; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg26265 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg26265
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionProtein of unknown function, DUF584
Genome locationCarg_Chr18:7470867..7475915
RNA-Seq ExpressionCarg26265
SyntenyCarg26265
Gene Ontology termsGO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR007608 - Senescence regulator S40


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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KAG7012711.1 hypothetical protein SDJN02_25464, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.0e-240100Show/hide
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XP_022945942.1 uncharacterized protein LOC111450033 [Cucurbita moschata]1.5e-10697.25Show/hide
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XP_022967102.1 uncharacterized protein LOC111466606 [Cucurbita maxima]5.8e-10395.87Show/hide
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XP_023522766.1 uncharacterized protein LOC111786770 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.6e-10395.87Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LT40 Uncharacterized protein3.5e-9084.86Show/hide
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A0A1S4E4F1 uncharacterized protein LOC1034998843.9e-8984.4Show/hide
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A0A5A7SY45 Senescence regulator3.9e-8984.4Show/hide
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A0A6J1HPU4 uncharacterized protein LOC1114666062.8e-10395.87Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G61930.1 Protein of unknown function, DUF5845.7e-0843.42Show/hide
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AT3G15040.1 Protein of unknown function, DUF5841.0e-3348.37Show/hide
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Query:  FYHK----------ASVSSSSSS-------SPSSSRMIPTIPKPPLERLPLPIS--SSLKY-QSAPVNVPMMSKAAVQRHQ------EIDVDDVDESDGE
        F+HK          ++ SSSSSS       S SS+R IPT PKPP ERLP   S     KY QSAPV VP++S A + RH+      ++  DD +E +GE
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        MLPPHEIVARSLAQS LLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQ  +  F  T
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AT4G04630.1 Protein of unknown function, DUF5843.6e-1039.57Show/hide
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        + + L E E SS       S+F    S SSSSSSSP + R    +             S +K  SAP+NVP  SK          +   H     DD ++
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         DG M+PPHE VAR LA++ + S S+ EG GRTLKGRDL
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AT4G21970.1 Protein of unknown function, DUF5841.0e-0937.5Show/hide
Query:  ENEASSSLRNSSYFYHKASVSSS----SSSSPSSSRMIPTIPKPPLERLPLPISSSLKYQSAPVNVPMMSKAAVQRHQEID-------VDDVDESDGEML
        E E  S LR S     +  +S S    S+SS SS+R IP   +         +S   K  SAP+N+P  SK      +          +DD DE  G M+
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        PPHE+VA+ LA++ + S S+ EG GRTLKGRDL ++ +   T T
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AT5G60680.1 Protein of unknown function, DUF5845.9e-0533.09Show/hide
Query:  ENEASSSLRNSSYFYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPLERLPLPISSSLKYQSAPVNVPMMSKAAVQRHQE---------IDVDDVDESDGEMLPP
        E++  + + + S  + +   SS  S   SS+R             P   SS+    S PVNVP  SK     +++          D DD +E  G+ LPP
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Query:  HEIVARSLAQSPLLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQSASVWF
        HE     LA++ + S SV EG GRTLKGRDL +  +  F
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GAATTGTGAGATCCCACATCTCTTGGGAAAGAGAATGAGTCGTGGAAACCTCCCCGTGAATTTAATGCGCTTCCTTCTCTCCTTCTCTTCTCCCTCCCCCCGCCCTTACC
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ACTCCTTCCTCCTCCTCCTCCTCCACTCCTCGCCACCATATTCATCACCTCCAGCATCACAAGGGCTTCCCCCAGTCTGAGACCTTCGGTATTCTCGCTGCCCTCCCTGA
GAATGAGGCCTCCTCCAGCCTTCGCAACTCCTCGTATTTCTACCACAAGGCCTCCGTCTCCTCCTCCTCTTCCTCTTCCCCTTCCTCTTCTCGGATGATTCCGACTATCC
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ATTTGAATCTGCTTGACACTCATCGTAAGAAGGAATTGGAATTGGAATTGGAATTGGAATTGGAATTGGAATTGGAATTGGAATTGGAATTGTAA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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