; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg24863 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg24863
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Description2-oxoglutarate-Fe(II) type oxidoreductase-like
Genome locationCarg_Chr16:9114280..9118439
RNA-Seq ExpressionCarg24863
SyntenyCarg24863
Gene Ontology termsGO:0016491 - oxidoreductase activity (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR026992 - Non-haem dioxygenase N-terminal domain
IPR027443 - Isopenicillin N synthase-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6577674.1 hypothetical protein SDJN03_25248, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.1e-9394.15Show/hide
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KAG7015711.1 hypothetical protein SDJN02_23348 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.1e-108100Show/hide
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XP_022923378.1 2-oxoglutarate-Fe(II) type oxidoreductase-like isoform X1 [Cucurbita moschata]1.0e-9495.21Show/hide
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XP_022923380.1 2-oxoglutarate-Fe(II) type oxidoreductase-like isoform X2 [Cucurbita moschata]1.0e-9495.21Show/hide
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XP_023552453.1 2-oxoglutarate-Fe(II) type oxidoreductase-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.3e-9393.09Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7THD2 1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase-like isoform X13.6e-8282.45Show/hide
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A0A6J1E687 2-oxoglutarate-Fe(II) type oxidoreductase-like isoform X14.9e-9595.21Show/hide
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A0A6J1EBM7 2-oxoglutarate-Fe(II) type oxidoreductase-like isoform X24.9e-9595.21Show/hide
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A0A6J1HKU1 2-oxoglutarate-Fe(II) type oxidoreductase-like isoform X23.0e-9292.02Show/hide
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        MASVLQLPIIDLSSQDR SVA SIH+ACLDYGFFYLINHGVEDELLERVFDESRKFFSLPIEEKMKLARKEHRGYTALYAEKLDPT STDIGDAKESYYI
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A0A6J1HQ38 2-oxoglutarate-Fe(II) type oxidoreductase-like isoform X13.0e-9292.02Show/hide
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        MASVLQLPIIDLSSQDR SVA SIH+ACLDYGFFYLINHGVEDELLERVFDESRKFFSLPIEEKMKLARKEHRGYTALYAEKLDPT STDIGDAKESYYI
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        GPLAGN TENDLNQWPSGELLPSWRATMESFYKQALRVGR+IISLLALALNLDENFFEKIGAFSKPSDFLRLLHYP DL+++   + G
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A6BM06 1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase7.2e-1934.22Show/hide
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        +LPIID+SS      D+  VA  I++AC +YGFFY+ NHGV+ EL+E + +  +KFFSLP+E KMK    L  +E  G+      K+    +    D KE
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          YY   + G+  T +++  +P+ E      +  +++T+ ++ ++   + +QII  ++L+LNL +++F K   +  P   + LLHYP
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Q4W946 2-oxoglutarate-Fe(II) type oxidoreductase2.3e-1732.28Show/hide
Query:  PIIDLS------SQDRASVALSIHEACLDYGFFYLINHGVEDELLERVFDESRKFFSLPIEEKMKLARKE---HRGYTALYAEKLDPTASTDIGDAKESY
        PI+D S      SQ +A +   + E CL+ GFF +  H V  EL  R FD +++FF LP+ EK K+ R     +RGY A  +    P ++    D KE  
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Query:  YIGP-LAGN---ATENDL----NQWPSG-ELLPSWRATMESFYKQALRVGRQIISLLALALNLDENFFEKI--GAFSKPSDFLRLLHYP
        ++GP LA +     +  L    N+WP G + L  ++     +Y    ++ + ++++LAL ++ +E FF+ +  GA +     LR LHYP
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Q76NT9 1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase7.2e-1934.22Show/hide
Query:  QLPIIDLSS-----QDRASVALSIHEACLDYGFFYLINHGVEDELLERVFDESRKFFSLPIEEKMK----LARKEHRGYTALYAEKLDPTASTDIGDAKE
        +LPIID+SS      D+  VA  I++AC +YGFFY+ NHGV+ EL+E + +  +KFFSLP+E KMK    L  +E  G+      K+    +    D KE
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Query:  S-YYIGPLAGNA-TENDLNQWPSGEL-----LPSWRATMESFYKQALRVGRQIISLLALALNLDENFFEKIGAFSKPSDFLRLLHYP
          YY   + G+  T +++  +P+ E      +  +++T+ ++ ++   + +QII  ++L+LNL +++F K   +  P   + LLHYP
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Q7LL04 UPF0676 protein C1494.019.4e-1932.32Show/hide
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        L++P IDLS  D + V   + +AC ++GF  L NHG+  + ++R F  + KFF +P+EEK K   K    H GYT  + EKLD    +  GD KESY + 
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Query:  PLAGNATENDLNQWPSGELLPSWRATME---SFYKQALRVGRQIISLLALALNLDENFFEKIGAFSKPSDFLRLLHYPDLKNVSRHVDGQMSGTHVIY
               EN         L P     M+    F +   ++  +++   A+   +  +FF K  + S   D LRLL Y   + V R  D + +G H  Y
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Q9FLV0 Protein DOWNY MILDEW RESISTANCE 61.3e-1530.46Show/hide
Query:  PIIDLSSQDRASVALSIHEACLDYGFFYLINHGVEDELLERVFDESRKFFSLPIEEKMKLARKEHRGYTALYAEKLDPTASTDIGDAKESY-----YIGP
        P+IDLSS DR+ +   IH+AC  +GFF +INHGV  ++++ +   +R+FFS+ +EEKMKL   +    T L         ST     KE       Y+  
Subjt:  PIIDLSSQDRASVALSIHEACLDYGFFYLINHGVEDELLERVFDESRKFFSLPIEEKMKLARKEHRGYTALYAEKLDPTASTDIGDAKESY-----YIGP

