CuGenDBv2

Gene ID	Carg26667
Organism	Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Description	nuclear pore complex protein NUP62
Genome location	Carg_Chr17:3158711..3173060
RNA-Seq Expression	Carg26667
Synteny	Carg26667
Gene Ontology terms	GO:0006405 - RNA export from nucleus (biological process) GO:0006606 - protein import into nucleus (biological process) GO:0044613 - nuclear pore central transport channel (cellular component) GO:0005543 - phospholipid binding (molecular function) GO:0017056 - structural constituent of nuclear pore (molecular function)
InterPro domains	IPR007758 - Nucleoporin, NSP1-like, C-terminal IPR026010 - Nucleoporin NSP1/NUP62

Homology

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KAG6575234.1 Nuclear pore complex protein NUP62, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

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        PLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAAT+GPAADRELLGQK WMS
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A0A1S3CAD4 nuclear pore complex protein NUP62

7.7e-245

78.59

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        MSGF FGSS+SQ SSSSSPFSSTTGFSFGST+ FSFGS  SPLSL SSSSSSNP+SSSS F N TSNPP SS+ FGF SSSF SS SSPFSFSL +ASTG
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        ASS S       S SSLF  SSSS G +SFGFG SSSS  SSA              P FGAAS+SGTS A LFG    +GSSP PSFGAAP+SGSSVAP
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         FG+  SS G+S  P FGAAPSAG+S  PS FG ASS+ +SS+P FG A SA +S  +LF G S+ A+ S A LFGTSAP++ S GS +FG         
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        SS FG++   +SSSVSTSNLF SS SS   +PFQ+S SSSSSQNL+SSSPFAAS SGFSF T++LSKTTSIT   ++SSSSSLT ASTSSSSFSFGTPAS
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Query:  SASQSSFGFSISNAASTGGSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQPSFSMPAFSLSSSAATTLSIAASSVPSTTSSGAASSFTG
        S+SQSSFGFSI+NAASTGGSSAP TTA KPTSLS S SVAPLFSTVTTTSASTPAA+ST QPSFS+PAFS SSSAATTLSIAASS PS  SSG  SSFTG
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Query:  FGVTSTAASSSAIVSLSLPTKSLTAASSSQAPASFGFSSLAPASTAATTTSGSNASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSTTVSATPKLPSEITGKTVEEI
        FGVTS+A+SSSAI SLSLPTK+ TAASSSQAPASFGF SLA ASTAATTTSG +ASSQSQTSS LVVASSSSGTTSTVS TVS+TPKLPSEITGKTVEEI
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        IKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEIEVAKVVETQ ELEKKLELIETHQQEVDKAL SVE+DAERIYKDERGLLLDDEAASTRDA
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        MYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNA+QGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAAT+GPAADRELLGQKFWMS
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A0A6J1H5C8 nuclear pore complex protein NUP62 isoform X1

0.0e+00

97.94

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        MSGFSFGSSSSQASSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGSSPLSLSSSSSSNPSSSSSAFSNQTSNPPSSTPFGFASSSFPSSASSPFSFSLPAASTGASSG
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        SSGSSLFAASSSSGGLSSFGFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSSGSSPVPSFGAAP SGSSVAPLFGSAPSSGSS
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        PLPSFGAAPSA              GSSSSPFFGAAPSAGTSAPSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASTAASGSSSSLFGSNPFASSSS
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        VSTSNLFGSSSSSASTTPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAASSSGFSFSTTSLSKTTSITAASSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAAST
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        GGSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQPSFSMPAFSLSSSAATTLSIAASSVPSTTSSGAASSFTGFGVTSTAASSSAIVSLS
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        QANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQTELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTE
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        QIKSIIQTLNASQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATQGPAADRELLGQKFWMS
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A0A6J1H7F5 nuclear pore complex protein NUP62 isoform X2

