| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6592218.1 DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 28, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 3.5e-88 | 84.98 | Show/hide |
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MA SFVF PPS EEFDHS+AEE+EED++ E+ +E G E EDEP+SRRRTESPWD ASYSESVA+EHARRS TSVDFKISKLL+KRS+ TPTAADDDE
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SSE ESDRQEDY+PEDDDDGTSNAGE KSFFAPSDGASFHANSFMELNL RPLI+ACEALGYAKPTPIQAACIPLA TG DI GSAITGSGKTAAFSLPT
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LERLLYRPKRDRA
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| KAG6607624.1 DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 28, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 2.8e-114 | 99.55 | Show/hide |
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LERLLYRPKRDRANKSSNPNSC
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| KAG7011070.1 DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 28, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 9.8e-115 | 100 | Show/hide |
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| KAG7022397.1 DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 28, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 3.5e-88 | 84.98 | Show/hide |
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MA SFVF PPS EEFDHS+AEE+EED++ E+ +E G E EDEP+SRRRTESPWD ASYSESVA+EHARRS TSVDFKISKLL+KRS+ TPTAADDDE
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SSE ESDRQEDY+PEDDDDGTSNAGE KSFFAPSDGASFHANSFMELNL RPLI+ACEALGYAKPTPIQAACIPLA TG DI GSAITGSGKTAAFSLPT
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LERLLYRPKRDRA
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| XP_023512999.1 DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 28-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 1.6e-88 | 84.98 | Show/hide |
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MA SFVF PPS EEFDHS+AEE EED+ +E+G+E+GG++E EDEP+SRRRTESPWD ASYSESVA+EH RRS TSVDFKISKLL+KRS++ TPTAA+DDE
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SSE ESDRQEDY+PEDDDDGTSNAGE KSFFAPSDGASFHANSFMELNL RPLI+ACEALGYAKPTPIQAACIPLA TG DI GSAITGSGKTAAFSLPT
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|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A6J1F9Y6 DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 28 isoform X3 | 7.1e-87 | 84.04 | Show/hide |
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MA SFVF PPS EEFDHS+AEE+E+++ +E+ +E+GG+ E EDEP+SRRRTESPWD ASYSESVA+EHARRS TSVDFKISKLL+KRS++ TPTAADDDE
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SSE ESDRQEDY+PEDDDDGTSNA E KSFFAPSDGASFHANSFMELNL RPLI+ACEALGYAKPTPIQAACIPLA TG DI GSAITGSGKTAAFSLPT
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|
| A0A6J1FFD3 DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 28 isoform X1 | 7.1e-87 | 84.04 | Show/hide |
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MA SFVF PPS EEFDHS+AEE+E+++ +E+ +E+GG+ E EDEP+SRRRTESPWD ASYSESVA+EHARRS TSVDFKISKLL+KRS++ TPTAADDDE
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SSE ESDRQEDY+PEDDDDGTSNA E KSFFAPSDGASFHANSFMELNL RPLI+ACEALGYAKPTPIQAACIPLA TG DI GSAITGSGKTAAFSLPT
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|
| A0A6J1IH00 DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 28 isoform X2 | 1.1e-87 | 84.04 | Show/hide |
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MA SFVF PPS EEFDHS+AEE+E+++ +E+ +E+GG++E EDEP+SRRRTESPWD ASYSESVA+EHARRS TSVDFKISKLL+KRS++ TPTAADDDE
