; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg24515 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg24515
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptiontranscriptional regulator SUPERMAN
Genome locationCarg_Chr19:1876133..1876840
RNA-Seq ExpressionCarg24515
SyntenyCarg24515
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR013087 - Zinc finger C2H2-type
IPR036236 - Zinc finger C2H2 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6571672.1 Zinc finger protein 10, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.3e-13097.87Show/hide
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KAG7011397.1 Zinc finger protein 10, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.7e-133100Show/hide
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XP_022963778.1 transcriptional regulator SUPERMAN [Cucurbita moschata]5.5e-12494.47Show/hide
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XP_022967174.1 transcriptional regulator SUPERMAN [Cucurbita maxima]1.1e-11694.55Show/hide
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XP_023511530.1 transcriptional regulator SUPERMAN-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.1e-12293.19Show/hide
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        P SNP KPSSSSS ISNSFIIPPPDFNGGGLCLLYQFPNPNGINGGINIPSLFS SNHSFN+FLPS AMSRG PVN H LGGLGESN SR EQ FSTSME
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LF36 C2H2-type domain-containing protein1.0e-7563.57Show/hide
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           + N  R E   +S SMEN N    + LDLELRLGHG P ST+ L+E G+K         + +RSSD
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A0A1S3CRJ1 transcriptional regulator SUPERMAN-like4.6e-7663.7Show/hide
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        MA +L LGFQ+  SLP   ET RDG N NG+NPMQTPDVV   DDDDSWEVRAFAEDT NVMGTTWPPRSYTCTYCRREF+SAQALGGHMNVHRRDRARL
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         HQAP   SNPMKPSS+SS  SNSFIIP PDFNGGG LCLLYQFPNPN INGGIN              SLFS  +HSFN++  ST++S  FP+N     
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           ++N  R E   +S SMEN N     + LDLELRLGHG P ST+ L+E G+K         + KRSSD
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A0A5D3E693 Transcriptional regulator SUPERMAN-like4.6e-7663.7Show/hide
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         HQAP   SNPMKPSS+SS  SNSFIIP PDFNGGG LCLLYQFPNPN INGGIN              SLFS  +HSFN++  ST++S  FP+N     
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           ++N  R E   +S SMEN N     + LDLELRLGHG P ST+ L+E G+K         + KRSSD
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A0A6J1HIW9 transcriptional regulator SUPERMAN2.6e-12494.47Show/hide
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A0A6J1HW10 transcriptional regulator SUPERMAN5.4e-11794.55Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80942 Zinc finger protein 106.5e-1966.22Show/hide
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        ++ + SWE  AFAED  +  G+ WPPRSYTC++CRREFKSAQALGGHMNVHRRDRARL QA     + P SSSS
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Q38895 Transcriptional regulator SUPERMAN6.7e-1638.29Show/hide
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        +D   ++G +WPPRSYTC++C+REF+SAQALGGHMNVHRRDRA  RL Q+P S+         P+ S S ++NS   PPP  +   L      P+     
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         G+ I SL   S H+  +   +   S         R        + R ++  S  +E G      Q+LDLELRLG
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Q9LHS9 Probable transcriptional regulator RABBIT EARS1.3e-1465.67Show/hide
Query:  EVRAF--AEDTRNVMGTTWPPRSYTCTYCRREFKSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAPLSNPMKPSSS
        E RAF  AE+     G  WPPRSY+C++C REFKSAQALGGHMNVHRRDRARL Q  LS    PSS+
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Q9SLB8 Zinc finger protein 116.9e-1334.27Show/hide
Query:  WPPRSYTCTYCRREFKSAQALGGHMNVHRRDRARL-----------HQAPLSNPMKPSSSSSLISNSFIIPPPDFNGGGL------CLLYQFPNPNGING
        WPP++YTC++CRREF+SAQALGGHMNVHRRDRA+L           H  P++NP    SSSS  S +     P                +   +     G
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Query:  GINIPSLFSTSNHSFNSFLPST---------AMSRGFPVNHHRLGGLGESNLSRFEQPFSTSMENGNQELDLELRLGH
        G+ +    + SN        S           +SRG  +N      +G             S+ N NQ LDLELRLG+
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Q9SR34 Transcriptional regulator TAC12.0e-0743.48Show/hide
Query:  MQTPDVVTDADDDDSWEVRAFAEDTRNVMGTTWPPRSYTCTYCRREFKSAQALGGHMNVHRRDRARLHQ
        ++ P    D  D  S       +D+ N        RSY C++C R F +AQALGGHMN+HRRDRA+L Q
Subjt:  MQTPDVVTDADDDDSWEVRAFAEDTRNVMGTTWPPRSYTCTYCRREFKSAQALGGHMNVHRRDRARLHQ