1.8e-270

97.54

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        MSGFSFGSSSSQASSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGSSPLSLSSSSSSNPSSSSSAFSNQTSNPPSSTPFGFASSSFPSSASSPFSFSLPAASTGASSG
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        SSGSSLFAASSSSGGLSSFGFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSSGSSPVPSFGAAP SGSSVAPLFGSAPSSGSS
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        PLPSFGAAPSA              GSSSSPFFGAAPSAGTSAPSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASTAASGSSSSLFGSNPFASSSS
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        VSTSNLFGSSSSSASTTPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAASSSGFSFSTTSLSKTTSITAASSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAAST
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        GGSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQPSFSMPAFSLSSSAATTLSIAASSVPSTTSSGAASSFTGFGVTSTAASSSAIVSLS
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Query:  LPTKSLTAASSSQAPASFGFSSLAPASTAATTTSGSNASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSTTVSATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRK
        LPTKSLTAASSSQAPASFGFSSLAPASTAATTTSGSNASSQSQTSSTLV+ASSSSGTTSTVSTTVSATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRK
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        QANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQTELEKKLELIETHQQEV
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A0A6J1L2D4 nuclear pore complex protein NUP62

0.0e+00

97.19

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        MSGFSFGSSSSQ+SSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGSSPLSLSSSSSSNPSSSSSAFSNQTSNPPSSTPFGFASSSFPSSASSPFSFSLPAASTGASSG
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         SGS+LFAASSSSGGLSSFGFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSSGSSPVPSFGAAPASGSSVAPLFGSAPSSGSS
Subjt:  SSGSSLFAASSSSGGLSSFGFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSSGSSPVPSFGAAPASGSSVAPLFGSAPSSGSS

Query:  PLPSFGAAPSAGSSPLPSFGAASSSGSSSSPFFGAAPSAGTSAPSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASTAASGSSSSLFGSNPFASS--
        PLPSFGA+PSAGSSPLPSFGAASSSGSSSSPFFGAAPS GTSAPSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGAS AASGSSSSLFGSN FASS  
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Query:  ---SSVSTSNLFGSSSSSASTTPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAASSSGFSFSTTSLSKTTSITAASSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSIS
           SSVSTSNLFGSSSSSASTTPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAASSSGFSFSTTSLSKTTSIT ASSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGF+IS
Subjt:  ---SSVSTSNLFGSSSSSASTTPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAASSSGFSFSTTSLSKTTSITAASSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSIS

Query:  NAASTGGSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQPSFSMPAFSLSSSAATTLSIAASSVPSTTSSGAASSFTGFGVTSTAASSSA
        NAAS  GSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQPSFSMPAFSLSSSAATTLSIAASS PS TSSGAASSFTGFG+TSTAASSSA
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Query:  IVSLSLPTKSLTAASSSQAPASFGFSSLAPASTAATTTSGSNASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSTTVSATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERT
        IVSLSLPTKSLTAASSSQAPASFGFSSLA AS AATTTSGSNASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVS TVSATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERT
Subjt:  IVSLSLPTKSLTAASSSQAPASFGFSSLAPASTAATTTSGSNASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSTTVSATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERT

Query:  GKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQTELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIEREL
        GKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQTELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIEREL
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Query:  EQMTEQIKSIIQTLNASQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATQGPAADRELLGQKFWMS
        EQMTEQIKSIIQTLNASQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATQGPAADRELLGQKFWMS
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SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

G0SBQ3 Nucleoporin NSP1

1.0e-12

30.99

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        SF FG  S+SG S   +   AP SG        S  P+F   + SGT    LFG A +   +S   +  +   +G+    LFG + SS S P     A+ 
Subjt:  SFGFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSG-------SSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPS-SGSSPVPSFGAAPASGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGAAP

Query:  SAGSSPLPSFGAASSSGSSSSPFFGAAPSAGTSAPSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASTAASGSSSSLFGSNPFASSSSVSTSNLFGS
         +G+     FG  S+S +      G++  AGT  PSLFG  S  ATTS+     T A TA  G S+FG++TA +  SS+   +  F  SS+ S S LFGS
Subjt:  SAGSSPLPSFGAASSSGSSSSPFFGAAPSAGTSAPSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASTAASGSSSSLFGSNPFASSSSVSTSNLFGS

