; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg24536 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg24536
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionprotein SAMBA isoform X2
Genome locationCarg_Chr19:1648769..1652213
RNA-Seq ExpressionCarg24536
SyntenyCarg24536
Gene Ontology termsGO:0046621 - negative regulation of organ growth (biological process)
GO:0010997 - anaphase-promoting complex binding (molecular function)
InterPro domainsIPR037547 - Protein SAMBA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6571647.1 Protein SAMBA, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.1e-4498.99Show/hide
Query:  MNTSSPANSSISTTPVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLVSLQERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGAHFLKKTEEKTR
        MNTSSPANSSISTTPVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLVSLQERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGAHFLKK EEKTR
Subjt:  MNTSSPANSSISTTPVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLVSLQERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGAHFLKKTEEKTR
XP_022131248.1 protein SAMBA isoform X2 [Momordica charantia]3.0e-3988.89Show/hide
Query:  MNTSSPANSSISTTPVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLVSLQERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGAHFLKKTEEKTR
        MN+SSPANSSISTT VAGRC+TNAAMS+DDFRFPANL+S+ ERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDD+WMFEGPRSRINLMSRQG  FLKKTEEK R
Subjt:  MNTSSPANSSISTTPVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLVSLQERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGAHFLKKTEEKTR
XP_022963561.1 protein SAMBA isoform X2 [Cucurbita moschata]2.8e-45100Show/hide
Query:  MNTSSPANSSISTTPVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLVSLQERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGAHFLKKTEEKTR
        MNTSSPANSSISTTPVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLVSLQERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGAHFLKKTEEKTR
Subjt:  MNTSSPANSSISTTPVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLVSLQERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGAHFLKKTEEKTR
XP_022967351.1 protein SAMBA isoform X2 [Cucurbita maxima]4.4e-4396.97Show/hide
Query:  MNTSSPANSSISTTPVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLVSLQERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGAHFLKKTEEKTR
        M TSSPANSSISTTPVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLVSLQERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINL SRQG HFLKKTEEKTR
Subjt:  MNTSSPANSSISTTPVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLVSLQERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGAHFLKKTEEKTR
XP_038888368.1 protein SAMBA isoform X2 [Benincasa hispida]9.3e-4190.91Show/hide
Query:  MNTSSPANSSISTTPVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLVSLQERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGAHFLKKTEEKTR
        MNTSSPANSSISTT VAGRC+TNAAMSLDDFRFPANL+S+ ERKDEAM+ALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMS+QG HFLKKTEEK R
Subjt:  MNTSSPANSSISTTPVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLVSLQERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGAHFLKKTEEKTR
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LK11 Uncharacterized protein5.5e-3986.87Show/hide
Query:  MNTSSPANSSISTTPVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLVSLQERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGAHFLKKTEEKTR
        MNT SPANSS+STT VAGRC+TNAA+SLDDFRFP+NL+S+ ERKDEAM+ALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQG  FLKKTEEK R
Subjt:  MNTSSPANSSISTTPVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLVSLQERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGAHFLKKTEEKTR
A0A6J1BST3 protein SAMBA isoform X21.4e-3988.89Show/hide
Query:  MNTSSPANSSISTTPVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLVSLQERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGAHFLKKTEEKTR
        MN+SSPANSSISTT VAGRC+TNAAMS+DDFRFPANL+S+ ERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDD+WMFEGPRSRINLMSRQG  FLKKTEEK R
Subjt:  MNTSSPANSSISTTPVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLVSLQERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGAHFLKKTEEKTR
A0A6J1HGF1 protein SAMBA isoform X21.3e-45100Show/hide
Query:  MNTSSPANSSISTTPVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLVSLQERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGAHFLKKTEEKTR
        MNTSSPANSSISTTPVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLVSLQERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGAHFLKKTEEKTR
Subjt:  MNTSSPANSSISTTPVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLVSLQERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGAHFLKKTEEKTR
A0A6J1HIC3 protein SAMBA isoform X12.5e-3998.88Show/hide
Query:  MNTSSPANSSISTTPVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLVSLQERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGAH
        MNTSSPANSSISTTPVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLVSLQERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGA+
Subjt:  MNTSSPANSSISTTPVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLVSLQERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGAH
A0A6J1HRR3 protein SAMBA isoform X22.2e-4396.97Show/hide
Query:  MNTSSPANSSISTTPVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLVSLQERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGAHFLKKTEEKTR
        M TSSPANSSISTTPVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLVSLQERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINL SRQG HFLKKTEEKTR
Subjt:  MNTSSPANSSISTTPVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLVSLQERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGAHFLKKTEEKTR
SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9C613 Protein SAMBA9.1e-2360.82Show/hide
Query:  MNTSSPANSSISTTPVA-GRCTTNAAMSLDDFRFPANLVSLQERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGAHFLKKTEE
        MN +SPA+S +STT VA G  ++ AA  LDDF FP ++ S+QERKDEAM  LK+++M  L+KEVKSL++D+WMFEGPRSRI+L+SR+G +FLKK  E
Subjt:  MNTSSPANSSISTTPVA-GRCTTNAAMSLDDFRFPANLVSLQERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGAHFLKKTEE
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G32310.1 unknown protein6.4e-2460.82Show/hide
Query:  MNTSSPANSSISTTPVA-GRCTTNAAMSLDDFRFPANLVSLQERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGAHFLKKTEE
        MN +SPA+S +STT VA G  ++ AA  LDDF FP ++ S+QERKDEAM  LK+++M  L+KEVKSL++D+WMFEGPRSRI+L+SR+G +FLKK  E
Subjt:  MNTSSPANSSISTTPVA-GRCTTNAAMSLDDFRFPANLVSLQERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGAHFLKKTEE

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAATACCTCGTCGCCGGCTAATTCTTCCATTTCTACCACACCGGTTGCCGGAAGATGTACCACTAATGCCGCAATGTCTCTTGACGATTTTCGCTTCCCCGCCAATTT
AGTTTCCCTACAAGAGCGCAAGGACGAGGCCATGAGCGCTCTTAAATCTAATATAATGGCTGCACTGAACAAGGAGGTCAAATCTCTGGATGATGATAACTGGATGTTTG
AAGGTCCTCGCTCTCGTATCAACCTTATGTCACGACAAGGTGCTCATTTCCTCAAAAAGACAGAAGAGAAAACAAGATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TGTATCTCATGTTTAAAAAATAAATGGTCATGTATATAAATCCTCGAAGCGCTTCAAATTGACAGCAGAAATTCAAAACCCTTATCTTCTCCAATCTCCATTGCTCAATT
TTCCTCTCAGACCCCTTCGTTGCATTTGCTGTTTTCCTTGTTGCTAAACGTTGATCTGACTTCTGATTCCTGTACAGTTCTAGGGCTTACTTCATTCGAAATTTGGGATC
GCAATGAATACCTCGTCGCCGGCTAATTCTTCCATTTCTACCACACCGGTTGCCGGAAGATGTACCACTAATGCCGCAATGTCTCTTGACGATTTTCGCTTCCCCGCCAA
TTTAGTTTCCCTACAAGAGCGCAAGGACGAGGCCATGAGCGCTCTTAAATCTAATATAATGGCTGCACTGAACAAGGAGGTCAAATCTCTGGATGATGATAACTGGATGT
TTGAAGGTCCTCGCTCTCGTATCAACCTTATGTCACGACAAGGTGCTCATTTCCTCAAAAAGACAGAAGAGAAAACAAGATAATGGGCCAGCTTGATCATAATCTCAGTA
CAGTTCTTCAGTAGAGTTCTTCAGCCTCATTCCCACAATCCAATCAACTAATCCTTCTATTCTATTTTTAATTTTTCTTTAGCTGTTTAAGGGTTTGCAAATGCTTGTTC
AAATCAAACCTTGCTTCACATGTTTGGATAATTTTTTTATCTTCCTCGTTTTTCTACTTATTTTTAAAACGTTTATACATCGAAAACATATATTTTGAAAGTTTAGAGAT
AAAAAAATATATATGTTCGAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MNTSSPANSSISTTPVAGRCTTNAAMSLDDFRFPANLVSLQERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGAHFLKKTEEKTR