; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg25981 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg25981
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionProtein CASP
Genome locationCarg_Chr11:4565626..4574364
RNA-Seq ExpressionCarg25981
SyntenyCarg25981
Gene Ontology termsGO:0006891 - intra-Golgi vesicle-mediated transport (biological process)
GO:0030173 - integral component of Golgi membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR012955 - CASP, C-terminal


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7022141.1 Protein CASP, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.7e-90100Show/hide
Query:  MTGIFLRQGVSFLENVDRKHFPLDQDQSSMLKVICSQRDRFRTRLHEAEEELRQLKEKVGQLTVELEKTKADNVKLYGKIRYVQYYNHEKVVSRGSKKHG
        MTGIFLRQGVSFLENVDRKHFPLDQDQSSMLKVICSQRDRFRTRLHEAEEELRQLKEKVGQLTVELEKTKADNVKLYGKIRYVQYYNHEKVVSRGSKKHG
Subjt:  MTGIFLRQGVSFLENVDRKHFPLDQDQSSMLKVICSQRDRFRTRLHEAEEELRQLKEKVGQLTVELEKTKADNVKLYGKIRYVQYYNHEKVVSRGSKKHG

Query:  EDLESGSMSDVEFKYKKIYEDDTRKVFPLETRIVVLKFRYYSSFPLGQAHIAFGQFSLSFKQAYINIPFHFFN
        EDLESGSMSDVEFKYKKIYEDDTRKVFPLETRIVVLKFRYYSSFPLGQAHIAFGQFSLSFKQAYINIPFHFFN
Subjt:  EDLESGSMSDVEFKYKKIYEDDTRKVFPLETRIVVLKFRYYSSFPLGQAHIAFGQFSLSFKQAYINIPFHFFN

XP_008450331.1 PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: protein CASP [Cucumis melo]3.4e-4691.74Show/hide
Query:  ENVDRKHFPLDQDQSSMLKVICSQRDRFRTRLHEAEEELRQLKEKVGQLTVELEKTKADNVKLYGKIRYVQYYNHEKVVSRGSKKHGEDLESGSMSDVEF
        ENVDRKHFPLDQDQSSMLKVICSQRDRFR RL EAEEE+RQLKEK+GQLTV+LEKTKADNVKLYGKIRYVQ YN EKVVSRGSKKH EDLESGSMSDVE 
Subjt:  ENVDRKHFPLDQDQSSMLKVICSQRDRFRTRLHEAEEELRQLKEKVGQLTVELEKTKADNVKLYGKIRYVQYYNHEKVVSRGSKKHGEDLESGSMSDVEF

Query:  KYKKIYEDD
        KYKKIYEDD
Subjt:  KYKKIYEDD

XP_011660168.1 protein CASP [Cucumis sativus]3.4e-4691.74Show/hide
Query:  ENVDRKHFPLDQDQSSMLKVICSQRDRFRTRLHEAEEELRQLKEKVGQLTVELEKTKADNVKLYGKIRYVQYYNHEKVVSRGSKKHGEDLESGSMSDVEF
        ENVDRKHFPLDQDQSSMLKVICSQRDRFR RL EAEEE+RQLKEK+GQLTV+LEKTKADNVKLYGKIRYVQ YN EKVVSRGSKKH EDLESGSMSDVE 
Subjt:  ENVDRKHFPLDQDQSSMLKVICSQRDRFRTRLHEAEEELRQLKEKVGQLTVELEKTKADNVKLYGKIRYVQYYNHEKVVSRGSKKHGEDLESGSMSDVEF

Query:  KYKKIYEDD
        KYKKIYEDD
Subjt:  KYKKIYEDD

XP_022153265.1 protein CASP isoform X1 [Momordica charantia]3.4e-4691.74Show/hide
Query:  ENVDRKHFPLDQDQSSMLKVICSQRDRFRTRLHEAEEELRQLKEKVGQLTVELEKTKADNVKLYGKIRYVQYYNHEKVVSRGSKKHGEDLESGSMSDVEF
        ENVDRKHFPLDQDQSSMLKVICSQRDRFR RL EAEE++RQLKEK+GQLTVELEKTKADNVKLYGKIRYVQ YN EKVVSRGSKKH EDLESGSMSDVE 
Subjt:  ENVDRKHFPLDQDQSSMLKVICSQRDRFRTRLHEAEEELRQLKEKVGQLTVELEKTKADNVKLYGKIRYVQYYNHEKVVSRGSKKHGEDLESGSMSDVEF

Query:  KYKKIYEDD
        KYKKIYEDD
Subjt:  KYKKIYEDD

XP_022153266.1 protein CASP isoform X2 [Momordica charantia]3.4e-4691.74Show/hide
Query:  ENVDRKHFPLDQDQSSMLKVICSQRDRFRTRLHEAEEELRQLKEKVGQLTVELEKTKADNVKLYGKIRYVQYYNHEKVVSRGSKKHGEDLESGSMSDVEF
        ENVDRKHFPLDQDQSSMLKVICSQRDRFR RL EAEE++RQLKEK+GQLTVELEKTKADNVKLYGKIRYVQ YN EKVVSRGSKKH EDLESGSMSDVE 
Subjt:  ENVDRKHFPLDQDQSSMLKVICSQRDRFRTRLHEAEEELRQLKEKVGQLTVELEKTKADNVKLYGKIRYVQYYNHEKVVSRGSKKHGEDLESGSMSDVEF

Query:  KYKKIYEDD
        KYKKIYEDD
Subjt:  KYKKIYEDD

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LXT3 Protein CASP1.6e-4691.74Show/hide
Query:  ENVDRKHFPLDQDQSSMLKVICSQRDRFRTRLHEAEEELRQLKEKVGQLTVELEKTKADNVKLYGKIRYVQYYNHEKVVSRGSKKHGEDLESGSMSDVEF
        ENVDRKHFPLDQDQSSMLKVICSQRDRFR RL EAEEE+RQLKEK+GQLTV+LEKTKADNVKLYGKIRYVQ YN EKVVSRGSKKH EDLESGSMSDVE 
Subjt:  ENVDRKHFPLDQDQSSMLKVICSQRDRFRTRLHEAEEELRQLKEKVGQLTVELEKTKADNVKLYGKIRYVQYYNHEKVVSRGSKKHGEDLESGSMSDVEF

Query:  KYKKIYEDD
        KYKKIYEDD
Subjt:  KYKKIYEDD

A0A1S3BQ05 Protein CASP1.6e-4691.74Show/hide
Query:  ENVDRKHFPLDQDQSSMLKVICSQRDRFRTRLHEAEEELRQLKEKVGQLTVELEKTKADNVKLYGKIRYVQYYNHEKVVSRGSKKHGEDLESGSMSDVEF
        ENVDRKHFPLDQDQSSMLKVICSQRDRFR RL EAEEE+RQLKEK+GQLTV+LEKTKADNVKLYGKIRYVQ YN EKVVSRGSKKH EDLESGSMSDVE 
Subjt:  ENVDRKHFPLDQDQSSMLKVICSQRDRFRTRLHEAEEELRQLKEKVGQLTVELEKTKADNVKLYGKIRYVQYYNHEKVVSRGSKKHGEDLESGSMSDVEF

Query:  KYKKIYEDD
        KYKKIYEDD
Subjt:  KYKKIYEDD

A0A6J1DGB8 Protein CASP1.6e-4691.74Show/hide
Query:  ENVDRKHFPLDQDQSSMLKVICSQRDRFRTRLHEAEEELRQLKEKVGQLTVELEKTKADNVKLYGKIRYVQYYNHEKVVSRGSKKHGEDLESGSMSDVEF
        ENVDRKHFPLDQDQSSMLKVICSQRDRFR RL EAEE++RQLKEK+GQLTVELEKTKADNVKLYGKIRYVQ YN EKVVSRGSKKH EDLESGSMSDVE 
Subjt:  ENVDRKHFPLDQDQSSMLKVICSQRDRFRTRLHEAEEELRQLKEKVGQLTVELEKTKADNVKLYGKIRYVQYYNHEKVVSRGSKKHGEDLESGSMSDVEF

