; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg27569 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg27569
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionBEST Arabidopsis thaliana protein match is: s in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink).
Genome locationCarg_Chr12:8184157..8184711
RNA-Seq ExpressionCarg27569
SyntenyCarg27569
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6586081.1 Transcription initiation factor TFIID subunit 4b, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.5e-8699.4Show/hide
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KAG7020905.1 hypothetical protein SDJN02_17593, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]6.2e-99100Show/hide
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KAG7020906.1 hypothetical protein SDJN02_17594, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]7.6e-9798.37Show/hide
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XP_022929606.1 uncharacterized protein LOC111436141 [Cucurbita moschata]7.4e-6070.1Show/hide
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XP_022938321.1 putative protein TPRXL [Cucurbita moschata]3.0e-9398.33Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5D3BQA0 Putative OSBP(Oxysterol binding protein)-related protein 4B1.4e-5163.54Show/hide
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         A+   ID+ N       DKLETFSFLSSDCEFM S     S S S + SSSSSPSSF +SL V               NAWQINR+L CYH
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A0A6J1DGF8 uncharacterized protein LOC1110208301.7e-5768.98Show/hide
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        +         N D FGHPDKLET SF+SSD EFM S R+S+SS    S SSSS PSS  ESL VR     +    WQINR LACYHC
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A0A6J1ENL5 uncharacterized protein LOC1114361413.6e-6070.1Show/hide
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A0A6J1FCU1 Uncharacterized protein1.4e-9398.33Show/hide
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A0A6J1K9Q8 uncharacterized protein LOC1114923756.1e-6070.62Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G40475.1 unknown protein3.6e-0434.67Show/hide
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        + +K+I + SS   SS  IYY G    VPF WET+PGTPK     +   LPPLTPPP+                         ++  S  +G + ++ART
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        I    + RF         + LS      + S +S SSS S S SSSS PS
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AT4G25845.1 BEST Arabidopsis thaliana protein match is: OSBP(oxysterol binding protein)-related protein 4B (TAIR:AT4G25850.2)1.1e-1353.66Show/hide
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        ISR SS+G      Y    PEGVPF+WE QPGTP +  P++++PPL+PPPA+LSLGLPKP   IE+PK    P  ++LR W+
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AT4G25850.2 OSBP(oxysterol binding protein)-related protein 4B1.1e-1353.66Show/hide
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AT5G01790.1 unknown protein5.6e-0538.2Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GCTAG
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