; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg25380 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg25380
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionRas-related protein Rab-1A
Genome locationCarg_Chr16:5222926..5226967
RNA-Seq ExpressionCarg25380
SyntenyCarg25380
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0012505 - endomembrane system (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L6Q4 Uncharacterized protein1.2e-10497.01Show/hide
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A0A1S3BTF1 ras-related protein RABD1 isoform X11.2e-10496.52Show/hide
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A0A6J1C4U5 ras-related protein RABD13.4e-10497.01Show/hide
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A0A6J1EMZ9 ras-related protein RABD1-like4.3e-107100Show/hide
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A0A6J1JCC5 ras-related protein RABD1-like4.3e-107100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P16976 GTP-binding protein YPTM18.1e-8780.19Show/hide
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P40392 Ras-related protein RIC17.3e-8879.21Show/hide
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Q05737 GTP-binding protein YPTM22.1e-8779.7Show/hide
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Q9SEH3 Ras-related protein RABD2c1.3e-8778.61Show/hide
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Q9ZRE2 Ras-related protein RABD12.2e-9284.16Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02130.1 RAS 53.2e-8677.23Show/hide
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AT3G09900.1 RAB GTPase homolog E1E4.2e-6257.49Show/hide
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        +  I+++A+DSV K+LVGNK D+ E+K  V T   +A ADE GI F ETSAK + NVEQ FL++A +IK+++    + +   G    K            
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        +KS+CCS
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AT3G11730.1 Ras-related small GTP-binding family protein1.6e-9384.16Show/hide
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AT4G17530.1 RAB GTPase homolog 1C8.9e-8978.61Show/hide
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AT5G47200.1 RAB GTPase homolog 1A2.2e-8778.11Show/hide
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Query:  S
        S
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Sequences Show/hide sequences
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