Query:  KYKKIYEDD
        KYKKIYEDD
Subjt:  KYKKIYEDD

A0A6J1DK44 Protein CASP1.6e-4691.74Show/hide
Query:  ENVDRKHFPLDQDQSSMLKVICSQRDRFRTRLHEAEEELRQLKEKVGQLTVELEKTKADNVKLYGKIRYVQYYNHEKVVSRGSKKHGEDLESGSMSDVEF
        ENVDRKHFPLDQDQSSMLKVICSQRDRFR RL EAEE++RQLKEK+GQLTVELEKTKADNVKLYGKIRYVQ YN EKVVSRGSKKH EDLESGSMSDVE 
Subjt:  ENVDRKHFPLDQDQSSMLKVICSQRDRFRTRLHEAEEELRQLKEKVGQLTVELEKTKADNVKLYGKIRYVQYYNHEKVVSRGSKKHGEDLESGSMSDVEF

Query:  KYKKIYEDD
        KYKKIYEDD
Subjt:  KYKKIYEDD

A0A6J1JL41 Protein CASP1.4e-4590.83Show/hide
Query:  ENVDRKHFPLDQDQSSMLKVICSQRDRFRTRLHEAEEELRQLKEKVGQLTVELEKTKADNVKLYGKIRYVQYYNHEKVVSRGSKKHGEDLESGSMSDVEF
        ENVDRKHFPLDQDQSSMLKVICSQRDRFR RL EAEEE+R+LKEK+GQLTVELEKTKADNVKLYGKIRYVQ YN EKVVSRGSKKH  DLESGSMSDVE 
Subjt:  ENVDRKHFPLDQDQSSMLKVICSQRDRFRTRLHEAEEELRQLKEKVGQLTVELEKTKADNVKLYGKIRYVQYYNHEKVVSRGSKKHGEDLESGSMSDVEF

Query:  KYKKIYEDD
        KYKKIYEDD
Subjt:  KYKKIYEDD

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P34237 Protein CASP1.8e-1037.37Show/hide
Query:  LDQDQSSMLKVICSQRDRFRTRLHEAEEELRQLKEKVGQLTVELEKTKADNVKLYGKIRYVQYYNHEKVVSRGSKKHGEDLESGSMSDVEFKYKKIYED
        L  +QS++L ++  QRDRFR+R  + E++LRQ   + G+L +E+ K K DN KLY +IRY+Q YN+               +S    DVE +Y ++Y++
Subjt:  LDQDQSSMLKVICSQRDRFRTRLHEAEEELRQLKEKVGQLTVELEKTKADNVKLYGKIRYVQYYNHEKVVSRGSKKHGEDLESGSMSDVEFKYKKIYED

P70403 Protein CASP4.2e-0732.12Show/hide
Query:  SMLKVICSQRDRFRTRLHEAEEELRQLKEKVGQLTVELEKTKADNVKLYGKIRYVQYYNHEKVVSRGSKKHGEDLESGSMSDVEFKYKKIYED--DTRKV
        S+L +I SQR+RFRTR  E E E R  +  +  L  EL+  +ADN+KL+ KI+++Q Y    + S                D E +Y   YE+  D    
Subjt:  SMLKVICSQRDRFRTRLHEAEEELRQLKEKVGQLTVELEKTKADNVKLYGKIRYVQYYNHEKVVSRGSKKHGEDLESGSMSDVEFKYKKIYED--DTRKV

Query:  FPLETRIVVLKFRYYSSFPLGQAHIAFGQFSLSFKQA
        F    R    + +Y    P  +A +  G+  LS K A
Subjt:  FPLETRIVVLKFRYYSSFPLGQAHIAFGQFSLSFKQA

Q13948 Protein CASP2.5e-0735.04Show/hide
Query:  SMLKVICSQRDRFRTRLHEAEEELRQLKEKVGQLTVELEKTKADNVKLYGKIRYVQYYNHEKVVSRGSKKHGEDLESGSMSDVEFKYKKIYED--DTRKV
        S+L +I SQR+RFR R  E E E R  +  +  L  EL+  +ADN+KL+ KI+++Q Y       RGS   G D       D E +Y   YE+  D    
Subjt:  SMLKVICSQRDRFRTRLHEAEEELRQLKEKVGQLTVELEKTKADNVKLYGKIRYVQYYNHEKVVSRGSKKHGEDLESGSMSDVEFKYKKIYED--DTRKV

Query:  FPLETRIVVLKFRYYSSFPLGQAHIAFGQFSLSFKQA
        F    R    + +Y S  P  +A ++ G+  LS K A
Subjt:  FPLETRIVVLKFRYYSSFPLGQAHIAFGQFSLSFKQA

