; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg24979 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg24979
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionUPF0301 protein
Genome locationCarg_Chr15:180456..184784
RNA-Seq ExpressionCarg24979
SyntenyCarg24979
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR003774 - Protein of unknown function UPF0301


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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A0A5A7T638 UPF0301 protein5.1e-18387.03Show/hide
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A1BEV6 UPF0301 protein Cpha266_08857.7e-1928.12Show/hide
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        GL +G     ++ + L+  G+++P + RFF+GY+GW   QL EE E   WY+A  S ++I   A     E +W   ++  GG+Y  ++  P+
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B3QMC9 UPF0301 protein Cpar_06621.0e-1828.65Show/hide
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        GL +G     ++ + L+  G+++P + RFF+GYAGW   QL++E E   WY A  S+  +         E +W   ++  GGDY  ++  P+
Subjt:  GLCFGARNSLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYVAACSSNLICGGASDSSSEGLWEEILQLMGGDYSELSRKPK

Q3AQ69 UPF0301 protein Cag_16011.1e-2031.21Show/hide
Query:  FERTVILLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNLDLATTFSDCSLHFGGPLEASMFLLKTGEKSKLHGFEEVIPGLCFGARNSLDEAAVLVKK
        F+RTV+L+      H +EG  G ++NRPL  K++       D+     D  LH GGP++ +           +H  +EV+PG+ +G     DE + L+  
Subjt:  FERTVILLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNLDLATTFSDCSLHFGGPLEASMFLLKTGEKSKLHGFEEVIPGLCFGARNSLDEAAVLVKK

Query:  GILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYVAACSSNLICGGASDSSSEGLWEEILQLMGGDYSELSRKPK
        G++ P + RF++GYAGW   QL  E E   WY A  + ++I   A     E +W   ++  GG Y  ++  P+
Subjt:  GILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYVAACSSNLICGGASDSSSEGLWEEILQLMGGDYSELSRKPK

Q3B561 UPF0301 protein Plut_06372.6e-1929.14Show/hide
Query:  FERTVILLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNLDLATTFS--DCSLHFGGPLEASMFLLKTGEKSKLHGFEEVIPGLCFGARNSLDEAAVLV
        F+RTV+++      H  +G  G ++NRP+  +++       +    F   D  LH GGP++++           + G E+++PGL +G     +E   L+
Subjt:  FERTVILLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNLDLATTFS--DCSLHFGGPLEASMFLLKTGEKSKLHGFEEVIPGLCFGARNSLDEAAVLV

Query:  KKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYVAACSSNLICGGASDSSSEGLWEEILQLMGGDYSELSRKPK
          G+LKP + RFF+GYAGW   QL  E E   WY A  +  ++  G      E +W   ++  GG+Y  ++  P+
Subjt:  KKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYVAACSSNLICGGASDSSSEGLWEEILQLMGGDYSELSRKPK

Q8KEM4 UPF0301 protein CT06632.9e-1830.29Show/hide
Query:  FERTVILLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNLDLATTFS--DCSLHFGGPLEASMFLLKTGEKSKLHGFEEVIPGLCFGARNSLDEAAVLV
        F+RTV+L+      H +EG  G ++N+P+  K+        +  + F   D  LH GGP++     +       + G  EVIPGL +G     ++ + L+
Subjt:  FERTVILLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNLDLATTFS--DCSLHFGGPLEASMFLLKTGEKSKLHGFEEVIPGLCFGARNSLDEAAVLV

Query:  KKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYVAACSSNLICGGASDSSSEGLWEEILQLMGGDYSELSRKPK
          G++K  + RFF+GYAGW   QL  E E   WY A  SS  +         E +W   ++  GG+Y  ++  P+
Subjt:  KKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYVAACSSNLICGGASDSSSEGLWEEILQLMGGDYSELSRKPK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G33780.1 Protein of unknown function (DUF179)2.2e-11768.49Show/hide
Query:  LEIRVFRPRICSPVSVSRSFLVRAIAKKNQDNSPSPENGDHSVPGDDAKSNNISDASKSNETSSKKAHHINLDWREFRANLFSREQAEKVEADMDVQSEN
        LE R    ++ +  S  RS +VRA +KK+ D+S S        PGD ++ N  S+ +KS ++++ K+  +N DWREFRANLF +EQ EK EA+       
Subjt:  LEIRVFRPRICSPVSVSRSFLVRAIAKKNQDNSPSPENGDHSVPGDDAKSNNISDASKSNETSSKKAHHINLDWREFRANLFSREQAEKVEADMDVQSEN