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SSE ESDRQEDY+PEDDDDG SNAGE KSFFAPSDGASFHANSFMELNL RPLI+ACEALGYAKPTPIQAACIPLA TG DI GSAITGSGKTAAFSLPT
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|
|
| A0A6J1II66 DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 28 isoform X1 | 1.1e-87 | 84.04 | Show/hide |
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MA SFVF PPS EEFDHS+AEE+E+++ +E+ +E+GG++E EDEP+SRRRTESPWD ASYSESVA+EHARRS TSVDFKISKLL+KRS++ TPTAADDDE
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SSE ESDRQEDY+PEDDDDG SNAGE KSFFAPSDGASFHANSFMELNL RPLI+ACEALGYAKPTPIQAACIPLA TG DI GSAITGSGKTAAFSLPT
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LERLLYRPKRDRA
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|
|
| A0A6J1INI2 DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 28 isoform X3 | 1.1e-87 | 84.04 | Show/hide |
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MA SFVF PPS EEFDHS+AEE+E+++ +E+ +E+GG++E EDEP+SRRRTESPWD ASYSESVA+EHARRS TSVDFKISKLL+KRS++ TPTAADDDE
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SSE ESDRQEDY+PEDDDDG SNAGE KSFFAPSDGASFHANSFMELNL RPLI+ACEALGYAKPTPIQAACIPLA TG DI GSAITGSGKTAAFSLPT
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LERLLYRPKRDRA
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|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A2QAX7 ATP-dependent RNA helicase drs1 | 4.8e-16 | 35.71 | Show/hide |
Query: EEQEEDDDDEQGKERGGEDEVEDEPISRRRTESPWDLASYSESVADEHARRSATSVDFKISKLLQKRSASFTPTAADDDESSESESDRQEDYKPEDDDDG
EE E+ D +++ KE G ++E E + E D AS +SVA TP DD +S+ +SD + E+++
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Query: TSNAGESKSFFAP-----SDGASFHA-NSFMELNLWRPLIQACEALGYAKPTPIQAACIPLAFTGGDIWGSAITGSGKTAAFSLPTLERLLYRPKR
+ K+FFAP S+ A A SF E NL RP+++ + ++ PTPIQ IP+A G DI GSA+TGSGKTAAF +P LERLL+RP++
Subjt: TSNAGESKSFFAP-----SDGASFHA-NSFMELNLWRPLIQACEALGYAKPTPIQAACIPLAFTGGDIWGSAITGSGKTAAFSLPTLERLLYRPKR
|
|
| A7TJM9 ATP-dependent RNA helicase DRS1 | 1.5e-17 | 44.54 | Show/hide |
Query: DDDESSESESDRQEDYKPEDDDDGTSN-AGESKSFFAP----SDGASFHANSFMELNLWRPLIQACEALGYAKPTPIQAACIPLAFTGGDIWGSAITGSG
DDD++ E E + +D K +DD++ + A E SF+AP S+ S ++F L L RP+++ LGY KP+PIQ+A IP+ +G DI A+TGSG
Subjt: DDDESSESESDRQEDYKPEDDDDGTSN-AGESKSFFAP----SDGASFHANSFMELNLWRPLIQACEALGYAKPTPIQAACIPLAFTGGDIWGSAITGSG
Query: KTAAFSLPTLERLLYRPKR
KTAAF +P +ERLLY+P +
Subjt: KTAAFSLPTLERLLYRPKR
|
|
| Q0CZN5 ATP-dependent RNA helicase drs1 | 6.3e-16 | 33.85 | Show/hide |
Query: EEDDDDEQGKERGGEDEVEDEPISRRRTESPWDLASYSESVADEHARRSATSVDFKISKLLQKRSASFTPTAADDDESSESESDRQEDYKPEDDDDGTSN
E++ D+E+ ++ G D D+ + + + AS ++SVA TP +DE+S+++SD + + E+ +
Subjt: EEDDDDEQGKERGGEDEVEDEPISRRRTESPWDLASYSESVADEHARRSATSVDFKISKLLQKRSASFTPTAADDDESSESESDRQEDYKPEDDDDGTSN
Query: AGESKSFFAP--------SDGASFHANSFMELNLWRPLIQACEALGYAKPTPIQAACIPLAFTGGDIWGSAITGSGKTAAFSLPTLERLLYRPKR
+ K+FFAP +DGA SF E NL RP+++ A+ + PTPIQ IP+A G DI GSA+TGSGKTAAF +P LERLL+RP++
Subjt: AGESKSFFAP--------SDGASFHANSFMELNLWRPLIQACEALGYAKPTPIQAACIPLAFTGGDIWGSAITGSGKTAAFSLPTLERLLYRPKR
|
|
| Q0INC5 DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 28 | 7.0e-39 | 46.41 | Show/hide |
Query: RRRTESPWDLASYSESVADEHARRSATSVDFKISKLLQKRSASFTPTAAD-----DDESSESESDRQEDYK----------------PEDDDDGT-----
R+ +SPW+ +SY+ESVA EHARR TS+D KIS+ L P+ D D++ SE E D +ED K EDDD+G
Subjt: RRRTESPWDLASYSESVADEHARRSATSVDFKISKLLQKRSASFTPTAAD-----DDESSESESDRQEDYK----------------PEDDDDGT-----
