; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg26083 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg26083
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionprotein MIZU-KUSSEI 1-like
Genome locationCarg_Chr06:5176461..5177237
RNA-Seq ExpressionCarg26083
SyntenyCarg26083
Gene Ontology termsGO:0009658 - chloroplast organization (biological process)
GO:0010274 - hydrotropism (biological process)
GO:0005789 - endoplasmic reticulum membrane (cellular component)
GO:0032541 - cortical endoplasmic reticulum (cellular component)
InterPro domainsIPR006460 - Protein MIZU-KUSSEI 1-like, plant


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6596966.1 Protein MIZU-KUSSEI 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.5e-138100Show/hide
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XP_023522902.1 protein MIZU-KUSSEI 1-like, partial [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.2e-93100Show/hide
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XP_023540797.1 protein MIZU-KUSSEI 1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.4e-13698.84Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LHM1 Uncharacterized protein8.8e-8971.04Show/hide
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A0A1S3B7Q2 protein MIZU-KUSSEI 14.9e-8769.5Show/hide
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        M+ + HLEL+ L+RSTS+  T+   K                   P +TSSH         SSLLHSLF+F  HRRN+LSL     +TLRRKLTGTLFGH
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A0A5A7UF10 Protein MIZU-KUSSEI 14.9e-8769.5Show/hide
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        M+ + HLEL+ L+RSTS+  T+   K                   P +TSSH         SSLLHSLF+F  HRRN+LSL     +TLRRKLTGTLFGH
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A0A6J1G1R9 protein MIZU-KUSSEI 1-like5.1e-13798.84Show/hide
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A0A6J1ICS4 protein MIZU-KUSSEI 1-like2.2e-13296.9Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22227 Protein MIZU-KUSSEI 11.2e-4750.44Show/hide
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        +M  +P+PPS++S     S+SN+                  +SL      +L R++TGTL+GH+ GHVTFS+Q + R+ P+ LL L +ST  L+KEMSSG
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        L+RIALE  K       +KL ++PKWTMYCNGR+ G A+SR   C   D  VLNT+  V+VGAGVIP    + D S  G+ +ELGEL+YMR +FERVVGS
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         DSEA +M+NPD N G ELSIFLLRI
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G41660.1 Protein of unknown function, DUF6178.8e-4950.44Show/hide
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        +M  +P+PPS++S     S+SN+                  +SL      +L R++TGTL+GH+ GHVTFS+Q + R+ P+ LL L +ST  L+KEMSSG
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Query:  LLRIALEAHKLPGRAQPSKLLKQPKWTMYCNGRETGLALSR--TCEPYDRHVLNTIRTVSVGAGVIP---VLHDGSKGGACSELGELVYMRAEFERVVGS
        L+RIALE  K       +KL ++PKWTMYCNGR+ G A+SR   C   D  VLNT+  V+VGAGVIP    + D S  G+ +ELGEL+YMR +FERVVGS
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Query:  SDSEALFMINPDGNCGSELSIFLLRI
         DSEA +M+NPD N G ELSIFLLRI
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AT3G25640.1 Protein of unknown function, DUF6174.3e-3545.4Show/hide
Query:  KLTGTLFGHRHGHVTFSLQLDPRAQPLSLLHLDISTTALLKEMSSGLLRIALE--AHKLPGRAQPSKLLKQPKWTMYCNGRETGLALSRTCEPYDRHVLN
        ++ GTLFG+R GHV F++Q DP   P  L+ L   T+ L++EM+SGL+RIALE  A+K   +    KLL++  W  YCNG++ G A  + C   +  VL 
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Query:  TIRTVSVGAGVIP----VLHDGSKGGACSELGELVYMRAEFERVVGSSDSEALFMINPD-GNCGSELSIFLLRI
         +  +++GAGV+P     + +   G   SE GEL+YMRA FERVVGS DSEA +M+NPD  + G ELS++ LR+
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AT4G39610.1 Protein of unknown function, DUF6172.1e-3437.17Show/hide
Query:  NPLTRSTSTASTS--STTKMLQPSSTFNPPQMAIVPNPPSATSSHKSHSLSNRASSLLHSLFQFLFHRRNSLSLTRTL---GLTL------RRKLTGTLF
        NP+  S+S++S+S   ++    P+ST  PP+   +  PP   SS K  + +N    L      F      S++    +   GL L        ++TGTLF
Subjt:  NPLTRSTSTASTS--STTKMLQPSSTFNPPQMAIVPNPPSATSSHKSHSLSNRASSLLHSLFQFLFHRRNSLSLTRTL---GLTL------RRKLTGTLF

