; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg24595 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg24595
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionglycine-rich cell wall structural protein 1-like
Genome locationCarg_Chr19:2472011..2472742
RNA-Seq ExpressionCarg24595
SyntenyCarg24595
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8647333.1 hypothetical protein Csa_003353 [Cucumis sativus]2.4e-1356.88Show/hide
Query:  GRGGEAIGGMLGRGGDAIGGTIGRGGEAIGGLLG-----PGEIMGRGGEAIGGIMGRGGKAIGGIV--GGKAIGGMLGRGGKAIGGMLGRGGEV-----G
        GRGG+  G +L RGG+A+G TIGRGGEA+G + G      GEI+GRGGEA+G  MGRGGKAIG I   GG AIG ++GR G  +G MLGRGG+V     G
Subjt:  GRGGEAIGGMLGRGGDAIGGTIGRGGEAIGGLLG-----PGEIMGRGGEAIGGIMGRGGKAIGGIV--GGKAIGGMLGRGGKAIGGMLGRGGEV-----G

Query:  GMLGRGGGGGGCGIVVGGGGGGGG---GGGGGIVVGGGGGGGLRGNIGGSIKG-GRIGRGGRRIGGIGIR--GGRRIGGIGTRGGRRIG-GIGTRGGRRI
        G  GRG GGGG G    GGGGGGG   GGGGG   GGGGGGG RG  GG  +G G  G GGR +GG G R  GG   GG G  GG  +G G G  GGR +
Subjt:  GMLGRGGGGGGCGIVVGGGGGGGG---GGGGGIVVGGGGGGGLRGNIGGSIKG-GRIGRGGRRIGGIGIR--GGRRIGGIGTRGGRRIG-GIGTRGGRRI

Query:  GGIGGRRIGGIGNGRVSN
        GG GGR  GG G GR  N
Subjt:  GGIGGRRIGGIGNGRVSN

KAG6571715.1 hypothetical protein SDJN03_28443, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.1e-2162.02Show/hide
Query:  MGRGGEAIGGMLGRGGDAIGGTIGRGGEAIGGLLG----PGEIMGRGGEAIGGIMGRGGKAIGGIV--GGKAIGGMLGRGGKAIGGMLGRGGE-VGGMLG
        MGRGGEAIGGMLGRGGDA+GGTIGRGGEAIGG+LG     GE+MGRGGEAIGG++GRGG A+GG +  GG+AIGGMLGRGGK +G M+GRGGE +GGMLG
Subjt:  MGRGGEAIGGMLGRGGDAIGGTIGRGGEAIGGLLG----PGEIMGRGGEAIGGIMGRGGKAIGGIV--GGKAIGGMLGRGGKAIGGMLGRGGE-VGGMLG

Query:  RGGGGGGCGIVVGG---GGGGGGGGGGGIVVGGGGG--GGLRGNIGGSIKGGRIGRGGRRIGGIGIRGGRRIGGIGTRGGRRIGGIGTRGGRRIGGI---
        RGG   G  I  GG   GG  G GG  G ++G GG   GG+ G  GG   GG IGRGG  +GG+  RGG ++G I  RGG  IGG+  RGG  IGG    
Subjt:  RGGGGGGCGIVVGG---GGGGGGGGGGGIVVGGGGG--GGLRGNIGGSIKGGRIGRGGRRIGGIGIRGGRRIGGIGTRGGRRIGGIGTRGGRRIGGI---

Query:  GGRRIGGI
        GG  IGG+
Subjt:  GGRRIGGI

KAG6571716.1 hypothetical protein SDJN03_28444, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.0e-29100Show/hide
Query:  MLGRGGKAIGGMLGRGGEVGGMLGRGGGGGGCGIVVGGGGGGGGGGGGGIVVGGGGGGGLRGNIGGSIKGGRIGRGGRRIGGIGIRGGRRIGGIGTRGG
        MLGRGGKAIGGMLGRGGEVGGMLGRGGGGGGCGIVVGGGGGGGGGGGGGIVVGGGGGGGLRGNIGGSIKGGRIGRGGRRIGGIGIRGGRRIGGIGTRGG
Subjt:  MLGRGGKAIGGMLGRGGEVGGMLGRGGGGGGCGIVVGGGGGGGGGGGGGIVVGGGGGGGLRGNIGGSIKGGRIGRGGRRIGGIGIRGGRRIGGIGTRGG