Query: ------SNAGESKS------------------------------------------FFAPSDGASFHANSFMELNLWRPLIQACEALGYAKPTPIQAACI
GE KS FFA S+GASFHANSF+ELNL RPL++ACEALGY KPTPIQAACI
Subjt: ------SNAGESKS------------------------------------------FFAPSDGASFHANSFMELNLWRPLIQACEALGYAKPTPIQAACI
Query: PLAFTGGDIWGSAITGSGKTAAFSLPTLERLLYRPKR
PLA TG DI GSAITGSGKTAAFSLP LERLL+RPKR
Subjt: PLAFTGGDIWGSAITGSGKTAAFSLPTLERLLYRPKR
|
|
| Q9ZRZ8 DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 28 | 3.8e-45 | 53.08 | Show/hide |
Query: SGEEFDHSEAEEQEEDDDDEQGKERGGEDEVEDEPISRRR----TESPWDLASYSESVADEHARRSATSVDFKISKLLQKRSASFTPTAADDDE-----S
S E+ EAEE E +D++ +E ED+ E+E +R+ +SPWD ASYS SV +EHARR TS+D KISK +Q R + +++E +
Subjt: SGEEFDHSEAEEQEEDDDDEQGKERGGEDEVEDEPISRRR----TESPWDLASYSESVADEHARRSATSVDFKISKLLQKRSASFTPTAADDDE-----S
Query: SESESDRQEDYKPEDDDDGTSNAGES--KSFFAPSDGASFHANSFMELNLWRPLIQACEALGYAKPTPIQAACIPLAFTGGDIWGSAITGSGKTAAFSLP
S++E+D+QE+Y EDD+ ++ K FF+ DG SFHA++FMELNL RPL++ACE LGY KPTPIQAACIPLA TG D+ SAITGSGKTAAF+LP
Subjt: SESESDRQEDYKPEDDDDGTSNAGES--KSFFAPSDGASFHANSFMELNLWRPLIQACEALGYAKPTPIQAACIPLAFTGGDIWGSAITGSGKTAAFSLP
Query: TLERLLYRPKR
TLERLL+RPKR
Subjt: TLERLLYRPKR
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G16280.1 RNA helicase 36 | 1.7e-11 | 40.66 | Show/hide |
Query: DGTSNAGESKSFFAPSDGA-SFHANSFMELNLWRPLIQACEALGYAKPTPIQAACIPLAFTGGDIWGSAITGSGKTAAFSLPTLERLLYRP
D N + + F P+ + + A +F L L ++ C+ LG KPTP+Q C+P G D+ G A TGSGKTAAF+LP L RL P
Subjt: DGTSNAGESKSFFAPSDGA-SFHANSFMELNLWRPLIQACEALGYAKPTPIQAACIPLAFTGGDIWGSAITGSGKTAAFSLPTLERLLYRP
|
|
| AT2G33730.1 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein | 2.4e-10 | 45.45 | Show/hide |
Query: SFMELNLWRPLIQACEALGYAKPTPIQAACIPLAFTGGDIWGSAITGSGKTAAFSLPTLERLLYRPKRDRANKSSNP
S+ E L L++A E GY KP+PIQ A IPL D+ G A TGSGKTAAF LP L + P N++ P
Subjt: SFMELNLWRPLIQACEALGYAKPTPIQAACIPLAFTGGDIWGSAITGSGKTAAFSLPTLERLLYRPKRDRANKSSNP
|
|
| AT2G45810.1 DEA(D/H)-box RNA helicase family protein | 2.5e-07 | 35.34 | Show/hide |
Query: PTAADDDE---SSESESD-RQEDYKPEDDDDGTSNAGESKSFFAPSDGASFHANSFMELNLWRPLIQACEALGYAKPTPIQAACIPLAFTGGDIWGSAIT
P+ D+ E SE+ SD ED+K T + + D + N F + L R L++ G+ KP+PIQ IP+A TG DI A
Subjt: PTAADDDE---SSESESD-RQEDYKPEDDDDGTSNAGESKSFFAPSDGASFHANSFMELNLWRPLIQACEALGYAKPTPIQAACIPLAFTGGDIWGSAIT
Query: GSGKTAAFSLPTLERL
G+GKT AF +PTLE++
Subjt: GSGKTAAFSLPTLERL
|
|
| AT4G16630.1 DEA(D/H)-box RNA helicase family protein | 2.7e-46 | 53.08 | Show/hide |
Query: SGEEFDHSEAEEQEEDDDDEQGKERGGEDEVEDEPISRRR----TESPWDLASYSESVADEHARRSATSVDFKISKLLQKRSASFTPTAADDDE-----S
S E+ EAEE E +D++ +E ED+ E+E +R+ +SPWD ASYS SV +EHARR TS+D KISK +Q R + +++E +
Subjt: SGEEFDHSEAEEQEEDDDDEQGKERGGEDEVEDEPISRRR----TESPWDLASYSESVADEHARRSATSVDFKISKLLQKRSASFTPTAADDDE-----S
Query: SESESDRQEDYKPEDDDDGTSNAGES--KSFFAPSDGASFHANSFMELNLWRPLIQACEALGYAKPTPIQAACIPLAFTGGDIWGSAITGSGKTAAFSLP
S++E+D+QE+Y EDD+ ++ K FF+ DG SFHA++FMELNL RPL++ACE LGY KPTPIQAACIPLA TG D+ SAITGSGKTAAF+LP
Subjt: SESESDRQEDYKPEDDDDGTSNAGES--KSFFAPSDGASFHANSFMELNLWRPLIQACEALGYAKPTPIQAACIPLAFTGGDIWGSAITGSGKTAAFSLP
Query: TLERLLYRPKR
TLERLL+RPKR
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|
|
| AT5G60990.1 DEA(D/H)-box RNA helicase family protein | 6.3e-11 | 42.31 | Show/hide |
Query: SFMELNLWRPLIQACEALGYAKPTPIQAACIPLAFTGGDIWGSAITGSGKTAAFSLPTLERLLYRPKRDRANKSSNPN
+F EL + L++ACE LG+ P+ IQA +P A G D+ G A TGSGKT AF++P L+ LL K P+
Subjt: SFMELNLWRPLIQACEALGYAKPTPIQAACIPLAFTGGDIWGSAITGSGKTAAFSLPTLERLLYRPKRDRANKSSNPN
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