; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg26499 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg26499
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionprotein RALF-like 4
Genome locationCarg_Chr11:8094658..8095014
RNA-Seq ExpressionCarg26499
SyntenyCarg26499
Gene Ontology termsGO:0005576 - extracellular region (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6588613.1 Protein RALF-like 4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.0e-59100Show/hide
Query:  MGTMKLCLFLVFVIFVSAIAAPHSFAFYETSLTHDNSKYGFFDGDSTSATEDSRRQLFQYGTNNKYSRNRYLSYYSLRPSSILCGQHGSSYYDCKKRKKV
        MGTMKLCLFLVFVIFVSAIAAPHSFAFYETSLTHDNSKYGFFDGDSTSATEDSRRQLFQYGTNNKYSRNRYLSYYSLRPSSILCGQHGSSYYDCKKRKKV
Subjt:  MGTMKLCLFLVFVIFVSAIAAPHSFAFYETSLTHDNSKYGFFDGDSTSATEDSRRQLFQYGTNNKYSRNRYLSYYSLRPSSILCGQHGSSYYDCKKRKKV

Query:  NPYHRSCTAISKCARIAE
        NPYHRSCTAISKCARIAE
Subjt:  NPYHRSCTAISKCARIAE

KAG6588676.1 Protein RALF-like 4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.0e-2758.06Show/hide
Query:  MGTMKLCLFLVFVIFVSAIAAPHSFAFYET----SLTHDNSKYGFFDGDSTSA-TEDSRRQLFQYG-TNNKYSRNRYLSYYSLRPSSILCGQHGSSYYDC
        MGTMKLC+FL+ V     +A P SFA +ET    SL  DN  Y FF GDS+ A TEDS RQLFQYG   NK +R RYLSYY+LR ++I CG+ G+SYYDC
Subjt:  MGTMKLCLFLVFVIFVSAIAAPHSFAFYET----SLTHDNSKYGFFDGDSTSA-TEDSRRQLFQYG-TNNKYSRNRYLSYYSLRPSSILCGQHGSSYYDC

Query:  KKRKKVNPYHRSCTAISKCARIAE
        KKR+++NPY R C AI+ CAR  +
Subjt:  KKRKKVNPYHRSCTAISKCARIAE

XP_022927737.1 protein RALF-like 19 [Cucurbita moschata]7.0e-2757.26Show/hide
Query:  MGTMKLCLFLVFVIFVSAIAAPHSFAFYET----SLTHDNSKYGFFDGDSTSA-TEDSRRQLFQYG-TNNKYSRNRYLSYYSLRPSSILCGQHGSSYYDC
        MGTMKL    +F++ V  +A P SFA +ET    SL +DN+ Y FF GDS+ A TEDSRRQLFQYG   NK +R RYLSYY+LR ++I CG+ G+SYYDC
Subjt:  MGTMKLCLFLVFVIFVSAIAAPHSFAFYET----SLTHDNSKYGFFDGDSTSA-TEDSRRQLFQYG-TNNKYSRNRYLSYYSLRPSSILCGQHGSSYYDC

Query:  KKRKKVNPYHRSCTAISKCARIAE
        KKR+++NPY R C AI+ CAR  +
Subjt:  KKRKKVNPYHRSCTAISKCARIAE

XP_022931602.1 protein RALF-like 4 [Cucurbita moschata]3.8e-5799.13Show/hide
Query:  MKLCLFLVFVIFVSAIAAPHSFAFYETSLTHDNSKYGFFDGDSTSATEDSRRQLFQYGTNNKYSRNRYLSYYSLRPSSILCGQHGSSYYDCKKRKKVNPY
        MKLCLFLVFV+FVSAIAAPHSFAFYETSLTHDNSKYGFFDGDSTSATEDSRRQLFQYGTNNKYSRNRYLSYYSLRPSSILCGQHGSSYYDCKKRKKVNPY
Subjt:  MKLCLFLVFVIFVSAIAAPHSFAFYETSLTHDNSKYGFFDGDSTSATEDSRRQLFQYGTNNKYSRNRYLSYYSLRPSSILCGQHGSSYYDCKKRKKVNPY