Query:  S------SSSASTTPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAASSSGFSFSTTSLSKTTSITAAS--SSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTG
        +      +S + TTP +  F S  S   + + P  A+ +   F   S   TT  +  +   S+S T+   SS+      PA +++ ++     ++ A+T 
Subjt:  S------SSSASTTPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAASSSGFSFSTTSLSKTTSITAAS--SSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTG

Query:  GSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTT-SASTPAATSTAQPSFSMPAFSLSSSAATTLSIAA--SSVPSTTSSGAASSFTG--FG----VTSTAAS
         +SAP +T       +  TS AP  ST T+T +ASTPAAT   +P F   A + +  ++TT +     S+ P+TT++  +S+ T   FG     T+ AA+
Subjt:  GSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTT-SASTPAATSTAQPSFSMPAFSLSSSAATTLSIAA--SSVPSTTSSGAASSFTG--FG----VTSTAAS

Query:  SSAIVSLSLPTKSLTAASSSQAPAS-FGFSSLAPASTAA-TTTSGSNASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTV-STTVSATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNA
        SS   + S P+   +  +S+ APAS    ++ APAST+A  TT+ +  S  S T+ST      +  TT+ + ++TV    +LP  +  KT++EII  W  
Subjt:  SSAIVSLSLPTKSLTAASSSQAPAS-FGFSSLAPASTAA-TTTSGSNASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTV-STTVSATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNA

Query:  ELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQTELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAA---STRDAMYE
        +L +   +F++QA  + EWDR +++N + + +L     +      E+E++L  +E+ Q+E+   L   E + + +Y  + G    ++AA     R+  Y+
Subjt:  ELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQTELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAA---STRDAMYE

Query:  QAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLN-----ASQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRI---QKLAATQG
         AE +  +L++M + +  +I+ +N      S+G + D      PL  +VR+LN  L+ L WID  A    +++   QK A + G
Subjt:  QAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLN-----ASQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRI---QKLAATQG

Q8L7F7 Nuclear pore complex protein NUP62

2.2e-116

51.92

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Query:  MSGFSFGSSSSQASSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGS-----SPLSLSSSSSSNPSSSSSAFSNQTSNPP--SSTP-FGFASSSFPSSASSPFSFSLPA
        MSGF FG S           +S  GFSFGS+SA +  S     SPLS S + SSNPSS+   F +  S+ P  S+TP FGF +SS PS     F F   A
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Query:  ASTGASSGSSGSSLFAASSSSGGLSSFGFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPS---FG----AASASGTSFAPLFGSAPSSGSSPVPS-FGAAPASG
        +S+  S G   S+    +S++    SFGFG ++SS   +   FG++ T+ SS  P    FG    +AS++ T  + LFG+  SS ++P  S FGAAPASG
Subjt:  ASTGASSGSSGSSLFAASSSSGGLSSFGFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPS---FG----AASASGTSFAPLFGSAPSSGSSPVPS-FGAAPASG

Query:  SSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGAAPSAGSSPLPSFGAASSSGSSSSPFFGAAPSAGTSAPSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASTAASG
        S+  PLFGS+PS  S+P     ++ SA +S L  FGA+SS+ +S+SP FGA  SA  + PS    V+S+A  SS+ +FG     A+  S  F  +++ASG
Subjt:  SSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGAAPSAGSSPLPSFGAASSSGSSSSPFFGAAPSAGTSAPSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASTAASG

Query:  SSSSLF---GSNPF--ASSSSVSTSNLFGSSSSSAST---TPF-QNSFSSSSSQNLS--SSSPFAASSSGFSFSTTSLSKTTSITAASSSSSLTSASTSS
        SS S+F   GS+PF  +SSS+ ST +LF SSSS A+T   +PF  ++F+SSS+ N S  S+SPF+A S+GFSF  ++ S TTS T  S+     S   SS
Subjt:  SSSSLF---GSNPF--ASSSSVSTSNLFGSSSSSAST---TPF-QNSFSSSSSQNLS--SSSPFAASSSGFSFSTTSLSKTTSITAASSSSSLTSASTSS

