; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg25733 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg25733
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionprotein ROOT PRIMORDIUM DEFECTIVE 1
Genome locationCarg_Chr03:1365937..1369030
RNA-Seq ExpressionCarg25733
SyntenyCarg25733
Gene Ontology termsGO:0003723 - RNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR021099 - Plant organelle RNA recognition domain
IPR045040 - PORR family


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6603284.1 Protein WHAT'S THIS FACTOR 9, mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.6e-22395.8Show/hide
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KAG7033566.1 Protein ROOT PRIMORDIUM DEFECTIVE 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.3e-278100Show/hide
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XP_023543563.1 protein WHAT'S THIS FACTOR 1 homolog [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.5e-22195.06Show/hide
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A0A6J1DTM9 protein ROOT PRIMORDIUM DEFECTIVE 12.1e-19785.19Show/hide
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A0A6J1EL68 protein WHAT'S THIS FACTOR 1 homolog2.7e-22195.56Show/hide
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A0A6J1ES37 protein WHAT'S THIS FACTOR 1 homolog6.5e-22396.05Show/hide
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A0A6J1HVG3 protein WHAT'S THIS FACTOR 1 homolog2.5e-21492.35Show/hide
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A0A6J1HXS6 protein WHAT'S THIS FACTOR 1 homolog1.7e-21592.59Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A0MFS5 Protein WHAT'S THIS FACTOR 1 homolog, chloroplastic4.6e-3227.06Show/hide
Query:  KVRLKWVKNRSLDHIIDTETDLKAASLLKDAINRSSTGFITAKSIADWPKLLGL--TIPVLRFIRRYPTLFHEFPHSRYANLPCFRLTDTALLLDQQQSS
        +  +K  K  + D ++  +  LK    ++  +       ++ + +  + + LGL      +  +R+YP +F       Y+    F++T  A  L   +  
Subjt:  KVRLKWVKNRSLDHIIDTETDLKAASLLKDAINRSSTGFITAKSIADWPKLLGL--TIPVLRFIRRYPTLFHEFPHSRYANLPCFRLTDTALLLDQQQSS

Query:  IHQIHESDTVERLCRVLMMMKNRAIPLQSLRPLEWDLGLPCGFERSLIPKYPDHFRLVKASNGDWCLRLMEWREEFAVSALQRSNESSELGDAY------
        I    E   V +L +++MM  ++ I L+ +  L+ DLGLP  F  ++  +YP +FR+V    G   L L  W  E AVSA + S + +   ++       
Subjt:  IHQIHESDTVERLCRVLMMMKNRAIPLQSLRPLEWDLGLPCGFERSLIPKYPDHFRLVKASNGDWCLRLMEWREEFAVSALQRSNESSELGDAY------

Query:  -RQFKRGRTTLAFPYEFSEGIWGTKEEFQKLPYISPYESCRQIDPNSDLMEKRVVGVLHELLSLTLHKKTKRNYLRSLREELNLPHKFTRIFTRYPGIFY
         R  K  R  L      S+       +F+ + YISPY+    +   +   EK   GV+HELLSLT  K+T  ++L   REE     +   +  R+P +FY
Subjt:  -RQFKRGRTTLAFPYEFSEGIWGTKEEFQKLPYISPYESCRQIDPNSDLMEKRVVGVLHELLSLTLHKKTKRNYLRSLREELNLPHKFTRIFTRYPGIFY

Query:  LSLKCKTTTVSLREGYQRGKLVNPHPLTRLREKFYHVMKTGLFYRGKGAALIEKEGILLNNTAEETVENGLDVESDE
        +SLK +  +V LRE Y+  +L++  PLT ++EK   ++    F R +G    ++EG        E   +G D + +E
Subjt:  LSLKCKTTTVSLREGYQRGKLVNPHPLTRLREKFYHVMKTGLFYRGKGAALIEKEGILLNNTAEETVENGLDVESDE

