; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg24970 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg24970
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionPentatricopeptide repeat-containing protein
Genome locationCarg_Chr04:12514146..12518765
RNA-Seq ExpressionCarg24970
SyntenyCarg24970
Gene Ontology termsGO:0009451 - RNA modification (biological process)
GO:0043231 - intracellular membrane-bounded organelle (cellular component)
GO:0003723 - RNA binding (molecular function)
GO:0005515 - protein binding (molecular function)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002885 - Pentatricopeptide repeat
IPR011990 - Tetratricopeptide-like helical domain superfamily
IPR032867 - DYW domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7032452.1 Pentatricopeptide repeat-containing protein, mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]0.0e+00100Show/hide
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XP_022929973.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At4g32450, mitochondrial-like [Cucurbita moschata]0.0e+0098.7Show/hide
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XP_022994138.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At4g32450, mitochondrial [Cucurbita maxima]0.0e+0097.4Show/hide
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XP_023530381.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At4g32450, mitochondrial [Cucurbita pepo subsp. pepo]0.0e+0098.54Show/hide
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A0A1S3B9H3 pentatricopeptide repeat-containing protein At4g32450, mitochondrial-like2.2e-27469.76Show/hide
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A0A5A7T5S8 Pentatricopeptide repeat-containing protein2.2e-27469.76Show/hide
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Query:  LEEAKVVCNYVIKSQTPLKVSTYNKILEMYSKCGSMDDAYMIFNKMPSRNLTSWDTMITWLAKNGLGEDAIDLFYELKKTGLRIDGKMFIGVFSACSVLG
        LEEAK VCNYVIKSQT +KVSTYNKILEMYSKCGSMDDAY IFNKMPSRN+TSWDTMITWLAKNGLGEDAIDLFYE KK GLR DGKMFIGVFSACSVLG
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Query:  DVDEGMLHFESMTKNYGIIPSMQHYVSIIDMLGSVGYVDEALEFIEKMPFEPGVDIWETMMNISRAHGLMELGDRCFELVEQLDPSRLNEQSKAGHLPIK
        DVDEGMLHFESMTKNYGI PSM HYVSI+DMLGS G+VDEALEFIEKMP EPGVDIWETMMNI+RAHGLMELGDRCFELVE LDPSRLNEQSKAG LPIK
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        ASDL KEREKKKLANRNLLEVRSRVHEYRAGDTSHPENDRIYTLLRGLREQMKEAGYIPETRFVLHDIDQE KNDALLGHSERLAVAYGLISSSARSPIR
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        VIKNLRVCGDCHSALKIISKIVGRELIIRDAKRFHHFKDGLCSC
Subjt:  VIKNLRVCGDCHSALKIISKIVGRELIIRDAKRFHHFKDGLCSC

A0A5D3D8E5 Pentatricopeptide repeat-containing protein1.1e-27369.62Show/hide
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        MCKK+AAILARRSLIAL   RSSCSSSVS+K LN VRNLSIASEREE Q+DNGYHADNSL+SYQ+HGG   S +QSPGYYQHHAQS S QS         
Subjt:  MCKKRAAILARRSLIALCNIRSSCSSSVSNKVLNQVRNLSIASEREEYQNDNGYHADNSLQSYQSHGG-FRSDSQSPGYYQHHAQSASFQS---------

Query:  ------------------------SSW--------------------------------------------------PNQNIL-----------------
                                SS+                                                  PN N +                 
Subjt:  ------------------------SSW--------------------------------------------------PNQNIL-----------------

Query:  --------------------------LERRENLTAYN--GFNNGELQQNNYEVSGQNSWGTQIESRQFVHGNSLNYHNSMPGLNNHIPISRQYEQNSMSQ
                                  L  RE  +AYN  G++N   QQN Y +SGQNSWGT  ES+Q++HG  L +HN M G NNHIP+SRQYEQNS+ Q
Subjt:  --------------------------LERRENLTAYN--GFNNGELQQNNYEVSGQNSWGTQIESRQFVHGNSLNYHNSMPGLNNHIPISRQYEQNSMSQ

Query:  PHPQGQYQQGGSVELYQPNPDTIQSHTIGTQVLNNTNSDEEIGVTKDNPYGGTLEELDEFCREGKLKEAVQILEMFEKQNIPVDLSRYLNLMNACGEARS
         +PQGQY QG SVE YQPNPDT Q++ IG QVL N N++EEIG T+D   GG LE+LDEFC+EG LKEAV+ILE+ EKQ+IPVDLSRYL+LMNACGEARS
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Query:  LEEAKVVCNYVIKSQTPLKVSTYNKILEMYSKCGSMDDAYMIFNKMPSRNLTSWDTMITWLAKNGLGEDAIDLFYELKKTGLRIDGKMFIGVFSACSVLG
        LEEAK VCNYVIKSQT +KVSTYNKILEMYSKCGSMDDAY IFNKMPSRN+TSWDTMITWLAKNGLGEDAIDLFYE KK GLR DGKMFIGVFSACSVLG
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Query:  DVDEGMLHFESMTKNYGIIPSMQHYVSIIDMLGSVGYVDEALEFIEKMPFEPGVDIWETMMNISRAHGLMELGDRCFELVEQLDPSRLNEQSKAGHLPIK
        DVDEGMLHFESMTKNYGI PSM HYVSI+DMLGS G+VDEALEFIEKMP EPGVDIWETMMNI+RAHGLMELGDRC ELVE LDPSRLNEQSKAG LPIK
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        ASDL KEREKKKLANRNLLEVRSRVHEYRAGDTSHPENDRIYTLLRGLREQMKEAGYIPETRFVLHDIDQE KNDALLGHSERLAVAYGLISSSARSPIR
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        VIKNLRVCGDCHSALKIISKIVGRELIIRDAKRFHHFKDGLCSC
Subjt:  VIKNLRVCGDCHSALKIISKIVGRELIIRDAKRFHHFKDGLCSC

