; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg26451 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg26451
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionTropomyosin-like
Genome locationCarg_Chr11:9663362..9666445
RNA-Seq ExpressionCarg26451
SyntenyCarg26451
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7022547.1 hypothetical protein SDJN02_16281 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]8.3e-70100Show/hide
Query:  MEDKGEGTDRWTGAVANLTEMASNLESFQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSQQARTIKVLDQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKTAELHVQ
        MEDKGEGTDRWTGAVANLTEMASNLESFQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSQQARTIKVLDQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKTAELHVQ
Subjt:  MEDKGEGTDRWTGAVANLTEMASNLESFQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSQQARTIKVLDQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKTAELHVQ

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKK
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKK
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKK
XP_022927931.1 uncharacterized protein LOC111434686 [Cucurbita moschata]1.6e-6897.97Show/hide
Query:  MEDKGEGTDRWTGAVANLTEMASNLESFQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSQQARTIKVLDQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKTAELHVQ
        MEDKG+GTDRWTGAVANLTEMASNLESFQKLLLKKAVYVD++TFARASLCSQQARTIKVLDQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKTAELHVQ
Subjt:  MEDKGEGTDRWTGAVANLTEMASNLESFQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSQQARTIKVLDQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKTAELHVQ

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKK
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKK
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKK
XP_022963475.1 uncharacterized protein LOC111463800 isoform X1 [Cucurbita moschata]1.6e-6593.24Show/hide
Query:  MEDKGEGTDRWTGAVANLTEMASNLESFQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSQQARTIKVLDQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKTAELHVQ
        MEDKG+GTDRW+GAVAN+TEMASNLES QK+L+KKAVYVDDETFARASLCS+QARTIKVL+QRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQK AELHVQ
Subjt:  MEDKGEGTDRWTGAVANLTEMASNLESFQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSQQARTIKVLDQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKTAELHVQ

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKK
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGK+
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKK
XP_022988990.1 uncharacterized protein LOC111486188 [Cucurbita maxima]1.3e-6797.3Show/hide
Query:  MEDKGEGTDRWTGAVANLTEMASNLESFQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSQQARTIKVLDQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKTAELHVQ
        MEDKG+GTDRWTGAVANLTEMASNLE FQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSQQARTIKVLDQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQK AELHVQ
Subjt:  MEDKGEGTDRWTGAVANLTEMASNLESFQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSQQARTIKVLDQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKTAELHVQ

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKK
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRD+DIKLLEAIIQTLGGKK
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKK
XP_038886855.1 uncharacterized protein LOC120077075 isoform X1 [Benincasa hispida]2.8e-6593.92Show/hide
Query:  MEDKGEGTDRWTGAVANLTEMASNLESFQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSQQARTIKVLDQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKTAELHVQ
        MEDKG+GTDRW+GAVANLTEMASNLES QKLLLKKAVYVDDETFARASLCSQQARTIKVL+QRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQ+ AELHVQ
Subjt:  MEDKGEGTDRWTGAVANLTEMASNLESFQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSQQARTIKVLDQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKTAELHVQ

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKK
        EVTRELENTTKVFQLHMDELR KQEEI+KRDKDIKLLEAIIQTLGGK+
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKK
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1EIV8 uncharacterized protein LOC1114346867.6e-6997.97Show/hide
Query:  MEDKGEGTDRWTGAVANLTEMASNLESFQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSQQARTIKVLDQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKTAELHVQ
        MEDKG+GTDRWTGAVANLTEMASNLESFQKLLLKKAVYVD++TFARASLCSQQARTIKVLDQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKTAELHVQ
Subjt:  MEDKGEGTDRWTGAVANLTEMASNLESFQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSQQARTIKVLDQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKTAELHVQ

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKK
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKK
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKK
A0A6J1HG82 uncharacterized protein LOC111463800 isoform X21.5e-6493.79Show/hide
Query:  MEDKGEGTDRWTGAVANLTEMASNLESFQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSQQARTIKVLDQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKTAELHVQ
        MEDKG+GTDRW+GAVAN+TEMASNLES QK+L+KKAVYVDDETFARASLCS+QARTIKVL+QRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQK AELHVQ
Subjt:  MEDKGEGTDRWTGAVANLTEMASNLESFQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSQQARTIKVLDQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKTAELHVQ

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLG
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLG
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLG
A0A6J1HI40 uncharacterized protein LOC111463800 isoform X17.9e-6693.24Show/hide
Query:  MEDKGEGTDRWTGAVANLTEMASNLESFQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSQQARTIKVLDQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKTAELHVQ
        MEDKG+GTDRW+GAVAN+TEMASNLES QK+L+KKAVYVDDETFARASLCS+QARTIKVL+QRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQK AELHVQ
Subjt:  MEDKGEGTDRWTGAVANLTEMASNLESFQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSQQARTIKVLDQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKTAELHVQ

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKK
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGK+
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKK
A0A6J1HXA5 uncharacterized protein LOC111467076 isoform X11.8e-6593.24Show/hide
Query:  MEDKGEGTDRWTGAVANLTEMASNLESFQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSQQARTIKVLDQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKTAELHVQ
        MEDKG+GTDRW+ AVAN+TEMASNLES QK+L+KKAVYVDDETFARASLCS+QARTIKVL+QRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQK AELHVQ
Subjt:  MEDKGEGTDRWTGAVANLTEMASNLESFQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSQQARTIKVLDQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKTAELHVQ

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKK
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKK
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKK
A0A6J1JEJ3 uncharacterized protein LOC1114861886.4e-6897.3Show/hide
Query:  MEDKGEGTDRWTGAVANLTEMASNLESFQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSQQARTIKVLDQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKTAELHVQ
        MEDKG+GTDRWTGAVANLTEMASNLE FQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSQQARTIKVLDQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQK AELHVQ
Subjt:  MEDKGEGTDRWTGAVANLTEMASNLESFQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSQQARTIKVLDQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKTAELHVQ

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKK
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRD+DIKLLEAIIQTLGGKK
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKK
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G64180.1 unknown protein5.8e-5373.83Show/hide
Query:  MEDKGEGTD-RWTGAVANLTEMASNLESFQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSQQARTIKVLDQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKTAELHV
        ME++  G+D RW G++ N+TEMASNL+S QKLLLKKAV+V+++TF+RASL S+QARTIKVL+QRV+TLERELDAAITAAAHARSEKRQAE++QK AE   
Subjt:  MEDKGEGTD-RWTGAVANLTEMASNLESFQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSQQARTIKVLDQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKTAELHV

Query:  QEVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKK
        Q+VT+ELENTTKVF+LHM+ELR  QE+I+KRD +IKLLEAIIQTLGGK+
Subjt:  QEVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKK

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGGACAAGGGCGAAGGAACGGACAGATGGACCGGCGCCGTTGCCAATCTAACTGAGATGGCTTCCAACTTGGAGTCATTCCAGAAGCTTTTACTCAAGAAAGCTGT
CTATGTCGACGACGAGACGTTTGCCAGAGCTTCATTGTGCTCCCAACAAGCAAGGACGATCAAGGTTCTTGATCAAAGGGTTGAGACTTTGGAAAGGGAACTTGATGCTG
CTATCACTGCTGCTGCTCATGCTCGTTCAGAAAAACGTCAGGCTGAGGCAGCACAAAAAACTGCTGAACTACACGTGCAGGAGGTCACTCGAGAGCTCGAGAACACTACA
AAGGTATTTCAACTGCATATGGATGAATTGCGCGCGAAGCAGGAAGAAATCAATAAACGTGATAAGGATATTAAGCTCTTGGAAGCAATAATTCAGACTCTTGGAGGGAA
AAAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAGCTCTTATTGAAGGTAATGGCATGATCGGGTGGGTTCTTAGCTCGCTCTCCAAGTCTCTCTACACGGATCATGACGTCGAACGACCATTGAATTGCGAATTTTCAAA
AGGGGCAAGCGTCGAAGAAGATTTGGATCATGGAGGACAAGGGCGAAGGAACGGACAGATGGACCGGCGCCGTTGCCAATCTAACTGAGATGGCTTCCAACTTGGAGTCA
TTCCAGAAGCTTTTACTCAAGAAAGCTGTCTATGTCGACGACGAGACGTTTGCCAGAGCTTCATTGTGCTCCCAACAAGCAAGGACGATCAAGGTTCTTGATCAAAGGGT
TGAGACTTTGGAAAGGGAACTTGATGCTGCTATCACTGCTGCTGCTCATGCTCGTTCAGAAAAACGTCAGGCTGAGGCAGCACAAAAAACTGCTGAACTACACGTGCAGG
AGGTCACTCGAGAGCTCGAGAACACTACAAAGGTATTTCAACTGCATATGGATGAATTGCGCGCGAAGCAGGAAGAAATCAATAAACGTGATAAGGATATTAAGCTCTTG
GAAGCAATAATTCAGACTCTTGGAGGGAAAAAATGACGTTCAGCAAATCTGTGAGGATTTGGTTTTTATATTTAGAGCCCTGGTACCTTTTTCTTTTCTTTCCGTGTAAA
TTTTTTTTATGGATAATCTGACTGAGCTTAATTAGGAACGTAGTGTATATTACATTATCTTGAATTCGTAGAGACATGTCTTGTTTATAAAAACATGGATAAATAAAATT
CAAATAATTTTTTATTTGCGAGTTATTCCCTACCAATGTCTTGTACTCTGATAGTAAATGAAAATTGGAACAATACAAAGTTTTAGTTCTTGTGCATCTTTTTGTGGATA
TGTTTAAAATCGTCGAAACAGTTATTATGGGTTTGGAGTTATCATTTTATAGTTCATAATTTTATGAGGAAAATACTTTGTTGTTACTTCAAACAAACCCAAAAGAAACA
ACCATGGTGATCAGCTGCACTTTGCTTGAGCAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEDKGEGTDRWTGAVANLTEMASNLESFQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSQQARTIKVLDQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKTAELHVQEVTRELENTT
KVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKK