; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg25194 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg25194
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptiontranscription factor Pur-alpha 1-like
Genome locationCarg_Chr11:3522450..3526342
RNA-Seq ExpressionCarg25194
SyntenyCarg25194
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0000977 - RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
GO:0032422 - purine-rich negative regulatory element binding (molecular function)
InterPro domainsIPR006628 - Purine-rich element binding protein family


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6588115.1 Transcription factor Pur-alpha 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.3e-16595.9Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S4DZ49 transcription factor Pur-alpha 1 isoform X13.4e-15989.05Show/hide
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A0A6J1H823 transcription factor Pur-alpha 1-like1.2e-15992.45Show/hide
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A0A6J1HVP1 transcription factor Pur-alpha 1-like2.7e-16495.3Show/hide
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A0A6J1JGC7 transcription factor Pur-alpha 1-like3.4e-15992.43Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O35295 Transcriptional activator protein Pur-beta3.4e-1530.33Show/hide
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P42669 Transcriptional activator protein Pur-alpha9.0e-1628.28Show/hide
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Q00577 Transcriptional activator protein Pur-alpha1.2e-1528.19Show/hide
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         LP Q   E  + L  L DD G                           ++E   L     +  D KRFFFD+GSN  G F+R+SEV    R+SI +P
Subjt:  ILPNQENSEHSERLVGLSDDVGAGFISGHSSQPGPTSDLNVDRQVDLSAQDEMGNLGVSKVIRADQKRFFFDLGSNNRGHFLRISEVAGADRSSIILP

Q68A21 Transcriptional activator protein Pur-beta1.9e-1329.67Show/hide
Query:  SSGGGGVSIGGTTAGSVAVGGVTGGGGGGGNDV-ELMCKTLQVEHKLFYFDLKENPRGRYLKISE-KTSATRSTIIVPFSGIPWFLDLFNYYINSDDPEV
        + G  G   GG   GS       GGG GG  +  EL  K L +++K FY D+K+N +GR+LKI+E     ++S + +  +    F D    +I       
Subjt:  SSGGGGVSIGGTTAGSVAVGGVTGGGGGGGNDV-ELMCKTLQVEHKLFYFDLKENPRGRYLKISE-KTSATRSTIIVPFSGIPWFLDLFNYYINSDDPEV

Query:  FSKELQLDTKAP----LFLYLFSLFIV-----FYFDIGENRRGRFLKVSEASVSRNRSTIIVPAGSNRDEGWTAFRNILAEINEASRLFILPNQENSEHS
         S   QL   A         L S F+V     +Y D+ EN+RGRFL++ + +V+R         G     G            ++ +   LP Q   E  
Subjt:  FSKELQLDTKAP----LFLYLFSLFIV-----FYFDIGENRRGRFLKVSEASVSRNRSTIIVPAGSNRDEGWTAFRNILAEINEASRLFILPNQENSEHS

Query:  ERLVGLSDDVG------AGFISGHSSQPGPTSDLNVDRQVDLSAQDEMGNLGVSKVIRADQKRFFFDLGSNNRGHFLRISEVAGADRSSIILPLSGLKQF
        + L  L DD G      AG   G +  PG                   G L     I  D KRFFFD+G N  G FLR+SEV  + R++I +P     +F
Subjt:  ERLVGLSDDVG------AGFISGHSSQPGPTSDLNVDRQVDLSAQDEMGNLGVSKVIRADQKRFFFDLGSNNRGHFLRISEVAGADRSSIILPLSGLKQF