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G37740.1 zinc-finger protein 104.6e-2066.22Show/hide
Query:  ADDDDSWEVRAFAEDTRNVMGTTWPPRSYTCTYCRREFKSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAPLSNPMKPSSSSS
        ++ + SWE  AFAED  +  G+ WPPRSYTC++CRREFKSAQALGGHMNVHRRDRARL QA     + P SSSS
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AT2G42410.1 zinc finger protein 114.9e-1434.27Show/hide
Query:  WPPRSYTCTYCRREFKSAQALGGHMNVHRRDRARL-----------HQAPLSNPMKPSSSSSLISNSFIIPPPDFNGGGL------CLLYQFPNPNGING
        WPP++YTC++CRREF+SAQALGGHMNVHRRDRA+L           H  P++NP    SSSS  S +     P                +   +     G
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Query:  GINIPSLFSTSNHSFNSFLPST---------AMSRGFPVNHHRLGGLGESNLSRFEQPFSTSMENGNQELDLELRLGH
        G+ +    + SN        S           +SRG  +N      +G             S+ N NQ LDLELRLG+
Subjt:  GINIPSLFSTSNHSFNSFLPST---------AMSRGFPVNHHRLGGLGESNLSRFEQPFSTSMENGNQELDLELRLGH

AT3G23130.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein4.8e-1738.29Show/hide
Query:  EDTRNVMGTTWPPRSYTCTYCRREFKSAQALGGHMNVHRRDRA--RLHQAPLSNPM------KPSSSSSLISNSFIIPPPDFNGGGLCLLYQFPNPNGIN
        +D   ++G +WPPRSYTC++C+REF+SAQALGGHMNVHRRDRA  RL Q+P S+         P+ S S ++NS   PPP  +   L      P+     
Subjt:  EDTRNVMGTTWPPRSYTCTYCRREFKSAQALGGHMNVHRRDRA--RLHQAPLSNPM------KPSSSSSLISNSFIIPPPDFNGGGLCLLYQFPNPNGIN

Query:  GGINIPSLFSTSNHSFNSFLPSTAMSRGFPVNH-HRLGGLGESNLSRFEQPFSTSMENG-----NQELDLELRLG
         G+ I SL   S H+  +   +   S         R        + R ++  S  +E G      Q+LDLELRLG
Subjt:  GGINIPSLFSTSNHSFNSFLPSTAMSRGFPVNH-HRLGGLGESNLSRFEQPFSTSMENG-----NQELDLELRLG

AT4G17810.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein5.4e-2941.35Show/hide
Query:  LNGLNPMQTPDVVTD-ADDDDSWEVRAFAEDTR-NVMGTTWPPRSYTCTYCRREFKSAQALGGHMNVHRRDRA--RLHQAPLSNPMKPSSSSSLISNSFI
        +NG   M  P+ + +  DDD+SWEV+AF +DT+ N+ GTTWPPRSYTC +CRREF+SAQALGGHMNVHRRDRA  R HQ         S    ++ NS  
Subjt:  LNGLNPMQTPDVVTD-ADDDDSWEVRAFAEDTR-NVMGTTWPPRSYTCTYCRREFKSAQALGGHMNVHRRDRA--RLHQAPLSNPMKPSSSSSLISNSFI

Query:  IPPPD---------FNGGGLCLLYQFPNPNGINGGI-NIPSLFSTSNHSFNSFLPSTAMSRGFPVNHHRL--GGLGESNLSRFEQPFSTSMENGNQELDL
         P P           N  GL   YQ  NP+GI G   ++ +L+ T++    S LP + ++    V    +      + ++   ++   TS++    ELDL
Subjt:  IPPPD---------FNGGGLCLLYQFPNPNGINGGI-NIPSLFSTSNHSFNSFLPSTAMSRGFPVNHHRL--GGLGESNLSRFEQPFSTSMENGNQELDL

