; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg26175 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg26175
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionsurvival of motor neuron-related-splicing factor 30
Genome locationCarg_Chr04:11454713..11461602
RNA-Seq ExpressionCarg26175
SyntenyCarg26175
Gene Ontology termsGO:0006397 - mRNA processing (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0003723 - RNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002999 - Tudor domain
IPR010304 - Survival motor neuron


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7032438.1 Survival of motor neuron-related-splicing factor 30 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]9.0e-178100Show/hide
Query:  MQGGEDVSMEELATNLSTYKDQLQQVRELLDDDPGNSEYIDMEKELEEVVYFCPPRYILTATWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDS
        MQGGEDVSMEELATNLSTYKDQLQQVRELLDDDPGNSEYIDMEKELEEVVYFCPPRYILTATWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDS
Subjt:  MQGGEDVSMEELATNLSTYKDQLQQVRELLDDDPGNSEYIDMEKELEEVVYFCPPRYILTATWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDS

Query:  ASISFQQTKGNKMEAESMCDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKI
        ASISFQQTKGNKMEAESMCDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKI
Subjt:  ASISFQQTKGNKMEAESMCDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKI

Query:  AQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGK
        AQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGK
Subjt:  AQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGK

Query:  GLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD
        GLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD
Subjt:  GLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD

XP_004142808.1 survival of motor neuron-related-splicing factor 30 isoform X1 [Cucumis sativus]6.8e-14987Show/hide
Query:  MQGGEDVSMEELATNLSTYKDQLQQVRELLDDDPGNSEYIDMEKELEEVVYFCPPRYILTATWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDS
        MQGGEDVS+EELA NLSTYKDQL QVR+LLDDDPGNSEYIDMEKELEE                        VIALTEELLSTAKQNE+SGSNVETGDDS
Subjt:  MQGGEDVSMEELATNLSTYKDQLQQVRELLDDDPGNSEYIDMEKELEEVVYFCPPRYILTATWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDS

Query:  ASISFQQTKGNKMEAESMCDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKI
        ASI FQQ+K N+MEA SM DYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVN LLEAER+AEATKQAIKRKI
Subjt:  ASISFQQTKGNKMEAESMCDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKI

Query:  AQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGK
        AQAASVDFQSRNLPS+LRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQ+AKGKSKKIGFFSGRK+ESIFKSPDDPNGKVGVTGSGK
Subjt:  AQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGK

Query:  GLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD
        GLTEFQKREKHLHLKGA+VEMD+
Subjt:  GLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD

XP_022155149.1 survival of motor neuron-related-splicing factor 30 [Momordica charantia]9.1e-14685.76Show/hide
Query:  MQGGEDVSMEELATNLSTYKDQLQQVRELLDDDPGNSEYIDMEKELEEVVYFCPPRYILTATWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDS
        MQGGEDVS+EELA+NLSTYKDQLQQVR+LLDDDP NSEYIDMEKELEE                        VI+LTEELL+TAKQNEISGSNVETGD+S
Subjt:  MQGGEDVSMEELATNLSTYKDQLQQVRELLDDDPGNSEYIDMEKELEEVVYFCPPRYILTATWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDS

Query:  ASISFQQTKGNKMEAESMCDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKI
        ASISF Q+K  KMEAES+ D+HEKFPIG+KVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYD WGNKEEVDPANVR IQ EVNALLEAERMAEATKQAIKRKI
Subjt:  ASISFQQTKGNKMEAESMCDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKI

Query:  AQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGK
        AQAASVDFQSRNLP +LRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRK+ESIFKSPDDPNGKVGVTGSGK
Subjt:  AQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGK

Query:  GLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD
        GLTEFQKREKHLHLKGA+VEMDD
Subjt:  GLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD

XP_022933076.1 survival of motor neuron-related-splicing factor 30 [Cucurbita moschata]5.2e-15792.26Show/hide
Query:  MQGGEDVSMEELATNLSTYKDQLQQVRELLDDDPGNSEYIDMEKELEEVVYFCPPRYILTATWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDS
        MQGGEDVSMEELATNLSTYKDQLQQVRELLDDDPGNSEYIDMEKELEE                        VIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDS
Subjt:  MQGGEDVSMEELATNLSTYKDQLQQVRELLDDDPGNSEYIDMEKELEEVVYFCPPRYILTATWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDS

Query:  ASISFQQTKGNKMEAESMCDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKI
        ASISFQQTKGNKMEAESM DYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKI
Subjt:  ASISFQQTKGNKMEAESMCDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKI

Query:  AQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGK
        AQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGK
Subjt:  AQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGK

Query:  GLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD
        GLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD
Subjt:  GLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD

XP_038876515.1 survival of motor neuron-related-splicing factor 30 [Benincasa hispida]1.5e-14887.31Show/hide
Query:  MQGGEDVSMEELATNLSTYKDQLQQVRELLDDDPGNSEYIDMEKELEEVVYFCPPRYILTATWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDS
        MQGGEDVS+EELA NLSTYKDQLQQVR+LLDDDPGNSEYIDMEKELEE                        VIALTEELLSTAKQNEI GSNVETGDDS
Subjt:  MQGGEDVSMEELATNLSTYKDQLQQVRELLDDDPGNSEYIDMEKELEEVVYFCPPRYILTATWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDS

Query:  ASISFQQTKGNKMEAESMCDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKI
        ASISF Q K N+MEA SM DYHEKFPIG+KVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPANVR IQLEVNALLEAER+AEATKQAIKRKI
Subjt:  ASISFQQTKGNKMEAESMCDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKI

Query:  AQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGK
        AQAASVDFQSRNLPS+LRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRK+ESIFKSPDDPNGKVGVTGSGK
Subjt:  AQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGK

Query:  GLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD
        GLTEFQKREKHLHLKGA+VEMD+
Subjt:  GLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CD96 survival of motor neuron-related-splicing factor 30 isoform X13.5e-13595.79Show/hide
Query:  WTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGNKMEAESMCDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWG
        WTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNE+SGSNVETGDDSASI FQQ K N+MEA SM DYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWG
Subjt:  WTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGNKMEAESMCDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWG

Query:  NKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQ
        NKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPS+LRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQ
Subjt:  NKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQ

Query:  SAKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD
        SAKGKSKKIGFFSGRK+ESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGA+VEMD+
Subjt:  SAKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD

A0A1S3CE07 survival of motor neuron-related-splicing factor 30 isoform X23.8e-12992.75Show/hide
Query:  TWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGNKMEAESMCDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGW
        T  W K  + +VIALTEELLSTAKQNE+SGSNVETGDDSASI FQQ K N+MEA SM DYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGW
Subjt:  TWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGNKMEAESMCDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGW

Query:  GNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQF
        GNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPS+LRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQF
Subjt:  GNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQF

Query:  QSAKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD
        QSAKGKSKKIGFFSGRK+ESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGA+VEMD+
Subjt:  QSAKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD

A0A6J1DPE2 survival of motor neuron-related-splicing factor 304.4e-14685.76Show/hide
Query:  MQGGEDVSMEELATNLSTYKDQLQQVRELLDDDPGNSEYIDMEKELEEVVYFCPPRYILTATWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDS
        MQGGEDVS+EELA+NLSTYKDQLQQVR+LLDDDP NSEYIDMEKELEE                        VI+LTEELL+TAKQNEISGSNVETGD+S
Subjt:  MQGGEDVSMEELATNLSTYKDQLQQVRELLDDDPGNSEYIDMEKELEEVVYFCPPRYILTATWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDS

Query:  ASISFQQTKGNKMEAESMCDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKI
        ASISF Q+K  KMEAES+ D+HEKFPIG+KVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYD WGNKEEVDPANVR IQ EVNALLEAERMAEATKQAIKRKI
Subjt:  ASISFQQTKGNKMEAESMCDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKI

Query:  AQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGK
        AQAASVDFQSRNLP +LRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRK+ESIFKSPDDPNGKVGVTGSGK
Subjt:  AQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGK

Query:  GLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD
        GLTEFQKREKHLHLKGA+VEMDD
Subjt:  GLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD

A0A6J1EY48 survival of motor neuron-related-splicing factor 302.5e-15792.26Show/hide
Query:  MQGGEDVSMEELATNLSTYKDQLQQVRELLDDDPGNSEYIDMEKELEEVVYFCPPRYILTATWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDS
        MQGGEDVSMEELATNLSTYKDQLQQVRELLDDDPGNSEYIDMEKELEE                        VIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDS
Subjt:  MQGGEDVSMEELATNLSTYKDQLQQVRELLDDDPGNSEYIDMEKELEEVVYFCPPRYILTATWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDS

Query:  ASISFQQTKGNKMEAESMCDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKI
        ASISFQQTKGNKMEAESM DYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKI
Subjt:  ASISFQQTKGNKMEAESMCDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKI

Query:  AQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGK
        AQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGK
Subjt:  AQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGK

Query:  GLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD
        GLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD
Subjt:  GLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD

A0A6J1K7R2 survival of motor neuron-related-splicing factor 302.5e-15792.26Show/hide
Query:  MQGGEDVSMEELATNLSTYKDQLQQVRELLDDDPGNSEYIDMEKELEEVVYFCPPRYILTATWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDS
        MQGGEDVSMEELATNLSTYKDQLQQVRELLDDDPGNSEYIDMEKELEE                        VIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDS
Subjt:  MQGGEDVSMEELATNLSTYKDQLQQVRELLDDDPGNSEYIDMEKELEEVVYFCPPRYILTATWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDS

Query:  ASISFQQTKGNKMEAESMCDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKI
        ASISFQQTKGNKMEAESM DYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKI
Subjt:  ASISFQQTKGNKMEAESMCDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKI

Query:  AQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGK
        AQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGK
Subjt:  AQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGK

Query:  GLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD
        GLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD
Subjt:  GLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O75940 Survival of motor neuron-related-splicing factor 305.6e-1327.6Show/hide
Query:  EELATNLSTYKDQLQQVRELLDDDPGNSEYIDMEKELEEVVYFCPPRYILTATWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTK
        E+LA  L++YK QLQQV   L  +  N + + ++K+L+E                        VI LT++LLST     ++ S+          SF  T+
Subjt:  EELATNLSTYKDQLQQVRELLDDDPGNSEYIDMEKELEEVVYFCPPRYILTATWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTK

Query:  GNKMEAESMCDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATI-EAHTVNG-FYVSYDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVD
                       + +G K  AVWSEDG+ Y+A I E    NG   +++ G+GN E     N++ ++    A  ++     + K+ I ++        
Subjt:  GNKMEAESMCDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATI-EAHTVNG-FYVSYDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVD

Query:  FQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQS-AKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSG---KGLT
                            +  K+KK  A K   RI++LE  +  ++  WQQF + A  K+KK     G+ K SIF SP+   GKVGV   G   K +T
Subjt:  FQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQS-AKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSG---KGLT

Query:  EFQKREKH
        ++Q   K+
Subjt:  EFQKREKH

Q3T045 Survival of motor neuron-related-splicing factor 301.6e-1226.95Show/hide
Query:  EELATNLSTYKDQLQQVRELLDDDPGNSEYIDMEKELEEVVYFCPPRYILTATWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTK
        E+LA  L++YK QLQQV   L  +  N + + ++K+L+E                        VI LT++LLST     ++ S+          +F  T+
Subjt:  EELATNLSTYKDQLQQVRELLDDDPGNSEYIDMEKELEEVVYFCPPRYILTATWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTK

Query:  GNKMEAESMCDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATI-EAHTVNG-FYVSYDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVD
                       + +G K  A+WSEDG+ Y+A I E    NG   +++ G+GN E     N++ ++    A  ++     + K+ I ++        
Subjt:  GNKMEAESMCDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATI-EAHTVNG-FYVSYDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVD

Query:  FQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQS-AKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSG---KGLT
                            +  K+KK  A K   RI++LE  +  ++  WQQF + A  K+KK     G+ K SIF SP+   GKVGV   G   K +T
Subjt:  FQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQS-AKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSG---KGLT

Query:  EFQKREKH
        ++Q   K+
Subjt:  EFQKREKH

Q5R591 Survival of motor neuron-related-splicing factor 307.3e-1327.27Show/hide
Query:  EELATNLSTYKDQLQQVRELLDDDPGNSEYIDMEKELEEVVYFCPPRYILTATWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTK
        E+LA  L++YK QLQQV   L  +  N + + ++K+L+E                        VI LT++LLST     ++ S+          SF  T+
Subjt:  EELATNLSTYKDQLQQVRELLDDDPGNSEYIDMEKELEEVVYFCPPRYILTATWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTK

Query:  GNKMEAESMCDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATI-EAHTVNG-FYVSYDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVD
                       + +G K  A+WSEDG+ Y+A I E    NG   +++ G+GN E     N++ ++    A  ++     + K+ I ++        
Subjt:  GNKMEAESMCDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATI-EAHTVNG-FYVSYDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVD

Query:  FQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQS-AKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSG---KGLT
                            +  K+KK  A K   RI++LE  +  ++  WQQF + A  K+KK     G+ K SIF SP+   GKVGV   G   K +T
Subjt:  FQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQS-AKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSG---KGLT