KAG7011439.1 hypothetical protein SDJN02_26344, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.9e-1857.94Show/hide
Query:  RGGEAIGGMLGRGGDAIGGTIGRGGEAIGGLLG----PGEIMGRGGEAIGGIMGRGGKAIGGIV--GGKAIGGMLGRGGKAIGGMLGRGGEVGGMLGRGG
        RGGEAIGGM+G GGDAIGG IGRGGEAIGG+LG     GE+MGRGGEAIGG++GRGG AIG +   GG A+GGM GRGG+A GGMLGRGGEVG M+GRGG
Subjt:  RGGEAIGGMLGRGGDAIGGTIGRGGEAIGGLLG----PGEIMGRGGEAIGGIMGRGGKAIGGIV--GGKAIGGMLGRGGKAIGGMLGRGGEVGGMLGRGG

Query:  ---------GGGGCGIVVGGGGGGGGG--GGGGIVVGGG-GGGGLRGNI---GGSIKGGRIGRGGRRIGGIGIRGGRRIGGIGTRGGRRIGGIGTRGGRR
                 GG   G ++G GG   GG  G GG  +GG  G GG  G +   GG   GG +GRGG  IGG   RGG  IGG+  RGG ++G +  RGG  
Subjt:  ---------GGGGCGIVVGGGGGGGGG--GGGGIVVGGG-GGGGLRGNI---GGSIKGGRIGRGGRRIGGIGIRGGRRIGGIGTRGGRRIGGIGTRGGRR

Query:  IGGI---GGRRIGG
        IGG+   GG  IGG
Subjt:  IGGI---GGRRIGG

KAG7022577.1 hypothetical protein SDJN02_16311, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.7e-1465.05Show/hide
Query:  MGRGGEAIGGMLGRGGDAIGGTIGRGGEAIGGLLGPGEIMGRGGEAIGGIMGRGGKAIGGIV--GGKAIGGMLGRGGKAIGGMLGRGGEVGGML-GRGGG
        MGRGGEA G  LGRGG  +GG +GRGGEA+GG L      GRGGEA+GGI+GRGG+A+GG++  GG+  GGM GRGGKAIGGMLGRGGE  G++ GRGG 
Subjt:  MGRGGEAIGGMLGRGGDAIGGTIGRGGEAIGGLLGPGEIMGRGGEAIGGIMGRGGKAIGGIV--GGKAIGGMLGRGGKAIGGMLGRGGEVGGML-GRGGG

Query:  GGG
          G
Subjt:  GGG

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KHS4 Pollen coat oleosin-glycine rich protein5.5e-1657.41Show/hide
Query:  GRGGEAIGGMLGRGGDAIGGTIGRGGEAIGGLLG-----PGEIMGRGGEAIGGIMGRGGKAIGGIV--GGKAIGGMLGRGGKAIGGMLGRG----GEVGG
        GRGG A+G +LGRGG+ +G T+GRGG+AIG + G      GEI+GRGGE +G  MGRGGKAIG I   GG+A+G +LGRGG+ +G  +GRG    GE+ G
Subjt:  GRGGEAIGGMLGRGGDAIGGTIGRGGEAIGGLLG-----PGEIMGRGGEAIGGIMGRGGKAIGGIV--GGKAIGGMLGRGGKAIGGMLGRG----GEVGG

Query:  MLGRGGGGGGCGIVVGGGGGG----GGGGGGGIVVGGGGGGGLRGNIGGSIKGGR----IGRGGRRIGGIGIRGGRRIGGIGTRGGRRIGGIGTRGGRRI
          GR GGGGG G  VGGGGGG    GGGGGGG  VGGGGGGG RG +GG   GGR     G GGR +GG G  GGR +GG G  GGR +GG G  GGR +
Subjt:  MLGRGGGGGGCGIVVGGGGGG----GGGGGGGIVVGGGGGGGLRGNIGGSIKGGR----IGRGGRRIGGIGIRGGRRIGGIGTRGGRRIGGIGTRGGRRI

