRRSRSRSRSRS R R R R R +SR S+ R R R + RS RS
Subjt: HKGKVSESFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYIDERRS--RS
Query: RSRSRSHSHSHSQSRGRGRGRSVDSASPGRQSPSPRSASPQRSPSPRG
+S+S S S S S+SR R R RS S + RS SP +SP G
Subjt: RSRSRSHSHSHSQSRGRGRGRSVDSASPGRQSPSPRSASPQRSPSPRG
|
|
| Q06A98 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 3.7e-27 | 42.74 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A++ +DG V+DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKVSESFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYIDERRS--RS
+G + Y RSRSPRR RRRSRSRSRSRS R R R R R +SR S+ R R R + RS RS
Subjt: HKGKVSESFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYIDERRS--RS
Query: RSRSRSHSHSHSQSRGRGRGRSVDSASPGRQSPSPRSASPQRSPSPRG
+S+S S S S S+SR R R RS AS RS SP +SP G
Subjt: RSRSRSHSHSHSQSRGRGRGRSVDSASPGRQSPSPRSASPQRSPSPRG
|
|
| Q3MHR5 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 1.1e-26 | 42.34 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A++ +DG V+DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKVSESFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYIDERRS--RS
+G + Y RSRSPRR RRRSRSRSRSRS R R R R R +SR S+ R R R + RS RS
Subjt: HKGKVSESFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYIDERRS--RS
Query: RSRSRSHSHSHSQSRGRGRGRSVDSASPGRQSPSPRSASPQRSPSPRG
+S+S S S S S+SR R R RS S RS SP +SP G
Subjt: RSRSRSHSHSHSQSRGRGRGRSVDSASPGRQSPSPRSASPQRSPSPRG
|
|
| Q5R1W5 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 6.4e-27 | 42.69 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A++ +DG V+DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKVSESFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYIDERRSRSRS
+G + Y RSRSPRR RRRSRSRSRSRS R R R R R +SR S+ R R R + RS RS
Subjt: HKGKVSESFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYIDERRSRSRS
Query: RSRSHSHSHSQSRGRGRGRSVDSASPGRQSPSPRSASPQRSPSPRGESPERNG
+S+S S S S+SR R R RS ++ P RS RS SP ESPE G
Subjt: RSRSHSHSHSQSRGRGRGRSVDSASPGRQSPSPRSASPQRSPSPRGESPERNG
|
|
| Q9FMG4 Serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 5.9e-65 | 59.08 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDI+DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KAVERLDG VVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKVSESFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRR
I KG+V E PKSR RSRSPRRR RDD+R++DYR+RSRSRS +DRR R E++RD+RRR+RS R
Subjt: IHKGKVSESFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRR
Query: PSPDYSKGRGRGRYIDERRSRSRSRS-----RSHSHSHSQSRGRGRGRSVDSASPGRQSPSPRSASPQRSPSPRGESPERNGDGGRSPTSRSVSPRGQPA
SPD K R RGRY +E RS SRS S RS S Q R S D S +SPSPR + RSP+ + SP + R RS SP G PA
Subjt: PSPDYSKGRGRGRYIDERRSRSRSRS-----RSHSHSHSQSRGRGRGRSVDSASPGRQSPSPRSASPQRSPSPRGESPERNGDGGRSPTSRSVSPRGQPA
Query: DSR
R
Subjt: DSR
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G55310.1 SC35-like splicing factor 33 | 2.7e-12 | 37.91 | Show/hide |
Query: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKVSESFPKSRYR
SLLV N+ +DL F ++G V DI++PRD TGD RGF FV++ +A A +DG ++ GRE+TV FA+ R
Subjt: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKVSESFPKSRYR
Query: SRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDY------RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYIDERRSRS----RSRSRSH
+ R R R R RD RRR+ R SRS R RRGR R R DY R RSISPR D + R D R RS R +SRS
Subjt: SRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDY------RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYIDERRSRS----RSRSRSH
Query: SHSHSQSRGRGRGRSVDSASPGRQSPSPR---SASPQRSPSPRGESPERNGDGGRSPTSRSVSPR-GQPADSRSPSQ
S S +S R RS + +S SPR S SP+RS SPR + R SRS SP GQ + RSPSQ
