; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg26491 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg26491
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionNEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like
Genome locationCarg_Chr11:8189990..8192885
RNA-Seq ExpressionCarg26491
SyntenyCarg26491
Gene Ontology termsGO:0045116 - protein neddylation (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
GO:0019788 - NEDD8 transferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000608 - Ubiquitin-conjugating enzyme E2
IPR016135 - Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like
IPR023313 - Ubiquitin-conjugating enzyme, active site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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KAG7022419.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.3e-124100Show/hide
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XP_023530137.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.7e-10399.45Show/hide
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XP_038888942.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like [Benincasa hispida]4.6e-10197.27Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BHD5 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like7.1e-10096.17Show/hide
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A0A5D3CPZ9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like2.0e-10291.41Show/hide
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A0A6J1C2V1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like3.8e-10196.72Show/hide
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A0A6J1EZ82 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like2.8e-104100Show/hide
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A0A6J1JMG9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like2.8e-104100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A3KN22 NEDD8-conjugating enzyme Ubc123.5e-6462.3Show/hide
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Q6DCZ9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc122.1e-6462.3Show/hide
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Q6P8D9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc122.1e-6462.3Show/hide
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Q9SDY5 NEDD8-conjugating enzyme Ubc121.0e-8783.7Show/hide
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Q9ZU75 Probable NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like5.3e-8481.08Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G18600.1 Ubiquitin-conjugating enzyme family protein3.7e-8581.08Show/hide
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AT3G08690.1 ubiquitin-conjugating enzyme 116.3e-2437.78Show/hide
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AT3G08690.2 ubiquitin-conjugating enzyme 116.3e-2437.78Show/hide
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AT4G36800.1 RUB1 conjugating enzyme 17.3e-8983.7Show/hide
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AT4G36800.2 RUB1 conjugating enzyme 17.3e-8983.7Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTATGCAACGATGTACTAGGAATAGATGTGGCATGCTGGCTGGAAAATGCGTGGAAATTTTTCTACGGAACTTTGGGTACCCTGCAGGAACGATGATTAAGCTTTT
TAAAGTGAAGGAAAAGCAGAGAGAGATCGCAAAAAACGCCGATGGAAAACCTCCTGTCAAGAAGCAAACTGCAGGAGAATTGCGTCTTCAAAAAGATATCAGTGAACTGA
ACCTGCCAAAAACGTGTAGTATATCCTTTCCTAATGGCAAGGATGAGTTGATGAACTTTGAGGTCACTATTCATCCTGATGAAGGATATTATCTAGGTGGTACATTTCTC
TTCTCTTTCCAAGTTTCCCCTGTCTACCCTCACGAGCCACCAAAAGTGAAGTGCAAGACAAAGGTGTATCATCCTAATATCGACTTGGAAGGAAATGTTTGTCTCAATAT
TTTAAGAGAGGACTGGAAGCCCGTTCTGAATATCAACACTATAATATACGGATTATTTCATCTTTTCACGCAACCAAATCATGAAGACCCCCTCAACCACGATGCCGCTG
CTGTTTTGAGGGATAACCCAAAGATGTTCGAATCCAATGTGCGAAGAGCCATGGCTGGAGGTTACGTGGGGCACACTTTCTTCACACGTTGCATGTAG
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ATGGTGTTGGATAATGTTCTATGCGGATGTTTCTGATTTTTGTTTTCATTGCTTTGATCGCTCTACTCTTCTGCGTCGTCTATTTGACGATTGGAAAGTAATTAACGAGT
TTACGCTTTGTTCTCTTCTGTTCTGTTCTGTTTGTTTGTTTTGTAATTGAGTTTGCTGGCACATGGCGCTGGATATCTAGTATTTGCTATCCCGATCAGTTATTGTGATC
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AACGATGATTAAGCTTTTTAAAGTGAAGGAAAAGCAGAGAGAGATCGCAAAAAACGCCGATGGAAAACCTCCTGTCAAGAAGCAAACTGCAGGAGAATTGCGTCTTCAAA
AAGATATCAGTGAACTGAACCTGCCAAAAACGTGTAGTATATCCTTTCCTAATGGCAAGGATGAGTTGATGAACTTTGAGGTCACTATTCATCCTGATGAAGGATATTAT
CTAGGTGGTACATTTCTCTTCTCTTTCCAAGTTTCCCCTGTCTACCCTCACGAGCCACCAAAAGTGAAGTGCAAGACAAAGGTGTATCATCCTAATATCGACTTGGAAGG
AAATGTTTGTCTCAATATTTTAAGAGAGGACTGGAAGCCCGTTCTGAATATCAACACTATAATATACGGATTATTTCATCTTTTCACGCAACCAAATCATGAAGACCCCC
TCAACCACGATGCCGCTGCTGTTTTGAGGGATAACCCAAAGATGTTCGAATCCAATGTGCGAAGAGCCATGGCTGGAGGTTACGTGGGGCACACTTTCTTCACACGTTGC
ATGTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAMQRCTRNRCGMLAGKCVEIFLRNFGYPAGTMIKLFKVKEKQREIAKNADGKPPVKKQTAGELRLQKDISELNLPKTCSISFPNGKDELMNFEVTIHPDEGYYLGGTFL
FSFQVSPVYPHEPPKVKCKTKVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKMFESNVRRAMAGGYVGHTFFTRCM