; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg26906 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg26906
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionserine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X2
Genome locationCarg_Chr04:7633257..7634923
RNA-Seq ExpressionCarg26906
SyntenyCarg26906
Gene Ontology termsGO:0003723 - RNA binding (molecular function)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000504 - RNA recognition motif domain
IPR001878 - Zinc finger, CCHC-type
IPR012677 - Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily
IPR035979 - RNA-binding domain superfamily
IPR036875 - Zinc finger, CCHC-type superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6601030.1 Serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.3e-16297.48Show/hide
Query:  RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIE
        RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIE
Subjt:  RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIE

Query:  KNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPHRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEEARHSLSPG
        KNCQNSPKKLKRGSYSRSPSP RGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEEARHSLSPG
Subjt:  KNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPHRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEEARHSLSPG

Query:  NRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRGRSMSPRGRSRSPR-------DRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDEGEDFNGGGSRNYRREENGYSRSPSPLPREEAS
        NRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRGRSMSPRGRSRSPR       DRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDEGEDFNGGGSRNYRREENGYSRSPSPLPREEAS
Subjt:  NRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRGRSMSPRGRSRSPR-------DRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDEGEDFNGGGSRNYRREENGYSRSPSPLPREEAS

Query:  PVNDEDNNGSPRGGSESA
        PVNDEDNNGSPRGGSESA
Subjt:  PVNDEDNNGSPRGGSESA

KAG7031835.1 Serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.3e-172100Show/hide
Query:  MMALPVSGTNLRRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKN
        MMALPVSGTNLRRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKN
Subjt:  MMALPVSGTNLRRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKN

Query:  KCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPHRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDER
        KCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPHRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDER
Subjt:  KCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPHRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDER

Query:  SPEEARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRGRSMSPRGRSRSPRDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDEGEDFNGGGSRNYRREENGYSRSPSPLP
        SPEEARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRGRSMSPRGRSRSPRDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDEGEDFNGGGSRNYRREENGYSRSPSPLP
Subjt:  SPEEARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRGRSMSPRGRSRSPRDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDEGEDFNGGGSRNYRREENGYSRSPSPLP

Query:  REEASPVNDEDNNGSPRGGSESA
        REEASPVNDEDNNGSPRGGSESA
Subjt:  REEASPVNDEDNNGSPRGGSESA

XP_022956472.1 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X2 [Cucurbita moschata]5.0e-16087.02Show/hide
Query:  MMALPVSGTNLRRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKN
        MMALPVSGTNLRRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKN
Subjt:  MMALPVSGTNLRRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKN

Query:  KCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPHRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDER
        KCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSP RGRSRSRSYSRG SYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRS TPDER
Subjt:  KCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPHRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDER

Query:  SPEEARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRG-----------RSMSPRGRSRSPR----------------------------DRSRSPIDRSR
        SPEEARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRG           RS SPRGRSRSPR                            DRSRSP+DRSR
Subjt:  SPEEARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRG-----------RSMSPRGRSRSPR----------------------------DRSRSPIDRSR

Query:  SPIDRSRSPMDEGEDFNGGGSRNYRREENGYSRSPSPLPREEASPVNDEDNNGSPRGGSESA
        SP+DRSRSPMDEGEDFNGGGS+NYRREENGYSRSPSPLPREEASPVNDEDNNGSPRG SESA
Subjt:  SPIDRSRSPMDEGEDFNGGGSRNYRREENGYSRSPSPLPREEASPVNDEDNNGSPRGGSESA

XP_022984404.1 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X3 [Cucurbita maxima]7.2e-15993.69Show/hide
Query:  MMALPVSGTNLRRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKN
        MMALPVSGTNLRRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRE LGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKN
Subjt:  MMALPVSGTNLRRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKN

Query:  KCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPHRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDER
        KCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSP  GRSRSRSYSRG SYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDER
Subjt:  KCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPHRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDER

Query:  SPEEARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSPR--------GRSRSRSPRGR-SMSPRGRSRSPRDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDEG-EDFNGGGSRNYRREEN
        SPEEA+HSLSPGNR SPRGGRSSRSPR        GRSRS SPRGR S+SPRGRSRSPR RSRSP  RSRSPIDRSRSPMDEG EDFNGGGSRNYRREEN
Subjt:  SPEEARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSPR--------GRSRSRSPRGR-SMSPRGRSRSPRDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDEG-EDFNGGGSRNYRREEN

Query:  GYSRSPSPLPREEASPVNDEDNNGSPRGGSESA
        GYSRSPSPLPREEASPVNDEDNNGSPRGGSESA
Subjt:  GYSRSPSPLPREEASPVNDEDNNGSPRGGSESA

XP_023540002.1 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X3 [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.7e-16187.78Show/hide
Query:  MMALPVSGTNLRRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKN
        MMALPVSGTNLRRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKN
Subjt:  MMALPVSGTNLRRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKN

Query:  KCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPHRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDER
        KCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSP RGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDER
Subjt:  KCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPHRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDER

Query:  SPEEARHSLSPGNRDSPRG---------------GRSSRSPRGRS----------------------RSRSPRGRSMSPRGRSRSPRDRSRSPIDRSRSP
        SPEEARHSLSPG RDSPRG               GRSSRSPRGRS                       SRSPRGRS+SPRGRSRSP DRSRSP+DRSRSP
Subjt:  SPEEARHSLSPGNRDSPRG---------------GRSSRSPRGRS----------------------RSRSPRGRSMSPRGRSRSPRDRSRSPIDRSRSP

Query:  IDRSRSPMDEGEDFNGGGSRNYRREENGYSRSPSPLPREEASPVNDEDNNGSPRGGSESA
        +DRSRSPMDEGEDFNGGGSRNYRREENGYSRSPSPLPREEASPVNDEDNNGSPRGGSESA
Subjt:  IDRSRSPMDEGEDFNGGGSRNYRREENGYSRSPSPLPREEASPVNDEDNNGSPRGGSESA

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1GWF1 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X22.4e-16087.02Show/hide
Query:  MMALPVSGTNLRRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKN
        MMALPVSGTNLRRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKN
Subjt:  MMALPVSGTNLRRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKN

Query:  KCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPHRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDER
        KCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSP RGRSRSRSYSRG SYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRS TPDER
Subjt:  KCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPHRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDER

Query:  SPEEARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRG-----------RSMSPRGRSRSPR----------------------------DRSRSPIDRSR
        SPEEARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRG           RS SPRGRSRSPR                            DRSRSP+DRSR
Subjt:  SPEEARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRG-----------RSMSPRGRSRSPR----------------------------DRSRSPIDRSR

Query:  SPIDRSRSPMDEGEDFNGGGSRNYRREENGYSRSPSPLPREEASPVNDEDNNGSPRGGSESA
        SP+DRSRSPMDEGEDFNGGGS+NYRREENGYSRSPSPLPREEASPVNDEDNNGSPRG SESA
Subjt:  SPIDRSRSPMDEGEDFNGGGSRNYRREENGYSRSPSPLPREEASPVNDEDNNGSPRGGSESA

A0A6J1GWY2 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X31.4e-15595.87Show/hide
Query:  RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIE
        RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIE
Subjt:  RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIE

Query:  KNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPHRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEEARHSLSPG
        KNCQNSPKKLKRGSYSRSPSP RGRSRSRSYSRG SYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRS TPDERSPEEARHSLSPG
Subjt:  KNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPHRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEEARHSLSPG

Query:  NRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRG--RSMSPRG--RSRSPRDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDEGEDFNGGGSRNYRREENGYSRSPSPLPREEASPVN
        NRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRG  RS SPRG  RSRSPR RSRSP  RSRSPIDRSRSPMDEGEDFNGGGS+NYRREENGYSRSPSPLPREEASPVN
Subjt:  NRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRG--RSMSPRG--RSRSPRDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDEGEDFNGGGSRNYRREENGYSRSPSPLPREEASPVN

Query:  DEDNNGSPRGGSESA
        DEDNNGSPRG SESA
Subjt:  DEDNNGSPRGGSESA

A0A6J1GZ46 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X12.9e-15386.57Show/hide
Query:  RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIE
        RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIE
Subjt:  RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIE

Query:  KNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPHRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEEARHSLSPG
        KNCQNSPKKLKRGSYSRSPSP RGRSRSRSYSRG SYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRS TPDERSPEEARHSLSPG
Subjt:  KNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPHRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEEARHSLSPG

Query:  NRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRG-----------RSMSPRGRSRSPR----------------------------DRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDE
        NRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRG           RS SPRGRSRSPR                            DRSRSP+DRSRSP+DRSRSPMDE
Subjt:  NRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRG-----------RSMSPRGRSRSPR----------------------------DRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDE

Query:  GEDFNGGGSRNYRREENGYSRSPSPLPREEASPVNDEDNNGSPRGGSESA
        GEDFNGGGS+NYRREENGYSRSPSPLPREEASPVNDEDNNGSPRG SESA
Subjt:  GEDFNGGGSRNYRREENGYSRSPSPLPREEASPVNDEDNNGSPRGGSESA

A0A6J1J216 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X14.1e-15293.46Show/hide
Query:  RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIE
        RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRE LGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIE
Subjt:  RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIE

Query:  KNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPHRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEEARHSLSPG
        KNCQNSPKKLKRGSYSRSPSP  GRSRSRSYSRG SYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEEA+HSLSPG
Subjt:  KNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPHRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEEARHSLSPG

Query:  NRDSPRGGRSSRSPR--------GRSRSRSPRGR-SMSPRGRSRSPRDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDEG-EDFNGGGSRNYRREENGYSRSPSPLPRE
        NR SPRGGRSSRSPR        GRSRS SPRGR S+SPRGRSRSPR RSRSP  RSRSPIDRSRSPMDEG EDFNGGGSRNYRREENGYSRSPSPLPRE
Subjt:  NRDSPRGGRSSRSPR--------GRSRSRSPRGR-SMSPRGRSRSPRDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDEG-EDFNGGGSRNYRREENGYSRSPSPLPRE

Query:  EASPVNDEDNNGSPRGGSESA
        EASPVNDEDNNGSPRGGSESA
Subjt:  EASPVNDEDNNGSPRGGSESA

A0A6J1JAE7 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X33.5e-15993.69Show/hide
Query:  MMALPVSGTNLRRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKN
        MMALPVSGTNLRRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRE LGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKN
Subjt:  MMALPVSGTNLRRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKN

Query:  KCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPHRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDER
        KCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSP  GRSRSRSYSRG SYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDER
Subjt:  KCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPHRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDER

Query:  SPEEARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSPR--------GRSRSRSPRGR-SMSPRGRSRSPRDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDEG-EDFNGGGSRNYRREEN
        SPEEA+HSLSPGNR SPRGGRSSRSPR        GRSRS SPRGR S+SPRGRSRSPR RSRSP  RSRSPIDRSRSPMDEG EDFNGGGSRNYRREEN
Subjt:  SPEEARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSPR--------GRSRSRSPRGR-SMSPRGRSRSPRDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDEG-EDFNGGGSRNYRREEN

Query:  GYSRSPSPLPREEASPVNDEDNNGSPRGGSESA
        GYSRSPSPLPREEASPVNDEDNNGSPRGGSESA
Subjt:  GYSRSPSPLPREEASPVNDEDNNGSPRGGSESA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q16629 Serine/arginine-rich splicing factor 78.1e-1239.57Show/hide
Query:  YAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKL
        +AFVEF DPRDA+DA   L+G+ + GSR+ VE++ G+PR     R    R P               AR  +  D  ++CY CGE+GH   +C       
Subjt:  YAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKL

Query:  KRGSYSRSPSPHRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEEARHSLSPG-NRDSPRGGR
            YSR     R RSRS S SRGR YSRSRS  +  RS   S +RSRS          SL    S +++RS +    S + +R+  SP  +R   R   
Subjt:  KRGSYSRSPSPHRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEEARHSLSPG-NRDSPRGGR

Query:  SSRSPRGRSRSRSPRGRSMSPRGRSRSPRDRSRSP
          RS R +SRS SP+ RS SP G   SPR RS SP
Subjt:  SSRSPRGRSRSRSPRGRSMSPRGRSRSPRDRSRSP

Q3T106 Serine/arginine-rich splicing factor 71.1e-1339.46Show/hide
Query:  YAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQ--NSPK
        +AFVEF DPRDA+DA   L+G+ + GSR+ VE++ G+PR     R    R      RC+ CG  GH+A DC     + +  R   R H     +  +  +
Subjt:  YAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQ--NSPK

Query:  KLKRGSYSRSPSPHRGRSRSRSYSRGRSYSRSRS-PVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTP-DERSPE
           RG  SRS SP R RS S   SR  S  RSRS  +K  RS  RS  RSRS     S +  S SP P ++   S +P    SPE
Subjt:  KLKRGSYSRSPSPHRGRSRSRSYSRGRSYSRSRS-PVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTP-DERSPE

Q8BL97 Serine/arginine-rich splicing factor 73.3e-1339.91Show/hide
Query:  YAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKL
        +AFVEF DPRDA+DA   L+G+ + GSR+ VE++ G+PR     R    R P               AR  +  D  ++CY CGE+GH   +C    ++ 
Subjt:  YAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKL

Query:  KRGSYSRSPSPHRGR--SRSRSYSRGRSYSRSRSP-----VKRERSLERSDKRSRS----------PRGRSSPKRHSLS-PPPSKAMKRSPTPD-ERSPE
        +  S SRS S  RGR  SRSRS SRGR  SRS SP     V   RS   S +RSRS           R RS  +  S+S P  S++  RSP+P   RSP 
Subjt:  KRGSYSRSPSPHRGR--SRSRSYSRGRSYSRSRSP-----VKRERSLERSDKRSRS----------PRGRSSPKRHSLS-PPPSKAMKRSPTPD-ERSPE

Query:  EARH-SLSPGNRD
         + H S SP   D
Subjt:  EARH-SLSPGNRD

Q8VYA5 Serine/arginine-rich splicing factor RS2Z334.5e-5559Show/hide
Query:  RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHI
        RVRDVDMKRDYAFVEF DPRDADDAR+ L+GRD  GSRI VE ++G PR   GSR++  RG PPG GRCFNCG+DGHWARDC AGDWKNKCYRCGERGHI
Subjt:  RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHI

Query:  EKNCQNSPKKLKR-GSYSRSP----SPHRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPV-KRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSPT-PDERSPEE
        E+NC+NSPKKL+R GSYSRSP    SP R RS SRS SR RSYSRSRSPV +RERS+E   +RSRSP+        SLSP   +A  RSP   DE SP+ 
Subjt:  EKNCQNSPKKLKR-GSYSRSP----SPHRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPV-KRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSPT-PDERSPEE

Query:  ARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSPR-GRSRSRSPRGRSMSP-RGRSRSPRDRSRSPIDRSRSP
           S  P    SP+  +   S R G S   + R   +SP  G         RSP+D    P
Subjt:  ARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSPR-GRSRSRSPRGRSMSP-RGRSRSPRDRSRSPIDRSRSP

Q9FYB7 Serine/arginine-rich splicing factor RS2Z321.3e-5762.29Show/hide
Query:  RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHI
        RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARY L+GRD  GSRI VE ++G PR   GSR+   RG PPG+GRCFNCG+DGHWARDC AGDWKNKCYRCGERGHI
Subjt:  RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHI

Query:  EKNCQNSP---KKLKRGSYSRSP----SPHRGR--SRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRERSLE---RSDK---RSRSPRGRS---SPKRHSLSPPPSKAMKR
        E+NC+NSP   K  + GSYSRSP    SP R R  SRSRSYSRGRSYSRSRSPV+RE+S+E   RS K   RS SP+GR    SP R  +   P +    
Subjt:  EKNCQNSP---KKLKRGSYSRSP----SPHRGR--SRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRERSLE---RSDK---RSRSPRGRS---SPKRHSLSPPPSKAMKR

Query:  SPTPDERSPEEARHSLSP--GNRDSPRG-GRSSRSP
          +P E      R+S SP  G  +SP G     RSP
Subjt:  SPTPDERSPEEARHSLSP--GNRDSPRG-GRSSRSP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G37340.1 arginine/serine-rich zinc knuckle-containing protein 333.2e-5659Show/hide
Query:  RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHI
        RVRDVDMKRDYAFVEF DPRDADDAR+ L+GRD  GSRI VE ++G PR   GSR++  RG PPG GRCFNCG+DGHWARDC AGDWKNKCYRCGERGHI
Subjt:  RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHI

Query:  EKNCQNSPKKLKR-GSYSRSP----SPHRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPV-KRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSPT-PDERSPEE
        E+NC+NSPKKL+R GSYSRSP    SP R RS SRS SR RSYSRSRSPV +RERS+E   +RSRSP+        SLSP   +A  RSP   DE SP+ 
Subjt:  EKNCQNSPKKLKR-GSYSRSP----SPHRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPV-KRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSPT-PDERSPEE

Query:  ARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSPR-GRSRSRSPRGRSMSP-RGRSRSPRDRSRSPIDRSRSP
           S  P    SP+  +   S R G S   + R   +SP  G         RSP+D    P
Subjt:  ARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSPR-GRSRSRSPRGRSMSP-RGRSRSPRDRSRSPIDRSRSP

AT2G37340.2 arginine/serine-rich zinc knuckle-containing protein 337.2e-4856.68Show/hide
Query:  EFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKR-
        EF DPRDADDAR+ L+GRD  GSRI VE ++G PR   GSR++  RG PPG GRCFNCG+DGHWARDC AGDWKNKCYRCGERGHIE+NC+NSPKKL+R 
Subjt:  EFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKR-

Query:  GSYSRSP----SPHRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPV-KRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSPT-PDERSPEEARHSLSPGNRDSPR
        GSYSRSP    SP R RS SRS SR RSYSRSRSPV +RERS+E   +RSRSP+        SLSP   +A  RSP   DE SP+    S  P    SP+
Subjt:  GSYSRSP----SPHRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPV-KRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSPT-PDERSPEEARHSLSPGNRDSPR

Query:  GGRSSRSPR-GRSRSRSPRGRSMSP-RGRSRSPRDRSRSPIDRSRSP
          +   S R G S   + R   +SP  G         RSP+D    P
Subjt:  GGRSSRSPR-GRSRSRSPRGRSMSP-RGRSRSPRDRSRSPIDRSRSP

AT2G37340.3 arginine/serine-rich zinc knuckle-containing protein 337.4e-5358.04Show/hide
Query:  MKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQN
        MKRDYAFVEF DPRDADDAR+ L+GRD  GSRI VE ++G PR   GSR++  RG PPG GRCFNCG+DGHWARDC AGDWKNKCYRCGERGHIE+NC+N
Subjt:  MKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQN

Query:  SPKKLKR-GSYSRSP----SPHRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPV-KRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSPT-PDERSPEEARHSLS
        SPKKL+R GSYSRSP    SP R RS SRS SR RSYSRSRSPV +RERS+E   +RSRSP+        SLSP   +A  RSP   DE SP+    S  
Subjt:  SPKKLKR-GSYSRSP----SPHRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPV-KRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSPT-PDERSPEEARHSLS

Query:  PGNRDSPRGGRSSRSPR-GRSRSRSPRGRSMSP-RGRSRSPRDRSRSPIDRSRSP
        P    SP+  +   S R G S   + R   +SP  G         RSP+D    P
Subjt:  PGNRDSPRGGRSSRSPR-GRSRSRSPRGRSMSP-RGRSRSPRDRSRSPIDRSRSP

AT3G53500.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein with retrovirus zinc finger-like domain2.1e-5561.3Show/hide
Query:  MKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQN
        MKRDYAFVEFSDPRDADDARY L+GRD  GSRI VE ++G PR   GSR+   RG PPG+GRCFNCG+DGHWARDC AGDWKNKCYRCGERGHIE+NC+N
Subjt:  MKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQN

Query:  SP---KKLKRGSYSRSP----SPHRGR--SRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRERSLE---RSDK---RSRSPRGRS---SPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDE
        SP   K  + GSYSRSP    SP R R  SRSRSYSRGRSYSRSRSPV+RE+S+E   RS K   RS SP+GR    SP R  +   P +      +P E
Subjt:  SP---KKLKRGSYSRSP----SPHRGR--SRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRERSLE---RSDK---RSRSPRGRS---SPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDE

Query:  RSPEEARHSLSP--GNRDSPRG-GRSSRSP
              R+S SP  G  +SP G     RSP
Subjt:  RSPEEARHSLSP--GNRDSPRG-GRSSRSP

AT3G53500.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein with retrovirus zinc finger-like domain9.0e-5962.29Show/hide
Query:  RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHI
        RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARY L+GRD  GSRI VE ++G PR   GSR+   RG PPG+GRCFNCG+DGHWARDC AGDWKNKCYRCGERGHI
Subjt:  RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHI

Query:  EKNCQNSP---KKLKRGSYSRSP----SPHRGR--SRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRERSLE---RSDK---RSRSPRGRS---SPKRHSLSPPPSKAMKR
        E+NC+NSP   K  + GSYSRSP    SP R R  SRSRSYSRGRSYSRSRSPV+RE+S+E   RS K   RS SP+GR    SP R  +   P +    
Subjt:  EKNCQNSP---KKLKRGSYSRSP----SPHRGR--SRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRERSLE---RSDK---RSRSPRGRS---SPKRHSLSPPPSKAMKR