Query:  EFQKREKH
        ++Q   K+
Subjt:  EFQKREKH

Q6DEY1 Survival of motor neuron-related-splicing factor 302.3e-1429.45Show/hide
Query:  EELATNLSTYKDQLQQVRELLDDDPGNSEYIDMEKELEEVVYFCPPRYILTATWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTK
        E+LA  L+ YK QLQQV   L  +  N + + ++K+L+E                        VI LT++LLS+           ET DD+         
Subjt:  EELATNLSTYKDQLQQVRELLDDDPGNSEYIDMEKELEEVVYFCPPRYILTATWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTK

Query:  GNKMEAESMCDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATI-EAHTVNG-FYVSYDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVD
         + M A       + + +G K  AVWS+DG+WY+A I E    NG   +++ G+GN E     N+R ++       E  +  E                 
Subjt:  GNKMEAESMCDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATI-EAHTVNG-FYVSYDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVD

Query:  FQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKR-KKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQS-AKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSG---KGL
          S NLP   +      E + A +  KK  A K   RI++LE  +  ++  WQQF + A  K+KK     G+ K SIF SP+   GKVGV   G   K +
Subjt:  FQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKR-KKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQS-AKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSG---KGL

Query:  TEFQKREKH
        T++Q   K+
Subjt:  TEFQKREKH

Q8BGT7 Survival of motor neuron-related-splicing factor 306.2e-1227.27Show/hide
Query:  EELATNLSTYKDQLQQVRELLDDDPGNSEYIDMEKELEEVVYFCPPRYILTATWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTK
        E+LA  L++YK QLQQV   L  +  N + + ++K+L+E                        VI LT++LLST     ++ S+          SF  T+
Subjt:  EELATNLSTYKDQLQQVRELLDDDPGNSEYIDMEKELEEVVYFCPPRYILTATWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTK

Query:  GNKMEAESMCDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATI-EAHTVNG-FYVSYDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVD
                       + +G K  AVWSEDG+ Y+A I E    NG   +++  +GN E     N++ ++    A  ++     + K+ I ++        
Subjt:  GNKMEAESMCDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATI-EAHTVNG-FYVSYDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVD

Query:  FQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQS-AKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSG---KGLT
                            +  K+KK  A K   RI++LE  +  ++  WQQF + A  K+KK     G+ K SIF SP+   GKVGV   G   K +T
Subjt:  FQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQS-AKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSG---KGLT

Query:  EFQKREKH
        ++Q   K+
Subjt:  EFQKREKH

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G02570.1 nucleic acid binding;RNA binding1.5e-10160.49Show/hide
Query:  GGEDVSMEELATNLSTYKDQLQQVRELLDDDPGNSEYIDMEKELEEVVYFCPPRYILTATWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSAS
        G E++S+E+LA+++STYK+QL+QVR+LL +DP NSEY DMEKEL+E                        VIALTEE+L+TAKQNEIS S+       A 
Subjt:  GGEDVSMEELATNLSTYKDQLQQVRELLDDDPGNSEYIDMEKELEEVVYFCPPRYILTATWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSAS

Query:  ISFQQTKGN--------KMEAESMCDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQ
        +S + T G+        K    +   +  KFP+GTKVQAV+S+DGEWYDATIEAHT NG++V+YD WGNKEEVDP NVR I  E NA++EAER+A+ATK 
Subjt:  ISFQQTKGN--------KMEAESMCDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQ

Query:  AIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVG
        A+KRKI +AAS D+Q++ LP++L+I+P+DPEDVK  KRKKIHAFKSK R EQLEV QNK+QN WQQFQ+ K K+KK+GFF+GRKKESIFKSP+DP GKVG
Subjt:  AIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVG

Query:  VTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD
        VTGSGKGLT+FQKREKHLHLK  + E  D
Subjt:  VTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD

AT2G02570.2 nucleic acid binding;RNA binding1.5e-10160.49Show/hide
Query:  GGEDVSMEELATNLSTYKDQLQQVRELLDDDPGNSEYIDMEKELEEVVYFCPPRYILTATWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSAS
        G E++S+E+LA+++STYK+QL+QVR+LL +DP NSEY DMEKEL+E                        VIALTEE+L+TAKQNEIS S+       A 
Subjt:  GGEDVSMEELATNLSTYKDQLQQVRELLDDDPGNSEYIDMEKELEEVVYFCPPRYILTATWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSAS

Query:  ISFQQTKGN--------KMEAESMCDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQ
        +S + T G+        K    +   +  KFP+GTKVQAV+S+DGEWYDATIEAHT NG++V+YD WGNKEEVDP NVR I  E NA++EAER+A+ATK 
Subjt:  ISFQQTKGN--------KMEAESMCDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQ

Query:  AIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVG
        A+KRKI +AAS D+Q++ LP++L+I+P+DPEDVK  KRKKIHAFKSK R EQLEV QNK+QN WQQFQ+ K K+KK+GFF+GRKKESIFKSP+DP GKVG
Subjt:  AIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVG

Query:  VTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD
        VTGSGKGLT+FQKREKHLHLK  + E  D
Subjt:  VTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD

AT2G02570.3 nucleic acid binding;RNA binding1.1e-9357.45Show/hide
Query:  GGEDVSMEELATNLSTYKDQLQQVRELLDDDPGNSEYIDMEKELEEVVYFCPPRYILTATWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSAS
        G E++S+E+LA+++STYK+QL+QVR+LL +DP NSEY DMEKEL+E                        VIALTEE+L+TAKQNEIS S+       A 
Subjt:  GGEDVSMEELATNLSTYKDQLQQVRELLDDDPGNSEYIDMEKELEEVVYFCPPRYILTATWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSAS

Query:  ISFQQTKGN--------KMEAESMCDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQ
        +S + T G+        K    +   +  KFP+GTKVQAV+S+DGEWYDATIEAHT NG++V+YD WGNKEEVDP NVR I  E NA++EAER+A+ATK 
Subjt:  ISFQQTKGN--------KMEAESMCDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQ

Query:  AIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVG
        A+KRKI +AAS D+Q++ LP++L+I+P+DPEDVK  KRKKIH            V QNK+QN WQQFQ+ K K+KK+GFF+GRKKESIFKSP+DP GKVG
Subjt:  AIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVG

Query:  VTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD
        VTGSGKGLT+FQKREKHLHLK  + E  D
Subjt:  VTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD

AT2G02570.4 nucleic acid binding;RNA binding1.5e-10160.49Show/hide
Query:  GGEDVSMEELATNLSTYKDQLQQVRELLDDDPGNSEYIDMEKELEEVVYFCPPRYILTATWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSAS
        G E++S+E+LA+++STYK+QL+QVR+LL +DP NSEY DMEKEL+E                        VIALTEE+L+TAKQNEIS S+       A 
Subjt:  GGEDVSMEELATNLSTYKDQLQQVRELLDDDPGNSEYIDMEKELEEVVYFCPPRYILTATWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSAS

Query:  ISFQQTKGN--------KMEAESMCDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQ
        +S + T G+        K    +   +  KFP+GTKVQAV+S+DGEWYDATIEAHT NG++V+YD WGNKEEVDP NVR I  E NA++EAER+A+ATK 
Subjt:  ISFQQTKGN--------KMEAESMCDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQ

Query:  AIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVG
        A+KRKI +AAS D+Q++ LP++L+I+P+DPEDVK  KRKKIHAFKSK R EQLEV QNK+QN WQQFQ+ K K+KK+GFF+GRKKESIFKSP+DP GKVG
Subjt:  AIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVG

Query:  VTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD
        VTGSGKGLT+FQKREKHLHLK  + E  D
Subjt:  VTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAAGGAGGAGAAGATGTAAGCATGGAAGAGTTGGCTACTAATCTCTCTACCTACAAAGACCAGCTTCAGCAGGTCAGGGAGCTGTTAGATGATGATCCTGGCAACTC
TGAGTACATAGATATGGAAAAGGAGCTTGAAGAGGTAGTTTATTTTTGTCCACCTAGGTATATTTTAACAGCAACATGGACTTGGGCTAAAGTTGCAGTAATGCAGGTTA
TCGCCTTGACGGAAGAGCTTCTTTCAACAGCAAAGCAAAATGAGATTTCTGGATCAAATGTAGAAACTGGTGATGACAGTGCATCAATTAGTTTCCAGCAGACTAAAGGA
AATAAGATGGAAGCTGAAAGCATGTGTGACTATCACGAAAAATTTCCTATTGGAACAAAAGTTCAAGCTGTTTGGAGCGAGGATGGGGAGTGGTACGATGCTACAATTGA
AGCCCATACTGTAAATGGTTTCTATGTTAGTTATGATGGTTGGGGAAACAAAGAAGAGGTGGACCCTGCTAATGTAAGAACAATCCAACTGGAAGTTAATGCTTTGCTTG
AAGCAGAAAGAATGGCTGAAGCTACAAAACAGGCTATCAAGCGCAAGATTGCTCAAGCTGCTTCTGTTGACTTCCAATCACGAAATTTACCATCAAGGCTTCGAATTGAA
CCTGATGATCCTGAGGATGTAAAAGCCACCAAACGCAAGAAAATACATGCTTTCAAGTCAAAGATGCGCATAGAACAGCTTGAAGTTACCCAGAATAAACGGCAGAATGC
TTGGCAGCAGTTTCAGTCAGCAAAAGGCAAGTCGAAGAAGATTGGCTTCTTCTCTGGGCGCAAGAAGGAGAGCATTTTCAAGTCTCCTGATGATCCAAATGGCAAGGTTG
GTGTGACTGGAAGTGGCAAGGGTTTGACTGAGTTTCAAAAGAGGGAAAAGCACTTGCATCTCAAGGGTGCATCGGTGGAGATGGATGATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CGGTGTTGTGTGTGCCTTATTCTTCGTCCAGATTTTCCCAATTTCACGCGTTTTTTCTTCCTCCTCCTCCTCTCTTCATCCCTGCAAGATATTCTCTCACACCATTCTCT
AGTTTCAACTTCTCAATTCATCTTCTACCAAAATGCAAGGAGGAGAAGATGTAAGCATGGAAGAGTTGGCTACTAATCTCTCTACCTACAAAGACCAGCTTCAGCAGGTC
AGGGAGCTGTTAGATGATGATCCTGGCAACTCTGAGTACATAGATATGGAAAAGGAGCTTGAAGAGGTAGTTTATTTTTGTCCACCTAGGTATATTTTAACAGCAACATG
GACTTGGGCTAAAGTTGCAGTAATGCAGGTTATCGCCTTGACGGAAGAGCTTCTTTCAACAGCAAAGCAAAATGAGATTTCTGGATCAAATGTAGAAACTGGTGATGACA
GTGCATCAATTAGTTTCCAGCAGACTAAAGGAAATAAGATGGAAGCTGAAAGCATGTGTGACTATCACGAAAAATTTCCTATTGGAACAAAAGTTCAAGCTGTTTGGAGC
GAGGATGGGGAGTGGTACGATGCTACAATTGAAGCCCATACTGTAAATGGTTTCTATGTTAGTTATGATGGTTGGGGAAACAAAGAAGAGGTGGACCCTGCTAATGTAAG
AACAATCCAACTGGAAGTTAATGCTTTGCTTGAAGCAGAAAGAATGGCTGAAGCTACAAAACAGGCTATCAAGCGCAAGATTGCTCAAGCTGCTTCTGTTGACTTCCAAT
CACGAAATTTACCATCAAGGCTTCGAATTGAACCTGATGATCCTGAGGATGTAAAAGCCACCAAACGCAAGAAAATACATGCTTTCAAGTCAAAGATGCGCATAGAACAG
CTTGAAGTTACCCAGAATAAACGGCAGAATGCTTGGCAGCAGTTTCAGTCAGCAAAAGGCAAGTCGAAGAAGATTGGCTTCTTCTCTGGGCGCAAGAAGGAGAGCATTTT
CAAGTCTCCTGATGATCCAAATGGCAAGGTTGGTGTGACTGGAAGTGGCAAGGGTTTGACTGAGTTTCAAAAGAGGGAAAAGCACTTGCATCTCAAGGGTGCATCGGTGG
AGATGGATGATTAAGGGCAGGTCAGATTTTGTAGGTTGCTGCTTTCTTTGTATGTATCTTCATTTAGTATCCATTTGGGGCCATCTGTCTGGTTAGATTCATATAAATGG
TTATACCTGTACTAAAAGAGCTTAGGTTGGGGGATGATTCCCTCTGGGTAACATAGTTTTCTTATAAGAATGGTTACGAAGCCTAGCCATGACAGGATCTCTTTTCTTCG
ACGTTTTATTTTACGTTCTGTTTCCTTATTATGTGAAAAACCCAGCAATTGTGTTC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQGGEDVSMEELATNLSTYKDQLQQVRELLDDDPGNSEYIDMEKELEEVVYFCPPRYILTATWTWAKVAVMQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKG
NKMEAESMCDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIE
PDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD