| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG7022543.1 Serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 2.3e-148 | 100 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAEK
Query: IQKGKISEPFPKSRHRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYVDERRNRSRSH
IQKGKISEPFPKSRHRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYVDERRNRSRSH
Subjt: IQKGKISEPFPKSRHRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYVDERRNRSRSH
Query: SRSRGRSRSVNSASPGRRSPSPQRSLSPRRSLSPRRSLSPQRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
SRSRGRSRSVNSASPGRRSPSPQRSLSPRRSLSPRRSLSPQRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
Subjt: SRSRGRSRSVNSASPGRRSPSPQRSLSPRRSLSPRRSLSPQRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
|
|
| XP_008455209.1 PREDICTED: serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Cucumis melo] | 4.4e-123 | 88.4 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAEK
Query: IQKGKISEPFPKSRHRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRR--RSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYVDERRNRSR
I KGKISE FPKSR+RSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRR RSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DERR+RS
Subjt: IQKGKISEPFPKSRHRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRR--RSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYVDERRNRSR
Query: SHSRSRGRSRSVNSASPGRRSPSPQRSLSPRRSLSPRRSLSPQRSLSPRRSPSPRGESPERNGD-GGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
S SRSRGRSRSV+S SPGRRSP SPRRS SP+RSLSPRRSPSPR ESPERNG+ GGRSPT RSVSPRG+PADSRSPSPQNSD
Subjt: SHSRSRGRSRSVNSASPGRRSPSPQRSLSPRRSLSPRRSLSPQRSLSPRRSPSPRGESPERNGD-GGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
|
|
| XP_022927926.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like [Cucurbita moschata] | 6.8e-148 | 99.66 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAEK
Query: IQKGKISEPFPKSRHRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYVDERRNRSRSH
IQKGKISEPFPKSRHRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYVDERRNRSRSH
Subjt: IQKGKISEPFPKSRHRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYVDERRNRSRSH
Query: SRSRGRSRSVNSASPGRRSPSPQRSLSPRRSLSPRRSLSPQRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
SRSRGRSRSVNSASPGRRSPSP+RSLSPRRSLSPRRSLSPQRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
Subjt: SRSRGRSRSVNSASPGRRSPSPQRSLSPRRSLSPRRSLSPQRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
|
|
| XP_022988862.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like [Cucurbita maxima] | 7.8e-144 | 96.66 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAEK
Query: IQKGKISEPFPKSRHRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYVDERRNRSRSH
IQKGKISEPFPKSRHRSRSRSPRRRYRD+YRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYVDERRNRSRSH
Subjt: IQKGKISEPFPKSRHRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYVDERRNRSRSH
Query: SRSRGRSRSVNSASPGRRSPSPQRSLSPRRSLSPR------RSLSPQRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
SRSRGRSRSVNSASPGRRSPSP+RSLSPRRSLSPR RSLSPQRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPRSVSPRGQ ADSRSPSPQNSDV+K
Subjt: SRSRGRSRSVNSASPGRRSPSPQRSLSPRRSLSPR------RSLSPQRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
|
|
| XP_023529917.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 9.2e-145 | 95.41 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAEK
Query: IQKGKISEPFPKSRHRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYVDERRNRSRSH
IQKGKISEPFPKSRHRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYVDERRNRSRSH
Subjt: IQKGKISEPFPKSRHRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYVDERRNRSRSH
Query: SRSRGRSRSVNSASPGRRSP------------SPQRSLSPRRSLSPRRSLSPQRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQN
SRSRGRSRSVNSASPGRRSP SP+RSLSPRRSLSPRRSLSPQRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPRSVSPRGQP DSRSPSPQN
Subjt: SRSRGRSRSVNSASPGRRSP------------SPQRSLSPRRSLSPRRSLSPQRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQN
Query: SDVDK
SDVDK
Subjt: SDVDK
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0K7C0 RRM domain-containing protein | 9.0e-122 | 87.03 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAEK
Query: IQKGKISEPFPKSRHRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRR--RSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYVDERRNRSR
I KGKISE FPKSR+RSRSRSPRRR+RDDYRD+DYRR RSRSRSRSLD++DRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DERR+RS
Subjt: IQKGKISEPFPKSRHRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRR--RSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYVDERRNRSR
Query: SHSRSRGRSRSVNSASPGRRSPSPQRSLSPRRSLSPRRSLSPQRSLSPRRSPSPRGESPERNGDG-GRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
S SRSRGRSRSV+S SPGRRSP SPRRS SP+RSLSPRRSPSPR ESPERNG+G GRSPT RSVSPRG+PADSRSPSPQNSD
Subjt: SHSRSRGRSRSVNSASPGRRSPSPQRSLSPRRSLSPRRSLSPQRSLSPRRSPSPRGESPERNGDG-GRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
|
|
| A0A1S3C0I4 serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 2.1e-123 | 88.4 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAEK
Query: IQKGKISEPFPKSRHRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRR--RSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYVDERRNRSR
I KGKISE FPKSR+RSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRR RSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DERR+RS
Subjt: IQKGKISEPFPKSRHRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRR--RSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYVDERRNRSR
Query: SHSRSRGRSRSVNSASPGRRSPSPQRSLSPRRSLSPRRSLSPQRSLSPRRSPSPRGESPERNGD-GGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
S SRSRGRSRSV+S SPGRRSP SPRRS SP+RSLSPRRSPSPR ESPERNG+ GGRSPT RSVSPRG+PADSRSPSPQNSD
Subjt: SHSRSRGRSRSVNSASPGRRSPSPQRSLSPRRSLSPRRSLSPQRSLSPRRSPSPRGESPERNGD-GGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
|
|
| A0A6J1CKN2 serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 9.0e-122 | 86.53 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAEK
Query: IQKGKISEPFPKSRHRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRR--RSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYVDERRNRSR
I KGKISE F K R+RSRSRSPRRRYRDD RDRDYRR RSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DERR+RSR
Subjt: IQKGKISEPFPKSRHRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRR--RSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYVDERRNRSR
Query: SHSR--SRGRSRSVNSASPGRRSPSPQRSLSPRRSLSPRRSLSPQRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
S SR SRG+SRSV+SASPG RRS SP+RSLSP+RSPSPRGESP RNGDGGR+PTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
Subjt: SHSR--SRGRSRSVNSASPGRRSPSPQRSLSPRRSLSPRRSLSPQRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
|
|
| A0A6J1EIV3 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like | 3.3e-148 | 99.66 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAEK
Query: IQKGKISEPFPKSRHRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYVDERRNRSRSH
IQKGKISEPFPKSRHRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYVDERRNRSRSH
Subjt: IQKGKISEPFPKSRHRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYVDERRNRSRSH
Query: SRSRGRSRSVNSASPGRRSPSPQRSLSPRRSLSPRRSLSPQRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
SRSRGRSRSVNSASPGRRSPSP+RSLSPRRSLSPRRSLSPQRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
Subjt: SRSRGRSRSVNSASPGRRSPSPQRSLSPRRSLSPRRSLSPQRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
|
|
| A0A6J1JE82 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like | 3.8e-144 | 96.66 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAEK
Query: IQKGKISEPFPKSRHRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYVDERRNRSRSH
IQKGKISEPFPKSRHRSRSRSPRRRYRD+YRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYVDERRNRSRSH
Subjt: IQKGKISEPFPKSRHRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYVDERRNRSRSH
Query: SRSRGRSRSVNSASPGRRSPSPQRSLSPRRSLSPR------RSLSPQRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
SRSRGRSRSVNSASPGRRSPSP+RSLSPRRSLSPR RSLSPQRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPRSVSPRGQ ADSRSPSPQNSDV+K
Subjt: SRSRGRSRSVNSASPGRRSPSPQRSLSPRRSLSPR------RSLSPQRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P30352 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 1.8e-26 | 43.48 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAEKI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A+D +DG V+DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAEKI
Query: QKGKISEPFPKSRHRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYVDERRNRSRSHS
++G + S + RSRSPRR RRRSRSRSRS R R R R R R +SRS R S SK R R + + SRS S
Subjt: QKGKISEPFPKSRHRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYVDERRNRSRSHS
Query: RSRGRSRSVNSASPGRRSPSPQRSLSPRRSLSPRRSLSPQRSLSPRRSPSPRG
RSR RSRS RSP P S R S S RS SP +SP G
Subjt: RSRGRSRSVNSASPGRRSPSPQRSLSPRRSLSPRRSLSPQRSLSPRRSPSPRG
|
|
| Q01130 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 4.0e-26 | 43.08 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAEKI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A+D +DG V+DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAEKI
Query: QKGKISEPFPKSRHRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYVDERRNRSRSHS
++G + + RSRSPRR RRRSRSRSRS R R R R R R +SRS R S SK R R + + SRS S
Subjt: QKGKISEPFPKSRHRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYVDERRNRSRSHS
Query: RSRGRSRSVNSASPGRRSPSPQRSLSPRRSLSPRRSLSPQRSLSPRRSPSPRG
RSR RSRS RSP P +S R S S RS SP +SP G
Subjt: RSRGRSRSVNSASPGRRSPSPQRSLSPRRSLSPRRSLSPQRSLSPRRSPSPRG
|
|
| Q3MHR5 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 4.0e-26 | 43.08 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAEKI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A+D +DG V+DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAEKI
Query: QKGKISEPFPKSRHRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYVDERRNRSRSHS
++G + + RSRSPRR RRRSRSRSRS R R R R R R +SRS R S SK R R + + SRS S
Subjt: QKGKISEPFPKSRHRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYVDERRNRSRSHS
Query: RSRGRSRSVNSASPGRRSPSPQRSLSPRRSLSPRRSLSPQRSLSPRRSPSPRG
RSR RSRS RSP P +S R S S RS SP +SP G
Subjt: RSRGRSRSVNSASPGRRSPSPQRSLSPRRSLSPRRSLSPQRSLSPRRSPSPRG
|
|
| Q62093 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 4.0e-26 | 43.08 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAEKI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A+D +DG V+DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAEKI
Query: QKGKISEPFPKSRHRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYVDERRNRSRSHS
++G + + RSRSPRR RRRSRSRSRS R R R R R R +SRS R S SK R R + + SRS S
Subjt: QKGKISEPFPKSRHRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYVDERRNRSRSHS
Query: RSRGRSRSVNSASPGRRSPSPQRSLSPRRSLSPRRSLSPQRSLSPRRSPSPRG
RSR RSRS RSP P +S R S S RS SP +SP G
Subjt: RSRGRSRSVNSASPGRRSPSPQRSLSPRRSLSPRRSLSPQRSLSPRRSPSPRG
|
|
| Q9FMG4 Serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 9.1e-71 | 61.59 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDI+DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KAV+RLDG VVDGREITVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAEK
Query: IQKGKISEPFPKSRHR-----------------------SRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPS
I KG++ EP PKSR RSRSPRRR RDDYR++DYR+RSRSRS DRR R E++RD+RRR+RS R S
Subjt: IQKGKISEPFPKSRHR-----------------------SRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPS
Query: PDYSKGRGRGRYVDERRNRSRSHSRSRGRSRSVNSASPGRRSPSPQRSLSP-----RRSLSPRRSLSPQRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPRSV
PD K R RGRY +E R+ SRS S S R RS S+SP + SP+ R +SP RS SPRRSLSP+ + SPS + SPER + RSP+P S
Subjt: PDYSKGRGRGRYVDERRNRSRSHSRSRGRSRSVNSASPGRRSPSPQRSLSP-----RRSLSPRRSLSPQRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPRSV
Query: SP-RGQPADSRSPSP
+P R A SRS SP
Subjt: SP-RGQPADSRSPSP
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G07350.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.1e-10 | 36.95 | Show/hide |
Query: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAEKIQKGKISEPFPKSRHR
SL V ++ R T DL F K GKV D+ + D T +SRGF F+ K +A + + LD +V+ GR ITV+ A+ + + RH+
Subjt: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAEKIQKGKISEPFPKSRHR
Query: SRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRS-----DRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYVD---ERRNRSRSHSRS-RGRS
S S SPRR RSRSRS S DR RRGR YRRR R PSPD R R R RR+RSRS+SR+ R R
Subjt: SRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRS-----DRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYVD---ERRNRSRSHSRS-RGRS
Query: RSVNSASPGRRSPSPQRSLSPRRSLSPRRSLSP-----QRSLSPRRSPSPRGESPERN------------GDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPS
RS RR S RS SPR + RS SP RS SP R SPE GGRS + RS+SPR +SRS S
Subjt: RSVNSASPGRRSPSPQRSLSPRRSLSPRRSLSP-----QRSLSPRRSPSPRGESPERN------------GDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPS
|
|
| AT1G55310.1 SC35-like splicing factor 33 | 5.9e-17 | 39.79 | Show/hide |
Query: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAEKIQKGKISEPFPKSRHR
SLLV N+ +DL F ++G V DI++PRD TGD RGF FV++ +A A +DG ++ GRE+TV FA+ +R
Subjt: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAEKIQKGKISEPFPKSRHR
Query: SRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDY------RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYVDERRNRSRSHSRSRGRSRSV
+ R R R R RD RRR+ R S RS RRGR R R DY R RSISPR D + R D +R RS + RG+SRS+
Subjt: SRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDY------RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYVDERRNRSRSHSRSRGRSRSV
Query: NSASPGRRSPSPQRSL--SPRRSLSP----RRSLSPQRSL--SPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPRSVSPR-GQPADSRSPS
SPSP+RS+ SPRRS SP RS+SP+RS+ SPRRS SPR + RS RS SP GQ + RSPS
Subjt: NSASPGRRSPSPQRSL--SPRRSLSP----RRSLSPQRSL--SPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPRSVSPR-GQPADSRSPS
|
|
| AT1G55310.3 SC35-like splicing factor 33 | 3.3e-15 | 38.51 | Show/hide |
Query: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTG------------DSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAEKIQKG
SLLV N+ +DL F ++G V DI++PRD TG D RGF FV++ +A A +DG ++ GRE+TV FA+ N +K
Subjt: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTG------------DSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAEKIQKG
Query: KISEPFPKSRHRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDY------RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYVDERRNRSR
+ R+R R R+RD RRR+ R S RS RRGR R R DY R RSISPR D + R D +R R
Subjt: KISEPFPKSRHRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDY------RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYVDERRNRSR
Query: SHSRSRGRSRSVNSASPGRRSPSPQRSL--SPRRSLSP----RRSLSPQRSL--SPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPRSVSPR-GQPADSRSPS
S + RG+SRS+ SPSP+RS+ SPRRS SP RS+SP+RS+ SPRRS SPR + RS RS SP GQ + RSPS
Subjt: SHSRSRGRSRSVNSASPGRRSPSPQRSL--SPRRSLSP----RRSLSPQRSL--SPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPRSVSPR-GQPADSRSPS
|
|
| AT5G64200.1 ortholog of human splicing factor SC35 | 6.5e-72 | 61.59 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDI+DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KAV+RLDG VVDGREITVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAEK
Query: IQKGKISEPFPKSRHR-----------------------SRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPS
I KG++ EP PKSR RSRSPRRR RDDYR++DYR+RSRSRS DRR R E++RD+RRR+RS R S
Subjt: IQKGKISEPFPKSRHR-----------------------SRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPS
Query: PDYSKGRGRGRYVDERRNRSRSHSRSRGRSRSVNSASPGRRSPSPQRSLSP-----RRSLSPRRSLSPQRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPRSV
PD K R RGRY +E R+ SRS S S R RS S+SP + SP+ R +SP RS SPRRSLSP+ + SPS + SPER + RSP+P S
Subjt: PDYSKGRGRGRYVDERRNRSRSHSRSRGRSRSVNSASPGRRSPSPQRSLSP-----RRSLSPRRSLSPQRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPRSV
Query: SP-RGQPADSRSPSP
+P R A SRS SP
Subjt: SP-RGQPADSRSPSP
|
|
| AT5G64200.2 ortholog of human splicing factor SC35 | 6.5e-72 | 61.59 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDI+DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KAV+RLDG VVDGREITVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAEK
Query: IQKGKISEPFPKSRHR-----------------------SRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPS
I KG++ EP PKSR RSRSPRRR RDDYR++DYR+RSRSRS DRR R E++RD+RRR+RS R S
Subjt: IQKGKISEPFPKSRHR-----------------------SRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPS
Query: PDYSKGRGRGRYVDERRNRSRSHSRSRGRSRSVNSASPGRRSPSPQRSLSP-----RRSLSPRRSLSPQRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPRSV
PD K R RGRY +E R+ SRS S S R RS S+SP + SP+ R +SP RS SPRRSLSP+ + SPS + SPER + RSP+P S
Subjt: PDYSKGRGRGRYVDERRNRSRSHSRSRGRSRSVNSASPGRRSPSPQRSLSP-----RRSLSPRRSLSPQRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPRSV
Query: SP-RGQPADSRSPSP
+P R A SRS SP
Subjt: SP-RGQPADSRSPSP
|
|