Query:  LAGNATENDLNQWPSGELLPSWRATMESFYKQALRVGRQIISLLALALNLDENFFEKIGAFSKPSDFLRLLHYP
        L        +N+WPS    PS++  +  + ++   VG +I  L++ +L L++++ +K+    +    + + +YP
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G35190.1 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein2.4e-3843.92Show/hide
Query:  VLQLPIIDLSSQDRASVALSIHEACLDYGFFYLINHGVEDELLERVFDESRKFFSLPIEEKMKLARKE-HRGYTALYAEKLDPTASTDIGDAKESYYIG-
        V  L  IDL++ D     +S+ +ACLD GFFY+INHG+ +E ++ VF++S+K F+LP+EEKMK+ R E HRGYT +  E LDP    + GD KE YYIG 
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Query:  --PLAGNATENDL---NQWPSGELLPSWRATMESFYKQALRVGRQIISLLALALNLDENFFEKIGAFSKPSDFLRLLHYPDLKNVSRHV
          P      +      N WP  ++LP WR TME ++++ALRV   I  LLALAL+LD  +F++     KP   +RLL Y  + + S+ +
Subjt:  --PLAGNATENDL---NQWPSGELLPSWRATMESFYKQALRVGRQIISLLALALNLDENFFEKIGAFSKPSDFLRLLHYPDLKNVSRHV

AT3G46490.1 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein6.9e-3339.68Show/hide
Query:  VLQLPIIDLSSQDRASVALSIHEACLDYGFFYLINHGVEDELLERVFDESRKFFSLPIEEKMKLARKE-HRGYTALYAEKLDPTASTDIGDAKESYYIGP
        V  L  IDL + D    A+ + +ACLD GFFY+INHG+ +EL +  F+ S+KFF+LP+EEKMK+ R E +RGY   +   LDP      GD KE + IG 
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Query:  LAG------NATENDLNQWPSGELLPSWRATMESFYKQALRVGRQIISLLALALNLDENFFEKIGAFSKPSDFLRLLHYPDLKNVSRHV
                 +   +  N WP+ ++LP WR TME +Y++ALRV + I  ++ALAL+LD ++F        P   + L HY    + S+ +
Subjt:  LAG------NATENDLNQWPSGELLPSWRATMESFYKQALRVGRQIISLLALALNLDENFFEKIGAFSKPSDFLRLLHYPDLKNVSRHV

AT4G16765.1 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein4.5e-3251.52Show/hide
Query:  MKLARKEHRGYTALYAEKLDPTASTDIGDAKESYYIGPLAGNATENDLNQWPSGELLPSWRATMESFYKQALRVGRQIISLLALALNLDENFFEKIGAFS
        M L R++  GYT LYAEKLDP+ S+ IGD+KES+Y G L G   +   NQWPS  +LPSWR TME++YK  L VGR+++ L+ALAL+LDE+FFEK+GA +
Subjt:  MKLARKEHRGYTALYAEKLDPTASTDIGDAKESYYIGPLAGNATENDLNQWPSGELLPSWRATMESFYKQALRVGRQIISLLALALNLDENFFEKIGAFS

Query:  KPSDFLRLLHYPDLKNVSRHVDGQMSGTHVIY
         P+  +RLL YP  + +S  V+   +  H  Y
Subjt:  KPSDFLRLLHYPDLKNVSRHVDGQMSGTHVIY

AT4G16765.2 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein4.5e-3251.52Show/hide
Query:  MKLARKEHRGYTALYAEKLDPTASTDIGDAKESYYIGPLAGNATENDLNQWPSGELLPSWRATMESFYKQALRVGRQIISLLALALNLDENFFEKIGAFS
        M L R++  GYT LYAEKLDP+ S+ IGD+KES+Y G L G   +   NQWPS  +LPSWR TME++YK  L VGR+++ L+ALAL+LDE+FFEK+GA +
Subjt:  MKLARKEHRGYTALYAEKLDPTASTDIGDAKESYYIGPLAGNATENDLNQWPSGELLPSWRATMESFYKQALRVGRQIISLLALALNLDENFFEKIGAFS

Query:  KPSDFLRLLHYPDLKNVSRHVDGQMSGTHVIY
         P+  +RLL YP  + +S  V+   +  H  Y
Subjt:  KPSDFLRLLHYPDLKNVSRHVDGQMSGTHVIY

AT4G16770.1 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein9.9e-4851.65Show/hide
Query:  MASVLQLPIIDLSSQDRASVALSIHEACLDYGFFYLINHGVEDELLERVFDESRKFFSLPIEEKMKLARKEHRGYTALYAEKLDPTASTDIGDAKESYYI
        M + L+LPIIDLSS ++ S +  I +ACLD+GFFYL NHGV +EL+E V  ES+K FSLP++EKM +AR   RGY+ LY EKL+ ++ST IGD+KE +  
Subjt:  MASVLQLPIIDLSSQDRASVALSIHEACLDYGFFYLINHGVEDELLERVFDESRKFFSLPIEEKMKLARKEHRGYTALYAEKLDPTASTDIGDAKESYYI

Query:  GPLAGNATENDLNQWPSGELLPSWRATMESFYKQALRVGRQIISLLALALNLDENFFEKIGAFSKPSDFLRLLHYPDLKNVS
        G   G   +   N+WP  ELLP WR TME +YK  + VG+++  L+ALALNL+EN+FE++GAF+  +  +RLL Y    N S
Subjt:  GPLAGNATENDLNQWPSGELLPSWRATMESFYKQALRVGRQIISLLALALNLDENFFEKIGAFSKPSDFLRLLHYPDLKNVS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGTCTGTTCTGCAACTCCCAATCATCGACCTCTCCTCTCAAGACCGCGCCTCTGTTGCTCTCTCAATCCATGAGGCATGCTTGGATTACGGATTCTTTTACTTGAT
CAACCATGGCGTTGAAGACGAATTGCTCGAGAGAGTGTTTGACGAAAGTAGGAAGTTCTTTTCTCTTCCTATTGAGGAGAAGATGAAACTTGCTCGGAAGGAACATAGGG
GATACACCGCTCTTTATGCCGAGAAGCTCGATCCCACCGCCTCGACTGATATAGGGGATGCAAAAGAGAGCTATTATATTGGCCCTTTGGCAGGCAACGCAACTGAAAAT
GACTTAAATCAGTGGCCTTCAGGAGAACTATTGCCTTCTTGGAGAGCTACTATGGAATCCTTCTATAAGCAAGCACTGCGTGTTGGAAGACAAATAATATCTTTGCTTGC
ATTGGCTCTGAATCTGGATGAGAATTTCTTTGAGAAAATTGGTGCCTTCAGTAAACCATCAGATTTTCTTCGGCTTCTACACTATCCAGATCTAAAGAACGTGAGCCGCC
ACGTGGATGGCCAGATGAGTGGGACCCACGTTATCTATTTTCTTGCCGTCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTTAATTAATATATATATTTTTTAAATTTAAAATTTAAGTAAAGAATTTTGTCAAAAGACGACGACTGAGAACCGTGGTTCTGGTTCTCTACTGCTTGCTTCGACCGAAA
ATGGCGTCTGTTCTGCAACTCCCAATCATCGACCTCTCCTCTCAAGACCGCGCCTCTGTTGCTCTCTCAATCCATGAGGCATGCTTGGATTACGGATTCTTTTACTTGAT
CAACCATGGCGTTGAAGACGAATTGCTCGAGAGAGTGTTTGACGAAAGTAGGAAGTTCTTTTCTCTTCCTATTGAGGAGAAGATGAAACTTGCTCGGAAGGAACATAGGG
GATACACCGCTCTTTATGCCGAGAAGCTCGATCCCACCGCCTCGACTGATATAGGGGATGCAAAAGAGAGCTATTATATTGGCCCTTTGGCAGGCAACGCAACTGAAAAT
GACTTAAATCAGTGGCCTTCAGGAGAACTATTGCCTTCTTGGAGAGCTACTATGGAATCCTTCTATAAGCAAGCACTGCGTGTTGGAAGACAAATAATATCTTTGCTTGC
ATTGGCTCTGAATCTGGATGAGAATTTCTTTGAGAAAATTGGTGCCTTCAGTAAACCATCAGATTTTCTTCGGCTTCTACACTATCCAGATCTAAAGAACGTGAGCCGCC
ACGTGGATGGCCAGATGAGTGGGACCCACGTTATCTATTTTCTTGCCGTCTGATCATCTCTTGTGGGGCCCATTAATATAGAGATAAAAATTAAAATAAAATAAGAAATG
GATAAACTTTTCATAAAGCGTTTTCAAAAGCTAAGATGTCTGTACCTTTGGATAAGATGGGATAGGTGACTCAATTCATTTTTCCCCCCTTTTAAATAATTTAAAATTTA
TTTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASVLQLPIIDLSSQDRASVALSIHEACLDYGFFYLINHGVEDELLERVFDESRKFFSLPIEEKMKLARKEHRGYTALYAEKLDPTASTDIGDAKESYYIGPLAGNATEN
DLNQWPSGELLPSWRATMESFYKQALRVGRQIISLLALALNLDENFFEKIGAFSKPSDFLRLLHYPDLKNVSRHVDGQMSGTHVIYFLAV