Subjt: SHSHSQSRGRGRGRSVDSASPGRQSPSPR---SASPQRSPSPRGESPERNGDGGRSPTSRSVSPR-GQPADSRSPSQ
|
|
| AT1G55310.3 SC35-like splicing factor 33 | 1.6e-12 | 35.99 | Show/hide |
Query: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTG------------DSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKG
SLLV N+ +DL F ++G V DI++PRD TG D RGF FV++ +A A +DG ++ GRE+TV FA+ N ++ +
Subjt: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTG------------DSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKG
Query: KVSESFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDY------RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYIDERRSR
+ E SR+R R R+P R + SRSRS RRGR R R DY R RSISPR D + R D R R
Subjt: KVSESFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDY------RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYIDERRSR
Query: S----RSRSRSHSHSHSQSRGRGRGRSVDSASPGRQSPSPR---SASPQRSPSPRGESPERNGDGGRSPTSRSVSPR-GQPADSRSPSQ
S R +SRS S S +S R RS + +S SPR S SP+RS SPR + R SRS SP GQ + RSPSQ
Subjt: S----RSRSRSHSHSHSQSRGRGRGRSVDSASPGRQSPSPR---SASPQRSPSPRGESPERNGDGGRSPTSRSVSPR-GQPADSRSPSQ
|
|
| AT3G13570.1 SC35-like splicing factor 30A | 5.0e-11 | 32.85 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYGPNAERIHK
FG S D+ SLLV N+ +DL F ++G V DI++PRD TGD RGF F+++ +A +A ++DG ++ GRE+TV FA+ N ++ +
Subjt: FGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYGPNAERIHK
Query: GKVSESFPKS-RYRSRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYIDERRSRSRSR
+ + +S R++ R RSP R R R R RSRSR + + R +SRS+SP+ D R + RS
Subjt: GKVSESFPKS-RYRSRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYIDERRSRSRSR
Query: SRSHSHSHSQSRGRGRGRSVDSASPGRQSPSPRSASPQRSPSPRGESPERNGDGGRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSQ
SRS H+ S+ R GR + R+S SPR R +SP RSPT PRG RSPSQ
Subjt: SRSHSHSHSQSRGRGRGRSVDSASPGRQSPSPRSASPQRSPSPRGESPERNGDGGRSPTSRSVSPRGQPADSRSPSQ
|
|
| AT5G64200.1 ortholog of human splicing factor SC35 | 4.2e-66 | 59.08 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDI+DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KAVERLDG VVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKVSESFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRR
I KG+V E PKSR RSRSPRRR RDD+R++DYR+RSRSRS +DRR R E++RD+RRR+RS R
Subjt: IHKGKVSESFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRR
Query: PSPDYSKGRGRGRYIDERRSRSRSRS-----RSHSHSHSQSRGRGRGRSVDSASPGRQSPSPRSASPQRSPSPRGESPERNGDGGRSPTSRSVSPRGQPA
SPD K R RGRY +E RS SRS S RS S Q R S D S +SPSPR + RSP+ + SP + R RS SP G PA
Subjt: PSPDYSKGRGRGRYIDERRSRSRSRS-----RSHSHSHSQSRGRGRGRSVDSASPGRQSPSPRSASPQRSPSPRGESPERNGDGGRSPTSRSVSPRGQPA
Query: DSR
R
Subjt: DSR
|
|
| AT5G64200.2 ortholog of human splicing factor SC35 | 4.2e-66 | 59.08 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDI+DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KAVERLDG VVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDIADTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGIVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKVSESFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRR
I KG+V E PKSR RSRSPRRR RDD+R++DYR+RSRSRS +DRR R E++RD+RRR+RS R
Subjt: IHKGKVSESFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRIDHDRRGRERERERDYRRRSRSISPRR
Query: PSPDYSKGRGRGRYIDERRSRSRSRS-----RSHSHSHSQSRGRGRGRSVDSASPGRQSPSPRSASPQRSPSPRGESPERNGDGGRSPTSRSVSPRGQPA
SPD K R RGRY +E RS SRS S RS S Q R S D S +SPSPR + RSP+ + SP + R RS SP G PA
Subjt: PSPDYSKGRGRGRYIDERRSRSRSRS-----RSHSHSHSQSRGRGRGRSVDSASPGRQSPSPRSASPQRSPSPRGESPERNGDGGRSPTSRSVSPRGQPA
Query: DSR
R
Subjt: DSR
|
|