A0A6J1EQB4 pentatricopeptide repeat-containing protein At4g32450, mitochondrial-like0.0e+0098.7Show/hide
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        MCKKRAAILARRSLIALCNIRSSCSSSVSNKVLNQVRNLSIASEREEYQNDNGYHADNSLQSYQSHGGF SDSQSPGYYQHHAQSASFQSSSWPNQNILL
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Query:  ERRENLTAYNGFNNGELQQNNYEVSGQNSWGTQIESRQFVHGNSLNYHNSMPGLNNHIPISRQYEQNSMSQPHPQGQYQQGGSVELYQPNPDTIQSHTIG
        ERRENLTAYNGFNNGELQQNNYEVSGQNSWGTQIESRQFVHGNSLNY NSMPGLNNHIPISRQYEQNSMSQPHPQGQYQQGGSVELYQPNPDTIQS TIG
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Query:  TQVLNNTNSDEEIGVTKDNPYGGTLEELDEFCREGKLKEAVQILEMFEKQNIPVDLSRYLNLMNACGEARSLEEAKVVCNYVIKSQTPLKVSTYNKILEM
        TQVLNNTN+DEEIGVTKDNPYGGTLEELDEFCREGKLKEAVQILEM EKQNIPVDLSRYLNLMNACGEARSLEEAKVVCNYVIKSQTPLKVSTYNKILEM
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Query:  YSKCGSMDDAYMIFNKMPSRNLTSWDTMITWLAKNGLGEDAIDLFYELKKTGLRIDGKMFIGVFSACSVLGDVDEGMLHFESMTKNYGIIPSMQHYVSII
        YSKCGSMDDAYMIFNKMPSRNLTSWDTMITWLAKNGLGEDAIDLFYE KKTGLRIDGKMFIGVFSACSVLGDVDEGMLHFESMTKNYGIIPSMQHYVSII
Subjt:  YSKCGSMDDAYMIFNKMPSRNLTSWDTMITWLAKNGLGEDAIDLFYELKKTGLRIDGKMFIGVFSACSVLGDVDEGMLHFESMTKNYGIIPSMQHYVSII

Query:  DMLGSVGYVDEALEFIEKMPFEPGVDIWETMMNISRAHGLMELGDRCFELVEQLDPSRLNEQSKAGHLPIKASDLAKEREKKKLANRNLLEVRSRVHEYR
        DMLGSVGYVDEALEFIEKMPFEPGVDIWE MMNISRAHGLMELGDRCFELVEQLDPSRLNEQSKAGHLPIKA DLAKEREKKKLANRNLLEVRSRVHEYR
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Query:  AGDTSHPENDRIYTLLRGLREQMKEAGYIPETRFVLHDIDQEGKNDALLGHSERLAVAYGLISSSARSPIRVIKNLRVCGDCHSALKIISKIVGRELIIR
        AGDTSHPENDRIYTLLRGLREQMKEAGYIPETRFVLHDIDQEGKNDALLGHSERLAVAYGLISSSARSPIRVIKNLRVCGDCHSALKIISKIVGRELIIR
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Query:  DAKRFHHFKDGLCSC
        DAKRFHHFKDGLCSC
Subjt:  DAKRFHHFKDGLCSC

A0A6J1JYC1 pentatricopeptide repeat-containing protein At4g32450, mitochondrial0.0e+0097.4Show/hide
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        MCKKRAAILARRSLIALCN RSSCSSSVSNK LNQVRNLSIASEREEYQNDNGYHADNSLQSYQSHGGF SDSQSPGYYQHHAQ ASFQSSSWPNQNILL
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Query:  ERRENLTAYNGFNNGELQQNNYEVSGQNSWGTQIESRQFVHGNSLNYHNSMPGLNNHIPISRQYEQNSMSQPHPQGQYQQGGSVELYQPNPDTIQSHTIG
        ERRENLTAYNGFNNGELQQNNYEVSGQNSWGTQ+ESRQFVHGNSLNYHNSMPGLNNHIP+SRQYEQNSMSQPHPQGQYQQGGSVELYQPNPDTIQS TIG
Subjt:  ERRENLTAYNGFNNGELQQNNYEVSGQNSWGTQIESRQFVHGNSLNYHNSMPGLNNHIPISRQYEQNSMSQPHPQGQYQQGGSVELYQPNPDTIQSHTIG

Query:  TQVLNNTNSDEEIGVTKDNPYGGTLEELDEFCREGKLKEAVQILEMFEKQNIPVDLSRYLNLMNACGEARSLEEAKVVCNYVIKSQTPLKVSTYNKILEM
        TQVLNNTN+DEEIGVTKDNPYGGTLEELDEFCREGKLKEAVQILEM EKQNIPVDLSRYLNLMNACGEARSLEEAKVVC YVIKSQTPLKVSTYNKILEM
Subjt:  TQVLNNTNSDEEIGVTKDNPYGGTLEELDEFCREGKLKEAVQILEMFEKQNIPVDLSRYLNLMNACGEARSLEEAKVVCNYVIKSQTPLKVSTYNKILEM

Query:  YSKCGSMDDAYMIFNKMPSRNLTSWDTMITWLAKNGLGEDAIDLFYELKKTGLRIDGKMFIGVFSACSVLGDVDEGMLHFESMTKNYGIIPSMQHYVSII
        YSKCGSM+DAY+IFNKMPSRNLTSWDTMITWLAKNGLGEDAIDLFYE KKTGLRIDGKMFIGVFSACSVLGDVDEGMLHFESMTKNYGI PSM HYVSII
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Query:  DMLGSVGYVDEALEFIEKMPFEPGVDIWETMMNISRAHGLMELGDRCFELVEQLDPSRLNEQSKAGHLPIKASDLAKEREKKKLANRNLLEVRSRVHEYR
        DMLGSVGYVDEALEFIE MPFEPGVDIWETMMNISRAHGLMELGDRCFELVEQLDPSRLNEQSKAGHLPIKASDLAKEREKKKLANRNLLEVRSRVHEYR
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Query:  AGDTSHPENDRIYTLLRGLREQMKEAGYIPETRFVLHDIDQEGKNDALLGHSERLAVAYGLISSSARSPIRVIKNLRVCGDCHSALKIISKIVGRELIIR
        AGDTSHPENDRIYTLLRGLREQMKEAGYIPETRFVLHDIDQEGKNDALLGHSERLAVAYGLISSSARSPIRVIKNLRVCGDCHSALKIISKIVGRELIIR
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        DAKRFHHFKDGLCSC
Subjt:  DAKRFHHFKDGLCSC

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q680H3 Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g255804.1e-12153.96Show/hide
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        +EE D FC+ GK+K+A+  +++    N  VDLSR L L   CGEA  L+EAK V   +  S + L +S+ + +LEMYS CG  ++A  +F KM  +NL +
Subjt:  LEELDEFCREGKLKEAVQILEMFEKQNIPVDLSRYLNLMNACGEARSLEEAKVVCNYVIKSQTPLKVSTYNKILEMYSKCGSMDDAYMIFNKMPSRNLTS

Query:  WDTMITWLAKNGLGEDAIDLFYELKKTGLRIDGKMFIGVFSACSVLGDVDEGMLHFESMTKNYGIIPSMQHYVSIIDMLGSVGYVDEALEFIEKMPFEPG
        W  +I   AKNG GEDAID+F   K+ G   DG++F G+F AC +LGDVDEG+LHFESM+++YGI PS++ YVS+++M    G++DEALEF+E+MP EP 
Subjt:  WDTMITWLAKNGLGEDAIDLFYELKKTGLRIDGKMFIGVFSACSVLGDVDEGMLHFESMTKNYGIIPSMQHYVSIIDMLGSVGYVDEALEFIEKMPFEPG

Query:  VDIWETMMNISRAHGLMELGDRCFELVEQLDPSRLNEQSKAGHLPIKASDLAKEREKKKLANRNLLEVRSRVHEYRAGDTSHPENDRIYTLLRGLREQMK
        VD+WET+MN+SR HG +ELGD C E+VE LDP+RLN+QS+ G +P+KASD+ KE  KK+  +  L  V+S + E+RAGDT+ PEND ++ LLR L+  M 
Subjt:  VDIWETMMNISRAHGLMELGDRCFELVEQLDPSRLNEQSKAGHLPIKASDLAKEREKKKLANRNLLEVRSRVHEYRAGDTSHPENDRIYTLLRGLREQMK

Query:  EAGYIPETRFVLHDIDQEGKNDALLGHSERLAVAYGLISSSARSPIRVIKNLRVCGDCHSALKIISKIVGRELIIRDAKRFHHFKDGLCSC
        E GY+ ETR  LHDIDQE K   LLGHSER+A A  +++S+ R P  VIKNLRVC DCH+ALKI+S IVGRE+I RD KRFH  K+G C+C
Subjt:  EAGYIPETRFVLHDIDQEGKNDALLGHSERLAVAYGLISSSARSPIRVIKNLRVCGDCHSALKIISKIVGRELIIRDAKRFHHFKDGLCSC

Q8S8Q7 Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g34370, mitochondrial1.0e-9543.86Show/hide
Query:  DNPYGGTLEELDEFCREGKLKEAVQILEMFEKQNIPVDLSRYLNLMNACGEARSLEEAKVVCNYVIKSQTPLKVSTYNKILEMYSKCGSMDDAYMIFNKM
        +N    T+E  D  C++ K++EA++++++ E +   VD  R L L   CGE  +LEEA+VV + +    TPL   +Y+ ++EMYS C S DDA  +FN+M
Subjt:  DNPYGGTLEELDEFCREGKLKEAVQILEMFEKQNIPVDLSRYLNLMNACGEARSLEEAKVVCNYVIKSQTPLKVSTYNKILEMYSKCGSMDDAYMIFNKM

Query:  PSRNLTSWDTMITWLAKNGLGEDAIDLFYELKKTGLRIDGKMFIGVFSACSVLGDVDEGMLHFESMTKNYGIIPSMQHYVSIIDMLGSVGYVDEALEFIE
        P RN  +W TMI  LAKNG GE AID+F    + G + D ++F  VF AC  +GD++EG+LHFESM ++YG++ SM+ YV++I+ML + G++DEAL+F+E
Subjt:  PSRNLTSWDTMITWLAKNGLGEDAIDLFYELKKTGLRIDGKMFIGVFSACSVLGDVDEGMLHFESMTKNYGIIPSMQHYVSIIDMLGSVGYVDEALEFIE

Query:  KMPFEPGVDIWETMMNISRAHGLMELGDRCFELVEQLDPSRLNEQSKAGHLPIKASDLAKEREKK-KLANRNLLEVRSRVHEYRAGDTSHPENDRIYTLL
        +M  EP V++WET+MN+    G +ELGDR  EL+++LD SR++++S AG +  KASD A E+ K+ +       + + R+HE+RAGDTSH       +  
Subjt:  KMPFEPGVDIWETMMNISRAHGLMELGDRCFELVEQLDPSRLNEQSKAGHLPIKASDLAKEREKK-KLANRNLLEVRSRVHEYRAGDTSHPENDRIYTLL

Query:  RGLREQMKEAGYIPETRFVLHDIDQEGKNDALLGHSERLAVAYGLISSSARSPIRVIKNLRVCGDCHSALKIISKIVGRELIIRDAKRFHHFKDGLCSC
        R L+ QM + G++P TR     +++E K + LL  S +LA A+ +I+S AR P+ V++N+R C D H+  K+IS I GR LI RD K++H +K+G+CSC
Subjt:  RGLREQMKEAGYIPETRFVLHDIDQEGKNDALLGHSERLAVAYGLISSSARSPIRVIKNLRVCGDCHSALKIISKIVGRELIIRDAKRFHHFKDGLCSC