Query:  HRSCTAISKCARIAE
        HRSCTAISKCARIAE
Subjt:  HRSCTAISKCARIAE

XP_022989015.1 protein RALF-like 4 [Cucurbita maxima]1.6e-2658.06Show/hide
Query:  MGTMKLCLFLVFVIFVSAIAAPHSFAFYET----SLTHDNSKYGFFDGDST-SATEDSRRQLFQYG-TNNKYSRNRYLSYYSLRPSSILCGQHGSSYYDC
        M TMK+CLFL+ V    A+ AP S AF+ET    SL  DNSKY FF GDS+ S TEDSRRQLFQYG   N  +R R+L+YY+L  ++I CG+ GSSYYDC
Subjt:  MGTMKLCLFLVFVIFVSAIAAPHSFAFYET----SLTHDNSKYGFFDGDST-SATEDSRRQLFQYG-TNNKYSRNRYLSYYSLRPSSILCGQHGSSYYDC

Query:  KKRKKVNPYHRSCTAISKCARIAE
        KKR+++NPY R C AI+ CAR  +
Subjt:  KKRKKVNPYHRSCTAISKCARIAE

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1EI16 protein RALF-like 193.4e-2757.26Show/hide
Query:  MGTMKLCLFLVFVIFVSAIAAPHSFAFYET----SLTHDNSKYGFFDGDSTSA-TEDSRRQLFQYG-TNNKYSRNRYLSYYSLRPSSILCGQHGSSYYDC
        MGTMKL    +F++ V  +A P SFA +ET    SL +DN+ Y FF GDS+ A TEDSRRQLFQYG   NK +R RYLSYY+LR ++I CG+ G+SYYDC
Subjt:  MGTMKLCLFLVFVIFVSAIAAPHSFAFYET----SLTHDNSKYGFFDGDSTSA-TEDSRRQLFQYG-TNNKYSRNRYLSYYSLRPSSILCGQHGSSYYDC

Query:  KKRKKVNPYHRSCTAISKCARIAE
        KKR+++NPY R C AI+ CAR  +
Subjt:  KKRKKVNPYHRSCTAISKCARIAE

A0A6J1EIU0 protein RALF-like 42.2e-2657.26Show/hide
Query:  MGTMKLCLFLVFVIFVSAIAAPHSFAFYET----SLTHDNSKYGFFDGDSTSA-TEDSRRQLFQYG-TNNKYSRNRYLSYYSLRPSSILCGQHGSSYYDC
        M T+KLCLFL+FV+ V  +A P SFA++ET    S  +D SKY FF GDS+ A TEDSRRQLFQYG   NK +R R+L+YY+L  ++I CG+ G+SYYDC
Subjt:  MGTMKLCLFLVFVIFVSAIAAPHSFAFYET----SLTHDNSKYGFFDGDSTSA-TEDSRRQLFQYG-TNNKYSRNRYLSYYSLRPSSILCGQHGSSYYDC

Query:  KKRKKVNPYHRSCTAISKCARIAE
        KKR+++NPY R C AI+ CAR  +
Subjt:  KKRKKVNPYHRSCTAISKCARIAE

A0A6J1EU43 protein RALF-like 41.8e-5799.13Show/hide
Query:  MKLCLFLVFVIFVSAIAAPHSFAFYETSLTHDNSKYGFFDGDSTSATEDSRRQLFQYGTNNKYSRNRYLSYYSLRPSSILCGQHGSSYYDCKKRKKVNPY
        MKLCLFLVFV+FVSAIAAPHSFAFYETSLTHDNSKYGFFDGDSTSATEDSRRQLFQYGTNNKYSRNRYLSYYSLRPSSILCGQHGSSYYDCKKRKKVNPY
Subjt:  MKLCLFLVFVIFVSAIAAPHSFAFYETSLTHDNSKYGFFDGDSTSATEDSRRQLFQYGTNNKYSRNRYLSYYSLRPSSILCGQHGSSYYDCKKRKKVNPY

Query:  HRSCTAISKCARIAE
        HRSCTAISKCARIAE
Subjt:  HRSCTAISKCARIAE

A0A6J1JL71 protein RALF-like 47.5e-2758.06Show/hide
Query:  MGTMKLCLFLVFVIFVSAIAAPHSFAFYET----SLTHDNSKYGFFDGDST-SATEDSRRQLFQYG-TNNKYSRNRYLSYYSLRPSSILCGQHGSSYYDC
        M TMK+CLFL+ V    A+ AP S AF+ET    SL  DNSKY FF GDS+ S TEDSRRQLFQYG   N  +R R+L+YY+L  ++I CG+ GSSYYDC
Subjt:  MGTMKLCLFLVFVIFVSAIAAPHSFAFYET----SLTHDNSKYGFFDGDST-SATEDSRRQLFQYG-TNNKYSRNRYLSYYSLRPSSILCGQHGSSYYDC