B6TTV8 Protein WHAT'S THIS FACTOR 1, chloroplastic6.9e-3630.24Show/hide
Query:  KRFFFSTLILPSPYLSPNPFLHLQCRRIAKVRLKWVKNRS---LDHIIDTETDLKAASLLKDAINRSSTGFITAKSIADWPKLLGLTIP--VLRFIRRYP
        K  F    + P P   P P L L+ R  A V    VK R     D +I  +  LK    L++ +       ++ + +  + + LGLT    ++  +RR+P
Subjt:  KRFFFSTLILPSPYLSPNPFLHLQCRRIAKVRLKWVKNRS---LDHIIDTETDLKAASLLKDAINRSSTGFITAKSIADWPKLLGLTIP--VLRFIRRYP

Query:  TLFHEFPHSRYANLPCFRLTDTALLLDQQQSSIHQIHESDTVERLCRVLMMMKNRAIPLQSLRPLEWDLGLPCGFERSLIPKYPDHFRLVKASNGDWCLR
         +F       Y+    FRLT  A  L   +  +    E   V +L ++LMM + + I ++ +  L+ DLGLP  F  ++  +YP +FR+V+   G   L 
Subjt:  TLFHEFPHSRYANLPCFRLTDTALLLDQQQSSIHQIHESDTVERLCRVLMMMKNRAIPLQSLRPLEWDLGLPCGFERSLIPKYPDHFRLVKASNGDWCLR

Query:  LMEWREEFAVSALQRSNESSELGDAY-------RQFKRGRTTLAFPYEFSEGIWGTKEEFQKLPYISPYESCRQIDPNSDLMEKRVVGVLHELLSLTLHK
        L  W  E AVSA + + E S   +A        R  K  R  L    + + G       F+++PYISPY     +   SD  EK   GV+HE+LSLT+ K
Subjt:  LMEWREEFAVSALQRSNESSELGDAY-------RQFKRGRTTLAFPYEFSEGIWGTKEEFQKLPYISPYESCRQIDPNSDLMEKRVVGVLHELLSLTLHK

Query:  KTKRNYLRSLREELNLPHKFTRIFTRYPGIFYLSLKCKTTTVSLREGYQRGKLVNPHPLTRLREKFYHVMKTGLFYR
        +T  ++L   REE         +  R+P +FY+S K    +V LRE Y+  +LV  + L  L+EK   ++    F R
Subjt:  KTKRNYLRSLREELNLPHKFTRIFTRYPGIFYLSLKCKTTTVSLREGYQRGKLVNPHPLTRLREKFYHVMKTGLFYR

Q65XL5 Protein WHAT'S THIS FACTOR 1 homolog, chloroplastic5.6e-3830.42Show/hide
Query:  PYLSPNPFLHL----QCRRIAKVRLKWVKNRS---LDHIIDTETDLKAASLLKDAINRSSTGFITAKSIADWPKLLGLTIP--VLRFIRRYPTLFHEFPH
        P L P P L L      RR+A V    VK R     D++I  +  LK    L++ +  +    ++ + +  + + LGLT    ++  ++R+P +F     
Subjt:  PYLSPNPFLHL----QCRRIAKVRLKWVKNRS---LDHIIDTETDLKAASLLKDAINRSSTGFITAKSIADWPKLLGLTIP--VLRFIRRYPTLFHEFPH

Query:  SRYANLPCFRLTDTALLLDQQQSSIHQIHESDTVERLCRVLMMMKNRAIPLQSLRPLEWDLGLPCGFERSLIPKYPDHFRLVKASNGDWCLRLMEWREEF
          Y+    FRLT  A  L   +  +    E   V +L ++LMM +++ I ++ +  L+ DLGLP  F  ++  +YP +FR+V+   G   L L  W  E 
Subjt:  SRYANLPCFRLTDTALLLDQQQSSIHQIHESDTVERLCRVLMMMKNRAIPLQSLRPLEWDLGLPCGFERSLIPKYPDHFRLVKASNGDWCLRLMEWREEF