Query:  --GGIGGRRIGGIGNG
          GG GGR +GG G G
Subjt:  --GGIGGRRIGGIGNG

A0A1R3H0Z1 Uncharacterized protein4.8e-0452.24Show/hide
Query:  GRGGEAIGGMLGRGGDAIGGTIGRGGEAIGGLLGPGEIMGRGGEAIGGIMG---RGGKAIGGIVGGKAIGGMLGRGGKAIGGMLGRGGEVGGMLGRGGG-
        G GG   GG  GRGG  +GG +G GG   GG+ G     G GG  +GG +G    GG   GG VGG A GG+ G GG   GG  G GG VGG +G GGG 
Subjt:  GRGGEAIGGMLGRGGDAIGGTIGRGGEAIGGLLGPGEIMGRGGEAIGGIMG---RGGKAIGGIVGGKAIGGMLGRGGKAIGGMLGRGGEVGGMLGRGGG-

Query:  GGGCGIVVGGGGGG--GGGGGGGIVVGGGGGGGLRGNIGGSIKGGRIGRGGRRIGGIGIRGGRRIGGIGTRGGRRIGGIGTRGGRRIGGIGGRRIGGIGN
        GGG G  VGGGGGG  GGGGGGGI  G G GGG+ G++GG I GG +G GG   GG G  GG   G  G  GG R GG+G RGG   GG+GG   GG+G 
Subjt:  GGGCGIVVGGGGGG--GGGGGGGIVVGGGGGGGLRGNIGGSIKGGRIGRGGRRIGGIGIRGGRRIGGIGTRGGRRIGGIGTRGGRRIGGIGGRRIGGIGN

Query:  G
        G
Subjt:  G

A0A1S4DXM4 glycine-rich cell wall structural protein 1-like1.0e-0653.43Show/hide
Query:  MGRGGEAIGGMLGRGGDAIGGTIGRGGEAIGGLLGP-----GEIMGRGGEAIGGIMGRGGKAIGGIV--GGKAIGGMLGRGGKAIGGMLGRGGE-VGGML
        +GRGGEA G ++GRGG+A+G  +GRGG+A+G +LG      GEI+GRGG+ IG I GRGG+A+G I   GG+A+G +LGRGGKAIG +LGRGGE +G + 
Subjt:  MGRGGEAIGGMLGRGGDAIGGTIGRGGEAIGGLLGP-----GEIMGRGGEAIGGIMGRGGKAIGGIV--GGKAIGGMLGRGGKAIGGMLGRGGE-VGGML

Query:  GRGGGGGGCGIVVGGGGGGGGGG---GGGIVVGGGGGGGLRGNIGGSIKGGRIGRGGRRIGGIGIRGGRRIGGIGTRGGRRIGGIGTRGGRRIGG--IGG
        GRG G GG  I    G GG   G   G G+ +G   G G  G + G I GG  G GGR IGG G RGG  I      GGRR+GGI   G   IGG  IGG
Subjt:  GRGGGGGGCGIVVGGGGGGGGGG---GGGIVVGGGGGGGLRGNIGGSIKGGRIGRGGRRIGGIGIRGGRRIGGIGTRGGRRIGGIGTRGGRRIGG--IGG

Query:  RRIG
        RRIG
Subjt:  RRIG

A0A314Z4E6 Uncharacterized protein1.3e-0448.15Show/hide
Query:  GRGGEAIGGMLGRG-----------GDAIGGTIGRGGEAIGGLLGPGEIMGRGGEAIGGIMGRGGKAIGGIVGGKAIGGMLGRGGKAIGGMLGRGGEVGG
        G  G  IGG +G+G           G  +GG+IG+GG   GG+       G+GG  +GG +G+GG   GGI  G  +GG +G+GG  +GG +G+GG VGG
Subjt:  GRGGEAIGGMLGRG-----------GDAIGGTIGRGGEAIGGLLGPGEIMGRGGEAIGGIMGRGGKAIGGIVGGKAIGGMLGRGGKAIGGMLGRGGEVGG

Query:  MLGRGGGGGGCGIVVGGGGGGGGGGGGGIV---VGGGGGGGLRGNIGGSIKGGR-------IGRGGRRIGGIGIRGGRRIGGIGTRGGRRIGGIGTRGGR
         +G+GGG GG GI  GGG GGGGGG GG V   +GGG GGG+ G  GG I GG        +G GG   GGIG +GG   GGIG  GG   GG GT GG 
Subjt:  MLGRGGGGGGCGIVVGGGGGGGGGGGGGIV---VGGGGGGGLRGNIGGSIKGGR-------IGRGGRRIGGIGIRGGRRIGGIGTRGGRRIGGIGTRGGR

Query:  RIGGIGGRRIGGIGNG
          GGIGG   GGIG G
Subjt:  RIGGIGGRRIGGIGNG

A0A5D3CNE0 Glycine-rich cell wall structural protein 1.8-like3.2e-0852.04Show/hide
Query:  MGRGGEAIGGMLGRGGDAIGGTIGRGGEAIGGLLG-----PGEIMGRGGEAIGGIMGRGGKAIGGIV--GGKAIGGMLGRGGKAIGGMLGRGGE-VGGML
        +GRGGEA+G M+GRGG+AIG  IGRGG A+G +LG      GEI+GRGGEA+G I+GRGG+A+G I+  GG+A+G ++GRGG+AIG ++GRGGE +G +L
Subjt:  MGRGGEAIGGMLGRGGDAIGGTIGRGGEAIGGLLG-----PGEIMGRGGEAIGGIMGRGGKAIGGIV--GGKAIGGMLGRGGKAIGGMLGRGGE-VGGML

Query:  GRGG---------GGGGCGIVVGGGGG------GGGGGGGGIVVGGGGG--GGLRGNIGGSIKGGRI-GRGGRRIGGIGIRGGRRIGGIGTRGGRRIGGI
        GRGG         GG   G +VG GG       G GG   G + G GG   G + G  G +I  G I GRGG+ IG I  RGG  IG I  R G  IG +
Subjt:  GRGG---------GGGGCGIVVGGGGG------GGGGGGGGIVVGGGGG--GGLRGNIGGSIKGGRI-GRGGRRIGGIGIRGGRRIGGIGTRGGRRIGGI

Query:  GTRGGRRIGG--IGGRRIGGI
          RGG  IGG  IGGRR+GGI
Subjt:  GTRGGRRIGG--IGGRRIGGI

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G23450.1 unknown protein1.7e-0653.73Show/hide
Query:  MGRGGEAIGGMLGRGGDAIGGTIGRGGEAIGGLLGPGEIMGRG---GEAIGGIMGRGGKAIGGIVGGKAIGGMLGRGGKAIGGMLGRGGEVGGMLGRGGG
        +G+GG  IGG +G+GG  +GG IG+GG  IGG +G G  +G G   G  IGG +G+GG   GGI  G  +GG  G+GG  +GG +G+GG VGG  G+GGG
Subjt:  MGRGGEAIGGMLGRGGDAIGGTIGRGGEAIGGLLGPGEIMGRG---GEAIGGIMGRGGKAIGGIVGGKAIGGMLGRGGKAIGGMLGRGGEVGGMLGRGGG

Query:  GGGCGIVVGGGGGGGGGGGGGIVVGGGGGGGLRGNIG-GSIKGGRIGRGGRRIGGIGIRGGRRIGGIGTRGGRRIGGIGTRGGRRIGGIGG-RRIGGIGN
         GG GI  GGG GGG G GGGI  G G GGG+ G IG G   GG IG+GG   GGIG +GG   GGIG +GG   GGIG  GG  IGG GG  + GGIG 
Subjt:  GGGCGIVVGGGGGGGGGGGGGIVVGGGGGGGLRGNIG-GSIKGGRIGRGGRRIGGIGIRGGRRIGGIGTRGGRRIGGIGTRGGRRIGGIGG-RRIGGIGN

Query:  G
        G
Subjt:  G


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGACGAGGGGGCGAAGCCATTGGTGGAATGCTTGGACGAGGAGGTGATGCTATTGGTGGAACGATTGGACGAGGGGGTGAAGCCATTGGTGGATTACTAGGGCCTGG
TGAAATAATGGGACGAGGGGGCGAAGCCATTGGTGGAATCATGGGGCGTGGGGGCAAAGCAATTGGTGGAATAGTTGGAGGCAAAGCAATTGGTGGAATGTTGGGACGAG
GTGGTAAAGCCATAGGAGGAATGCTCGGAAGAGGCGGTGAAGTTGGTGGAATGTTGGGACGAGGTGGAGGAGGTGGTGGGTGTGGAATTGTAGTTGGTGGAGGAGGAGGC
GGTGGAGGAGGTGGTGGGGGTGGAATTGTAGTTGGAGGAGGAGGAGGTGGTGGTCTAAGAGGAAATATTGGTGGTAGTATTAAAGGTGGAAGAATAGGTAGAGGAGGGAG
ACGGATAGGCGGTATTGGTATAAGAGGAGGGAGACGGATAGGTGGTATTGGTACAAGAGGAGGGAGACGGATAGGTGGTATTGGTACAAGAGGAGGGAGACGGATAGGTG
GTATTGGAGGGAGACGGATAGGTGGTATTGGTAACGGGAGAGTAAGCAATTGTGAATTGACATGTTGGTCGGACGAGGAAGGTGTTTGTTGGAGACGGCGGGCTGCTTCA
CTCGCCTCAATATTCAAACAACATAAACTCACAAAAACACCAAACAACACAACTAAGGTCTTGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGACGAGGGGGCGAAGCCATTGGTGGAATGCTTGGACGAGGAGGTGATGCTATTGGTGGAACGATTGGACGAGGGGGTGAAGCCATTGGTGGATTACTAGGGCCTGG
TGAAATAATGGGACGAGGGGGCGAAGCCATTGGTGGAATCATGGGGCGTGGGGGCAAAGCAATTGGTGGAATAGTTGGAGGCAAAGCAATTGGTGGAATGTTGGGACGAG
GTGGTAAAGCCATAGGAGGAATGCTCGGAAGAGGCGGTGAAGTTGGTGGAATGTTGGGACGAGGTGGAGGAGGTGGTGGGTGTGGAATTGTAGTTGGTGGAGGAGGAGGC
GGTGGAGGAGGTGGTGGGGGTGGAATTGTAGTTGGAGGAGGAGGAGGTGGTGGTCTAAGAGGAAATATTGGTGGTAGTATTAAAGGTGGAAGAATAGGTAGAGGAGGGAG
ACGGATAGGCGGTATTGGTATAAGAGGAGGGAGACGGATAGGTGGTATTGGTACAAGAGGAGGGAGACGGATAGGTGGTATTGGTACAAGAGGAGGGAGACGGATAGGTG
GTATTGGAGGGAGACGGATAGGTGGTATTGGTAACGGGAGAGTAAGCAATTGTGAATTGACATGTTGGTCGGACGAGGAAGGTGTTTGTTGGAGACGGCGGGCTGCTTCA
CTCGCCTCAATATTCAAACAACATAAACTCACAAAAACACCAAACAACACAACTAAGGTCTTGTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGRGGEAIGGMLGRGGDAIGGTIGRGGEAIGGLLGPGEIMGRGGEAIGGIMGRGGKAIGGIVGGKAIGGMLGRGGKAIGGMLGRGGEVGGMLGRGGGGGGCGIVVGGGGG
GGGGGGGGIVVGGGGGGGLRGNIGGSIKGGRIGRGGRRIGGIGIRGGRRIGGIGTRGGRRIGGIGTRGGRRIGGIGGRRIGGIGNGRVSNCELTCWSDEEGVCWRRRAAS
LASIFKQHKLTKTPNNTTKVL