Query:  KKRKKVNPYHRSCTAISKCARIAE
        KKR+++NPY R C AI+ CAR  +
Subjt:  KKRKKVNPYHRSCTAISKCARIAE

A0A6J1JN66 protein RALF-like 41.7e-2658.06Show/hide
Query:  MGTMKLCLFLVFVIFVSAIAAPHSFAFYET----SLTHDNSKYGFFDGDSTSA-TEDSRRQLFQYG-TNNKYSRNRYLSYYSLRPSSILCGQHGSSYYDC
        MGTMKL +FL+ V     +  P SFA +ET    SL  DNS+Y FF GDS+ A TEDSRRQLFQYG   NK +R RYLSYY+LR ++I CG+ G+SYYDC
Subjt:  MGTMKLCLFLVFVIFVSAIAAPHSFAFYET----SLTHDNSKYGFFDGDSTSA-TEDSRRQLFQYG-TNNKYSRNRYLSYYSLRPSSILCGQHGSSYYDC

Query:  KKRKKVNPYHRSCTAISKCARIAE
        KKR+ +NPY R C AI+ CAR  +
Subjt:  KKRKKVNPYHRSCTAISKCARIAE

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6NME6 Protein RALF-like 195.2e-0945.45Show/hide
Query:  TEDSRRQLFQYGTNNKYSRNRYLSYYSLRPSSILCGQHGSSYYDCKKRKKVNPYHRSCTAISKCAR
        +E +RRQL         +R  Y+SY +LR +++ C + G SYYDCKKRK+ NPY R C+ I+ C R
Subjt:  TEDSRRQLFQYGTNNKYSRNRYLSYYSLRPSSILCGQHGSSYYDCKKRKKVNPYHRSCTAISKCAR

Q8L9P8 Protein RALF-like 331.4e-0643.48Show/hide
Query:  RYLSYYSLRPSSILCGQHGSSYYDCKKRKKVNPYHRSCTAISKCAR
        +Y+SY +LR +++ C + G+SYY+C++  + NPY R C+AI++C R
Subjt:  RYLSYYSLRPSSILCGQHGSSYYDCKKRKKVNPYHRSCTAISKCAR

Q9FZA0 Protein RALF-like 47.5e-0833.33Show/hide
Query:  MKLCLFLVFVIFVSAIAAPHSFAFYETSLTHDNSKYGFFDGDSTSATEDS---RRQLFQYGTNNKYSRNRYLSYYSLRPSSILCGQHGSSYYDCKKRKKV
        M + + L+F + + A+ A    A Y  + +  N +    + D   +  DS   RRQL +          RY+ Y +L+ +++ C + G SYYDCKKR++ 
Subjt:  MKLCLFLVFVIFVSAIAAPHSFAFYETSLTHDNSKYGFFDGDSTSATEDS---RRQLFQYGTNNKYSRNRYLSYYSLRPSSILCGQHGSSYYDCKKRKKV

Query:  NPYHRSCTAISKCARIA
        NPY R C+AI+ C R A
Subjt:  NPYHRSCTAISKCARIA

Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 234.9e-0747.83Show/hide
Query:  RYLSYYSLRPSSILCGQHGSSYYDCKKRKKVNPYHRSCTAISKCAR
        RY+SY +LR ++I C + G+SYY+C++  + NPY R C+AI++C R
Subjt:  RYLSYYSLRPSSILCGQHGSSYYDCKKRKKVNPYHRSCTAISKCAR

Q9SRY3 Protein RALF-like 17.0e-0643.18Show/hide
Query:  RYLSYYSLRPSSILCGQHGSSYYDCKKRKKVNPYHRSCTAISKC
        +Y+SY SL+ +S+ C + G+SYY+C+   + NPY R C+ I++C
Subjt:  RYLSYYSLRPSSILCGQHGSSYYDCKKRKKVNPYHRSCTAISKC