Query:  GHRHGHVTFSLQLDPRAQPLSLLHLDISTTALLKEMSSGLLRIALEAHKLP-------GRAQPSKLLKQPKWTMYCNGRETGLALSRTCEPYDRHVLNTI
        G+R G V+ S+Q +P+  P  ++ L + TT L KE+S+G++RIALE  K P          + + +L++P WTMYC G +TG  + R     D +V+  +
Subjt:  GHRHGHVTFSLQLDPRAQPLSLLHLDISTTALLKEMSSGLLRIALEAHKLP-------GRAQPSKLLKQPKWTMYCNGRETGLALSRTCEPYDRHVLNTI

Query:  RTVSVGAGVIPVLHDGSKGGACSE--LGELVYMRAEFERVVGSSDSEALFMINPDGNCGSELSIFLLRI
        R VS+GAGV+P       G + SE   GE+ YMRA FERV+GS DSE  +M++P+GN G ELS F +R+
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AT5G06990.1 Protein of unknown function, DUF6178.6e-3637.16Show/hide
Query:  LNPLTRSTSTASTSSTTKMLQPSSTFNPPQMAIVPNPPSATSSHKSHSLSNRASSLLHSL------FQFLFHRRNSLSLTRTLGLTLRRKLTGTLFGHRH
        L P   + +T S   + K  + ++T  P      P+  + T+  KS  L  R  S+  SL       +F       L      G T   ++TGTLFG+R 
Subjt:  LNPLTRSTSTASTSSTTKMLQPSSTFNPPQMAIVPNPPSATSSHKSHSLSNRASSLLHSL------FQFLFHRRNSLSLTRTLGLTLRRKLTGTLFGHRH

Query:  GHVTFSLQLDPRAQPLSLLHLDISTTALLKEMSSGLLRIALEAHKLPGRAQPSKLLKQPKWTMYCNGRETGLALSRTCEPYDRHVLNTIRTVSVGAGVIP
          V  ++Q +PR+ P+ LL L I T  LL+++  GL+RIALE  K P  ++ +K++ +P W +YCNG+++G  + R     D  V+  +  VS+GAGV+P
Subjt:  GHVTFSLQLDPRAQPLSLLHLDISTTALLKEMSSGLLRIALEAHKLPGRAQPSKLLKQPKWTMYCNGRETGLALSRTCEPYDRHVLNTIRTVSVGAGVIP

Query:  V-----LHDGSKGGACSELGELVYMRAEFERVVGSSDSEALFMINPDGNCGSELSIFLLRI
        V           GG   + G+L YMRA FERV+GS DSE  +M+NPDGN G ELSIF +R+
Subjt:  V-----LHDGSKGGACSELGELVYMRAEFERVVGSSDSEALFMINPDGNCGSELSIFLLRI

AT5G23100.1 Protein of unknown function, DUF6175.6e-3537.7Show/hide
Query:  SSHK---SHSLSNRASSLLHSLFQFLFHRRN----SLSLTRTLGLTLRR------------KLTGTLFGHRHGHVTFSLQLDPRAQPLSLLHLDISTTAL
        SSHK    H+ +  +SS   S    + H++     ++S  R++  TL R            ++ GTLFG R GHV FS+Q DP + P  L+ L    + L
Subjt:  SSHK---SHSLSNRASSLLHSLFQFLFHRRN----SLSLTRTLGLTLRR------------KLTGTLFGHRHGHVTFSLQLDPRAQPLSLLHLDISTTAL

Query:  LKEMSSGLLRIALEAHK------------------------LPGRAQPSKLLKQPKWTMYCNGRETGLALSRTCEPYDRHVLNTIRTVSVGAGVIPVLHD
        +KEM+SGL+RIALE  K                            A   +L+++P W  YCNG++ G A  R C   ++ VL  +  VS+GAGV+P   +
Subjt:  LKEMSSGLLRIALEAHK------------------------LPGRAQPSKLLKQPKWTMYCNGRETGLALSRTCEPYDRHVLNTIRTVSVGAGVIPVLHD

Query:  GSKGGACSELGELVYMRAEFERVVGSSDSEALFMINPDGNCGSELSIFLLRI
           GG     G+++YMRA+FER+VGS DSEA +M+NPD N   ELSI+LLRI
Subjt:  GSKGGACSELGELVYMRAEFERVVGSSDSEALFMINPDGNCGSELSIFLLRI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CCAGATGGCCATTGTTCCCAACCCTCCCTCCGCCACGTCCTCTCACAAATCCCATTCTCTATCCAATAGAGCCTCTTCCCTCCTCCACTCTCTCTTCCAATTCCTCTTCC
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AATATGA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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