; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg26556 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg26556
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptiontranscription factor bHLH69-like
Genome locationCarg_Chr02:10014537..10018399
RNA-Seq ExpressionCarg26556
SyntenyCarg26556
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR011598 - Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domain
IPR036638 - Helix-loop-helix DNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_023533990.1 transcription factor bHLH69-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.5e-13993.57Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
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A0A6J1ESR3 transcription factor bHLH69-like3.5e-13993.57Show/hide
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A0A6J1K067 transcription factor bHLH69-like isoform X31.0e-13892.5Show/hide
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A0A6J1K740 transcription factor PIF7-like isoform X27.8e-12384.64Show/hide
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A0A6J1K988 transcription factor bHLH69-like isoform X11.0e-13892.5Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
D0PX88 bHLH transcription factor RHL13.5e-1132.62Show/hide
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             L  D+S    GG    +      G G  +                  E  V KL+E D  +A Q L+ KGL +MP+     +
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O22768 Transcription factor UNE123.5e-1133.55Show/hide
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        E      G     + ++   +  E  V KL+E +  AA QLL++K L +MP+
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Q8S3D5 Transcription factor LRL24.0e-1532.04Show/hide
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        +++ I ++P+S     D +      G + ++ P GS     T S+        G+ ++P+T     +RRG +TD      R RR RIAER+++LQ L+P 
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         +K ++AS LD++ID++K+LQLQ+KV               LS S++GG +S+   +  + G  H  +    + +  E  V KL+E D  +A Q L+ KG
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        L +MP+
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Q9LSQ3 Transcription factor LRL31.2e-1132.75Show/hide
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        KPR    +RRG +TD      R RR RIAER+++LQ L+P  +K ++AS LD++I+++++LQLQ+KV               LS S++GG  S  P L  
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                          + G G+            E+ V KL+E D  +A Q L+ KGL +MP+     +
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Q9ZUG9 Transcription factor LRL17.5e-1433.88Show/hide
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        ++P  S      G+++ P   RT   +RRG +TD      R RR RIAER++ALQ L+P  +K ++AS LD++ID++K+LQLQ+KV              
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         LS S++GG +S    +   G  H  +   M G               E  V KL+E D  +A Q L+ KGL +MP+     +
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G24260.1 LJRHL1-like 15.3e-1533.88Show/hide
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        ++P  S      G+++ P   RT   +RRG +TD      R RR RIAER++ALQ L+P  +K ++AS LD++ID++K+LQLQ+KV              
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         LS S++GG +S    +   G  H  +   M G               E  V KL+E D  +A Q L+ KGL +MP+     +
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AT4G02590.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein2.5e-1233.55Show/hide
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Query:  E------GYGHYMSHQEMQGEPLEEMVGKLLEVDPLAAAQLLENKGLFVMPM
        E      G     + ++   +  E  V KL+E +  AA QLL++K L +MP+
Subjt:  E------GYGHYMSHQEMQGEPLEEMVGKLLEVDPLAAAQLLENKGLFVMPM

AT4G02590.2 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein2.5e-1233.55Show/hide
Query:  SRRGYSTD------RQRRIRIAERLEALQALLPLASKGNQASALDDVIDHIKYLQLQIKVGIFALALFCTFLYRDLSQSKIGGESSSEPFL-------FV
        +RRG +TD      R RR RIAER+ ALQ L+P  +K ++A+ +D+++D++K+L+LQ+KV               LS S++GG  +  P +        V
Subjt:  SRRGYSTD------RQRRIRIAERLEALQALLPLASKGNQASALDDVIDHIKYLQLQIKVGIFALALFCTFLYRDLSQSKIGGESSSEPFL-------FV

Query:  E------GYGHYMSHQEMQGEPLEEMVGKLLEVDPLAAAQLLENKGLFVMPM
        E      G     + ++   +  E  V KL+E +  AA QLL++K L +MP+
Subjt:  E------GYGHYMSHQEMQGEPLEEMVGKLLEVDPLAAAQLLENKGLFVMPM

AT4G30980.1 LJRHL1-like 22.8e-1632.04Show/hide
Query:  TKDMIAVVPVSSIQTIDGVSE--IHGEISYNHPAGSYTSKPTDSR---KDNMSGSLSKPRTSSS--SRRGYSTD------RQRRIRIAERLEALQALLPL
        +++ I ++P+S     D +      G + ++ P GS     T S+        G+ ++P+T     +RRG +TD      R RR RIAER+++LQ L+P 
Subjt:  TKDMIAVVPVSSIQTIDGVSE--IHGEISYNHPAGSYTSKPTDSR---KDNMSGSLSKPRTSSS--SRRGYSTD------RQRRIRIAERLEALQALLPL

Query:  ASKGNQASALDDVIDHIKYLQLQIKVGIFALALFCTFLYRDLSQSKIGGESSSEPFLFVE-GYGHYMSHQEMQGEPLEEMVGKLLEVDPLAAAQLLENKG
         +K ++AS LD++ID++K+LQLQ+KV               LS S++GG +S+   +  + G  H  +    + +  E  V KL+E D  +A Q L+ KG
Subjt:  ASKGNQASALDDVIDHIKYLQLQIKVGIFALALFCTFLYRDLSQSKIGGESSSEPFLFVE-GYGHYMSHQEMQGEPLEEMVGKLLEVDPLAAAQLLENKG

Query:  LFVMPM
        L +MP+
Subjt:  LFVMPM

AT5G64980.1 unknown protein1.2e-2240.28Show/hide
Query:  SSSSRRGYSTDRQRRIRIAERLEALQALLPLASKG-NQASALDDVIDHIKYLQLQIKVGIFALALFCTFLYRDLSQSKIGGESSSEPFLFVEGYGHYMSH
        S+ S + Y+ +R+R+ RIA+ ++AL  LLP   +G N    L+ ++DH+K L LQ+K               +LS+S++GGE  S P  F+EGYGHY+ H
Subjt:  SSSSRRGYSTDRQRRIRIAERLEALQALLPLASKG-NQASALDDVIDHIKYLQLQIKVGIFALALFCTFLYRDLSQSKIGGESSSEPFLFVEGYGHYMSH

Query:  QEMQGEPLEEMVGKLLEVDPLAAAQLLENKGLFVMPMDFVEGLC
        ++   + LEE++  LL  D  AAA LLE+KGL++ P+  V+G C
Subjt:  QEMQGEPLEEMVGKLLEVDPLAAAQLLENKGLFVMPMDFVEGLC


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAGGACAAAATGGCTGCAATGGCTCTGTACAAATGCTCTCTCTGAATTTTGGTGCGAATGTCAACATTGTTTCCCAAGTACCTGGAGATTGTGCAAACCACCACCA
TGTTTCGGCTGCTGATAGGAATCTAAACCAAACTAACTTCCCCCACATAATTGAGTGGACTCAAACTGCAAAAACGTCTCCGACCTTTGTTGAGTTTATTGCTGAAACTT
CAAACTTTCCTAGAAAGGAATCTACCAAAGATATGATAGCAGTTGTTCCTGTCAGTTCCATTCAAACTATTGATGGAGTCTCTGAGATTCATGGAGAAATTTCATACAAT
CATCCCGCAGGTTCATACACTTCAAAACCTACTGATTCACGCAAGGACAATATGTCAGGTAGTCTATCCAAGCCACGTACCAGTTCATCAAGTAGACGAGGCTATTCAAC
TGACCGTCAACGCAGGATAAGGATAGCTGAAAGACTCGAAGCATTGCAGGCACTACTGCCTCTGGCTTCAAAGGGAAATCAAGCATCCGCTCTAGATGATGTCATTGACC
ACATCAAGTACTTACAGCTTCAAATAAAGGTAGGCATCTTCGCCCTTGCTCTGTTTTGTACGTTTCTTTATAGGGACTTGAGTCAGAGTAAAATAGGCGGAGAATCCTCT
TCTGAGCCTTTCCTATTCGTTGAGGGATATGGCCATTACATGAGCCATCAAGAGATGCAGGGCGAGCCACTTGAAGAGATGGTAGGAAAATTGCTGGAAGTTGATCCGTT
AGCTGCTGCTCAGCTGCTGGAGAACAAGGGTCTATTCGTGATGCCCATGGATTTTGTTGAAGGATTATGCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAACATCGATGATGAAGTTCGATTGGAACTTAGTCATATGTAGCTTGACTTTACATTTACAATGGCTTGCCGCTCCGACAGCATATTTCCCCCAGCTTTGTCGTGCTTC
AATCAGACTAGCATTTTTTTTCTCTCTGTTTATGTTCTCCGTTTGGGATATCGAGACATTTGACAACATAAAGTCCTGATGCTTTGTTTAATTTTGTTTCGCTTCAGTTC
CAGATGAAGATCTGTTACTTAGAACCTGTTGCTCTTTCTGTACTATCATTATGTTTTTCCCTCTGGGCACTGTTTTTTCTTTTTTTACTTCCTTGTTTTTCCATATAACG
GTGTTTAACATCCTTCGCCATACATGTATTGGTATTCTGTCTGTTTTTCCTCTCGATCTTCTATTTTCTTAAGGCTTCTATGCTCCCTTATTGCTGTTTAGTGGTGCTTT
TCGTTTCCCAGTAGCTTCTTTTACTTATTTATTGGTCCTGCCCTTTTTCTTCATGAAAACCCAGGAATGCTTTTCCTGTTTCGACAATTTGTTGTTTACAAAACATAGCT
AGTACTTTTTAACATCGTATGTTCAAAAACAAATGGAAAATATGGGGAAATGCCCATTTCATGTGCTAGTAGGCGTTGGGTTTCAAATGTCCCTTGGGTATGCTCAGGTA
AATCGATATATTGGATGCCCCGGGAGAGATGTTCTAGGAATTTTCGATTTATGTTTCTGATTTTTTTTTAAGGAGTTATTTGGTAGGTGACTTAGAGTTACTCTCAAGAA
ATCTGTAATCGAGTACTAGTTCCCTCTCAATTGTTCTAACAACGGTGACTTCGGCCGATTCTTTCTTCAAGGTTCGTATTTGATTTTTGGGGTGATTTGACGCTTTGGAG
CAGCTCTAGCTTATTCTAAGCAAATTTTAGCTTCCTCATAAGTTGTAGCAATGCTAAGAATAGCCAGTCATTTTTTAGTTCTTATCGTTAAGTGTTTCAGTTTGAGGACT
GATTCCTTTTGAACTATTAAGGTTTAAAAAGTTGCAATGCAGGAAAAATGGAAGGACAAAATGGCTGCAATGGCTCTGTACAAATGCTCTCTCTGAATTTTGGTGCGAAT
GTCAACATTGTTTCCCAAGTACCTGGAGATTGTGCAAACCACCACCATGTTTCGGCTGCTGATAGGAATCTAAACCAAACTAACTTCCCCCACATAATTGAGTGGACTCA
AACTGCAAAAACGTCTCCGACCTTTGTTGAGTTTATTGCTGAAACTTCAAACTTTCCTAGAAAGGAATCTACCAAAGATATGATAGCAGTTGTTCCTGTCAGTTCCATTC
AAACTATTGATGGAGTCTCTGAGATTCATGGAGAAATTTCATACAATCATCCCGCAGGTTCATACACTTCAAAACCTACTGATTCACGCAAGGACAATATGTCAGGTAGT
CTATCCAAGCCACGTACCAGTTCATCAAGTAGACGAGGCTATTCAACTGACCGTCAACGCAGGATAAGGATAGCTGAAAGACTCGAAGCATTGCAGGCACTACTGCCTCT
GGCTTCAAAGGGAAATCAAGCATCCGCTCTAGATGATGTCATTGACCACATCAAGTACTTACAGCTTCAAATAAAGGTAGGCATCTTCGCCCTTGCTCTGTTTTGTACGT
TTCTTTATAGGGACTTGAGTCAGAGTAAAATAGGCGGAGAATCCTCTTCTGAGCCTTTCCTATTCGTTGAGGGATATGGCCATTACATGAGCCATCAAGAGATGCAGGGC
GAGCCACTTGAAGAGATGGTAGGAAAATTGCTGGAAGTTGATCCGTTAGCTGCTGCTCAGCTGCTGGAGAACAAGGGTCTATTCGTGATGCCCATGGATTTTGTTGAAGG
ATTATGCTGAACCATTTAATCAACCATGGAGCTTCCTGTATGAAACAGTTCTCTCTCAGTTAATGCTTCTGCTTTATTAAGTACCTACGGCTTGTCAATCACCTCACTTG
AAAGTAAAGATACCTGGGTAACACTGAAAAATGATAGTTTTGTTTGTCCGTAGCATCATTCCATTTTGGGGAAAAAAAATCTCACAAAATATAGTTTAATGGTCGTTTGA
CAATCATTCTTATTTTTCCTCATGATTTCTGGGTTTTGTTAAGCATTTTTAAAATTTTTG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEGQNGCNGSVQMLSLNFGANVNIVSQVPGDCANHHHVSAADRNLNQTNFPHIIEWTQTAKTSPTFVEFIAETSNFPRKESTKDMIAVVPVSSIQTIDGVSEIHGEISYN
HPAGSYTSKPTDSRKDNMSGSLSKPRTSSSSRRGYSTDRQRRIRIAERLEALQALLPLASKGNQASALDDVIDHIKYLQLQIKVGIFALALFCTFLYRDLSQSKIGGESS
SEPFLFVEGYGHYMSHQEMQGEPLEEMVGKLLEVDPLAAAQLLENKGLFVMPMDFVEGLC