Query:  AHESKTLGLKWAHPIPVPETGCVLVATEKLDGVRTFERTVILLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNLDLATTFSDCSLHFGGPLEASMFLL
         HES+ +GLKWAHPIP PETGCVLVATEKLDG RTF RTV+LLLR+G+RHPQEGPFGVVINRPLHK IKHMK T  +LATTFS+CSL+FGGPLEASMFLL
Subjt:  AHESKTLGLKWAHPIPVPETGCVLVATEKLDGVRTFERTVILLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNLDLATTFSDCSLHFGGPLEASMFLL

Query:  KTGEKSKLHGFEEVIPGLCFGARNSLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYVAACSSNLICGGASDSSSEGLWEEILQLMGGDY
        KTG+K+K+ GFEEV+PGL FG RNSLDEAAVLVKKG+LKPQ+FRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYW+VAACSS+LICG    +SSE LWEEILQLMGG Y
Subjt:  KTGEKSKLHGFEEVIPGLCFGARNSLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYVAACSSNLICGGASDSSSEGLWEEILQLMGGDY

Query:  SELSRKPKQDM
        SELSRKPK D+
Subjt:  SELSRKPKQDM

AT3G19780.1 LOCATED IN: endomembrane system3.1e-1531.85Show/hide
Query:  PVPETGCVLVATEKLDGVRTFERTVILLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNLDLATTFSDCSLHFGGPLE----ASMFLLKTGEKSKLHGF
        P  +TG VLVATEKL    TF ++ IL++++G   P+ G  G++ N+ +  K     P   + A    +  L FGGP+       + L +  + S  H  
Subjt:  PVPETGCVLVATEKLDGVRTFERTVILLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNLDLATTFSDCSLHFGGPLE----ASMFLLKTGEKSKLHGF

Query:  EEVIPGLCFGARNSLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYV
         E+ PG+ F    S+      +K   L P ++ FF+GY+ W  +QL +EI    W V
Subjt:  EEVIPGLCFGARNSLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYV

AT3G19780.2 LOCATED IN: endomembrane system3.1e-1531.85Show/hide
Query:  PVPETGCVLVATEKLDGVRTFERTVILLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNLDLATTFSDCSLHFGGPLE----ASMFLLKTGEKSKLHGF
        P  +TG VLVATEKL    TF ++ IL++++G   P+ G  G++ N+ +  K     P   + A    +  L FGGP+       + L +  + S  H  
Subjt:  PVPETGCVLVATEKLDGVRTFERTVILLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNLDLATTFSDCSLHFGGPLE----ASMFLLKTGEKSKLHGF

Query:  EEVIPGLCFGARNSLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYV
         E+ PG+ F    S+      +K   L P ++ FF+GY+ W  +QL +EI    W V
Subjt:  EEVIPGLCFGARNSLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYV

AT3G29240.1 Protein of unknown function (DUF179)2.7e-5147.28Show/hide
Query:  DWREFRANLFSREQAEKVEADMDVQSE---------NAHESKTLGLKWAHPIPVPETGCVLVATEKLDGVRTFERTVILLLRSGSRHPQEGPFGVVINRP
        DWREFRA L + EQA   E D    S          ++    T+G KWAH I  PETGC+L+ATEKLDGV  FE+TVILLL  G      GP GV++NRP
Subjt:  DWREFRANLFSREQAEKVEADMDVQSE---------NAHESKTLGLKWAHPIPVPETGCVLVATEKLDGVRTFERTVILLLRSGSRHPQEGPFGVVINRP

Query:  LHKKIKHMKPTNLDLATTFSDCSLHFGGPLEASMFLLK-----TGEKSKLHGFEEVIPGLCFGARNSLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLR
            IK  K T LD+A TFSD  L FGGPLE  +FL+        E  K   F +V+ GL +G R S+  AA +VK+ ++   + RFF GY GW+ +QL+
Subjt:  LHKKIKHMKPTNLDLATTFSDCSLHFGGPLEASMFLLK-----TGEKSKLHGFEEVIPGLCFGARNSLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLR

Query:  EEIESDYWYVAACSSNLICGGASDSSSEGLWEEILQLMG
         EI   YW VAACSS ++  G S   S GLW+E+L L+G
Subjt:  EEIESDYWYVAACSSNLICGGASDSSSEGLWEEILQLMG

AT3G29240.2 Protein of unknown function (DUF179)2.7e-5147.28Show/hide
Query:  DWREFRANLFSREQAEKVEADMDVQSE---------NAHESKTLGLKWAHPIPVPETGCVLVATEKLDGVRTFERTVILLLRSGSRHPQEGPFGVVINRP
        DWREFRA L + EQA   E D    S          ++    T+G KWAH I  PETGC+L+ATEKLDGV  FE+TVILLL  G      GP GV++NRP
Subjt:  DWREFRANLFSREQAEKVEADMDVQSE---------NAHESKTLGLKWAHPIPVPETGCVLVATEKLDGVRTFERTVILLLRSGSRHPQEGPFGVVINRP

Query:  LHKKIKHMKPTNLDLATTFSDCSLHFGGPLEASMFLLK-----TGEKSKLHGFEEVIPGLCFGARNSLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLR
            IK  K T LD+A TFSD  L FGGPLE  +FL+        E  K   F +V+ GL +G R S+  AA +VK+ ++   + RFF GY GW+ +QL+
Subjt:  LHKKIKHMKPTNLDLATTFSDCSLHFGGPLEASMFLLK-----TGEKSKLHGFEEVIPGLCFGARNSLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLR

Query:  EEIESDYWYVAACSSNLICGGASDSSSEGLWEEILQLMG
         EI   YW VAACSS ++  G S   S GLW+E+L L+G
Subjt:  EEIESDYWYVAACSSNLICGGASDSSSEGLWEEILQLMG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATCTCTTTGCTGTAAATGTCAAGAACACCGCCACTCCTCCACCGCCCTTCTCACTCAAACACTCCTTTCCCGACAGACCCATTTCTTGCTCTTTGGCGAAGCCTTC
GAGGAGATTTTCTTGTTCGCATCCCTTTGGCGCTCAACTTCTCCGCCTGCTTGAGATCCGAGTATTCAGGCCCAGGATTTGCTCTCCCGTTTCTGTCTCTCGCTCCTTTC
TGGTGAGAGCGATTGCGAAGAAGAATCAAGACAATTCTCCGTCTCCTGAAAATGGAGATCACTCAGTTCCTGGAGACGACGCTAAATCAAACAATATTTCTGATGCCAGC
AAAAGTAATGAAACTTCTTCCAAGAAAGCGCATCATATTAATTTGGACTGGCGAGAATTCAGAGCAAACTTATTCTCACGCGAGCAGGCAGAAAAGGTCGAAGCTGACAT
GGACGTCCAGAGTGAAAATGCTCACGAGTCTAAGACTCTCGGCCTGAAGTGGGCACATCCTATTCCTGTACCTGAGACTGGCTGTGTCCTTGTTGCCACAGAGAAGTTGG
ACGGTGTTCGCACTTTTGAGCGAACAGTCATCCTTCTCCTCAGATCTGGAAGCAGACATCCTCAGGAGGGGCCGTTCGGGGTTGTGATTAACCGCCCACTCCACAAAAAG
ATCAAGCACATGAAACCAACCAATCTTGACCTAGCAACTACATTTTCTGATTGCTCCCTACACTTTGGGGGGCCTCTTGAGGCGAGCATGTTTTTGCTGAAAACAGGAGA
AAAATCAAAACTACATGGGTTTGAAGAAGTGATCCCAGGCCTCTGCTTTGGCGCTCGAAACAGCCTCGATGAAGCTGCAGTGCTGGTGAAGAAGGGAATCCTTAAACCTC
AGGACTTCAGATTCTTTGTGGGTTATGCTGGGTGGCAACTGGATCAATTGAGGGAGGAAATTGAATCAGATTACTGGTATGTGGCAGCTTGTAGCTCAAATCTAATCTGT
GGAGGCGCATCAGATTCCTCATCAGAGGGACTGTGGGAGGAGATATTGCAATTGATGGGCGGTGACTATTCAGAGTTGAGCAGAAAGCCTAAGCAAGATATGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ACATCTCCTTTTCATTCACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCCTTCACCTTAACTGTTAGCTGCTGATTGTTTGGCTTTCTATCTTCAATATATATCGCCTTAATATTCTCT
CCTTTTCTCTTTTCTCCACATCTCTACTGTTCTCGGGTGGATTGGATCATCCTTTCCGACGCTTCTATCTAATTTCCCGGCCAAATTCGTTTCCGATATGGATCTCTTTG
CTGTAAATGTCAAGAACACCGCCACTCCTCCACCGCCCTTCTCACTCAAACACTCCTTTCCCGACAGACCCATTTCTTGCTCTTTGGCGAAGCCTTCGAGGAGATTTTCT
TGTTCGCATCCCTTTGGCGCTCAACTTCTCCGCCTGCTTGAGATCCGAGTATTCAGGCCCAGGATTTGCTCTCCCGTTTCTGTCTCTCGCTCCTTTCTGGTGAGAGCGAT
TGCGAAGAAGAATCAAGACAATTCTCCGTCTCCTGAAAATGGAGATCACTCAGTTCCTGGAGACGACGCTAAATCAAACAATATTTCTGATGCCAGCAAAAGTAATGAAA
CTTCTTCCAAGAAAGCGCATCATATTAATTTGGACTGGCGAGAATTCAGAGCAAACTTATTCTCACGCGAGCAGGCAGAAAAGGTCGAAGCTGACATGGACGTCCAGAGT
GAAAATGCTCACGAGTCTAAGACTCTCGGCCTGAAGTGGGCACATCCTATTCCTGTACCTGAGACTGGCTGTGTCCTTGTTGCCACAGAGAAGTTGGACGGTGTTCGCAC
TTTTGAGCGAACAGTCATCCTTCTCCTCAGATCTGGAAGCAGACATCCTCAGGAGGGGCCGTTCGGGGTTGTGATTAACCGCCCACTCCACAAAAAGATCAAGCACATGA
AACCAACCAATCTTGACCTAGCAACTACATTTTCTGATTGCTCCCTACACTTTGGGGGGCCTCTTGAGGCGAGCATGTTTTTGCTGAAAACAGGAGAAAAATCAAAACTA
CATGGGTTTGAAGAAGTGATCCCAGGCCTCTGCTTTGGCGCTCGAAACAGCCTCGATGAAGCTGCAGTGCTGGTGAAGAAGGGAATCCTTAAACCTCAGGACTTCAGATT
CTTTGTGGGTTATGCTGGGTGGCAACTGGATCAATTGAGGGAGGAAATTGAATCAGATTACTGGTATGTGGCAGCTTGTAGCTCAAATCTAATCTGTGGAGGCGCATCAG
ATTCCTCATCAGAGGGACTGTGGGAGGAGATATTGCAATTGATGGGCGGTGACTATTCAGAGTTGAGCAGAAAGCCTAAGCAAGATATGTAGTTTTCTATATGAAGGAAC
ATTAAAAATCTCTGAAGCTGAAGGTGTAATCAAAGTTGAAGCCATAAAAGCTGAAAGCCAAATGTACAGAAGTTAGCTGGCTTTTGAAATTTAGCAGACTTCATCTCTTT
CTCTAAGGACAACAACGATCTCTTATAATACCTACTTATAAATGTAATTTATGTAGAGACAGTATTGTGTTGTGTTCACATTTGCTTGATCGATTCAAAATAGCTTTAGA
ATGTGTCTATATCTGATATTAATTCAAACTTTTACCGTACGGCGCATGGCCAGGGCTGCCAACGTAATACTCATCCCTTTTGTTATAAATGCAACTCCCACTTTTGAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDLFAVNVKNTATPPPPFSLKHSFPDRPISCSLAKPSRRFSCSHPFGAQLLRLLEIRVFRPRICSPVSVSRSFLVRAIAKKNQDNSPSPENGDHSVPGDDAKSNNISDAS
KSNETSSKKAHHINLDWREFRANLFSREQAEKVEADMDVQSENAHESKTLGLKWAHPIPVPETGCVLVATEKLDGVRTFERTVILLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKK
IKHMKPTNLDLATTFSDCSLHFGGPLEASMFLLKTGEKSKLHGFEEVIPGLCFGARNSLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYVAACSSNLIC
GGASDSSSEGLWEEILQLMGGDYSELSRKPKQDM