Q5R8V1 Protein CASP1.9e-0735.04Show/hide
Query:  SMLKVICSQRDRFRTRLHEAEEELRQLKEKVGQLTVELEKTKADNVKLYGKIRYVQYYNHEKVVSRGSKKHGEDLESGSMSDVEFKYKKIYED--DTRKV
        S+L +I SQR+RFR R  E E E R  +  +  L  EL+  +ADN+KL+ KI+++Q Y       RGS   G D       D E +Y   YE+  D    
Subjt:  SMLKVICSQRDRFRTRLHEAEEELRQLKEKVGQLTVELEKTKADNVKLYGKIRYVQYYNHEKVVSRGSKKHGEDLESGSMSDVEFKYKKIYED--DTRKV

Query:  FPLETRIVVLKFRYYSSFPLGQAHIAFGQFSLSFKQA
        F    R    + +Y S  P  +A ++ G+  LS K A
Subjt:  FPLETRIVVLKFRYYSSFPLGQAHIAFGQFSLSFKQA

Q9LS42 Protein CASP1.5e-4180.73Show/hide
Query:  ENVDRKHFPLDQDQSSMLKVICSQRDRFRTRLHEAEEELRQLKEKVGQLTVELEKTKADNVKLYGKIRYVQYYNHEKVVSRGSKKHGEDLESGSMSDVEF
        E +D+KH P +QDQSSMLKVICSQRDRFR RL E EEE+R+LKEK+G LT ELEKTKADNVKLYGKIRYVQ YNH+KVVSRGSKK+ EDLESG  SDVE 
Subjt:  ENVDRKHFPLDQDQSSMLKVICSQRDRFRTRLHEAEEELRQLKEKVGQLTVELEKTKADNVKLYGKIRYVQYYNHEKVVSRGSKKHGEDLESGSMSDVEF

Query:  KYKKIYEDD
        KYKKIYEDD
Subjt:  KYKKIYEDD

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G18480.1 CCAAT-displacement protein alternatively spliced product1.1e-4280.73Show/hide
Query:  ENVDRKHFPLDQDQSSMLKVICSQRDRFRTRLHEAEEELRQLKEKVGQLTVELEKTKADNVKLYGKIRYVQYYNHEKVVSRGSKKHGEDLESGSMSDVEF
        E +D+KH P +QDQSSMLKVICSQRDRFR RL E EEE+R+LKEK+G LT ELEKTKADNVKLYGKIRYVQ YNH+KVVSRGSKK+ EDLESG  SDVE 
Subjt:  ENVDRKHFPLDQDQSSMLKVICSQRDRFRTRLHEAEEELRQLKEKVGQLTVELEKTKADNVKLYGKIRYVQYYNHEKVVSRGSKKHGEDLESGSMSDVEF

Query:  KYKKIYEDD
        KYKKIYEDD
Subjt:  KYKKIYEDD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACTGGGATCTTTCTGAGGCAAGGAGTGAGCTTTCTAGAGAATGTAGATCGAAAACATTTCCCATTGGATCAAGATCAAAGCTCAATGCTAAAAGTAATTTGTAGTCA
GAGGGACCGTTTTAGGACACGCTTACATGAGGCAGAAGAGGAATTAAGACAATTGAAGGAGAAGGTAGGACAGCTTACAGTTGAGCTCGAAAAGACAAAAGCTGATAACG
TCAAATTGTATGGAAAGATTCGTTATGTCCAGTATTACAATCATGAAAAAGTAGTGTCCAGGGGATCGAAGAAGCATGGAGAGGATCTCGAAAGTGGTTCCATGTCCGAT
GTTGAATTCAAGTATAAGAAAATATATGAGGATGATACCAGAAAGGTTTTCCCCCTCGAAACTCGTATTGTAGTGTTGAAATTTAGATACTATTCATCATTTCCTCTAGG
TCAGGCACACATTGCATTTGGACAATTCTCTCTGTCCTTCAAACAAGCATATATAAACATACCATTTCACTTTTTTAAT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TGGTCACTGGTTTCCTATTTGCAGAGTTTGATTTAGAGGAGGAGAAAAGTGCATTGGATGAACAAGGACTTAGGATAGCTGAAAACCAAGAAAATAGCCAGAAAAATCGT
CGGAAGCTTGCTGAAAGTACAAGAGATTTCAAGAAGGCTTCACCAGTGGATAAATTGAACTTGTTTAATTCTCTACTTAAAAATTACCAAGAGGAAGTTGACAATCTCAC
GAAGAGGGCAAAATTTGGAGAAAATTCTTTTCTTAACATCTATCAGAAACTTTATGAGGCTCCTGATCCTTATCCTGCTCTTGCTTCAATTGGTGAACAAGATTTGAAAT
TGTCTGAATTAGAATCTAAGAACAAGAAAATGAAAGTTGAGCTTGAGGAGTTTAGAACTGAAGCAACACATTTAAAGAATCAGCAGGCCACAATTAGAAAACTTGGAAGA
GCGCAATCGGCAATTGGAGCAACAGATGGAGGAGAAAATTAAGGAAATTGTGGATATCAAGCAACGCAGTCTGGCAGAAGAAAACCAGAAGGCATTAGATGCAATAAAAG
AAAGGGAGAGATTGTTACAAGATCAACTAAGACGTGAACAAGAAAGTGTTTCAAACATGAAAAAGCTACATGAACGTGCCCAGAGTCAATTGTTTGAACTTCGTGCTCAA
TCAGACGATGAGAGGGCGGCAAAACAGTCGGAGGTCACTCTCCTAATGGATGAAGTTGAGAGGGCTCAAACATGGTTTCTTAGCCTCGAAAGGGAAAAGAGACTTCTGCG
CTCCCAGTTACAGTCAGCAAATGACGACACTGGCAATAAGAAAAGTATTTCTGATTATTTGACCTGTTATAATTTTTTCAAAAAGAACAGAGTAATTCCTTGGTAAACAT
GGAACTGCACGAAATTGAGACAACTTTATCAAGTGAACGAGAACAACATATTATTGAGATCAAGAATCTGAATGCCTTGATAAATGAAAAGGAAGCTGCTATTGATGAGA
TGAAGAGAGAGCTTCAAGCGAGGCCAACAGAAAAAATGGTTGATGATCTGCGAAAAAAGTGAAGATTTTGCAAGCTGTAGGTTATAATTCAATTGAGGCTGAAGATTGGG
AGGTTGCCACCAGTGGGGAAAGAGATGAGCAAAATGGAATCTCTTCTTCTTGATAAGAACCGAAAAATGGAACATGAGCTTACACAGTATAAGGTTAAACTTTCAGAAAA
AACATCTTTGTTGGATACAGCTGAAAGCAAGAGAGCTGAACTCACAGAAAAGGTTGCTGAACAACAGAAGTTGATTCAAAAGTTGGAAGAAGACATTAAAGGGGTATAAC
TCCAAGGACCAAAAGGGCAGTTTATTTGATGACTGGGATCTTTCTGAGGCAAGGAGTGAGCTTTCTAGAGAATGTAGATCGAAAACATTTCCCATTGGATCAAGATCAAA
GCTCAATGCTAAAAGTAATTTGTAGTCAGAGGGACCGTTTTAGGACACGCTTACATGAGGCAGAAGAGGAATTAAGACAATTGAAGGAGAAGGTAGGACAGCTTACAGTT
GAGCTCGAAAAGACAAAAGCTGATAACGTCAAATTGTATGGAAAGATTCGTTATGTCCAGTATTACAATCATGAAAAAGTAGTGTCCAGGGGATCGAAGAAGCATGGAGA
GGATCTCGAAAGTGGTTCCATGTCCGATGTTGAATTCAAGTATAAGAAAATATATGAGGATGATACCAGAAAGGTTTTCCCCCTCGAAACTCGTATTGTAGTGTTGAAAT
TTAGATACTATTCATCATTTCCTCTAGGTCAGGCACACATTGCATTTGGACAATTCTCTCTGTCCTTCAAACAAGCATATATAAACATACCATTTCACTTTTTTAAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MTGIFLRQGVSFLENVDRKHFPLDQDQSSMLKVICSQRDRFRTRLHEAEEELRQLKEKVGQLTVELEKTKADNVKLYGKIRYVQYYNHEKVVSRGSKKHGEDLESGSMSD
VEFKYKKIYEDDTRKVFPLETRIVVLKFRYYSSFPLGQAHIAFGQFSLSFKQAYINIPFHFFN