Q9SKZ1 Transcription factor Pur-alpha 13.4e-12475.16Show/hide
Query:  MEGSSGGGGVSIGGTTAGSVAVGGVTGGGGGGGNDVELMCKTLQVEHKLFYFDLKENPRGRYLKISEKTSATRSTIIVPFSGIPWFLDLFNYYINSDDPE
        ME +SGGGG + GG      AV G  GGGGGGG+DVEL+ KTLQVEHKLFYFDLKENPRGRYLKISEKTSATRSTIIVP SGI WFLDLFNYY+NS++ E
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Query:  VFSKELQLDTKAPLFLYLFSLFIVFYFDIGENRRGRFLKVSEASVSRNRSTIIVPAGSNRDEGWTAFRNILAEINEASRLFILPNQ-ENSEHSERLVGLS
        +FSKELQLD+K            VFYFDIGENRRGRFLKVSEASVSRNRSTIIVPAGS+ DEGW AFRNILAEI+EAS LF++PNQ + S+  E LV   
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Query:  DDVGAGFISGHSSQPGPTSDLNVDRQVDLSAQDEMGNLGVSKVIRADQKRFFFDLGSNNRGHFLRISEVAGADRSSIILPLSGLKQFYEIVGHFVEITKD
        DDVGAGFI GH SQ   +S+ NVDR +D   Q+E G  GVSKVIRADQKRFFFDLG+NNRGHFLRISEVAG+DRSSIILPLSGLKQF+E++GHFVEITKD
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Query:  RIEGMTGVNVRTVDPPHR
        +IEGMTG NVRTVDPP R
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G32080.1 purin-rich alpha 12.4e-12575.16Show/hide
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        ME +SGGGG + GG      AV G  GGGGGGG+DVEL+ KTLQVEHKLFYFDLKENPRGRYLKISEKTSATRSTIIVP SGI WFLDLFNYY+NS++ E
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        +FSKELQLD+K            VFYFDIGENRRGRFLKVSEASVSRNRSTIIVPAGS+ DEGW AFRNILAEI+EAS LF++PNQ + S+  E LV   
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Query:  DDVGAGFISGHSSQPGPTSDLNVDRQVDLSAQDEMGNLGVSKVIRADQKRFFFDLGSNNRGHFLRISEVAGADRSSIILPLSGLKQFYEIVGHFVEITKD
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AT2G32080.2 purin-rich alpha 19.9e-12775.39Show/hide
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        ME +SGGGG + GG      AV G  GGGGGGG+DVEL+ KTLQVEHKLFYFDLKENPRGRYLKISEKTSATRSTIIVP SGI WFLDLFNYY+NS++ E
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Query:  VFSKELQLDTKAPLFLYLFSLFIVFYFDIGENRRGRFLKVSEASVSRNRSTIIVPAGSNRDEGWTAFRNILAEINEASRLFILPNQENSEHSERLVGLSD
        +FSKELQLD+K            VFYFDIGENRRGRFLKVSEASVSRNRSTIIVPAGS+ DEGW AFRNILAEI+EAS LF++PNQ+ S+  E LV   D
Subjt:  VFSKELQLDTKAPLFLYLFSLFIVFYFDIGENRRGRFLKVSEASVSRNRSTIIVPAGSNRDEGWTAFRNILAEINEASRLFILPNQENSEHSERLVGLSD

Query:  DVGAGFISGHSSQPGPTSDLNVDRQVDLSAQDEMGNLGVSKVIRADQKRFFFDLGSNNRGHFLRISEVAGADRSSIILPLSGLKQFYEIVGHFVEITKDR
        DVGAGFI GH SQ   +S+ NVDR +D   Q+E G  GVSKVIRADQKRFFFDLG+NNRGHFLRISEVAG+DRSSIILPLSGLKQF+E++GHFVEITKD+
Subjt:  DVGAGFISGHSSQPGPTSDLNVDRQVDLSAQDEMGNLGVSKVIRADQKRFFFDLGSNNRGHFLRISEVAGADRSSIILPLSGLKQFYEIVGHFVEITKDR