Query:  AVSALQRSNESSELGDAY-------RQFKRGRTTLAFPYEFSEGIWGTKEEFQKLPYISPYESCRQIDPNSDLMEKRVVGVLHELLSLTLHKKTKRNYLR
        AVSA + + E +   +         R  K  R  L    + S G      +F+++PYISPY     +   S   EK   GV+HE+LSLTL K+T  ++L 
Subjt:  AVSALQRSNESSELGDAY-------RQFKRGRTTLAFPYEFSEGIWGTKEEFQKLPYISPYESCRQIDPNSDLMEKRVVGVLHELLSLTLHKKTKRNYLR

Query:  SLREELNLPHKFTRIFTRYPGIFYLSLKCKTTTVSLREGYQRGKLVNPHPLTRLREKFYHVMKTGLFYRGKGAALIEKEGILLNNTAEETVENGLDVESD
          REE         +  R+P +FY+SLK    +V LRE Y+  +LV    L  L+EK   ++    F R +G     +E    N  A + +  G DVE D
Subjt:  SLREELNLPHKFTRIFTRYPGIFYLSLKCKTTTVSLREGYQRGKLVNPHPLTRLREKFYHVMKTGLFYRGKGAALIEKEGILLNNTAEETVENGLDVESD

Query:  E
        E
Subjt:  E

Q689D6 Protein ROOT PRIMORDIUM DEFECTIVE 13.8e-2632.74Show/hide
Query:  FIRRYPTLFHEFPHSRYANLPCFRLTDTAL--LLDQQQSSIHQIHESDTVERLCRVLMMMKNRAIPLQSLRPLEWDLGLPCGFERSLIPKYPDHFRLVKA
        F+ ++P +F  + H     L C RLT  AL  +  + ++ + QI   D V RL +++MM     I L+ +R    + GLP  FE S+I K+P  FRL+  
Subjt:  FIRRYPTLFHEFPHSRYANLPCFRLTDTAL--LLDQQQSSIHQIHESDTVERLCRVLMMMKNRAIPLQSLRPLEWDLGLPCGFERSLIPKYPDHFRLVKA

Query:  -SNGDWCLRLMEWREEFAVSALQRSNE-SSELGDAYRQFKRGRTTLAFPYEFSEG------IWGTKEEFQKLPYISPYESCRQIDPNS----DLMEKRVV
            D  + ++E     ++ A++R  E          +  R    + FP  F  G      +W    ++Q+LPY SPYE     D  S    + +EKR V
Subjt:  -SNGDWCLRLMEWREEFAVSALQRSNE-SSELGDAYRQFKRGRTTLAFPYEFSEG------IWGTKEEFQKLPYISPYESCRQIDPNS----DLMEKRVV

Query:  GVLHELLSLTLHKKTKRNYLRSLREELNLPHKFTRIFTRYPGIFYLSLK---CKTTTVSLREGYQRGKLVNPHPLTRLREK
          +HELLSLT+ KK     +   R  +NLP K      ++ GIFY+S +    K  TV LREGY+RG+LV P+ +   R +
Subjt:  GVLHELLSLTLHKKTKRNYLRSLREELNLPHKFTRIFTRYPGIFYLSLK---CKTTTVSLREGYQRGKLVNPHPLTRLREK

Q9ZUZ6 Protein WHAT'S THIS FACTOR 9, mitochondrial1.8e-4433.43Show/hide
Query:  QCRRIAKVRLKWVKNRSLDHI--IDTETDLKAASLLKDAINRSSTGFITAKSIADWPKLLGLTIPVLRFIRRYPTLFHEFPHSRYANLPCFRLTDTALLL
        Q R    V +KW ++   D+I  I   + LK+   LK+ I +     I   +I+   +   ++  +  F+R++P++F EF    Y NLP FRLT  A  L
Subjt:  QCRRIAKVRLKWVKNRSLDHI--IDTETDLKAASLLKDAINRSSTGFITAKSIADWPKLLGLTIPVLRFIRRYPTLFHEFPHSRYANLPCFRLTDTALLL

Query:  DQQQSSIHQIHESDTVERLCRVLMMMKNRAIPLQSLRPLEWDLGLPCGFERSLIPKYPDHFRLVKASNGDWCLRLMEWREEFAVSALQRSNESSELGDAY
        D+Q+  ++Q    D  +RL ++++M K+  +PL  ++ ++W LGLP  + +         FR V   +G   L +     +  +S LQ++      G+  
Subjt:  DQQQSSIHQIHESDTVERLCRVLMMMKNRAIPLQSLRPLEWDLGLPCGFERSLIPKYPDHFRLVKASNGDWCLRLMEWREEFAVSALQRSNESSELGDAY

Query:  RQFKRGRTTLAFPYEFSEG------IWGTKEEFQKLPYISPYESCRQIDPNSDLMEKRVVGVLHELLSLTLHKKTKRNYLRSLREELNLPHKFTRIFTRY
         +       + FP   S+G      I     EFQKLPY+SPY+    +DP+SD+ EKRVVG LHELL L +    +R  L  L++   LP K  + F R+
Subjt:  RQFKRGRTTLAFPYEFSEG------IWGTKEEFQKLPYISPYESCRQIDPNSDLMEKRVVGVLHELLSLTLHKKTKRNYLRSLREELNLPHKFTRIFTRY

Query:  PGIFYLSLKCKTTTVSLREGYQRGKLVNPHPLTRLREKFYHVMK
        P IFYLS+K KT T  LRE Y+    V  HP+  +R+K+  +MK
Subjt:  PGIFYLSLKCKTTTVSLREGYQRGKLVNPHPLTRLREKFYHVMK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G71850.1 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase family protein2.5e-4932.74Show/hide
Query:  KWVKNRSLDHIIDTETDLKAASLLKDAINRSSTGFITAKSIADWPKLLGLTIPVLRFIRRYPTLFHEFPHSRYANLPCFRLTDTALLLDQQQSSIH--QI
        K+V++R LDH ++ E +L+    +KD I       +    I      L + +  + FIR +P++F EF        P   LT   L  D  +  ++  + 
Subjt:  KWVKNRSLDHIIDTETDLKAASLLKDAINRSSTGFITAKSIADWPKLLGLTIPVLRFIRRYPTLFHEFPHSRYANLPCFRLTDTALLLDQQQSSIH--QI

Query:  HESDTVERLCRVLMMMKNRAIPLQSLRPLEWDLGLPCGFERSLIPKYPDHFRLVKAS----NGDWCLRLMEWREEFAVSALQRSNESSELGDAYRQFKRG
        ++    +RL ++LM+ +   IPL+ L  L+WDLGLP  +  +++P++PD+FR++K+     +G+  L L+ W  E AVS L++   +   G    ++ +G
Subjt:  HESDTVERLCRVLMMMKNRAIPLQSLRPLEWDLGLPCGFERSLIPKYPDHFRLVKAS----NGDWCLRLMEWREEFAVSALQRSNESSELGDAYRQFKRG

Query:  RTTLAFPYEFSEGIWGTK------EEFQKLPYISPYESCRQIDPNSDLMEKRVVGVLHELLSLTLHKKTKRNYLRSLREELNLPHKFTRIFTRYPGIFYL
         + +AFP +FS G    K      +++QKLPYISPYE+   +   SD  +K    VLHE+++L + KK +++ +  L E + L  +F R+   +PGIFYL
Subjt:  RTTLAFPYEFSEGIWGTK------EEFQKLPYISPYESCRQIDPNSDLMEKRVVGVLHELLSLTLHKKTKRNYLRSLREELNLPHKFTRIFTRYPGIFYL

Query:  SLKCKTTTVSLREGYQRGKLVNPHPLTRLREKFYHVMKT
        S K +T TV LR+GY+RG L+  + L   R ++  +M T
Subjt:  SLKCKTTTVSLREGYQRGKLVNPHPLTRLREKFYHVMKT

