; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg26960 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg26960
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
Descriptionhistone-lysine N-methyltransferase SETD1B-like
Genome locationCarg_Chr13:73576..74091
RNA-Seq ExpressionCarg26960
SyntenyCarg26960
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR007789 - Protein of unknown function DUF688


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6583323.1 hypothetical protein SDJN03_19255, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.4e-8999.42Show/hide
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KAG7019099.1 hypothetical protein SDJN02_18057, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]6.4e-90100Show/hide
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XP_022964745.1 uncharacterized protein LOC111464733 [Cucurbita moschata]1.7e-8797.08Show/hide
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XP_023519368.1 uncharacterized protein LOC111782803 [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.7e-8796.49Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LYC9 Uncharacterized protein5.2e-4563.54Show/hide
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        S LQP SP    SSSSSSS+ ER    SPRRLSFDSRVDDD+   NE+  +ESPVSTL FG  +DKGCYPKLVKVFTR SK
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A0A1S3C5A7 uncharacterized protein At4g009505.5e-4763.54Show/hide
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        +LQP SP    SSSSSS + ER   GSPRRLSFDSRVDD   D+ NE+  VESPVSTL FG G++KGCYP LVKVFTR SK
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A0A5D3BF70 NADPH oxidase activator5.5e-4763.54Show/hide
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A0A6J1HLP7 uncharacterized protein LOC1114647338.5e-8897.08Show/hide
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A0A6J1I3P2 uncharacterized protein LOC1114693819.4e-8797.09Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G06930.1 unknown protein9.4e-1540.94Show/hide
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        VE DY+ G SA+VPF+WES+PGTP+                 NFP +    +PLTPPPSYF  +P+S   ++  KT       N +F  L  K    P S
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        P S  SSSSSSSS     P SP R S     D  N       ES  S+L +G  + K  GCY  LVKV  R
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AT2G40475.1 unknown protein1.7e-1138.52Show/hide
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        Y+ G  ASVPF WE+ PGTPK         L PLTPPPSY+S++ +S   L+ ++T  +  F+  +  +   + S    S  S  SSS SSSS       
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         PR+    SR      +EEE V  SP STL +  G
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AT3G56260.2 unknown protein1.8e-1038.22Show/hide
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        R  DD  I EE       AS+PF WES PGTPK +   + +   PLTPPPSY+S+   S     S      + FL+ ++F  L  S   S +  S     
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        SS+SSSSS     P S  +R+S D  S +   N  E+E   SP STL   +G   GC
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AT5G01790.1 unknown protein2.1e-0657.14Show/hide
Query:  YHTGVSASVPFQWESEPGTPKANFPENGAFLSPLTPPPSYFS
        Y+ G + +VPF+WES PGTPK    E    L PLTPPPS+FS
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAATAAGCTGAAGAAGGTGAGGACAAGAGACGATATGTGGATTGTGGAAGAAGATTACCACACAGGAGTATCAGCCTCGGTGCCATTCCAGTGGGAGTCAGAGCCAGG
CACTCCCAAGGCCAATTTCCCTGAAAATGGGGCCTTCCTCTCTCCTCTCACGCCCCCACCTTCCTATTTCTCCACCAATCCTAACTCCCCCCTCGGCCTTAACTCTTCTA
AGACCTTTCATAGAGCCAGTTTCCTCAACAATGTCTTCAGAAAGCTTTCTATGAAGGCCAGTCTGCAGCCTCGGTCGCCCGGCTCTATGTTGTCATCTTCGTCTTCGAGT
TCTAGCAGGGAAAGAGGGACACCTGGAAGCCCGAGGAGATTATCATTTGATTCGAGGGTAGACGATGACAACGGCAACGAAGAGGAGACTGTTGAATCACCTGTTTCTAC
TTTGTCCTTTGGACATGGAAATGATAAAGGATGCTACCCAAAGTTGGTTAAGGTATTCACTAGAGATTCTAAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAATAAGCTGAAGAAGGTGAGGACAAGAGACGATATGTGGATTGTGGAAGAAGATTACCACACAGGAGTATCAGCCTCGGTGCCATTCCAGTGGGAGTCAGAGCCAGG
CACTCCCAAGGCCAATTTCCCTGAAAATGGGGCCTTCCTCTCTCCTCTCACGCCCCCACCTTCCTATTTCTCCACCAATCCTAACTCCCCCCTCGGCCTTAACTCTTCTA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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