Query:  SSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQPS-----FSMPAFSLSSSAATTLSIAASS
        SSFSFGT A+S      GF++    STG S+AP   A+  +   FS       +T TTTS+STPAATS    S      + P+F ++SSA  T   ++++
Subjt:  SSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQPS-----FSMPAFSLSSSAATTLSIAASS

Query:  VPSTTSSGAASSFTGFGVTSTAASSSAIVSLSLPTKSLTAASSSQAPASFGFSSLAPASTAATTTSGSNASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSTTVSAT
          STT  G ASS      T    S+++    ++P  S  A+SS     S  FS   P+ST+ T  + S+A++   T +TLVV SSS   TST    V+ +
Subjt:  VPSTTSSGAASSFTGFGVTSTAASSSAIVSLSLPTKSLTAASSSQAPASFGFSSLAPASTAATTTSGSNASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSTTVSAT

Query:  PKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQTELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDE
        PKLPSEITGKTVEEIIKEWN ELQERTG+FRKQANAIAEWD+RILQNRD+LLRLEIEVAKVVETQ+ LE++LELIETHQQEVDKALQS+EE+AERIY DE
Subjt:  PKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQTELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDE

Query:  RGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNASQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATQGPAADRE
        R  LLDDEAASTRDAMYEQ+E +ERELE MTEQI+SIIQ++NA+QGGEL+ IDGM+PLD VVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK+ A QG   DRE
Subjt:  RGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNASQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATQGPAADRE

Query:  LLGQKFWMS
        L+  K WMS
Subjt:  LLGQKFWMS

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G45000.1 structural constituent of nuclear pore

1.6e-117

51.92

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Query:  MSGFSFGSSSSQASSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGS-----SPLSLSSSSSSNPSSSSSAFSNQTSNPP--SSTP-FGFASSSFPSSASSPFSFSLPA
        MSGF FG S           +S  GFSFGS+SA +  S     SPLS S + SSNPSS+   F +  S+ P  S+TP FGF +SS PS     F F   A
Subjt:  MSGFSFGSSSSQASSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGS-----SPLSLSSSSSSNPSSSSSAFSNQTSNPP--SSTP-FGFASSSFPSSASSPFSFSLPA

Query:  ASTGASSGSSGSSLFAASSSSGGLSSFGFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPS---FG----AASASGTSFAPLFGSAPSSGSSPVPS-FGAAPASG
        +S+  S G   S+    +S++    SFGFG ++SS   +   FG++ T+ SS  P    FG    +AS++ T  + LFG+  SS ++P  S FGAAPASG
Subjt:  ASTGASSGSSGSSLFAASSSSGGLSSFGFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPS---FG----AASASGTSFAPLFGSAPSSGSSPVPS-FGAAPASG

Query:  SSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGAAPSAGSSPLPSFGAASSSGSSSSPFFGAAPSAGTSAPSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASTAASG
        S+  PLFGS+PS  S+P     ++ SA +S L  FGA+SS+ +S+SP FGA  SA  + PS    V+S+A  SS+ +FG     A+  S  F  +++ASG
Subjt:  SSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGAAPSAGSSPLPSFGAASSSGSSSSPFFGAAPSAGTSAPSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASTAASG

Query:  SSSSLF---GSNPF--ASSSSVSTSNLFGSSSSSAST---TPF-QNSFSSSSSQNLS--SSSPFAASSSGFSFSTTSLSKTTSITAASSSSSLTSASTSS
        SS S+F   GS+PF  +SSS+ ST +LF SSSS A+T   +PF  ++F+SSS+ N S  S+SPF+A S+GFSF  ++ S TTS T  S+     S   SS
Subjt:  SSSSLF---GSNPF--ASSSSVSTSNLFGSSSSSAST---TPF-QNSFSSSSSQNLS--SSSPFAASSSGFSFSTTSLSKTTSITAASSSSSLTSASTSS