AT2G39120.1 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase family protein1.3e-4533.43Show/hide
Query:  QCRRIAKVRLKWVKNRSLDHI--IDTETDLKAASLLKDAINRSSTGFITAKSIADWPKLLGLTIPVLRFIRRYPTLFHEFPHSRYANLPCFRLTDTALLL
        Q R    V +KW ++   D+I  I   + LK+   LK+ I +     I   +I+   +   ++  +  F+R++P++F EF    Y NLP FRLT  A  L
Subjt:  QCRRIAKVRLKWVKNRSLDHI--IDTETDLKAASLLKDAINRSSTGFITAKSIADWPKLLGLTIPVLRFIRRYPTLFHEFPHSRYANLPCFRLTDTALLL

Query:  DQQQSSIHQIHESDTVERLCRVLMMMKNRAIPLQSLRPLEWDLGLPCGFERSLIPKYPDHFRLVKASNGDWCLRLMEWREEFAVSALQRSNESSELGDAY
        D+Q+  ++Q    D  +RL ++++M K+  +PL  ++ ++W LGLP  + +         FR V   +G   L +     +  +S LQ++      G+  
Subjt:  DQQQSSIHQIHESDTVERLCRVLMMMKNRAIPLQSLRPLEWDLGLPCGFERSLIPKYPDHFRLVKASNGDWCLRLMEWREEFAVSALQRSNESSELGDAY

Query:  RQFKRGRTTLAFPYEFSEG------IWGTKEEFQKLPYISPYESCRQIDPNSDLMEKRVVGVLHELLSLTLHKKTKRNYLRSLREELNLPHKFTRIFTRY
         +       + FP   S+G      I     EFQKLPY+SPY+    +DP+SD+ EKRVVG LHELL L +    +R  L  L++   LP K  + F R+
Subjt:  RQFKRGRTTLAFPYEFSEG------IWGTKEEFQKLPYISPYESCRQIDPNSDLMEKRVVGVLHELLSLTLHKKTKRNYLRSLREELNLPHKFTRIFTRY

Query:  PGIFYLSLKCKTTTVSLREGYQRGKLVNPHPLTRLREKFYHVMK
        P IFYLS+K KT T  LRE Y+    V  HP+  +R+K+  +MK
Subjt:  PGIFYLSLKCKTTTVSLREGYQRGKLVNPHPLTRLREKFYHVMK

AT3G58520.1 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase family protein7.8e-15267.02Show/hide
Query:  IAKVRLKWVKNRSLDHIIDTETDLKAASLLKDAINRSSTGFITAKSIADWPKLLGLTIPVLRFIRRYPTLFHEFPHSRYANLPCFRLTDTALLLDQQQSS
        + KVRLKWVKN++LDH+IDTETDLKAA +LKDAI RS TGF+TAKS+ADW KLLGLT+PVLRF+RRYPTLFHEFPH+RYA+LPCF+LTDTAL+LD Q+  
Subjt:  IAKVRLKWVKNRSLDHIIDTETDLKAASLLKDAINRSSTGFITAKSIADWPKLLGLTIPVLRFIRRYPTLFHEFPHSRYANLPCFRLTDTALLLDQQQSS

Query:  IHQIHESDTVERLCRVLMMMKNRAIPLQSLRPLEWDLGLPCGFERSLIPKYPDHFRLVKASNGDWCLRLMEWREEFAVSALQRSNESSELG---DAYRQF
        IHQ HE+DTVERLCRVLMMM+++ + L+SL  L++DLGLP  +E++L+ KYPDHF  VKASNG+ CL+L++WR+EFA SALQ+ NE +++      YR+F
Subjt:  IHQIHESDTVERLCRVLMMMKNRAIPLQSLRPLEWDLGLPCGFERSLIPKYPDHFRLVKASNGDWCLRLMEWREEFAVSALQRSNESSELG---DAYRQF

Query:  KRGRTTLAFPYEFSEGIWGTK------EEFQKLPYISPYESCRQIDPNSDLMEKRVVGVLHELLSLTLHKKTKRNYLRSLREELNLPHKFTRIFTRYPGI
        KRG++TL FP  F  G    K      +EFQKLPYISPY+    IDP SDLMEKR V VLHELLSLT+HKKTKRNYLRS+R ELN+PHKFTR+FTRYPGI
Subjt:  KRGRTTLAFPYEFSEGIWGTK------EEFQKLPYISPYESCRQIDPNSDLMEKRVVGVLHELLSLTLHKKTKRNYLRSLREELNLPHKFTRIFTRYPGI

Query:  FYLSLKCKTTTVSLREGYQRGKLVNPHPLTRLREKFYHVMKTGLFYRGKGAALIEKEGILLNNTAEETVENGLDVE
        FYLSLKCKTTTV L+EGY+RGKLV+PHPLTRLR+KFYHVM+TG  YR +G  ++ KE +LL+   ++  E G + E
Subjt:  FYLSLKCKTTTVSLREGYQRGKLVNPHPLTRLREKFYHVMKTGLFYRGKGAALIEKEGILLNNTAEETVENGLDVE

AT3G58520.2 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase family protein7.8e-13662.07Show/hide
Query:  IAKVRLKWVKNRSLDHIIDTETDLKAASLLKDAINRSSTGFITAKSI-ADWPKLLGLTIPVLRFIRRYPTLFHEFPHSRYANLPCFRLTDTALLLDQQQS
        + KVRLKWVKN++LDH+IDTETDLKAA +LKDAI RS TG    ++    W K             RYPTLFHEFPH+RYA+LPCF+LTDTAL+LD Q+ 
Subjt:  IAKVRLKWVKNRSLDHIIDTETDLKAASLLKDAINRSSTGFITAKSI-ADWPKLLGLTIPVLRFIRRYPTLFHEFPHSRYANLPCFRLTDTALLLDQQQS

Query:  SIHQIHESDTVERLCRVLMMMKNRAIPLQSLRPLEWDLGLPCGFERSLIPKYPDHFRLVKASNGDWCLRLMEWREEFAVSALQRSNESSELG---DAYRQ
         IHQ HE+DTVERLCRVLMMM+++ + L+SL  L++DLGLP  +E++L+ KYPDHF  VKASNG+ CL+L++WR+EFA SALQ+ NE +++      YR+
Subjt:  SIHQIHESDTVERLCRVLMMMKNRAIPLQSLRPLEWDLGLPCGFERSLIPKYPDHFRLVKASNGDWCLRLMEWREEFAVSALQRSNESSELG---DAYRQ

Query:  FKRGRTTLAFPYEFSEGIWGTK------EEFQKLPYISPYESCRQIDPNSDLMEKRVVGVLHELLSLTLHKKTKRNYLRSLREELNLPHKFTRIFTRYPG
        FKRG++TL FP  F  G    K      +EFQKLPYISPY+    IDP SDLMEKR V VLHELLSLT+HKKTKRNYLRS+R ELN+PHKFTR+FTRYPG
Subjt:  FKRGRTTLAFPYEFSEGIWGTK------EEFQKLPYISPYESCRQIDPNSDLMEKRVVGVLHELLSLTLHKKTKRNYLRSLREELNLPHKFTRIFTRYPG

Query:  IFYLSLKCKTTTVSLREGYQRGKLVNPHPLTRLREKFYHVMKTGLFYRGKGAALIEKEGILLNNTAEETVENGLDVE
        IFYLSLKCKTTTV L+EGY+RGKLV+PHPLTRLR+KFYHVM+TG  YR +G  ++ KE +LL+   ++  E G + E
Subjt:  IFYLSLKCKTTTVSLREGYQRGKLVNPHPLTRLREKFYHVMKTGLFYRGKGAALIEKEGILLNNTAEETVENGLDVE

