; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg26516 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg26516
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionX-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1-like
Genome locationCarg_Chr13:4944505..4945212
RNA-Seq ExpressionCarg26516
SyntenyCarg26516
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6583719.1 hypothetical protein SDJN03_19651, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.9e-10298.31Show/hide
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KAG7019366.1 hypothetical protein SDJN02_18326, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.0e-106100Show/hide
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XP_022927104.1 X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1-like [Cucurbita moschata]1.1e-9589.64Show/hide
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        QD+SP SSSSSSSSSFGY SFSHSVHHDQFEHDLVADASDGYDSDESEEQ               EHEDEHEDEHEDEHEEQEEDEEDEGCFTEEV    
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         EEEEEEEG RRDLEVVVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQTQQLIAV
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XP_031736046.1 uncharacterized protein LOC105434473 [Cucumis sativus]2.4e-4263.29Show/hide
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        ++N+++Y+ +    +SS   S+ VE LKRMVK    + VF L+L LFFS FSLFPHSF+VYFSTFLFS+L H +ERK+MFLICN GILFLLATSSV    
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           SSSSSSSSFG YC F HS    HH+ FEHD+VA  +   +SD    QE E+E E+        +EE EEDEGCFT+EVEEEEEEEEE++ EG RR+L
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Query:  EVVVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQTQQLIAV
        E+VVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQT  LIAV
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XP_038877796.1 glutamic acid-rich protein-like [Benincasa hispida]3.9e-5369.08Show/hide
Query:  MEKRVEAINMDSYESLDL------DRTSSTSNN----VERLKRMVKFIVSICVFSLVLALFFSFFSLFPHSFTVYFSTFLFSLLNHGMERKFMFLICNGI
        ME+  EA N+DS +SL+L       RTSS   N    VE L RMVKF     VFSLVLALFFSFFSLFPHSF+VYFSTF+FSLLNH MERK+MFLICNGI
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Query:  LFLLATSSVLQDASPSSSSSSSSSFGYCSF-SHS--VHHDQFEHDLVADASDGYDSDESEEQEHEDEHEDEHEDEHEEQEED-EEDEGCFTEEVEEEEEE
        LFLLATSSV++D     SSSSSSSFG CSF SHS   HH Q EHDLVA A DG DS+ES +Q  E+E E+E E   +E EE+ EEDEGCFT+EV    E+
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        ++EEEEG RR+LEVVVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQT QLIAV
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A061GIF6 Uncharacterized protein1.4e-1142.91Show/hide
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        MD Y + + L       +    LKR ++ +VS+ + S  L     FF +FPHSF+VYFSTFLFS   H +ERK+MFLICNGIL  LA SSV     PSSS
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Query:  SSSSSSFGYCSFSHSVHHDQFEHDLVADASDGYDSD---ESEEQEHEDEHEDEHEDEHEE-----------QEEDEEDEGCFTEEVEEEE----------
        S S S  G    + S +  Q  +++V   SD  D+D    +E +E ED +E+E E++ E+           +E+DEE E   +  VE+ E          
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Query:  EEEEEEEEGNRRDL---EVVVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQTQQLIAV
        +E++ +EEG    L   E V STE+LN+K EEFIRKMKEE+RIEA   QQLIAV
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A0A0A0LVQ2 Uncharacterized protein1.4e-2455.56Show/hide
Query:  AINMDSYESLDLDRTSS--TSNNVERLKRMVKFIVSICVFSLVLALFFSFFSLFPHSFTVYFSTFLFSLLNHGMERKFMFLICN-GILFLLATSSVLQDA
        ++N+++Y+ +    +SS   S+ VE LKRMVK    + VF L+L LFFS FSLFPHSF+VYFSTFLFS+L H +ERK+MFLICN GILFLLATSSV    
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Query:  SPSSSSSSSSSFG-YCSFSHS---VHHDQFEHDLVADASDGYDSDESEEQEHEDEHEDEHEDEHEEQEEDEEDEGCFTEEVEEEEEEEEEEEEGNRRD
           SSSSSSSSFG YC F HS    HH+ FEHD+VA  +   +SD    QE E+E E+        +EE EEDEGCFT+EVEEEEEEE+E ++  +++
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A0A6J1CN51 nardilysin-like5.5e-2950.4Show/hide
Query:  MEKRVEAINMDSYESLDLDRTSST--SNNVERLKRMVKFIVSICVFSLVLALFFSFFSLFPHSFTVYFSTFLFSLLNHGMERKFMFLICNGILFLLATSS
        ME+  +A ++DS ESL+LD    T  S+ V+RLK MVKF+VS+CVF LV+ALF S FSLFPHSFT+YFS  LFSLLNH ++R +MFL+CNGIL LLATS 
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Query:  VLQDASPSSSSSSSSSFGYCSFSHSVHHDQFEHDLVADASDGYDSDESEEQEHEDEHEDEHEDEHEEQE---------EDEEDEGCFTEEVEEEEEEEEE
        +                     S+S+ H  +E             +E +E+E ED+ +D       +           E+E+DEGCFT+EVEEEEEEEE 
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Query:  EEEGNRRDLEVVVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQT--QQLIAV
        +      +LEVVVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRI+AA     QL+AV
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A0A6J1EH25 X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1-like5.2e-9689.64Show/hide
Query:  MEKRVEAINMDSYESLDLDRTSSTSNNVERLKRMVKFIVSICVFSLVLALFFSFFSLFPHSFTVYFSTFLFSLLNHGMERKFMFLICNGILFLLATSSVL
        ME RVEAINMDSYESLDLDRTSST+NNVERLKRMVKFIVSICVFSLVLALFFSFFSLFPHSFTVYFSTFLFSLLNHGMERKFMFLICNGILFLLATSSVL
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        QD+SP SSSSSSSSSFGY SFSHSVHHDQFEHDLVADASDGYDSDESEEQ               EHEDEHEDEHEDEHEEQEEDEEDEGCFTEEV    
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Query:  EEEEEEEEGNRRDLEVVVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQTQQLIAV
         EEEEEEEG RRDLEVVVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQTQQLIAV
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A0A6P3ZZX9 glutamic acid-rich protein-like5.5e-1343.83Show/hide
Query:  SNNVERLKRMVKFIVSICVFSLVLALFFSFFSLFPHSFTVYFSTFLFSLLNHGMERKFMFLICNGILFLLATSSVLQDASPSSSSSSSSSFGYCSFSHSV
        ++N++ L+R ++  +S+ + SL L  + S  SLFPHSF+VYFST LFS+    +ERK+MFL+CNGIL  LA SSV        SS+SSS+F        V
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Query:  HHDQFEHDLV-ADASDGYDSDESEEQEHEDEHEDEHE-------------DEHEE--------QEEDEEDEGCFTEEVEEEEEEEEEE--EEGNRRDLEV
           +   D V A     ++ +E EE E EDE EDE +             D H+E        + E  E+EG ++  +++E EE+E E  E GN     V
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Query:  VVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQTQQLIAV
        V ST+ELNKK EEFIRKMKEE+RIEA   QQLIAV
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGAAAAGGGTTGAAGCCATAAACATGGATTCATATGAAAGTTTGGATCTTGATAGAACATCATCAACAAGCAATAATGTTGAGAGGTTGAAAAGGATGGTGAAGTT
CATAGTGTCAATTTGTGTGTTTTCTTTGGTTTTGGCATTGTTTTTTTCCTTCTTCTCTCTCTTCCCTCATTCATTTACCGTCTATTTCTCCACTTTCCTCTTCTCTCTCC
TCAACCATGGCATGGAGAGAAAGTTCATGTTCTTGATCTGTAATGGAATCCTGTTTCTTCTTGCCACTTCCTCTGTTCTTCAAGATGCTTCTCCTTCTTCTTCTTCTTCT
TCCTCCTCCTCTTTTGGGTATTGTTCATTTTCCCATTCTGTTCATCATGATCAATTTGAACATGATCTTGTGGCTGATGCCTCTGATGGGTATGATTCTGATGAGTCAGA
AGAACAAGAACATGAAGATGAACATGAAGATGAACATGAAGATGAACATGAAGAACAAGAAGAAGATGAAGAAGATGAAGGGTGTTTTACAGAGGAGGTTGAAGAAGAAG
AAGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAAGGAAACAGGAGGGATTTAGAGGTGGTGGTGAGTACAGAAGAATTGAACAAGAAAATAGAAGAGTTTATAAGGAAAATGAAGGAG
GAAATGAGGATTGAAGCAGCTCAAACTCAGCAGCTCATTGCAGTGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAGAAAAGGGTTGAAGCCATAAACATGGATTCATATGAAAGTTTGGATCTTGATAGAACATCATCAACAAGCAATAATGTTGAGAGGTTGAAAAGGATGGTGAAGTT
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TCAACCATGGCATGGAGAGAAAGTTCATGTTCTTGATCTGTAATGGAATCCTGTTTCTTCTTGCCACTTCCTCTGTTCTTCAAGATGCTTCTCCTTCTTCTTCTTCTTCT
TCCTCCTCCTCTTTTGGGTATTGTTCATTTTCCCATTCTGTTCATCATGATCAATTTGAACATGATCTTGTGGCTGATGCCTCTGATGGGTATGATTCTGATGAGTCAGA
AGAACAAGAACATGAAGATGAACATGAAGATGAACATGAAGATGAACATGAAGAACAAGAAGAAGATGAAGAAGATGAAGGGTGTTTTACAGAGGAGGTTGAAGAAGAAG
AAGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAAGGAAACAGGAGGGATTTAGAGGTGGTGGTGAGTACAGAAGAATTGAACAAGAAAATAGAAGAGTTTATAAGGAAAATGAAGGAG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEKRVEAINMDSYESLDLDRTSSTSNNVERLKRMVKFIVSICVFSLVLALFFSFFSLFPHSFTVYFSTFLFSLLNHGMERKFMFLICNGILFLLATSSVLQDASPSSSSS
SSSSFGYCSFSHSVHHDQFEHDLVADASDGYDSDESEEQEHEDEHEDEHEDEHEEQEEDEEDEGCFTEEVEEEEEEEEEEEEGNRRDLEVVVSTEELNKKIEEFIRKMKE
EMRIEAAQTQQLIAV