Query:  IEGMTGVNVRTVDPPHR
        IEGMTG NVRTVDPP R
Subjt:  IEGMTGVNVRTVDPPHR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGGGGAGTTCCGGCGGAGGTGGAGTGAGTATTGGGGGAACGACGGCGGGCAGCGTGGCGGTGGGTGGAGTGACGGGTGGCGGCGGCGGAGGAGGAAACGACGTGGA
GTTGATGTGCAAAACATTGCAGGTGGAGCACAAATTGTTCTACTTCGATCTGAAGGAGAATCCCAGAGGCCGATATCTGAAGATTTCAGAGAAGACGTCGGCTACAAGGT
CAACGATCATTGTTCCCTTCTCTGGGATTCCATGGTTCTTAGATCTCTTCAATTACTATATCAATTCTGATGATCCGGAGGTTTTTAGCAAGGAATTGCAGCTCGACACC
AAGGCACCTTTGTTCCTCTATCTCTTTTCTCTGTTCATCGTGTTCTACTTTGACATTGGTGAAAATCGTAGGGGTCGATTCTTGAAGGTATCTGAAGCTTCTGTCAGTAG
AAACCGCAGCACCATTATCGTTCCTGCTGGAAGCAATCGGGACGAGGGATGGACTGCGTTCAGAAACATTTTGGCAGAGATCAATGAAGCGTCTAGGCTTTTCATACTGC
CCAATCAGGAAAATTCCGAACATTCAGAACGTCTAGTCGGACTTTCGGATGATGTAGGTGCTGGCTTCATATCAGGTCATAGTAGTCAACCTGGTCCAACCTCTGACTTG
AATGTAGACAGACAAGTAGACTTATCAGCTCAAGATGAAATGGGCAATCTGGGGGTATCAAAAGTTATCCGAGCTGATCAGAAGCGATTCTTTTTCGATCTTGGAAGTAA
CAACCGGGGTCATTTTTTGAGGATATCTGAGGTTGCAGGGGCAGATCGTTCTTCGATCATTCTCCCATTGTCGGGGCTAAAGCAGTTCTATGAAATAGTTGGACATTTCG
TGGAGATCACCAAAGATAGGATTGAAGGAATGACGGGCGTGAATGTTAGGACGGTGGATCCGCCTCATAGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAGGGGAGTTCCGGCGGAGGTGGAGTGAGTATTGGGGGAACGACGGCGGGCAGCGTGGCGGTGGGTGGAGTGACGGGTGGCGGCGGCGGAGGAGGAAACGACGTGGA
GTTGATGTGCAAAACATTGCAGGTGGAGCACAAATTGTTCTACTTCGATCTGAAGGAGAATCCCAGAGGCCGATATCTGAAGATTTCAGAGAAGACGTCGGCTACAAGGT
CAACGATCATTGTTCCCTTCTCTGGGATTCCATGGTTCTTAGATCTCTTCAATTACTATATCAATTCTGATGATCCGGAGGTTTTTAGCAAGGAATTGCAGCTCGACACC
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TGGAGATCACCAAAGATAGGATTGAAGGAATGACGGGCGTGAATGTTAGGACGGTGGATCCGCCTCATAGATGAACACTATAGGCCCAGGGGGGTTTGTGGTGAATAATT
TCGGTTAATGTTTGTGTAGATGATGTTCGAGTAGGGTTGAAATTGTGGTGGGTGTGGTTTGATATTGTGTCGTCGTCGTCGTCTTGATTTTCTAGTTCTAAGTCTGAATA
ATCCATGCTGCTTGATCAGCAGAGGCTATGGAAAATGCTTGAGAAGCTTAATTATTCTTCTTCCATGAATAACACAAGAGAGGGGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGA
AACGATGCTTGTAATTGTCACTTTATAATAATGGTGTGTTCAGGTGTGTTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEGSSGGGGVSIGGTTAGSVAVGGVTGGGGGGGNDVELMCKTLQVEHKLFYFDLKENPRGRYLKISEKTSATRSTIIVPFSGIPWFLDLFNYYINSDDPEVFSKELQLDT
KAPLFLYLFSLFIVFYFDIGENRRGRFLKVSEASVSRNRSTIIVPAGSNRDEGWTAFRNILAEINEASRLFILPNQENSEHSERLVGLSDDVGAGFISGHSSQPGPTSDL
NVDRQVDLSAQDEMGNLGVSKVIRADQKRFFFDLGSNNRGHFLRISEVAGADRSSIILPLSGLKQFYEIVGHFVEITKDRIEGMTGVNVRTVDPPHR