AT5G48040.1 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase family protein3.5e-6739Show/hide
Query:  FLHLQCRRIAKVRLKWVKNRSLDHIIDTETDLKAASLLKDAINRSSTGFITAKSIADWPKLLGL--TIPVLRFIRRYPTLF--HEFPHSRYANLPCFRLT
        F + Q   +  V+LKWVK+R LD ++  E  L+A   L   I+ S    +    +      LGL   + +  FIRRYP +F  H +  S   ++PCF LT
Subjt:  FLHLQCRRIAKVRLKWVKNRSLDHIIDTETDLKAASLLKDAINRSSTGFITAKSIADWPKLLGL--TIPVLRFIRRYPTLF--HEFPHSRYANLPCFRLT

Query:  DTALLLDQQQSSIHQIHESDTVERLCRVLMMMKNRAIPLQSLRPLEWDLGLPCGFERSLIPKYPDHFRLVKASNGDWCLRLMEWREEFAVSALQRSNESS
           + L  ++  + +++E D + RLC++LM+   R + L S+  L WDLGLP  +  SLI K+PD F LVK S+    L+L+ W E  AVS +Q      
Subjt:  DTALLLDQQQSSIHQIHESDTVERLCRVLMMMKNRAIPLQSLRPLEWDLGLPCGFERSLIPKYPDHFRLVKASNGDWCLRLMEWREEFAVSALQRSNESS

Query:  ELGDAYRQFKRGRTTLAFPYEFSEGIWGTK-------EEFQKLPYISPYESCRQIDPNSDLMEKRVVGVLHELLSLTLHKKTKRNYLRSLREELNLPHKF
        ++G+  R        +AFP +F+ G +G K       +E+Q+LPY SPY     +DP +DL EKR VGV HELL LT+ KKT+R  + +LR+   LP KF
Subjt:  ELGDAYRQFKRGRTTLAFPYEFSEGIWGTK-------EEFQKLPYISPYESCRQIDPNSDLMEKRVVGVLHELLSLTLHKKTKRNYLRSLREELNLPHKF

Query:  TRIFTRYPGIFYLSLKCKTTTVSLREGYQRGKLVNPHPLTRLREKFYHVMKTGLFYRGKGAALIEKEGILLNNTAEETVENGLDVESDETVLLAVNSIRG
        T++F R+PGIFY+S+KC T TV LRE Y R  L+  HPL  +REKF ++M  G   R +G      E  L  N     ++    V SDE   L  N I G
Subjt:  TRIFTRYPGIFYLSLKCKTTTVSLREGYQRGKLVNPHPLTRLREKFYHVMKTGLFYRGKGAALIEKEGILLNNTAEETVENGLDVESDETVLLAVNSIRG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAGAGATTCTTCTTTTCAACCCTAATTCTTCCATCGCCATACCTGAGCCCTAATCCTTTTCTGCACCTTCAATGCCGACGAATTGCGAAGGTTCGCCTCAAATGGGT
CAAGAATCGGAGTCTCGATCACATCATCGACACGGAGACCGATTTGAAGGCTGCTTCCCTCCTCAAGGACGCCATTAACCGCTCTTCCACTGGCTTCATTACTGCTAAGT
CCATCGCCGATTGGCCAAAGCTGCTCGGCCTCACCATCCCTGTTCTTCGATTCATCCGGAGGTATCCAACTCTCTTTCACGAATTTCCTCATTCTCGTTACGCTAATTTG
CCTTGCTTTCGTTTGACGGATACCGCGCTGCTTTTAGATCAGCAACAGAGTAGTATTCACCAAATTCATGAGAGCGACACTGTCGAAAGACTTTGTAGAGTTCTTATGAT
GATGAAAAATAGGGCTATTCCTCTTCAGTCGTTGCGTCCTTTAGAATGGGATCTAGGTCTCCCGTGTGGTTTTGAGAGGTCATTGATTCCCAAGTATCCCGATCATTTTC
GATTAGTGAAGGCCTCCAATGGGGATTGGTGTCTGCGGCTTATGGAATGGCGCGAGGAATTTGCAGTTTCGGCCTTGCAAAGGAGCAATGAGAGCTCTGAACTGGGAGAT
GCGTATAGGCAATTCAAGAGGGGGCGTACCACATTGGCTTTTCCCTATGAGTTTTCCGAGGGGATATGGGGCACAAAAGAAGAGTTTCAGAAGTTACCTTACATTTCTCC
ATATGAGAGTTGCAGGCAAATTGACCCCAACAGTGATCTCATGGAGAAACGAGTTGTTGGGGTTCTTCATGAGCTTTTGAGTCTCACTCTTCACAAGAAAACTAAAAGAA
ACTATTTGAGAAGCTTGAGAGAGGAATTGAATCTTCCCCATAAGTTCACTCGAATCTTCACCCGTTATCCCGGAATCTTCTACCTGTCTTTGAAGTGTAAGACCACGACT
GTTTCTCTTAGGGAAGGGTATCAGCGAGGAAAGCTAGTGAACCCACATCCTTTGACACGTCTAAGGGAAAAGTTTTATCATGTCATGAAGACTGGTCTGTTTTACCGGGG
GAAAGGTGCTGCATTGATAGAAAAGGAGGGCATTCTGCTTAATAATACAGCCGAGGAGACGGTGGAGAATGGTTTGGATGTTGAATCAGATGAGACGGTTTTATTGGCTG
TTAACTCCATTCGAGGGATCAACATTGTCCCATGCAAAGCAATGCTTTATAGTTTATGCGATAAAGACATAAGCTATAGAGGAAAGAAATGGTTTGTGGTGACAGAGATT
TGGAAAGATGGGACTATCCGCTTTCCCGACCCAGGAAAAGAAATGCTGAAGCTTTGCCATAGTCATATAATTGTTGCCATAGAAGAATGTGTTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAAGAGATTCTTCTTTTCAACCCTAATTCTTCCATCGCCATACCTGAGCCCTAATCCTTTTCTGCACCTTCAATGCCGACGAATTGCGAAGGTTCGCCTCAAATGGGT
CAAGAATCGGAGTCTCGATCACATCATCGACACGGAGACCGATTTGAAGGCTGCTTCCCTCCTCAAGGACGCCATTAACCGCTCTTCCACTGGCTTCATTACTGCTAAGT
CCATCGCCGATTGGCCAAAGCTGCTCGGCCTCACCATCCCTGTTCTTCGATTCATCCGGAGGTATCCAACTCTCTTTCACGAATTTCCTCATTCTCGTTACGCTAATTTG
CCTTGCTTTCGTTTGACGGATACCGCGCTGCTTTTAGATCAGCAACAGAGTAGTATTCACCAAATTCATGAGAGCGACACTGTCGAAAGACTTTGTAGAGTTCTTATGAT
GATGAAAAATAGGGCTATTCCTCTTCAGTCGTTGCGTCCTTTAGAATGGGATCTAGGTCTCCCGTGTGGTTTTGAGAGGTCATTGATTCCCAAGTATCCCGATCATTTTC
GATTAGTGAAGGCCTCCAATGGGGATTGGTGTCTGCGGCTTATGGAATGGCGCGAGGAATTTGCAGTTTCGGCCTTGCAAAGGAGCAATGAGAGCTCTGAACTGGGAGAT
GCGTATAGGCAATTCAAGAGGGGGCGTACCACATTGGCTTTTCCCTATGAGTTTTCCGAGGGGATATGGGGCACAAAAGAAGAGTTTCAGAAGTTACCTTACATTTCTCC
ATATGAGAGTTGCAGGCAAATTGACCCCAACAGTGATCTCATGGAGAAACGAGTTGTTGGGGTTCTTCATGAGCTTTTGAGTCTCACTCTTCACAAGAAAACTAAAAGAA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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