Query:  ELRLGHGP
        ELRLGH P
Subjt:  ELRLGHGP

AT5G06070.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein9.0e-1665.67Show/hide
Query:  EVRAF--AEDTRNVMGTTWPPRSYTCTYCRREFKSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAPLSNPMKPSSS
        E RAF  AE+     G  WPPRSY+C++C REFKSAQALGGHMNVHRRDRARL Q  LS    PSS+
Subjt:  EVRAF--AEDTRNVMGTTWPPRSYTCTYCRREFKSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAPLSNPMKPSSS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTACTAAGCTTGAGCTTGGATTCCAACACGATCCTTCTTTGCCTGAAACGGTTCGTGACGGGTGGAATCTGAACGGTTTAAACCCTATGCAAACTCCCGACGTCGT
TACAGATGCCGATGACGATGACTCGTGGGAAGTCAGAGCTTTCGCCGAGGACACTCGTAATGTTATGGGAACTACTTGGCCTCCTAGGTCATATACTTGCACTTATTGTA
GAAGAGAGTTCAAATCAGCTCAAGCCCTAGGAGGTCATATGAATGTTCACCGTCGCGACCGTGCTCGCCTCCATCAAGCTCCTCTGTCGAATCCAATGAAACCCTCTTCG
TCGTCTTCCTTGATTTCCAATTCTTTCATCATCCCACCTCCTGATTTTAATGGTGGAGGCTTGTGCCTTCTCTACCAATTCCCAAACCCTAATGGTATTAATGGTGGGAT
CAATATCCCTTCTCTTTTCTCCACGTCCAATCATTCCTTCAATAGCTTTCTGCCCTCCACGGCGATGTCTCGGGGTTTTCCGGTGAACCACCACCGTCTCGGAGGGCTCG
GAGAGAGTAATTTATCTCGATTTGAACAACCGTTCTCGACGTCCATGGAAAATGGAAACCAAGAACTTGATCTGGAGCTCAGGCTTGGACACGGTCCAGATTCGACTCGA
ACTCTCATCGAAAATGGACAGAAGATCTCTAAGAGATCATCAGATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTACTAAGCTTGAGCTTGGATTCCAACACGATCCTTCTTTGCCTGAAACGGTTCGTGACGGGTGGAATCTGAACGGTTTAAACCCTATGCAAACTCCCGACGTCGT
TACAGATGCCGATGACGATGACTCGTGGGAAGTCAGAGCTTTCGCCGAGGACACTCGTAATGTTATGGGAACTACTTGGCCTCCTAGGTCATATACTTGCACTTATTGTA
GAAGAGAGTTCAAATCAGCTCAAGCCCTAGGAGGTCATATGAATGTTCACCGTCGCGACCGTGCTCGCCTCCATCAAGCTCCTCTGTCGAATCCAATGAAACCCTCTTCG
TCGTCTTCCTTGATTTCCAATTCTTTCATCATCCCACCTCCTGATTTTAATGGTGGAGGCTTGTGCCTTCTCTACCAATTCCCAAACCCTAATGGTATTAATGGTGGGAT
CAATATCCCTTCTCTTTTCTCCACGTCCAATCATTCCTTCAATAGCTTTCTGCCCTCCACGGCGATGTCTCGGGGTTTTCCGGTGAACCACCACCGTCTCGGAGGGCTCG
GAGAGAGTAATTTATCTCGATTTGAACAACCGTTCTCGACGTCCATGGAAAATGGAAACCAAGAACTTGATCTGGAGCTCAGGCTTGGACACGGTCCAGATTCGACTCGA
ACTCTCATCGAAAATGGACAGAAGATCTCTAAGAGATCATCAGATTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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SSSLISNSFIIPPPDFNGGGLCLLYQFPNPNGINGGINIPSLFSTSNHSFNSFLPSTAMSRGFPVNHHRLGGLGESNLSRFEQPFSTSMENGNQELDLELRLGHGPDSTR
TLIENGQKISKRSSD