; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg25839 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg25839
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionUroporphyrinogen-III synthase
Genome locationCarg_Chr12:3072999..3073636
RNA-Seq ExpressionCarg25839
SyntenyCarg25839
Gene Ontology termsGO:0006780 - uroporphyrinogen III biosynthetic process (biological process)
GO:0006782 - protoporphyrinogen IX biosynthetic process (biological process)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0004852 - uroporphyrinogen-III synthase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR003754 - Tetrapyrrole biosynthesis, uroporphyrinogen III synthase
IPR036108 - Tetrapyrrole biosynthesis, uroporphyrinogen III synthase superfamily
IPR039793 - Uroporphyrinogen-III synthase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6585644.1 Uroporphyrinogen-III synthase, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.4e-1895.83Show/hide
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KAG7020555.1 Uroporphyrinogen-III synthase, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.6e-44100Show/hide
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XP_022951382.1 uroporphyrinogen-III synthase, chloroplastic [Cucurbita moschata]7.4e-1895.83Show/hide
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XP_023002006.1 uroporphyrinogen-III synthase, chloroplastic-like [Cucurbita maxima]2.2e-1793.75Show/hide
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XP_023537362.1 uroporphyrinogen-III synthase, chloroplastic isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.2e-1793.75Show/hide
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A0A0A0LLB2 Uroporphyrinogen-III synthase1.3e-1583.33Show/hide
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A0A6J1GHG9 Uroporphyrinogen-III synthase3.6e-1895.83Show/hide
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A0A6J1HDZ7 Uroporphyrinogen-III synthase8.9e-1787.5Show/hide
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A0A6J1KA58 Uroporphyrinogen-III synthase8.9e-1787.5Show/hide
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A0A6J1KK69 Uroporphyrinogen-III synthase1.0e-1793.75Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O48721 Uroporphyrinogen-III synthase, chloroplastic7.5e-1366.67Show/hide
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Q10QR9 Uroporphyrinogen-III synthase, chloroplastic1.8e-1160Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G26540.1 uroporphyrinogen-III synthase family protein5.3e-1466.67Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CAGTCGATATGCCCGAGTTTCTATTCGAGTTCGATATCAGATAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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