; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg26504 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg26504
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionphotosystem I subunit O
Genome locationCarg_Chr13:4845255..4846663
RNA-Seq ExpressionCarg26504
SyntenyCarg26504
Gene Ontology termsGO:0009767 - photosynthetic electron transport chain (biological process)
GO:0009522 - photosystem I (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR017498 - Photosystem I PsaO


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
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A0A1S3CJR4 photosystem I subunit O6.0e-6687.07Show/hide
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A0A6J1CLD0 photosystem I subunit O2.7e-6685.81Show/hide
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A0A6J1EID2 photosystem I subunit O4.0e-78100Show/hide
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A0A6J1IDS7 photosystem I subunit O3.2e-7596.6Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q949Q5 Photosystem I subunit O1.4e-5670.34Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G08380.1 photosystem I subunit O1.0e-5770.34Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GTGA
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GTGAAAAATGTAATAATTGTTATTAAAGGAAATGTAATTTCAGTTTTTATTCTTCATGTTTATTACTTTATTAAGTTATCAACTAGTGTTTAGTGTTTGAATAATTATCA
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TTTGAATCGTTATCTTTTCA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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