| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6588226.1 Pentatricopeptide repeat-containing protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 2.7e-149 | 99.26 | Show/hide |
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+EHSWAESLPGSSRSLMLRFAPNLLRRFSNSATSTIHLYRFTDCTFFEHHRPQQQLLLRFITGSASSPSLSIWRRKKEMGKEGLIVVKELKRIQSNLIRL
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DRFISSHVSRLLKSDLVAVLVELQRQNQVFLCMKLYNVVRKEVWYRPDMFFYRDMLMMLAKNKRVEETKQVWEDLKGEGVLFDQHTFGDIMRAYLDNAMP
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SEAMDIYREMRQSPDRPLSLPFRVILKGLVPYPELREQVKDDFLELFPDMIVYDPPEDLFEEDEDMCKSV+
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|
|
| KAG7022139.1 Pentatricopeptide repeat-containing protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 5.3e-161 | 100 | Show/hide |
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FVAPSIRTPASSFEFHFRQEHSWAESLPGSSRSLMLRFAPNLLRRFSNSATSTIHLYRFTDCTFFEHHRPQQQLLLRFITGSASSPSLSIWRRKKEMGKE
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|
|
| XP_022930047.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g62350 [Cucurbita moschata] | 8.2e-138 | 98.43 | Show/hide |
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MLRFAPNLLRRFSNSATSTIH+YR T CTFFEHHRPQQQLLLRFITGSASSPSLSIWRRKKEMGKEGLIVVKELKRIQSNLIRLDRFISSHVSRLLKSDL
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VAVLVELQRQNQVFLCMKLYNVVRKEVWYRPDMFFYRDMLMMLAKNKRVEETKQVWEDLKGEGVLFDQHTFGDIMRAYLDNAMPSEAMDIYREMRQSPDR
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PLSLPFRVILKGLVPYPELREQVKDDFLELFPDMIVYDPPEDLFEEDE MCKSVK
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|
|
| XP_022966084.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g62350 [Cucurbita maxima] | 2.2e-135 | 96.86 | Show/hide |
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MLRFAPNLLRR SNSATSTIHLYRFT CTFFEHHRPQQQLLLRFITGSASSPSLSIWRRKKEMGKEGLIVVKELKR+QSNLIRLDRFISSHVSRLLKSDL
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VAVLVELQRQNQVFLCMKLYNVVRKEVWYRPDMFFYRDML MLAKNKRVEETKQVWEDLKGEGVLFDQHTFGDIMRAYLDNAMPSEAMDIYREMRQSPDR
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PLSLPFRVILKGLVPYPELREQV+DDFLELFPDMIVYDPPEDLFEEDED KSV+
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|
|
| XP_023531705.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g62350 [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 5.7e-139 | 98.82 | Show/hide |
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MLRFAPNLLRRFSN ATSTIHLYRFT CTFFEHHRPQQQLLLRFITGSASSPSLS+WRRKKEMGKEGLIVVKELKRIQSNLIRLDRFISSHVSRLLKSDL
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PLSLPFRVILKGLVPYPELREQVKDDFLELFPDMIVYDPPEDLFEEDEDMCKSVK
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|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A1S3BQ11 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g62350 | 1.3e-117 | 87.75 | Show/hide |
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MLR APNLLR+ S+S S+ +RF+ TF QQQLLLRFI GSASSPSLSIWRRKKEMGKEGLIVVKELKR+QSN IRLDRFISSHVSRLLKSDL
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VAVLVELQRQN VFLCMKLYNVVRKEVWYRPDMFFYRDMLMMLAKNKRVEETKQVWEDLK EGVLFDQHTFGDI+RAYLDNAM SEAMDIYREMR+SPDR
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PLSLPFRVILKGL+PYPELREQVKDDFLELFPDMIVYDPPEDLFEEDED KS
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|
|
| A0A2I4F1J6 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g62350 | 1.1e-95 | 71.37 | Show/hide |
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MLR A NL R+ S S T+ + F+ TF ++H QQ+ LR++ GSASSPSLSIWRR+KEMGKEGLIV KELKR++ N +RLDRFI SHVS
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RLLKSDL+AVL E QRQ+Q+ LCMKLY+VVRKE+WYRPDM+FYRDMLMMLA+NK+V+E KQVWEDLK E VLFDQHTFGDI+RA+LDN +PSEAMDIY E
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MR SPD P+SLPFRVILKGL+PYPELRE++KDDFLELFPDM+VYDPPEDLFE ++
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|
|
| A0A6J1DGX4 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g62350 | 6.2e-115 | 86.06 | Show/hide |
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MLR PNLLRR N + T+TI + + TFF+ + QQQ L RFITGSASSPSLSIWRRKKEMGKEGLIVVKELKR+QSNLIRLDRFISSHVSRLLKS
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DLVAVLVELQRQ QVFLCMKLYNVVRKEVWYRPDMFFYRDMLMML+KNK+VEETKQVW+DLK E VLFDQHTFGDI+RAYLDN MPSEAMDIYREMRQSP
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Query: DRPLSLPFRVILKGLVPYPELREQVKDDFLELFPDMIVYDPPEDLFEEDED
DRPLSLPFRVILKGL+PYPELREQ+KDDFLELFPDMIVYDPPEDLFEEDED
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|
|
| A0A6J1EQI1 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g62350 | 4.0e-138 | 98.43 | Show/hide |
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MLRFAPNLLRRFSNSATSTIH+YR T CTFFEHHRPQQQLLLRFITGSASSPSLSIWRRKKEMGKEGLIVVKELKRIQSNLIRLDRFISSHVSRLLKSDL
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Query: VAVLVELQRQNQVFLCMKLYNVVRKEVWYRPDMFFYRDMLMMLAKNKRVEETKQVWEDLKGEGVLFDQHTFGDIMRAYLDNAMPSEAMDIYREMRQSPDR
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Query: PLSLPFRVILKGLVPYPELREQVKDDFLELFPDMIVYDPPEDLFEEDEDMCKSVK
PLSLPFRVILKGLVPYPELREQVKDDFLELFPDMIVYDPPEDLFEEDE MCKSVK
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|
|
| A0A6J1HQL7 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g62350 | 1.1e-135 | 96.86 | Show/hide |
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MLRFAPNLLRR SNSATSTIHLYRFT CTFFEHHRPQQQLLLRFITGSASSPSLSIWRRKKEMGKEGLIVVKELKR+QSNLIRLDRFISSHVSRLLKSDL