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02900.1 rapid alkalinization factor 15.0e-0743.18Show/hide
Query:  RYLSYYSLRPSSILCGQHGSSYYDCKKRKKVNPYHRSCTAISKC
        +Y+SY SL+ +S+ C + G+SYY+C+   + NPY R C+ I++C
Subjt:  RYLSYYSLRPSSILCGQHGSSYYDCKKRKKVNPYHRSCTAISKC

AT1G28270.1 ralf-like 45.3e-0933.33Show/hide
Query:  MKLCLFLVFVIFVSAIAAPHSFAFYETSLTHDNSKYGFFDGDSTSATEDS---RRQLFQYGTNNKYSRNRYLSYYSLRPSSILCGQHGSSYYDCKKRKKV
        M + + L+F + + A+ A    A Y  + +  N +    + D   +  DS   RRQL +          RY+ Y +L+ +++ C + G SYYDCKKR++ 
Subjt:  MKLCLFLVFVIFVSAIAAPHSFAFYETSLTHDNSKYGFFDGDSTSATEDS---RRQLFQYGTNNKYSRNRYLSYYSLRPSSILCGQHGSSYYDCKKRKKV

Query:  NPYHRSCTAISKCARIA
        NPY R C+AI+ C R A
Subjt:  NPYHRSCTAISKCARIA

AT2G33775.1 ralf-like 193.7e-1045.45Show/hide
Query:  TEDSRRQLFQYGTNNKYSRNRYLSYYSLRPSSILCGQHGSSYYDCKKRKKVNPYHRSCTAISKCAR
        +E +RRQL         +R  Y+SY +LR +++ C + G SYYDCKKRK+ NPY R C+ I+ C R
Subjt:  TEDSRRQLFQYGTNNKYSRNRYLSYYSLRPSSILCGQHGSSYYDCKKRKKVNPYHRSCTAISKCAR

AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 233.5e-0847.83Show/hide
Query:  RYLSYYSLRPSSILCGQHGSSYYDCKKRKKVNPYHRSCTAISKCAR
        RY+SY +LR ++I C + G+SYY+C++  + NPY R C+AI++C R
Subjt:  RYLSYYSLRPSSILCGQHGSSYYDCKKRKKVNPYHRSCTAISKCAR

AT4G15800.1 ralf-like 331.0e-0743.48Show/hide
Query:  RYLSYYSLRPSSILCGQHGSSYYDCKKRKKVNPYHRSCTAISKCAR
        +Y+SY +LR +++ C + G+SYY+C++  + NPY R C+AI++C R
Subjt:  RYLSYYSLRPSSILCGQHGSSYYDCKKRKKVNPYHRSCTAISKCAR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGAACAATGAAGCTCTGCCTATTTCTCGTATTCGTCATATTCGTCTCGGCCATTGCTGCTCCACACTCTTTCGCCTTCTATGAGACATCTCTCACCCACGACAACTC
CAAATATGGCTTCTTCGATGGAGACTCCACTTCAGCAACTGAAGATAGTCGACGACAACTTTTCCAATATGGAACCAACAATAAGTACTCTCGCAATAGATATTTGAGCT
ACTATTCATTGAGGCCGAGTAGTATCCTTTGTGGCCAACATGGTAGCTCGTACTATGATTGCAAGAAGCGTAAGAAGGTTAATCCGTATCATCGCAGTTGCACTGCCATC
TCCAAATGCGCTCGAATTGCCGAATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGAACAATGAAGCTCTGCCTATTTCTCGTATTCGTCATATTCGTCTCGGCCATTGCTGCTCCACACTCTTTCGCCTTCTATGAGACATCTCTCACCCACGACAACTC
CAAATATGGCTTCTTCGATGGAGACTCCACTTCAGCAACTGAAGATAGTCGACGACAACTTTTCCAATATGGAACCAACAATAAGTACTCTCGCAATAGATATTTGAGCT
ACTATTCATTGAGGCCGAGTAGTATCCTTTGTGGCCAACATGGTAGCTCGTACTATGATTGCAAGAAGCGTAAGAAGGTTAATCCGTATCATCGCAGTTGCACTGCCATC
TCCAAATGCGCTCGAATTGCCGAATAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGTMKLCLFLVFVIFVSAIAAPHSFAFYETSLTHDNSKYGFFDGDSTSATEDSRRQLFQYGTNNKYSRNRYLSYYSLRPSSILCGQHGSSYYDCKKRKKVNPYHRSCTAI
SKCARIAE