Q9C6G2 Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g29710, mitochondrial1.3e-9343.94Show/hide
Query:  TLEELDEFCREGKLKEAVQILEMFEKQNIPVDLSRYLNLMNACGEARSLEEAKVVCNYVIKSQTPLKVSTYNKILEMYSKCGSMDDAYMIFNKMPSRNLT
        T+E  D  C +G  +EAV++L+  E +   +DL R L L   CG+  +LE A+VV   +I   +P  V   N I+EMYS C S+DDA  +F +MP  N  
Subjt:  TLEELDEFCREGKLKEAVQILEMFEKQNIPVDLSRYLNLMNACGEARSLEEAKVVCNYVIKSQTPLKVSTYNKILEMYSKCGSMDDAYMIFNKMPSRNLT

Query:  SWDTMITWLAKNGLGEDAIDLFYELKKTGLRIDGKMFIGVFSACSVLGDVDEGMLHFESMTKNYGIIPSMQHYVSIIDMLGSVGYVDEALEFIEKMPFEP
        +   M+     NG GE+AIDLF   K+ G + +G++F  VFS C++ GDV EG L F++M + YGI+PSM+HY S+  ML + G++DEAL F+E+MP EP
Subjt:  SWDTMITWLAKNGLGEDAIDLFYELKKTGLRIDGKMFIGVFSACSVLGDVDEGMLHFESMTKNYGIIPSMQHYVSIIDMLGSVGYVDEALEFIEKMPFEP

Query:  GVDIWETMMNISRAHGLMELGDRCFELVEQLDPSRLNEQSKAGHLPIKASDLAKEREKKKLANRNLLEVRSRVHEY---RAGDTSHPENDRIYTLLRGLR
         VD+WET+MN+SR HG +ELGDRC ELVE+LD +RL++ S AG +  KASD  K+              RS  + Y   R  D+SHP+ + IY  L  LR
Subjt:  GVDIWETMMNISRAHGLMELGDRCFELVEQLDPSRLNEQSKAGHLPIKASDLAKEREKKKLANRNLLEVRSRVHEY---RAGDTSHPENDRIYTLLRGLR

Query:  EQMKEAGYIPETRFVLHDIDQEGKNDALLGHSERLAVAYGLISSSARSPIRVIKNLRVCGDCHSALKIISKIVGRELIIRDAKRFHHFKDGLCSCH
         Q+KE GY+P+TR+    I      + + G+ E +AV   L+ S  RS I ++ N+R+ GDCH  +K++S I GR++I RDAK +H FK+G+C C+
Subjt:  EQMKEAGYIPETRFVLHDIDQEGKNDALLGHSERLAVAYGLISSSARSPIRVIKNLRVCGDCHSALKIISKIVGRELIIRDAKRFHHFKDGLCSCH

Q9SUU7 Pentatricopeptide repeat-containing protein At4g32450, mitochondrial4.6e-12048.22Show/hide
Query:  YEQ--NSMSQPHPQGQYQQGGSVELYQPNPDTIQSHTIGTQVLNNTNSDEEI------------GVTKDNPYGG-----------TLEELDEFCREGKLK
        YEQ  N +S  +P  ++ Q G    Y  N    QS+   ++++N  N + +             GV ++N  GG           +L+ELD  CREGK+K
Subjt:  YEQ--NSMSQPHPQGQYQQGGSVELYQPNPDTIQSHTIGTQVLNNTNSDEEI------------GVTKDNPYGG-----------TLEELDEFCREGKLK

Query:  EAVQILEMFEKQNIPVDLSRYLNLMNACGEARSLEEAKVVCNYVIKSQTPLKVSTYNKILEMYSKCGSMDDAYMIFNKMPSRNLTSWDTMITWLAKNGLG
        +AV+I++ +  +   VDL R   +   CG+A++L+EAKVV  ++  S     +S YN I+EMYS CGS++DA  +FN MP RNL +W  +I   AKNG G
Subjt:  EAVQILEMFEKQNIPVDLSRYLNLMNACGEARSLEEAKVVCNYVIKSQTPLKVSTYNKILEMYSKCGSMDDAYMIFNKMPSRNLTSWDTMITWLAKNGLG

Query:  EDAIDLFYELKKTGLRIDGKMFIGVFSACSVLGDVDEGMLHFESMTKNYGIIPSMQHYVSIIDMLGSVGYVDEALEFIEKMPFEPGVDIWETMMNISRAH
        EDAID F   K+ G + DG+MF  +F AC VLGD++EG+LHFESM K YGIIP M+HYVS++ ML   GY+DEAL F+E M  EP VD+WET+MN+SR H
Subjt:  EDAIDLFYELKKTGLRIDGKMFIGVFSACSVLGDVDEGMLHFESMTKNYGIIPSMQHYVSIIDMLGSVGYVDEALEFIEKMPFEPGVDIWETMMNISRAH

Query:  GLMELGDRCFELVEQLDPSRLNEQSKAGHLPIKASDLAKEREKKKLANRNLLEVRSRVHEYRAGDTSHPENDRIYTLLRGLREQMKEAGYIPETRFVLHD
        G + LGDRC ++VEQLD SRLN++SKAG +P+K+SDL KE+ ++     N       +    AGD S PEN  +Y  L+ L+E M E GY+P ++  LHD
Subjt:  GLMELGDRCFELVEQLDPSRLNEQSKAGHLPIKASDLAKEREKKKLANRNLLEVRSRVHEYRAGDTSHPENDRIYTLLRGLREQMKEAGYIPETRFVLHD