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VAVLVELQRQNQVFLCMKLYNVVRKEVWYRPDMFFYRDML MLAKNKRVEETKQVWEDLKGEGVLFDQHTFGDIMRAYLDNAMPSEAMDIYREMRQSPDR
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|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| Q1PFH7 Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g62350 | 2.3e-82 | 76.96 | Show/hide |
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M KEGLI KELKR+Q+ +RLDRFI SHVSRLLKSDLV+VL E QRQNQVFLCMKLY VVR+E+WYRPDMFFYRDMLMMLA+NK+V+ETK+VWEDLK E
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Query: GVLFDQHTFGDIMRAYLDNAMPSEAMDIYREMRQSPDRPLSLPFRVILKGLVPYPELREQVKDDFLELFPDMIVYDPPEDLFEEDEDMCKS
VLFDQHTFGD++R +LDN +P EAM +Y EMR+SPDRPLSLPFRVILKGLVPYPELRE+VKDDFLELFP MIVYDPPED+ E+ ++ ++
Subjt: GVLFDQHTFGDIMRAYLDNAMPSEAMDIYREMRQSPDRPLSLPFRVILKGLVPYPELREQVKDDFLELFPDMIVYDPPEDLFEEDEDMCKS
|
|
| Q9FKC3 Pentatricopeptide repeat-containing protein At5g48730, chloroplastic | 9.5e-04 | 20.99 | Show/hide |
Query: MKLYNVVRKEVWYRPDMFFYRDMLMMLAKNKRVEETKQVWEDLKGEGVLFDQHTFGDIMRAYLDNAMPSEAMDIYREMRQS
++++ ++R+++WY+P++ Y +++ML K K+ E+ ++++++ EG + + + ++ AY + A + M+ S
Subjt: MKLYNVVRKEVWYRPDMFFYRDMLMMLAKNKRVEETKQVWEDLKGEGVLFDQHTFGDIMRAYLDNAMPSEAMDIYREMRQS
|
|
| Q9LVW6 Protein THYLAKOID ASSEMBLY 8, chloroplastic | 5.0e-05 | 27.21 | Show/hide |
Query: MGKEGLIVVKELKRIQSNLIRLDRFISSHVSRLLKSDLVAVLVELQRQNQVFLCMKLYNVVRKEVWYRP-DMFFYRDMLMMLAKNKRVEETKQVWEDLKG
+ E + ++ LKR + L + + RL+KSDL++VL EL RQ+ L + + + +R E Y P D+ Y D++ L +NK +E ++ ++ G
Subjt: MGKEGLIVVKELKRIQSNLIRLDRFISSHVSRLLKSDLVAVLVELQRQNQVFLCMKLYNVVRKEVWYRP-DMFFYRDMLMMLAKNKRVEETKQVWEDLKG
Query: EGVLFDQHTFGDIMRAYLDNAMPSEAMDIYREMRQS
D ++RA + + +Y MR+S
Subjt: EGVLFDQHTFGDIMRAYLDNAMPSEAMDIYREMRQS
|
|
| Q9STF9 Protein THYLAKOID ASSEMBLY 8-like, chloroplastic | 6.0e-51 | 45.24 | Show/hide |
Query: RPQQQLLLRFITGSASSPSLSIWRRKKEMGKEGLIVVKELKRIQSNLIRLDRFISSHVSRLLKSDLVAVLVELQRQNQVFLCMKLYNVVRKEVWYRPDMF
+P + RF G P +WR KK +GKE L V+ LKR++ + +LD+FI +HV RLLK D++AV+ EL+RQ + L +K++ V++K+ WY+PD+F
Subjt: RPQQQLLLRFITGSASSPSLSIWRRKKEMGKEGLIVVKELKRIQSNLIRLDRFISSHVSRLLKSDLVAVLVELQRQNQVFLCMKLYNVVRKEVWYRPDMF
Query: FYRDMLMMLAKNKRVEETKQVWEDLKGEGVLFDQHTFGDIMRAYLDNAMPSEAMDIYREMRQSPDRPLSLPFRVILKGLVPYPELREQVKDDFLELFPDM
Y+D+++ LAK+KR++E +WE +K E + D T+ +++R +L + P++AM++Y +M +SPD P LPFRV+LKGL+P+P LR +VK DF ELFP+
Subjt: FYRDMLMMLAKNKRVEETKQVWEDLKGEGVLFDQHTFGDIMRAYLDNAMPSEAMDIYREMRQSPDRPLSLPFRVILKGLVPYPELREQVKDDFLELFPDM
Query: IVYDPPEDLF
YDPPE++F
Subjt: IVYDPPEDLF
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G62350.1 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein | 1.6e-83 | 76.96 | Show/hide |
Query: MGKEGLIVVKELKRIQSNLIRLDRFISSHVSRLLKSDLVAVLVELQRQNQVFLCMKLYNVVRKEVWYRPDMFFYRDMLMMLAKNKRVEETKQVWEDLKGE
M KEGLI KELKR+Q+ +RLDRFI SHVSRLLKSDLV+VL E QRQNQVFLCMKLY VVR+E+WYRPDMFFYRDMLMMLA+NK+V+ETK+VWEDLK E
Subjt: MGKEGLIVVKELKRIQSNLIRLDRFISSHVSRLLKSDLVAVLVELQRQNQVFLCMKLYNVVRKEVWYRPDMFFYRDMLMMLAKNKRVEETKQVWEDLKGE
Query: GVLFDQHTFGDIMRAYLDNAMPSEAMDIYREMRQSPDRPLSLPFRVILKGLVPYPELREQVKDDFLELFPDMIVYDPPEDLFEEDEDMCKS
VLFDQHTFGD++R +LDN +P EAM +Y EMR+SPDRPLSLPFRVILKGLVPYPELRE+VKDDFLELFP MIVYDPPED+ E+ ++ ++
Subjt: GVLFDQHTFGDIMRAYLDNAMPSEAMDIYREMRQSPDRPLSLPFRVILKGLVPYPELREQVKDDFLELFPDMIVYDPPEDLFEEDEDMCKS
|
|
| AT3G27750.1 FUNCTIONS IN: molecular_function unknown | 3.6e-06 | 27.21 | Show/hide |
Query: MGKEGLIVVKELKRIQSNLIRLDRFISSHVSRLLKSDLVAVLVELQRQNQVFLCMKLYNVVRKEVWYRP-DMFFYRDMLMMLAKNKRVEETKQVWEDLKG
+ E + ++ LKR + L + + RL+KSDL++VL EL RQ+ L + + + +R E Y P D+ Y D++ L +NK +E ++ ++ G
Subjt: MGKEGLIVVKELKRIQSNLIRLDRFISSHVSRLLKSDLVAVLVELQRQNQVFLCMKLYNVVRKEVWYRP-DMFFYRDMLMMLAKNKRVEETKQVWEDLKG
Query: EGVLFDQHTFGDIMRAYLDNAMPSEAMDIYREMRQS
D ++RA + + +Y MR+S
Subjt: EGVLFDQHTFGDIMRAYLDNAMPSEAMDIYREMRQS
|
|
| AT3G42570.1 peroxidase family protein | 7.2e-07 | 73.53 | Show/hide |
Query: KKEMGKEGLIVVKELKRIQSNLIRLDRFISSHVS
KKE KEGLI KELKR+Q+NL+RLDRFI SH S
Subjt: KKEMGKEGLIVVKELKRIQSNLIRLDRFISSHVS
|
|
| AT3G46870.1 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein | 4.3e-52 | 45.24 | Show/hide |
Query: RPQQQLLLRFITGSASSPSLSIWRRKKEMGKEGLIVVKELKRIQSNLIRLDRFISSHVSRLLKSDLVAVLVELQRQNQVFLCMKLYNVVRKEVWYRPDMF
+P + RF G P +WR KK +GKE L V+ LKR++ + +LD+FI +HV RLLK D++AV+ EL+RQ + L +K++ V++K+ WY+PD+F
Subjt: RPQQQLLLRFITGSASSPSLSIWRRKKEMGKEGLIVVKELKRIQSNLIRLDRFISSHVSRLLKSDLVAVLVELQRQNQVFLCMKLYNVVRKEVWYRPDMF
Query: FYRDMLMMLAKNKRVEETKQVWEDLKGEGVLFDQHTFGDIMRAYLDNAMPSEAMDIYREMRQSPDRPLSLPFRVILKGLVPYPELREQVKDDFLELFPDM
Y+D+++ LAK+KR++E +WE +K E + D T+ +++R +L + P++AM++Y +M +SPD P LPFRV+LKGL+P+P LR +VK DF ELFP+
Subjt: FYRDMLMMLAKNKRVEETKQVWEDLKGEGVLFDQHTFGDIMRAYLDNAMPSEAMDIYREMRQSPDRPLSLPFRVILKGLVPYPELREQVKDDFLELFPDM
Query: IVYDPPEDLF
YDPPE++F
Subjt: IVYDPPEDLF
|
|
| AT5G09320.1 Vacuolar sorting protein 9 (VPS9) domain | 1.2e-17 | 34.12 | Show/hide |
Query: LDRFISSHVSRLLKSDLVAVLVELQRQNQVFLCMKLYNVVRKEVWYRPDMFFYRDMLMMLAKNKRVEETKQVWEDLKGE-GVLFDQHTFGDIMRAYLDNA
LDR I S RLLK D+VAVL EL RQN+ L +K++ +RKE WY+P + Y DM+ ++A N +EE ++ +K E G++ + F ++ L++
Subjt: LDRFISSHVSRLLKSDLVAVLVELQRQNQVFLCMKLYNVVRKEVWYRPDMFFYRDMLMMLAKNKRVEETKQVWEDLKGE-GVLFDQHTFGDIMRAYLDNA
Query: MPSEAMDIYREMRQSPDRPLSLPFRVILKGLVPYPE--LREQVKDDFLELFPDMIVYDPPEDLFEEDEDM
+ MD Y M+ P FRV++ GL E L V+ D E + + + + EEDE++
Subjt: MPSEAMDIYREMRQSPDRPLSLPFRVILKGLVPYPE--LREQVKDDFLELFPDMIVYDPPEDLFEEDEDM
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