; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg27397 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg27397
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionUBA domain-containing protein
Genome locationCarg_Chr14:7459715..7471441
RNA-Seq ExpressionCarg27397
SyntenyCarg27397
Gene Ontology termsGO:0006508 - proteolysis (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0004252 - serine-type endopeptidase activity (molecular function)
GO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR009060 - UBA-like superfamily
IPR015940 - Ubiquitin-associated domain
IPR022764 - Peptidase S54, rhomboid domain
IPR035952 - Rhomboid-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6581669.1 Rhomboid-like protein 20, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.0e-15699.66Show/hide
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KAG7018158.1 Rhomboid-like protein 20 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.6e-157100Show/hide
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XP_022930600.1 rhomboid-like protein 20 [Cucurbita moschata]6.7e-15699.31Show/hide
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XP_023516629.1 rhomboid-like protein 20 [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.9e-15699.31Show/hide
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A0A1S3CMQ9 rhomboid-like protein 202.3e-14692.78Show/hide
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A0A5D3D5B1 Rhomboid-like protein 202.3e-14692.78Show/hide
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A0A6J1DN01 rhomboid-like protein 204.0e-14692.47Show/hide
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A0A6J1IRZ2 rhomboid-like protein 201.8e-15497.94Show/hide
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Q4R910 Ubiquitin-associated domain-containing protein 24.0e-1825.95Show/hide
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        G SG   AP+++S ++  +  ++   +     +    Y    VK   +IW+L+          +      L+Y FR+FER+ GS K++ F+L S + S L
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        F+ L +  ++      AA+ + SG    +FA FVPF+  IP     ++ G +  ++K+ IY+ GLQL  S    W    +  I G+++G  Y   +F + 
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        +    P +++ FF     P  S+  P +        T D+ R      + RQ+                                        +S P  P
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           E  E+ +A L+ MGF R  A +AL  + ND+N+ATN LL+
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Q5ZJQ8 Ubiquitin-associated domain-containing protein 22.1e-1926.98Show/hide
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        G +G   AP+++S ++  +  +I   +  +  +   +Y    +K   +IW+LV          +      L+Y FR+FER+ GS K+S F+L +   S L
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        F++L +   +       N + SG  G +FA FVPF+  IP     +V G    ++K+ +Y+ GLQLL S     IL  + G+++G  Y  ++  + +   
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Query:  FPEFVSSFFLRFSLPSAGNPPAAPTRDVRGNMPSFV-----------GRQV---------------------ERSHPPV------------------PTA
         P +V+  F     P   +  A PT ++R  M + V            RQ+                      R  PP+                  P  
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        TE  E+ +A L+ MGF R  A +AL  + ND+N+ATN LL+
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Q8NBM4 Ubiquitin-associated domain-containing protein 25.2e-1827.09Show/hide
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        G SG   AP+++S ++  +  ++   +     +    Y    VK   +IW+L+          +      L+Y FR+FER+ GS K++ F+L S + S L
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Query:  KAK-FPEFVSSFF---------------------------------------LRFSLPSAG-------------NPPAAPTRDVRGNMPSFVGRQVERSH
        +    P +++ FF                                       L FS  + G             N    P R  R N+    GRQ E + 
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        PP+    E  E+ +A L+ MGF R  A +AL  + ND+N+ATN LL+
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Q8RXQ2 Rhomboid-like protein 181.3e-10970.21Show/hide
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        MNGGPSGFNNAPVT++FV+A+ALFT+FFGI+G S KLGLSYQD+  K RIWKL+ S FAFSST +L+ GL+LLY+FRVFERQIGSNKYSVFI FS   SL
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        + E + +SL KDP ANL+TSGPY L+FASFVPFF DIPV+ RF V GV FSDKSFIYLAG+QLLLSSW+RSI  GICGI+AGSLYRLN+FGIRKAKFPEF
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        ++S F RFSLPS  +    P R      P+ +GRQ  R++  P+P+ TEP E++IATLVSMGFD+N+ARQALVHA NDVN ATNILLE+ SH
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Q9LET3 Rhomboid-like protein 209.2e-12476.45Show/hide
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        MNGGPSGF+NAPVT++FV+ SALFT+FFGIQGRS KLGLSYQD+  K RIWKL+ S FAFSSTPELMFGL+LLYYFRVFERQIGSNKYSVFILFS   SL
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        L EV+ +SLLKD  ANL+TSGPYGL+FASF+PF+ DIPVSTRFRVFGV FSDKSFIYLAG+QLLLSSW+RSI PGICGI+AGSLYRLN+ GIRKAKFPEF
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        V+SFF R S PS GN PP AP+R++ G +    GR+ ERS P P+P++ EP E++I TLVSMGFDRN+ARQALVHA NDVN ATNILLE+QSH
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G41160.1 Ubiquitin-associated (UBA) protein9.2e-11170.21Show/hide
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        MNGGPSGFNNAPVT++FV+A+ALFT+FFGI+G S KLGLSYQD+  K RIWKL+ S FAFSST +L+ GL+LLY+FRVFERQIGSNKYSVFI FS   SL
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        + E + +SL KDP ANL+TSGPY L+FASFVPFF DIPV+ RF V GV FSDKSFIYLAG+QLLLSSW+RSI  GICGI+AGSLYRLN+FGIRKAKFPEF
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        ++S F RFSLPS  +    P R      P+ +GRQ  R++  P+P+ TEP E++IATLVSMGFD+N+ARQALVHA NDVN ATNILLE+ SH
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AT3G56740.1 Ubiquitin-associated (UBA) protein6.5e-12576.45Show/hide
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        MNGGPSGF+NAPVT++FV+ SALFT+FFGIQGRS KLGLSYQD+  K RIWKL+ S FAFSSTPELMFGL+LLYYFRVFERQIGSNKYSVFILFS   SL
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        L EV+ +SLLKD  ANL+TSGPYGL+FASF+PF+ DIPVSTRFRVFGV FSDKSFIYLAG+QLLLSSW+RSI PGICGI+AGSLYRLN+ GIRKAKFPEF
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        V+SFF R S PS GN PP AP+R++ G +    GR+ ERS P P+P++ EP E++I TLVSMGFDRN+ARQALVHA NDVN ATNILLE+QSH
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAACGGCGGCCCGTCTGGTTTCAACAATGCCCCTGTCACCCGGAGCTTCGTCGTCGCCTCCGCTCTTTTCACCATTTTCTTTGGGATCCAAGGCCGTTCAATTAAGCT
TGGCTTGTCCTATCAGGATGTGATTGTGAAGCTTCGCATTTGGAAGTTAGTAACGTCAGTTTTTGCCTTTTCATCTACTCCTGAATTGATGTTCGGACTGTTTCTGCTCT
ATTACTTCAGAGTATTTGAAAGACAGATAGGTTCCAACAAATACTCGGTCTTTATTTTGTTCTCTATAATAACCTCTTTACTTTTTGAGGTCCTTGCGATATCATTACTT
AAAGATCCTGCAGCGAATCTAGTTACTTCTGGACCTTATGGTCTTCTATTTGCTTCCTTTGTACCCTTCTTCTTTGATATTCCTGTTTCAACTCGGTTCCGTGTATTTGG
AGTTCGTTTCTCTGACAAGTCTTTCATATATCTGGCTGGTCTTCAGCTCCTACTGTCCTCGTGGAGAAGATCCATCTTACCAGGGATATGCGGAATTCTTGCTGGTTCCT
TATATCGTTTGAATGTATTTGGCATCCGAAAGGCCAAGTTTCCAGAGTTCGTCAGTTCATTTTTTTTACGGTTTTCTTTGCCATCCGCGGGAAATCCTCCAGCAGCCCCA
ACTAGAGATGTTAGAGGAAACATGCCATCTTTCGTGGGCCGCCAGGTTGAGAGGAGCCATCCTCCTGTGCCAACTGCCACAGAACCACCAGAGGACTCCATTGCCACACT
TGTTTCGATGGGGTTCGACAGAAACTCAGCGAGGCAGGCCCTTGTGCATGCTGGAAATGACGTTAACATTGCGACAAACATACTTCTCGAATCACAATCGCACTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GAAATCGAGTTCCACTCCCAAGTTCTTCCCAGCAGACAACAAATCAAAATCAAAATCAAAATCAAAATCGGAATCGGAATCGGAATCGGAATCAGATTGAGAAGCCTCTG
ACCGTCTGAGCGGGTCGTTGCTTCCTCTCTAAGACGATGAACGGCGGCCCGTCTGGTTTCAACAATGCCCCTGTCACCCGGAGCTTCGTCGTCGCCTCCGCTCTTTTCAC
CATTTTCTTTGGGATCCAAGGCCGTTCAATTAAGCTTGGCTTGTCCTATCAGGATGTGATTGTGAAGCTTCGCATTTGGAAGTTAGTAACGTCAGTTTTTGCCTTTTCAT
CTACTCCTGAATTGATGTTCGGACTGTTTCTGCTCTATTACTTCAGAGTATTTGAAAGACAGATAGGTTCCAACAAATACTCGGTCTTTATTTTGTTCTCTATAATAACC
TCTTTACTTTTTGAGGTCCTTGCGATATCATTACTTAAAGATCCTGCAGCGAATCTAGTTACTTCTGGACCTTATGGTCTTCTATTTGCTTCCTTTGTACCCTTCTTCTT
TGATATTCCTGTTTCAACTCGGTTCCGTGTATTTGGAGTTCGTTTCTCTGACAAGTCTTTCATATATCTGGCTGGTCTTCAGCTCCTACTGTCCTCGTGGAGAAGATCCA
TCTTACCAGGGATATGCGGAATTCTTGCTGGTTCCTTATATCGTTTGAATGTATTTGGCATCCGAAAGGCCAAGTTTCCAGAGTTCGTCAGTTCATTTTTTTTACGGTTT
TCTTTGCCATCCGCGGGAAATCCTCCAGCAGCCCCAACTAGAGATGTTAGAGGAAACATGCCATCTTTCGTGGGCCGCCAGGTTGAGAGGAGCCATCCTCCTGTGCCAAC
TGCCACAGAACCACCAGAGGACTCCATTGCCACACTTGTTTCGATGGGGTTCGACAGAAACTCAGCGAGGCAGGCCCTTGTGCATGCTGGAAATGACGTTAACATTGCGA
CAAACATACTTCTCGAATCACAATCGCACTAATTTCATGGAAATTTTTCTCGGTATATGAAACCTTTGATGTCCCCAGTTCTGAGAACAGTCAAATTCAGTATCCAGGGT
TGATGGTCGGACACACTTGCATTTGCTGACAACAGAGTTTTGATAGGTTGCAGAAACTCATCAGGCTGTTTCTCTTAACTCTCTTTTCGGTTTCCCTTTTGTTCGTATCG
TAGCTGTCAAATTTTCTTAATACTTGATGTCTGACTACAGAAGATTGCTTAGTTTGTACGTATGAAGTTAAGCTGGTAGAAGTATTTGTGGAAGCAGAATGTGCAGAATT
CTTTTGTTCTGTGATAGCTATAAAAGTTGCAGATTCATACAGAAATTTTATTGGCTGCTAATCGTGATTATCTCACTACGTGCAAACTTGCTCTGTTACTGCGCTCTGAT
ATTGAACTGAAATTTTGGTTTTCATTTAGGAATCAAAGAATGCGAATTCTGTTTTGTGTTGGGTATATAAAATGTTTGATTCAGCCCCTCGCAATCCTTCGATTGTTCTG
TTCTTTTCTTTGAATGAGACTGAGCCT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MNGGPSGFNNAPVTRSFVVASALFTIFFGIQGRSIKLGLSYQDVIVKLRIWKLVTSVFAFSSTPELMFGLFLLYYFRVFERQIGSNKYSVFILFSIITSLLFEVLAISLL
KDPAANLVTSGPYGLLFASFVPFFFDIPVSTRFRVFGVRFSDKSFIYLAGLQLLLSSWRRSILPGICGILAGSLYRLNVFGIRKAKFPEFVSSFFLRFSLPSAGNPPAAP
TRDVRGNMPSFVGRQVERSHPPVPTATEPPEDSIATLVSMGFDRNSARQALVHAGNDVNIATNILLESQSH