Query:  IDQEGKNDALLGHSERLAVAYGLISSSARSPIRVIKNLRVCGDCHSALKIISKIVGRELIIRDAKRFHHFKDGLCSC
        +DQE K++ L  H+ER A     + + ARS IRV+KNLRVC DCH+ALK++SKIVGRELI RDAKRFHH KDG+CSC
Subjt:  IDQEGKNDALLGHSERLAVAYGLISSSARSPIRVIKNLRVCGDCHSALKIISKIVGRELIIRDAKRFHHFKDGLCSC

Q9SY02 Pentatricopeptide repeat-containing protein At4g027501.1e-7837.06Show/hide
Query:  FCREGKLKEAVQILEMFEKQNIPVDLSRYLNLMNACGEARSLEEAKVVCNYVIKSQTPLKVSTYNKILEMYSKCGSMDDAYMIFNKMPSRNLTSWDTMIT
        + + G   EA+++    E++   ++ S + + ++ C +  +LE  K +   ++K          N +L MY KCGS+++A  +F +M  +++ SW+TMI 
Subjt:  FCREGKLKEAVQILEMFEKQNIPVDLSRYLNLMNACGEARSLEEAKVVCNYVIKSQTPLKVSTYNKILEMYSKCGSMDDAYMIFNKMPSRNLTSWDTMIT

Query:  WLAKNGLGEDAIDLFYELKKTGLRIDGKMFIGVFSACSVLGDVDEGMLHFESMTKNYGIIPSMQHYVSIIDMLGSVGYVDEALEFIEKMPFEPGVDIWET
          +++G GE A+  F  +K+ GL+ D    + V SACS  G VD+G  +F +MT++YG++P+ QHY  ++D+LG  G +++A   ++ MPFEP   IW T
Subjt:  WLAKNGLGEDAIDLFYELKKTGLRIDGKMFIGVFSACSVLGDVDEGMLHFESMTKNYGIIPSMQHYVSIIDMLGSVGYVDEALEFIEKMPFEPGVDIWET

Query:  MMNISRAHGLMELGDRCFELVEQLDPSRLNEQSKAGHLPIKA---SDLAKEREK------KKLANRNLLEVRSRVHEYRAGDTSHPENDRIYTLLRGLRE
        ++  SR HG  EL +   + +  ++P          +L   +    D+ K R +      KK+   + +E++++ H +  GD  HPE D I+  L  L  
Subjt:  MMNISRAHGLMELGDRCFELVEQLDPSRLNEQSKAGHLPIKA---SDLAKEREK------KKLANRNLLEVRSRVHEYRAGDTSHPENDRIYTLLRGLRE

Query:  QMKEAGYIPETRFVLHDIDQEGKNDALLGHSERLAVAYGLISSSARSPIRVIKNLRVCGDCHSALKIISKIVGRELIIRDAKRFHHFKDGLCSC
        +MK+AGY+ +T  VLHD+++E K   +  HSERLAVAYG++  S+  PIRVIKNLRVC DCH+A+K +++I GR +I+RD  RFHHFKDG CSC
Subjt:  QMKEAGYIPETRFVLHDIDQEGKNDALLGHSERLAVAYGLISSSARSPIRVIKNLRVCGDCHSALKIISKIVGRELIIRDAKRFHHFKDGLCSC

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G29710.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein8.9e-9543.94Show/hide
Query:  TLEELDEFCREGKLKEAVQILEMFEKQNIPVDLSRYLNLMNACGEARSLEEAKVVCNYVIKSQTPLKVSTYNKILEMYSKCGSMDDAYMIFNKMPSRNLT
        T+E  D  C +G  +EAV++L+  E +   +DL R L L   CG+  +LE A+VV   +I   +P  V   N I+EMYS C S+DDA  +F +MP  N  
Subjt:  TLEELDEFCREGKLKEAVQILEMFEKQNIPVDLSRYLNLMNACGEARSLEEAKVVCNYVIKSQTPLKVSTYNKILEMYSKCGSMDDAYMIFNKMPSRNLT

Query:  SWDTMITWLAKNGLGEDAIDLFYELKKTGLRIDGKMFIGVFSACSVLGDVDEGMLHFESMTKNYGIIPSMQHYVSIIDMLGSVGYVDEALEFIEKMPFEP
        +   M+     NG GE+AIDLF   K+ G + +G++F  VFS C++ GDV EG L F++M + YGI+PSM+HY S+  ML + G++DEAL F+E+MP EP
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Query:  GVDIWETMMNISRAHGLMELGDRCFELVEQLDPSRLNEQSKAGHLPIKASDLAKEREKKKLANRNLLEVRSRVHEY---RAGDTSHPENDRIYTLLRGLR
         VD+WET+MN+SR HG +ELGDRC ELVE+LD +RL++ S AG +  KASD  K+              RS  + Y   R  D+SHP+ + IY  L  LR
Subjt:  GVDIWETMMNISRAHGLMELGDRCFELVEQLDPSRLNEQSKAGHLPIKASDLAKEREKKKLANRNLLEVRSRVHEY---RAGDTSHPENDRIYTLLRGLR

Query:  EQMKEAGYIPETRFVLHDIDQEGKNDALLGHSERLAVAYGLISSSARSPIRVIKNLRVCGDCHSALKIISKIVGRELIIRDAKRFHHFKDGLCSCH
         Q+KE GY+P+TR+    I      + + G+ E +AV   L+ S  RS I ++ N+R+ GDCH  +K++S I GR++I RDAK +H FK+G+C C+
Subjt:  EQMKEAGYIPETRFVLHDIDQEGKNDALLGHSERLAVAYGLISSSARSPIRVIKNLRVCGDCHSALKIISKIVGRELIIRDAKRFHHFKDGLCSCH

AT2G25580.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein2.9e-12253.96Show/hide
Query:  LEELDEFCREGKLKEAVQILEMFEKQNIPVDLSRYLNLMNACGEARSLEEAKVVCNYVIKSQTPLKVSTYNKILEMYSKCGSMDDAYMIFNKMPSRNLTS
        +EE D FC+ GK+K+A+  +++    N  VDLSR L L   CGEA  L+EAK V   +  S + L +S+ + +LEMYS CG  ++A  +F KM  +NL +
Subjt:  LEELDEFCREGKLKEAVQILEMFEKQNIPVDLSRYLNLMNACGEARSLEEAKVVCNYVIKSQTPLKVSTYNKILEMYSKCGSMDDAYMIFNKMPSRNLTS

Query:  WDTMITWLAKNGLGEDAIDLFYELKKTGLRIDGKMFIGVFSACSVLGDVDEGMLHFESMTKNYGIIPSMQHYVSIIDMLGSVGYVDEALEFIEKMPFEPG
        W  +I   AKNG GEDAID+F   K+ G   DG++F G+F AC +LGDVDEG+LHFESM+++YGI PS++ YVS+++M    G++DEALEF+E+MP EP 
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Query:  VDIWETMMNISRAHGLMELGDRCFELVEQLDPSRLNEQSKAGHLPIKASDLAKEREKKKLANRNLLEVRSRVHEYRAGDTSHPENDRIYTLLRGLREQMK
        VD+WET+MN+SR HG +ELGD C E+VE LDP+RLN+QS+ G +P+KASD+ KE  KK+  +  L  V+S + E+RAGDT+ PEND ++ LLR L+  M 
Subjt:  VDIWETMMNISRAHGLMELGDRCFELVEQLDPSRLNEQSKAGHLPIKASDLAKEREKKKLANRNLLEVRSRVHEYRAGDTSHPENDRIYTLLRGLREQMK

Query:  EAGYIPETRFVLHDIDQEGKNDALLGHSERLAVAYGLISSSARSPIRVIKNLRVCGDCHSALKIISKIVGRELIIRDAKRFHHFKDGLCSC
        E GY+ ETR  LHDIDQE K   LLGHSER+A A  +++S+ R P  VIKNLRVC DCH+ALKI+S IVGRE+I RD KRFH  K+G C+C
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AT2G34370.1 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein7.3e-9743.86Show/hide
Query:  DNPYGGTLEELDEFCREGKLKEAVQILEMFEKQNIPVDLSRYLNLMNACGEARSLEEAKVVCNYVIKSQTPLKVSTYNKILEMYSKCGSMDDAYMIFNKM
        +N    T+E  D  C++ K++EA++++++ E +   VD  R L L   CGE  +LEEA+VV + +    TPL   +Y+ ++EMYS C S DDA  +FN+M
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Query:  PSRNLTSWDTMITWLAKNGLGEDAIDLFYELKKTGLRIDGKMFIGVFSACSVLGDVDEGMLHFESMTKNYGIIPSMQHYVSIIDMLGSVGYVDEALEFIE
        P RN  +W TMI  LAKNG GE AID+F    + G + D ++F  VF AC  +GD++EG+LHFESM ++YG++ SM+ YV++I+ML + G++DEAL+F+E
Subjt:  PSRNLTSWDTMITWLAKNGLGEDAIDLFYELKKTGLRIDGKMFIGVFSACSVLGDVDEGMLHFESMTKNYGIIPSMQHYVSIIDMLGSVGYVDEALEFIE

Query:  KMPFEPGVDIWETMMNISRAHGLMELGDRCFELVEQLDPSRLNEQSKAGHLPIKASDLAKEREKK-KLANRNLLEVRSRVHEYRAGDTSHPENDRIYTLL
        +M  EP V++WET+MN+    G +ELGDR  EL+++LD SR++++S AG +  KASD A E+ K+ +       + + R+HE+RAGDTSH       +  
Subjt:  KMPFEPGVDIWETMMNISRAHGLMELGDRCFELVEQLDPSRLNEQSKAGHLPIKASDLAKEREKK-KLANRNLLEVRSRVHEYRAGDTSHPENDRIYTLL

Query:  RGLREQMKEAGYIPETRFVLHDIDQEGKNDALLGHSERLAVAYGLISSSARSPIRVIKNLRVCGDCHSALKIISKIVGRELIIRDAKRFHHFKDGLCSC
        R L+ QM + G++P TR     +++E K + LL  S +LA A+ +I+S AR P+ V++N+R C D H+  K+IS I GR LI RD K++H +K+G+CSC
Subjt:  RGLREQMKEAGYIPETRFVLHDIDQEGKNDALLGHSERLAVAYGLISSSARSPIRVIKNLRVCGDCHSALKIISKIVGRELIIRDAKRFHHFKDGLCSC

AT4G02750.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein8.1e-8037.06Show/hide
Query:  FCREGKLKEAVQILEMFEKQNIPVDLSRYLNLMNACGEARSLEEAKVVCNYVIKSQTPLKVSTYNKILEMYSKCGSMDDAYMIFNKMPSRNLTSWDTMIT
        + + G   EA+++    E++   ++ S + + ++ C +  +LE  K +   ++K          N +L MY KCGS+++A  +F +M  +++ SW+TMI 
Subjt:  FCREGKLKEAVQILEMFEKQNIPVDLSRYLNLMNACGEARSLEEAKVVCNYVIKSQTPLKVSTYNKILEMYSKCGSMDDAYMIFNKMPSRNLTSWDTMIT

Query:  WLAKNGLGEDAIDLFYELKKTGLRIDGKMFIGVFSACSVLGDVDEGMLHFESMTKNYGIIPSMQHYVSIIDMLGSVGYVDEALEFIEKMPFEPGVDIWET
          +++G GE A+  F  +K+ GL+ D    + V SACS  G VD+G  +F +MT++YG++P+ QHY  ++D+LG  G +++A   ++ MPFEP   IW T
Subjt:  WLAKNGLGEDAIDLFYELKKTGLRIDGKMFIGVFSACSVLGDVDEGMLHFESMTKNYGIIPSMQHYVSIIDMLGSVGYVDEALEFIEKMPFEPGVDIWET

