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Carg27269 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg27269
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionAuxin efflux carrier component
Genome locationCarg_Chr04:16357712..16359900
RNA-Seq ExpressionCarg27269
SyntenyCarg27269
Gene Ontology termsGO:0009926 - auxin polar transport (biological process)
GO:0010252 - auxin homeostasis (biological process)
GO:0010315 - auxin efflux (biological process)
GO:0055085 - transmembrane transport (biological process)
GO:0005783 - endoplasmic reticulum (cellular component)
GO:0005886 - plasma membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0010329 - auxin efflux transmembrane transporter activity (molecular function)
InterPro domainsIPR004776 - Membrane transport protein


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6601835.1 Auxin efflux carrier component 3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.1e-43100Show/hide
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KAG7032541.1 Auxin efflux carrier component 4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.3e-51100Show/hide
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XP_028077206.1 auxin efflux carrier component 3-like isoform X3 [Camellia sinensis]3.8e-4688.5Show/hide
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A0A6J1GLX3 Auxin efflux carrier component2.5e-43100Show/hide
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A0A6J1JNU5 Auxin efflux carrier component2.5e-43100Show/hide
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A0A6J1JQT9 Auxin efflux carrier component2.5e-43100Show/hide
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A0A6J1K2E3 Auxin efflux carrier component7.9e-4297Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q5VP70 Auxin efflux carrier component 3a1.3e-3886Show/hide
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Q67UL3 Probable auxin efflux carrier component 1c2.3e-3883Show/hide
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Q8RWZ6 Auxin efflux carrier component 41.2e-3983Show/hide
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Q940Y5 Auxin efflux carrier component 71.9e-4086Show/hide
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Q9S7Z8 Auxin efflux carrier component 32.2e-4188Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G23080.1 Auxin efflux carrier family protein1.3e-4186Show/hide
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AT1G23080.3 Auxin efflux carrier family protein1.3e-4186Show/hide
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AT1G70940.1 Auxin efflux carrier family protein1.6e-4288Show/hide
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AT2G01420.1 Auxin efflux carrier family protein8.6e-4183Show/hide
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AT2G01420.2 Auxin efflux carrier family protein8.6e-4183Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCTCGTCGCTGATCATCCACAAAACGGTGAAAACAAAGGTATTTTTATGGGACTACAACCAAAGATGATAGCATGTGGGAACTCTGTTGCTGTTTTTTCCATGGCCAT
CAGATTCCTAACTGGGCCTGCTGTCATGGCCATCGCTTCCTTTGCCATCGGCTTACGTGGAACTCTCCTCCGTGTCGCCATTGTTCAGGCGGCATTGCCTCAAGGAATTG
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CTGGGTCTGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCTCGTCGCTGATCATCCACAAAACGGTGAAAACAAAGGTATTTTTATGGGACTACAACCAAAGATGATAGCATGTGGGAACTCTGTTGCTGTTTTTTCCATGGCCAT
CAGATTCCTAACTGGGCCTGCTGTCATGGCCATCGCTTCCTTTGCCATCGGCTTACGTGGAACTCTCCTCCGTGTCGCCATTGTTCAGGCGGCATTGCCTCAAGGAATTG
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CTGGGTCTGTAAACTGGTTTCAACTTGGAATGAATTTCTTTCATATTTCTTAATGGGTTTGAGATGAAGAAGAAGATGATAGAATATATAGAGAAAAAGTTTGACAAAAG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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LGL