; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg26846 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg26846
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionprotein RALF-like 4
Genome locationCarg_Chr11:8795777..8796133
RNA-Seq ExpressionCarg26846
SyntenyCarg26846
Gene Ontology termsGO:0005576 - extracellular region (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6588678.1 Protein RALF-like 4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.4e-61100Show/hide
Query:  MGTMKLCLFLLLVSPPFSFAFHETSDGSSPFDYSSQYSFFGGNSSEAITEDSRRQLFQYGFAYNREARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRRRI
        MGTMKLCLFLLLVSPPFSFAFHETSDGSSPFDYSSQYSFFGGNSSEAITEDSRRQLFQYGFAYNREARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRRRI
Subjt:  MGTMKLCLFLLLVSPPFSFAFHETSDGSSPFDYSSQYSFFGGNSSEAITEDSRRQLFQYGFAYNREARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRRRI

Query:  NPYRRGCAAITGCARFTD
        NPYRRGCAAITGCARFTD
Subjt:  NPYRRGCAAITGCARFTD

XP_022927734.1 protein RALF-like 4 [Cucurbita moschata]1.9e-4882.79Show/hide
Query:  MGTMKLCLFLL----LVSPPFSFAFHETSDGSSPFDYSSQYSFFGGNSSEAITEDSRRQLFQYGFAYNREARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKK
        M T+KLCLFLL    +V+PP SFA+HETS+ SS  +  S+YSFFGG+SSEA+TEDSRRQLFQYGFAYN+EARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKK
Subjt:  MGTMKLCLFLL----LVSPPFSFAFHETSDGSSPFDYSSQYSFFGGNSSEAITEDSRRQLFQYGFAYNREARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKK

Query:  RRRINPYRRGCAAITGCARFTD
        RRRINPYRRGCAAITGCARFTD
Subjt:  RRRINPYRRGCAAITGCARFTD

XP_022927735.1 protein RALF-like 4 [Cucurbita moschata]1.1e-5694.26Show/hide
Query:  MGTMKLCLFLLL----VSPPFSFAFHETSDGSSPFDYSSQYSFFGGNSSEAITEDSRRQLFQYGFAYNREARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKK
        M TMKLCLFLLL    VSPPFSFAFHETSDGSS FDYSSQYSFFGG+SSEAITEDSRRQLFQYGFAYNREARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKK
Subjt:  MGTMKLCLFLLL----VSPPFSFAFHETSDGSSPFDYSSQYSFFGGNSSEAITEDSRRQLFQYGFAYNREARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKK

Query:  RRRINPYRRGCAAITGCARFTD
        RRRINPYRRGCAAITGCARFTD
Subjt:  RRRINPYRRGCAAITGCARFTD

XP_023531827.1 protein RALF-like 4 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.5e-5086.29Show/hide
Query:  MGTMKLCLFLLL----VSPPFSFAFHETSDGS--SPFDYSSQYSFFGGNSSEAITEDSRRQLFQYGFAYNREARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDC
        M T KLCLFLLL    VSPP SFAFHETSDGS  SPFD +SQYSFFGG+SSEA+TEDSRRQLFQYGFAYN EAR+R L+YYALSKNNIPCGRRGTSYYDC
Subjt:  MGTMKLCLFLLL----VSPPFSFAFHETSDGS--SPFDYSSQYSFFGGNSSEAITEDSRRQLFQYGFAYNREARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDC

Query:  KKRRRINPYRRGCAAITGCARFTD
        KKRRRINPYRRGCAAITGCARFTD
Subjt:  KKRRRINPYRRGCAAITGCARFTD

XP_023531888.1 protein RALF-like 4 [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.5e-4883.47Show/hide
Query:  MGTMKLCLFLLL---VSPPFSFAFHETSDGSSPFDYSSQYSFFGGNSSEAITEDSRRQLFQYGFAYNREARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKR
        MGTMKLC+FLLL   V  PFSFAFHETS  SS  D  S+YSFFGG+SSEA+TED+RRQLFQYGFAYN EAR+R L+YYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKR
Subjt:  MGTMKLCLFLLL---VSPPFSFAFHETSDGSSPFDYSSQYSFFGGNSSEAITEDSRRQLFQYGFAYNREARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKR

Query:  RRINPYRRGCAAITGCARFTD
        RRINPYRRGCAAITGCARFTD
Subjt:  RRINPYRRGCAAITGCARFTD

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1EIG3 rapid alkalinization factor 23-like5.5e-4680.99Show/hide
Query:  MGTMKLCLFLLLV---SPPFSFAFHETSDGSSPFDYSSQYSFFGGNSSEAITEDSRRQLFQYGFAYNREARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKR
        M TMK+ L LLLV     P SFAFHE S  SS  D +SQYSFFGG+SSEA+TEDSRRQLFQYGF YN+EAR+RFL+YYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKR
Subjt:  MGTMKLCLFLLLV---SPPFSFAFHETSDGSSPFDYSSQYSFFGGNSSEAITEDSRRQLFQYGFAYNREARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKR

Query:  RRINPYRRGCAAITGCARFTD
        RRINPYRRGCAAITGCARFTD
Subjt:  RRINPYRRGCAAITGCARFTD

A0A6J1EIU0 protein RALF-like 49.1e-4982.79Show/hide
Query:  MGTMKLCLFLL----LVSPPFSFAFHETSDGSSPFDYSSQYSFFGGNSSEAITEDSRRQLFQYGFAYNREARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKK
        M T+KLCLFLL    +V+PP SFA+HETS+ SS  +  S+YSFFGG+SSEA+TEDSRRQLFQYGFAYN+EARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKK
Subjt:  MGTMKLCLFLL----LVSPPFSFAFHETSDGSSPFDYSSQYSFFGGNSSEAITEDSRRQLFQYGFAYNREARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKK

Query:  RRRINPYRRGCAAITGCARFTD
        RRRINPYRRGCAAITGCARFTD
Subjt:  RRRINPYRRGCAAITGCARFTD

A0A6J1EPT5 protein RALF-like 45.3e-5794.26Show/hide
Query:  MGTMKLCLFLLL----VSPPFSFAFHETSDGSSPFDYSSQYSFFGGNSSEAITEDSRRQLFQYGFAYNREARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKK
        M TMKLCLFLLL    VSPPFSFAFHETSDGSS FDYSSQYSFFGG+SSEAITEDSRRQLFQYGFAYNREARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKK
Subjt:  MGTMKLCLFLLL----VSPPFSFAFHETSDGSSPFDYSSQYSFFGGNSSEAITEDSRRQLFQYGFAYNREARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKK

Query:  RRRINPYRRGCAAITGCARFTD
        RRRINPYRRGCAAITGCARFTD
Subjt:  RRRINPYRRGCAAITGCARFTD

A0A6J1JIT9 protein RALF-like 42.2e-4782.93Show/hide
Query:  MGTMKLCLFLLLV---SPPFSFAFHETSDGSSPFDYSSQYSFFGGNSS--EAITEDSRRQLFQYGFAYNREARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCK
        M TMK+CLFLLLV     P SFAFHETS GSS  D +S+YSFFGG SS  EA+TEDSRRQLF+YGFAYNREAR+RFLTYYALSKNNIPCGRRG SYYDCK
Subjt:  MGTMKLCLFLLLV---SPPFSFAFHETSDGSSPFDYSSQYSFFGGNSS--EAITEDSRRQLFQYGFAYNREARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCK

Query:  KRRRINPYRRGCAAITGCARFTD
        KRRRINPYRRGCAAITGCARFTD
Subjt:  KRRRINPYRRGCAAITGCARFTD

A0A6J1JL71 protein RALF-like 42.2e-4782.64Show/hide
Query:  MGTMKLCLFLLL---VSPPFSFAFHETSDGSSPFDYSSQYSFFGGNSSEAITEDSRRQLFQYGFAYNREARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKR
        M TMK+CLFLLL   V  PFS AFHETS  SS  D +S+YSFFGG+SSE++TEDSRRQLFQYGFAYN EAR+RFLTYYALSKNNIPCGRRG+SYYDCKKR
Subjt:  MGTMKLCLFLLL---VSPPFSFAFHETSDGSSPFDYSSQYSFFGGNSSEAITEDSRRQLFQYGFAYNREARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKR

Query:  RRINPYRRGCAAITGCARFTD
        RRINPYRRGCAAITGCARFTD
Subjt:  RRINPYRRGCAAITGCARFTD

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6NME6 Protein RALF-like 193.7e-1557.97Show/hide
Query:  TEDSRRQLFQYGFAYNREARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRRRINPYRRGCAAITGCARFT
        +E +RRQL          ARR +++Y AL KNN+PC RRG SYYDCKKR+R NPYRRGC+ IT C R T
Subjt:  TEDSRRQLFQYGFAYNREARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRRRINPYRRGCAAITGCARFT

Q945T0 Rapid alkalinization factor3.6e-1044.59Show/hide
Query:  GNSSEAITEDSRRQLFQYGFAYNRE--ARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRRRINPYRRGCAAITGC
        G+  E I E+     F+     NR   A +++++Y AL KN++PC RRG SYY+CK   + NPY RGC+AIT C
Subjt:  GNSSEAITEDSRRQLFQYGFAYNRE--ARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRRRINPYRRGCAAITGC

Q9FZA0 Protein RALF-like 48.3e-1558.82Show/hide
Query:  TEDSRRQLFQYGFAYNREARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRRRINPYRRGCAAITGCARF
        +E +RRQL +          RR++ Y AL KNN+PC RRG SYYDCKKRRR NPYRRGC+AIT C R+
Subjt:  TEDSRRQLFQYGFAYNREARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRRRINPYRRGCAAITGCARF

Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 231.6e-1057.14Show/hide
Query:  ARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRRRINPYRRGCAAITGCAR
        A RR+++Y AL +N IPC RRG SYY+C++  + NPY RGC+AIT C R
Subjt:  ARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRRRINPYRRGCAAITGCAR

Q9MA62 Protein RALF-like 226.1e-1034.65Show/hide
Query:  AFHETSDGSSPFDY-----SSQYSFFGGNSSEAITEDSRRQLFQYGFAYNREARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRRRINPYRRGCAAITGCA
        A   T D     D+     SS +S   G+ +E I E+   + F    +    A++++++Y A+ +N++PC RRG SYY+C++  + NPY RGC+ IT C 
Subjt:  AFHETSDGSSPFDY-----SSQYSFFGGNSSEAITEDSRRQLFQYGFAYNREARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRRRINPYRRGCAAITGCA

Query:  R
        R
Subjt:  R

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28270.1 ralf-like 45.9e-1658.82Show/hide
Query:  TEDSRRQLFQYGFAYNREARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRRRINPYRRGCAAITGCARF
        +E +RRQL +          RR++ Y AL KNN+PC RRG SYYDCKKRRR NPYRRGC+AIT C R+
Subjt:  TEDSRRQLFQYGFAYNREARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRRRINPYRRGCAAITGCARF

AT2G33775.1 ralf-like 192.6e-1657.97Show/hide
Query:  TEDSRRQLFQYGFAYNREARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRRRINPYRRGCAAITGCARFT
        +E +RRQL          ARR +++Y AL KNN+PC RRG SYYDCKKR+R NPYRRGC+ IT C R T
Subjt:  TEDSRRQLFQYGFAYNREARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRRRINPYRRGCAAITGCARFT

AT3G05490.1 ralf-like 224.4e-1134.65Show/hide
Query:  AFHETSDGSSPFDY-----SSQYSFFGGNSSEAITEDSRRQLFQYGFAYNREARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRRRINPYRRGCAAITGCA
        A   T D     D+     SS +S   G+ +E I E+   + F    +    A++++++Y A+ +N++PC RRG SYY+C++  + NPY RGC+ IT C 
Subjt:  AFHETSDGSSPFDY-----SSQYSFFGGNSSEAITEDSRRQLFQYGFAYNREARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRRRINPYRRGCAAITGCA

Query:  R
        R
Subjt:  R

AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 231.1e-1157.14Show/hide
Query:  ARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRRRINPYRRGCAAITGCAR
        A RR+++Y AL +N IPC RRG SYY+C++  + NPY RGC+AIT C R
Subjt:  ARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRRRINPYRRGCAAITGCAR

AT4G15800.1 ralf-like 331.4e-0933.33Show/hide
Query:  MGTMKLCLFLLLVSPPFSFAFHETSDGSSPFDYSSQYSFFGGNSSEAITEDSRRQLFQYGFAYNRE--ARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRR
        + T  + + + +++  F FA   TS  S   D+    S   G  +E     +  + F+     NR   A  ++++Y AL +N +PC RRG SYY+C++  
Subjt:  MGTMKLCLFLLLVSPPFSFAFHETSDGSSPFDYSSQYSFFGGNSSEAITEDSRRQLFQYGFAYNRE--ARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRR

Query:  RINPYRRGCAAITGCAR
        + NPY RGC+AIT C R
Subjt:  RINPYRRGCAAITGCAR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGAACAATGAAGCTCTGCCTCTTTCTCCTTCTCGTTTCTCCTCCATTCTCCTTTGCTTTCCATGAAACCTCTGACGGTTCATCCCCTTTCGACTATAGTTCTCAATA
CAGTTTTTTTGGTGGAAACTCTTCGGAAGCGATCACGGAAGATAGTCGGCGACAACTTTTCCAATATGGATTTGCCTATAATAGAGAAGCTCGCAGGAGGTTTTTGACCT
ACTATGCACTTAGTAAGAATAATATCCCTTGTGGCCGTCGTGGTACCTCCTACTATGATTGCAAGAAGCGTAGAAGGATCAATCCTTATCGTCGCGGTTGTGCCGCCATC
ACTGGATGTGCTCGATTTACAGATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGAACAATGAAGCTCTGCCTCTTTCTCCTTCTCGTTTCTCCTCCATTCTCCTTTGCTTTCCATGAAACCTCTGACGGTTCATCCCCTTTCGACTATAGTTCTCAATA
CAGTTTTTTTGGTGGAAACTCTTCGGAAGCGATCACGGAAGATAGTCGGCGACAACTTTTCCAATATGGATTTGCCTATAATAGAGAAGCTCGCAGGAGGTTTTTGACCT
ACTATGCACTTAGTAAGAATAATATCCCTTGTGGCCGTCGTGGTACCTCCTACTATGATTGCAAGAAGCGTAGAAGGATCAATCCTTATCGTCGCGGTTGTGCCGCCATC
ACTGGATGTGCTCGATTTACAGATTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGTMKLCLFLLLVSPPFSFAFHETSDGSSPFDYSSQYSFFGGNSSEAITEDSRRQLFQYGFAYNREARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRRRINPYRRGCAAI
TGCARFTD