Query:  SSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQPS-----FSMPAFSLSSSAATTLSIAASS
        SSFSFGT A+S      GF++    STG S+AP   A+  +   FS       +T TTTS+STPAATS    S      + P+F ++SSA  T   ++++
Subjt:  SSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQPS-----FSMPAFSLSSSAATTLSIAASS

Query:  VPSTTSSGAASSFTGFGVTSTAASSSAIVSLSLPTKSLTAASSSQAPASFGFSSLAPASTAATTTSGSNASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSTTVSAT
          STT  G ASS      T    S+++    ++P  S  A+SS     S  FS   P+ST+ T  + S+A++   T +TLVV SSS   TST    V+ +
Subjt:  VPSTTSSGAASSFTGFGVTSTAASSSAIVSLSLPTKSLTAASSSQAPASFGFSSLAPASTAATTTSGSNASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSTTVSAT

Query:  PKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQTELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDE
        PKLPSEITGKTVEEIIKEWN ELQERTG+FRKQANAIAEWD+RILQNRD+LLRLEIEVAKVVETQ+ LE++LELIETHQQEVDKALQS+EE+AERIY DE
Subjt:  PKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQTELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDE

Query:  RGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNASQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATQGPAADRE
        R  LLDDEAASTRDAMYEQ+E +ERELE MTEQI+SIIQ++NA+QGGEL+ IDGM+PLD VVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK+ A QG   DRE
Subjt:  RGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNASQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATQGPAADRE

Query:  LLGQKFWMS
        L+  K WMS
Subjt:  LLGQKFWMS

Sequences

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CDS sequence

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ATGTCGGGTTTCTCGTTTGGTTCTTCCTCCTCCCAAGCTTCTTCTTCTTCTTCTCCGTTTTCGTCAACCACTGGTTTCTCCTTCGGATCCACCTCCGCCTTCTCGTTCGG
ATCATCCCCTTTATCTCTTTCATCTTCCTCCTCCTCAAACCCTAGTTCCTCTTCCTCTGCATTTTCCAATCAAACCTCCAATCCTCCCTCTTCCACTCCCTTTGGCTTTG
CCTCTTCTTCTTTTCCCTCTTCCGCTTCCTCTCCTTTCTCTTTCTCCCTTCCCGCCGCTTCCACTGGGGCCTCTTCTGGAAGTTCAGGTTCTTCATTGTTTGCGGCTTCT
TCATCCTCAGGAGGGTTGAGTTCTTTCGGGTTTGGGGTTTCATCTTCATCAGGAGGCTCGTCTGCTCCTTCATTTGGGGCTGCTCCGACCTCTGGGAGCTCACCTGTGCC
CTCATTTGGGGCTGCTTCGGCCTCTGGGACCTCATTTGCGCCCTTGTTTGGGTCTGCTCCGTCATCTGGGAGCTCACCTGTGCCCTCATTTGGGGCTGCTCCGGCCTCTG
GGAGTTCAGTTGCGCCCTTGTTTGGGTCTGCTCCGTCCTCTGGAAGCTCCCCTTTGCCCTCGTTTGGGGCTGCTCCGTCCGCTGGGAGCTCACCTTTGCCCTCGTTTGGG
GCTGCTTCGTCCTCTGGGAGCTCATCTTCGCCCTTTTTTGGGGCTGCTCCATCTGCAGGGACCTCGGCTCCGTCCTTGTTCGGAGGGGTGTCTTCTGCTGCAACTACTTC
CAGTGCACCATTGTTTGGCACTTCTGCACCCACTGCAAGTCCGGGGTCATCGATATTTGGAGCTTCTACTGCCGCTTCAGGTTCAAGCTCCTCCCTGTTTGGGTCTAATC
CCTTTGCTTCATCTTCTTCGGTATCCACTTCGAACTTGTTTGGGTCATCTTCATCATCTGCATCGACTACTCCATTCCAGAACTCTTTTTCTTCGAGTTCTTCCCAGAAT
TTGAGTTCGTCTTCACCATTTGCGGCTTCTTCTTCTGGGTTCTCATTTTCGACCACTTCTTTGTCCAAAACTACTAGTATTACCGCAGCATCTTCTTCTTCTTCTCTTAC
ATCAGCTTCTACTAGTTCCTCGAGCTTCTCATTCGGAACACCTGCTTCATCGGCATCTCAATCTTCTTTCGGGTTCAGTATTAGCAATGCAGCATCGACGGGAGGGTCTT
CTGCTCCGGGCACTACAGCTGCGAAGCCTACTTCTCTATCGTTTTCAACTTCTGTGGCACCTTTATTCTCTACGGTTACTACCACCAGTGCTTCCACTCCGGCTGCAACT
AGCACAGCTCAGCCATCCTTCTCCATGCCAGCTTTTAGCTTGAGTTCTTCAGCTGCTACTACCTTATCCATAGCAGCATCCTCCGTTCCCTCAACTACTTCTTCAGGTGC
TGCGAGTTCATTCACCGGTTTTGGCGTCACAAGCACGGCTGCTTCATCAAGTGCCATTGTTTCCTTGTCGTTGCCAACCAAATCATTGACTGCTGCTTCATCATCCCAAG
CACCAGCCTCTTTCGGTTTCTCATCTCTTGCTCCTGCTTCCACTGCTGCTACCACCACGTCTGGTTCCAATGCTTCCAGTCAGAGTCAGACTTCATCAACTCTTGTTGTA
GCAAGCAGTAGTAGTGGTACAACTTCAACTGTGAGTACCACAGTGTCTGCTACACCAAAATTACCATCTGAGATAACAGGGAAGACTGTTGAAGAGATCATCAAGGAATG
GAATGCGGAGCTTCAAGAGCGTACTGGAAAGTTTCGGAAGCAGGCCAATGCTATTGCTGAGTGGGATAGGAGGATTTTGCAAAATCGGGATATTCTTCTTAGACTTGAGA
TTGAAGTTGCAAAGGTTGTTGAGACCCAAACTGAGCTGGAGAAGAAATTGGAGCTGATAGAAACTCACCAACAAGAGGTTGATAAGGCATTGCAAAGTGTGGAAGAAGAT
GCTGAGCGCATTTACAAGGATGAACGTGGTTTACTCCTTGACGATGAAGCTGCATCTACTAGGGATGCAATGTATGAGCAAGCTGAATATATAGAACGAGAACTTGAGCA
GATGACAGAACAGATCAAATCAATTATCCAGACCCTAAATGCGAGCCAGGGAGGAGAACTTGATGTGATTGATGGGATGACGCCGTTGGATGCAGTTGTTCGAATTTTAA
ACAATCAATTGAGTTCATTAATGTGGATCGATGAAAAGGCCGAAGAGTTTTCTTCACGTATACAGAAGCTTGCTGCTACCCAGGGTCCTGCTGCAGATCGTGAATTGTTG
GGTCAGAAGTTCTGGATGTCTTAA

mRNA sequence

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Protein sequence

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MSGFSFGSSSSQASSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGSSPLSLSSSSSSNPSSSSSAFSNQTSNPPSSTPFGFASSSFPSSASSPFSFSLPAASTGASSGSSGSSLFAAS
SSSGGLSSFGFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSSGSSPVPSFGAAPASGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGAAPSAGSSPLPSFG
AASSSGSSSSPFFGAAPSAGTSAPSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASTAASGSSSSLFGSNPFASSSSVSTSNLFGSSSSSASTTPFQNSFSSSSSQN
LSSSSPFAASSSGFSFSTTSLSKTTSITAASSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAAT
STAQPSFSMPAFSLSSSAATTLSIAASSVPSTTSSGAASSFTGFGVTSTAASSSAIVSLSLPTKSLTAASSSQAPASFGFSSLAPASTAATTTSGSNASSQSQTSSTLVV
ASSSSGTTSTVSTTVSATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQTELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEED
AERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNASQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATQGPAADRELL
GQKFWMS

Carg26667 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome