; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg25882 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg25882
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Description40S ribosomal protein S14
Genome locationCarg_Chr06:2388843..2389946
RNA-Seq ExpressionCarg25882
SyntenyCarg25882
Gene Ontology termsGO:0000028 - ribosomal small subunit assembly (biological process)
GO:0000462 - maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) (biological process)
GO:0005975 - carbohydrate metabolic process (biological process)
GO:0006412 - translation (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0022627 - cytosolic small ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
GO:0004553 - hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds (molecular function)
GO:0008168 - methyltransferase activity (molecular function)
GO:0048027 - mRNA 5'-UTR binding (molecular function)
GO:0070181 - small ribosomal subunit rRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001971 - Ribosomal protein S11
IPR036967 - Ribosomal protein S11 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0043861.1 beta-fructofuranosidase, insoluble isoenzyme 1 [Cucumis melo var. makuwa]7.0e-6399.22Show/hide
Query:  SRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATGG
        SRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATGG
Subjt:  SRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATGG

Query:  NKTKTPGPGAQSALRALARSGMRVGRIG
        NKTKTPGPGAQSALRALARSGMR+GRIG
Subjt:  NKTKTPGPGAQSALRALARSGMRVGRIG

KAA0057107.1 40S ribosomal protein S14-2-like [Cucumis melo var. makuwa]7.0e-6399.22Show/hide
Query:  SRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATGG
        SRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATGG
Subjt:  SRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATGG

Query:  NKTKTPGPGAQSALRALARSGMRVGRIG
        NKTKTPGPGAQSALRALARSGMR+GRIG
Subjt:  NKTKTPGPGAQSALRALARSGMRVGRIG

KAG7028120.1 40S ribosomal protein S14-2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]7.2e-68100Show/hide
Query:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG
        MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG
Subjt:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG

Query:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRVGRIGTIIFILYS
        GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRVGRIGTIIFILYS
Subjt:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRVGRIGTIIFILYS

XP_022946789.1 40S ribosomal protein S14-2-like [Cucurbita moschata]7.0e-63100Show/hide
Query:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG
        MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG
Subjt:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG

Query:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRVGRI
        GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRVGRI
Subjt:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRVGRI

XP_038903510.1 40S ribosomal protein S14-2-like isoform X1 [Benincasa hispida]4.8e-6494.85Show/hide
Query:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG
        MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG
Subjt:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG

Query:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRVGRIGTIIFILY
        GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMR+GR+GT  +  Y
Subjt:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRVGRIGTIIFILY

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7TQL8 Beta-fructofuranosidase, insoluble isoenzyme 13.4e-6399.22Show/hide
Query:  SRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATGG
        SRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATGG
Subjt:  SRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATGG

Query:  NKTKTPGPGAQSALRALARSGMRVGRIG
        NKTKTPGPGAQSALRALARSGMR+GRIG
Subjt:  NKTKTPGPGAQSALRALARSGMRVGRIG

A0A5A7UR49 40S ribosomal protein S14-2-like3.4e-6399.22Show/hide
Query:  SRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATGG
        SRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATGG
Subjt:  SRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATGG

Query:  NKTKTPGPGAQSALRALARSGMRVGRIG
        NKTKTPGPGAQSALRALARSGMR+GRIG
Subjt:  NKTKTPGPGAQSALRALARSGMRVGRIG

A0A6J1G4X6 40S ribosomal protein S14-2-like3.4e-63100Show/hide
Query:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG
        MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG
Subjt:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG

Query:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRVGRI
        GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRVGRI
Subjt:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRVGRI

A0A6J1J4Y9 40S ribosomal protein S14-24.4e-6399.22Show/hide
Query:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG
        MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG
Subjt:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG

Query:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRVGRI
        GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMR+GRI
Subjt:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRVGRI

A0A6J1L3H8 40S ribosomal protein S14-2-like3.4e-63100Show/hide
Query:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG
        MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG
Subjt:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG

Query:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRVGRI
        GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRVGRI
Subjt:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRVGRI

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P19950 40S ribosomal protein S146.8e-6194.53Show/hide
Query:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG
        MSRRKTREPKEE V LGP VREGE VFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDV+QRCKELGITALHIKLRATG
Subjt:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG

Query:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRVGRI
        GNKTKTPGPGAQSALRALARSGM++GRI
Subjt:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRVGRI

P19951 40S ribosomal protein S141.2e-6094.44Show/hide
Query:  RRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATGGN
        R+KTREPKEE V LGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLA+QDV+QRCKELGITALHIKLRATGGN
Subjt:  RRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATGGN

Query:  KTKTPGPGAQSALRALARSGMRVGRI
        KTKTPGPGAQSALRALARSGM++GRI
Subjt:  KTKTPGPGAQSALRALARSGMRVGRI

P42036 40S ribosomal protein S14-35.2e-6190.62Show/hide
Query:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG
        MS+RKT+EPK E VTLGPAVREGE VFGV H+FASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDV+QRCKELGITA+H+KLRATG
Subjt:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG

Query:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRVGRI
        GNKTKTPGPGAQSALRALARSGM++GRI
Subjt:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRVGRI

Q9CAX6 40S ribosomal protein S14-22.3e-6191.41Show/hide
Query:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG
        MS+RKT+EPK ETVTLGP+VREGE VFGV HIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDV+QRCKELGITA+H+KLRATG
Subjt:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG

Query:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRVGRI
        GNKTKTPGPGAQSALRALARSGM++GRI
Subjt:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRVGRI

Q9SIH0 40S ribosomal protein S14-12.0e-6089.84Show/hide
Query:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG
        MS+RKT+EPK + VTLGP+VREGE VFGV HIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDV+QRCKELGITA+H+KLRATG
Subjt:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG

Query:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRVGRI
        GNKTKTPGPGAQSALRALARSGM++GRI
Subjt:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRVGRI

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G36160.1 Ribosomal protein S11 family protein1.4e-6189.84Show/hide
Query:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG
        MS+RKT+EPK + VTLGP+VREGE VFGV HIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDV+QRCKELGITA+H+KLRATG
Subjt:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG

Query:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRVGRI
        GNKTKTPGPGAQSALRALARSGM++GRI
Subjt:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRVGRI

AT3G11510.1 Ribosomal protein S11 family protein1.7e-6291.41Show/hide
Query:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG
        MS+RKT+EPK ETVTLGP+VREGE VFGV HIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDV+QRCKELGITA+H+KLRATG
Subjt:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG

Query:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRVGRI
        GNKTKTPGPGAQSALRALARSGM++GRI
Subjt:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRVGRI

AT3G52580.1 Ribosomal protein S11 family protein3.7e-6290.62Show/hide
Query:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG
        MS+RKT+EPK E VTLGPAVREGE VFGV H+FASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDV+QRCKELGITA+H+KLRATG
Subjt:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG

Query:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRVGRI
        GNKTKTPGPGAQSALRALARSGM++GRI
Subjt:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRVGRI

ATCG00750.1 ribosomal protein S112.2e-0631.15Show/hide
Query:  SRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATGG
        SR+ TR    + V   P         GV H+ ASFN+T + VTD+ GR       G    +  R   +P+AA  AA +  +   + G+    +++     
Subjt:  SRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATGG

Query:  NKTKTPGPGAQSALRALARSGM
           K PG G  +ALRA+ RSG+
Subjt:  NKTKTPGPGAQSALRALARSGM


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCGAGAAGAAAGACTAGAGAGCCTAAGGAGGAAACTGTCACTCTTGGCCCTGCTGTTCGTGAAGGAGAGCATGTTTTTGGCGTCGCCCACATTTTTGCTTCATTTAA
CGACACATTTATTCATGTGACCGATCTGTCTGGTCGAGAAACGCTTGTTCGTATCACTGGTGGTATGAAGGTGAAAGCCGATAGAGATGAATCATCGCCTTATGCTGCCA
TGCTTGCTGCACAGGACGTTTCTCAAAGATGCAAGGAACTTGGTATTACTGCTTTGCATATAAAACTCAGAGCAACCGGTGGAAACAAAACTAAGACTCCTGGGCCTGGT
GCTCAATCGGCTCTTAGAGCCCTTGCTCGTTCAGGCATGAGAGTTGGTCGTATAGGTACGATCATATTCATTCTTTATTCA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCGAGAAGAAAGACTAGAGAGCCTAAGGAGGAAACTGTCACTCTTGGCCCTGCTGTTCGTGAAGGAGAGCATGTTTTTGGCGTCGCCCACATTTTTGCTTCATTTAA
CGACACATTTATTCATGTGACCGATCTGTCTGGTCGAGAAACGCTTGTTCGTATCACTGGTGGTATGAAGGTGAAAGCCGATAGAGATGAATCATCGCCTTATGCTGCCA
TGCTTGCTGCACAGGACGTTTCTCAAAGATGCAAGGAACTTGGTATTACTGCTTTGCATATAAAACTCAGAGCAACCGGTGGAAACAAAACTAAGACTCCTGGGCCTGGT
GCTCAATCGGCTCTTAGAGCCCTTGCTCGTTCAGGCATGAGAGTTGGTCGTATAGGTACGATCATATTCATTCTTTATTCA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATGGNKTKTPGPG
AQSALRALARSGMRVGRIGTIIFILYS