Query:  MMNISRAHGLMELGDRCFELVEQLDPSRLNEQSKAGHLPIKA---SDLAKEREK------KKLANRNLLEVRSRVHEYRAGDTSHPENDRIYTLLRGLRE
        ++  SR HG  EL +   + +  ++P          +L   +    D+ K R +      KK+   + +E++++ H +  GD  HPE D I+  L  L  
Subjt:  MMNISRAHGLMELGDRCFELVEQLDPSRLNEQSKAGHLPIKA---SDLAKEREK------KKLANRNLLEVRSRVHEYRAGDTSHPENDRIYTLLRGLRE

Query:  QMKEAGYIPETRFVLHDIDQEGKNDALLGHSERLAVAYGLISSSARSPIRVIKNLRVCGDCHSALKIISKIVGRELIIRDAKRFHHFKDGLCSC
        +MK+AGY+ +T  VLHD+++E K   +  HSERLAVAYG++  S+  PIRVIKNLRVC DCH+A+K +++I GR +I+RD  RFHHFKDG CSC
Subjt:  QMKEAGYIPETRFVLHDIDQEGKNDALLGHSERLAVAYGLISSSARSPIRVIKNLRVCGDCHSALKIISKIVGRELIIRDAKRFHHFKDGLCSC

AT4G32450.1 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein3.2e-12148.22Show/hide
Query:  YEQ--NSMSQPHPQGQYQQGGSVELYQPNPDTIQSHTIGTQVLNNTNSDEEI------------GVTKDNPYGG-----------TLEELDEFCREGKLK
        YEQ  N +S  +P  ++ Q G    Y  N    QS+   ++++N  N + +             GV ++N  GG           +L+ELD  CREGK+K
Subjt:  YEQ--NSMSQPHPQGQYQQGGSVELYQPNPDTIQSHTIGTQVLNNTNSDEEI------------GVTKDNPYGG-----------TLEELDEFCREGKLK

Query:  EAVQILEMFEKQNIPVDLSRYLNLMNACGEARSLEEAKVVCNYVIKSQTPLKVSTYNKILEMYSKCGSMDDAYMIFNKMPSRNLTSWDTMITWLAKNGLG
        +AV+I++ +  +   VDL R   +   CG+A++L+EAKVV  ++  S     +S YN I+EMYS CGS++DA  +FN MP RNL +W  +I   AKNG G
Subjt:  EAVQILEMFEKQNIPVDLSRYLNLMNACGEARSLEEAKVVCNYVIKSQTPLKVSTYNKILEMYSKCGSMDDAYMIFNKMPSRNLTSWDTMITWLAKNGLG

Query:  EDAIDLFYELKKTGLRIDGKMFIGVFSACSVLGDVDEGMLHFESMTKNYGIIPSMQHYVSIIDMLGSVGYVDEALEFIEKMPFEPGVDIWETMMNISRAH
        EDAID F   K+ G + DG+MF  +F AC VLGD++EG+LHFESM K YGIIP M+HYVS++ ML   GY+DEAL F+E M  EP VD+WET+MN+SR H
Subjt:  EDAIDLFYELKKTGLRIDGKMFIGVFSACSVLGDVDEGMLHFESMTKNYGIIPSMQHYVSIIDMLGSVGYVDEALEFIEKMPFEPGVDIWETMMNISRAH

Query:  GLMELGDRCFELVEQLDPSRLNEQSKAGHLPIKASDLAKEREKKKLANRNLLEVRSRVHEYRAGDTSHPENDRIYTLLRGLREQMKEAGYIPETRFVLHD
        G + LGDRC ++VEQLD SRLN++SKAG +P+K+SDL KE+ ++     N       +    AGD S PEN  +Y  L+ L+E M E GY+P ++  LHD
Subjt:  GLMELGDRCFELVEQLDPSRLNEQSKAGHLPIKASDLAKEREKKKLANRNLLEVRSRVHEYRAGDTSHPENDRIYTLLRGLREQMKEAGYIPETRFVLHD

Query:  IDQEGKNDALLGHSERLAVAYGLISSSARSPIRVIKNLRVCGDCHSALKIISKIVGRELIIRDAKRFHHFKDGLCSC
        +DQE K++ L  H+ER A     + + ARS IRV+KNLRVC DCH+ALK++SKIVGRELI RDAKRFHH KDG+CSC
Subjt:  IDQEGKNDALLGHSERLAVAYGLISSSARSPIRVIKNLRVCGDCHSALKIISKIVGRELIIRDAKRFHHFKDGLCSC


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTGTAAGAAGAGAGCTGCAATTCTTGCTAGACGCTCCTTAATAGCACTATGCAACATACGATCTTCATGTAGCTCCTCAGTATCAAACAAAGTCCTAAATCAAGTTAG
AAATTTAAGCATTGCTTCTGAAAGAGAGGAATATCAGAACGATAATGGATATCATGCAGATAACTCTTTGCAGAGTTACCAAAGCCATGGTGGATTTAGAAGTGACAGCC
AAAGCCCTGGGTACTATCAGCATCATGCCCAAAGTGCCAGTTTCCAAAGCTCTTCTTGGCCTAATCAGAATATTCTACTTGAGCGTAGAGAAAATTTAACTGCTTACAAT
GGGTTTAACAATGGAGAACTGCAGCAGAACAATTACGAGGTTTCTGGACAGAATTCATGGGGCACACAGATTGAATCCAGACAATTTGTACATGGCAACAGCCTAAATTA
CCACAATTCTATGCCAGGACTAAACAACCATATTCCCATCTCAAGACAATATGAGCAAAACTCCATGTCTCAGCCACATCCACAGGGGCAATATCAACAAGGTGGCAGTG
TTGAACTATATCAGCCAAACCCAGATACTATTCAGAGTCACACGATTGGTACTCAAGTATTAAACAACACCAATTCTGATGAGGAAATTGGCGTGACTAAGGATAACCCA
TATGGTGGTACCCTTGAGGAGCTTGATGAATTCTGCAGGGAAGGAAAATTGAAGGAGGCTGTGCAAATTCTGGAAATGTTTGAGAAACAAAACATTCCTGTTGATTTATC
CCGGTATTTAAATTTGATGAATGCATGTGGGGAAGCAAGGTCCCTAGAAGAAGCCAAAGTGGTTTGTAATTACGTAATAAAATCTCAAACCCCTCTCAAAGTTAGCACCT
ATAACAAAATTCTGGAGATGTACTCTAAATGTGGTTCCATGGATGATGCCTATATGATATTCAACAAAATGCCCAGCCGCAACCTAACATCTTGGGATACTATGATTACA
TGGCTTGCCAAGAATGGCCTAGGGGAAGATGCTATTGACCTTTTCTACGAGTTAAAAAAAACTGGGTTGAGAATTGATGGAAAAATGTTCATTGGAGTTTTCTCAGCATG
TAGTGTCTTGGGAGATGTTGATGAGGGGATGTTACACTTTGAATCAATGACAAAGAATTATGGCATCATTCCTTCTATGCAACATTATGTTAGTATAATAGACATGCTTG
GTAGTGTAGGTTATGTAGATGAAGCTTTGGAGTTCATTGAAAAGATGCCATTTGAGCCAGGGGTAGATATTTGGGAAACAATGATGAATATCTCTAGAGCTCATGGGTTG
ATGGAGCTTGGTGATCGTTGTTTTGAGCTTGTTGAGCAGCTTGATCCCTCTCGCTTAAATGAGCAGTCAAAAGCTGGCCATCTGCCTATAAAAGCTTCAGACCTCGCAAA
AGAGAGAGAGAAGAAAAAATTAGCCAACCGGAACCTTTTAGAAGTCAGGAGCCGAGTACATGAATATCGAGCTGGAGATACTTCTCACCCTGAGAATGACAGGATCTATA
CCTTGCTTAGGGGTTTGAGAGAACAAATGAAGGAGGCTGGTTATATTCCAGAGACTCGATTTGTACTCCATGATATAGATCAGGAAGGCAAAAATGATGCTCTACTTGGT
CATAGTGAGAGACTTGCTGTTGCATATGGTCTAATCAGCAGCTCAGCCCGTTCACCCATAAGAGTAATTAAGAACCTTCGAGTTTGTGGTGATTGCCATAGTGCACTAAA
GATAATCTCAAAAATTGTGGGTCGAGAACTCATCATCCGTGATGCTAAGAGATTTCACCATTTTAAAGATGGATTATGCTCTTGCCATTACATGCTTCCTTGTTCACGAG
CTGTTTCAGAAGGTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTGTAAGAAGAGAGCTGCAATTCTTGCTAGACGCTCCTTAATAGCACTATGCAACATACGATCTTCATGTAGCTCCTCAGTATCAAACAAAGTCCTAAATCAAGTTAG
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CTGTTTCAGAAGGTTAGCTTTTTTAGTAGGTATTTCTCATCTTCCCCTCTGGCTATTGTAGAAGCACTATGACAGATAAATGCACAACTCTCATTGCATATGCATCTTCT
GCAGCTCCATTACCATGTTCAAAAGGGTGTCGAGGTTCAAAATTAACAGAAAGTTCAAAATTACTATTCCCAGGCAAAGTCACCGAACTCTCACACTTGGTGGAGGCTTA
GGCTTGAGAATGTATGGAACAAACCGTTGATGGCTTGTGCCTGGGCTCGGATCAAACCTAAACTATTCTTCCTAAACTGCAGCTATTATTTCTCGACATCTCTTATTTAC
TTAGTAATGTAATCACCATTATCAATAACCCCAATTTTGATGTAGCAAGATAACTAGTGATAGACAAATTGGAGCCAAGCAGTCGGTCAAACTAAACAAAAGTCGAATTG
AACAAATTCTATTTTGTTTTCCCAATGATTTATTGGTTCAATTCTATGTACTATTTTATATTTGGATTGGTTTGATCAAAGTTCTATAGAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MCKKRAAILARRSLIALCNIRSSCSSSVSNKVLNQVRNLSIASEREEYQNDNGYHADNSLQSYQSHGGFRSDSQSPGYYQHHAQSASFQSSSWPNQNILLERRENLTAYN
GFNNGELQQNNYEVSGQNSWGTQIESRQFVHGNSLNYHNSMPGLNNHIPISRQYEQNSMSQPHPQGQYQQGGSVELYQPNPDTIQSHTIGTQVLNNTNSDEEIGVTKDNP
YGGTLEELDEFCREGKLKEAVQILEMFEKQNIPVDLSRYLNLMNACGEARSLEEAKVVCNYVIKSQTPLKVSTYNKILEMYSKCGSMDDAYMIFNKMPSRNLTSWDTMIT
WLAKNGLGEDAIDLFYELKKTGLRIDGKMFIGVFSACSVLGDVDEGMLHFESMTKNYGIIPSMQHYVSIIDMLGSVGYVDEALEFIEKMPFEPGVDIWETMMNISRAHGL
MELGDRCFELVEQLDPSRLNEQSKAGHLPIKASDLAKEREKKKLANRNLLEVRSRVHEYRAGDTSHPENDRIYTLLRGLREQMKEAGYIPETRFVLHDIDQEGKNDALLG
HSERLAVAYGLISSSARSPIRVIKNLRVCGDCHSALKIISKIVGRELIIRDAKRFHHFKDGLCSCHYMLPCSRAVSEG