Query:  SPTPDERSPEEARHSLSP--GNRDSPRG-GRSSRSP
          +P E      R+S SP  G  +SP G     RSP
Subjt:  SPTPDERSPEEARHSLSP--GNRDSPRG-GRSSRSP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATGGCCTTACCTGTTTCTGGAACCAATTTGCGCAGAGTACGCGATGTGGATATGAAGCGAGACTATGCATTTGTTGAGTTTAGTGATCCCCGAGATGCTGACGATGC
AAGATATAGTTTAAATGGGAGGGATGTTCAAGGAAGTAGAATCATTGTGGAAATAGCTAAAGGGGTACCCCGTGGTCCTGGTGGATCCCGTGAATATCTTGGTAGAGGCC
CTCCTGGAACTGGGCGATGTTTTAACTGTGGGATTGATGGCCACTGGGCTAGAGATTGCAAGGCTGGAGACTGGAAAAATAAGTGCTATCGCTGTGGTGAACGGGGTCAC
ATAGAGAAGAATTGCCAGAACAGTCCTAAGAAATTGAAACGTGGAAGTTACTCACGCTCACCCAGTCCTCACCGTGGTAGAAGCCGCAGTCGAAGTTACAGCAGAGGTCG
TAGCTACAGTCGTTCTAGATCACCAGTAAAAAGAGAGAGAAGCCTTGAACGATCAGATAAAAGATCAAGGAGTCCGAGAGGCAGGTCAAGCCCAAAGAGGCACAGTTTGT
CACCTCCTCCTTCGAAAGCTATGAAACGTAGCCCCACACCTGATGAGAGGAGTCCAGAAGAAGCAAGACACAGTCTGTCCCCTGGGAATCGCGACAGTCCAAGAGGAGGT
AGGAGCAGCAGGAGTCCGAGAGGTAGGAGCAGGAGCAGAAGTCCAAGAGGTAGGAGCATGAGTCCAAGAGGTAGGAGCAGAAGTCCCAGAGATAGAAGCAGGAGTCCAAT
AGATAGGAGCAGGAGTCCAATAGATAGGAGCAGGAGTCCAATGGATGAAGGCGAGGACTTCAATGGTGGTGGAAGTAGGAATTATCGGAGGGAAGAAAATGGCTACAGTC
GCAGCCCCAGTCCATTGCCCAGAGAAGAAGCGAGTCCTGTAAACGATGAAGATAATAATGGTTCTCCAAGGGGGGGCAGCGAGTCTGCTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGATGGCCTTACCTGTTTCTGGAACCAATTTGCGCAGAGTACGCGATGTGGATATGAAGCGAGACTATGCATTTGTTGAGTTTAGTGATCCCCGAGATGCTGACGATGC
AAGATATAGTTTAAATGGGAGGGATGTTCAAGGAAGTAGAATCATTGTGGAAATAGCTAAAGGGGTACCCCGTGGTCCTGGTGGATCCCGTGAATATCTTGGTAGAGGCC
CTCCTGGAACTGGGCGATGTTTTAACTGTGGGATTGATGGCCACTGGGCTAGAGATTGCAAGGCTGGAGACTGGAAAAATAAGTGCTATCGCTGTGGTGAACGGGGTCAC
ATAGAGAAGAATTGCCAGAACAGTCCTAAGAAATTGAAACGTGGAAGTTACTCACGCTCACCCAGTCCTCACCGTGGTAGAAGCCGCAGTCGAAGTTACAGCAGAGGTCG
TAGCTACAGTCGTTCTAGATCACCAGTAAAAAGAGAGAGAAGCCTTGAACGATCAGATAAAAGATCAAGGAGTCCGAGAGGCAGGTCAAGCCCAAAGAGGCACAGTTTGT
CACCTCCTCCTTCGAAAGCTATGAAACGTAGCCCCACACCTGATGAGAGGAGTCCAGAAGAAGCAAGACACAGTCTGTCCCCTGGGAATCGCGACAGTCCAAGAGGAGGT
AGGAGCAGCAGGAGTCCGAGAGGTAGGAGCAGGAGCAGAAGTCCAAGAGGTAGGAGCATGAGTCCAAGAGGTAGGAGCAGAAGTCCCAGAGATAGAAGCAGGAGTCCAAT
AGATAGGAGCAGGAGTCCAATAGATAGGAGCAGGAGTCCAATGGATGAAGGCGAGGACTTCAATGGTGGTGGAAGTAGGAATTATCGGAGGGAAGAAAATGGCTACAGTC
GCAGCCCCAGTCCATTGCCCAGAGAAGAAGCGAGTCCTGTAAACGATGAAGATAATAATGGTTCTCCAAGGGGGGGCAGCGAGTCTGCTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MMALPVSGTNLRRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGH
IEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPHRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEEARHSLSPGNRDSPRGG
RSSRSPRGRSRSRSPRGRSMSPRGRSRSPRDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDEGEDFNGGGSRNYRREENGYSRSPSPLPREEASPVNDEDNNGSPRGGSESA