; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Carg27609 (gene) of Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2 genome

Gene IDCarg27609
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma cv. SMH-JMG-627 (Silver-seed gourd (SMH-JMG-627) v2)
DescriptionGlycoprotein membrane precursor GPI-anchored
Genome locationCarg_Chr10:7534022..7536662
RNA-Seq ExpressionCarg27609
SyntenyCarg27609
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6590391.1 putative GPI-anchored protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.2e-10198.45Show/hide
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KAG7023953.1 putative GPI-anchored protein [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.7e-102100Show/hide
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XP_022961524.1 uncharacterized GPI-anchored protein At5g19250-like isoform X1 [Cucurbita moschata]1.7e-102100Show/hide
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XP_022968795.1 uncharacterized GPI-anchored protein At3g06035-like [Cucurbita maxima]2.7e-9292.27Show/hide
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XP_023516540.1 uncharacterized GPI-anchored protein At5g19250-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.6e-9996.39Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BQD0 uncharacterized GPI-anchored protein At5g19250-like3.2e-6768.88Show/hide
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        ++DGI+LP+CVP LDP SV  NYT SHD +YIN +N+TGAGVGT +D W+VL+LSTNTSTGN+ + GSSSLVVA GG +G+MV  LG+FV  LL F
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A0A5D3CFH2 Putative GPI-anchored protein3.2e-6768.88Show/hide
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        R+F LFFF VI+ FLL PN VLCDVKD  IL+AIN YRQSK+LS  ++NKNAACLA + VYKLRDEPCSS ++F+KEI+SE  LADF KLL+KCHIAYNS
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A0A6J1HCG9 uncharacterized GPI-anchored protein At3g06035-like isoform X27.9e-8285.57Show/hide
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A0A6J1HEB1 uncharacterized GPI-anchored protein At5g19250-like isoform X18.1e-103100Show/hide
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A0A6J1HY77 uncharacterized GPI-anchored protein At3g06035-like1.3e-9292.27Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P59833 Uncharacterized GPI-anchored protein At5g192501.4e-2235.03Show/hide
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           T DG +LPACVP+LDP  V  N+T S     +N   FTG G+G+ D+WIV+VL+T+T  G+++   +S +      G +   + FL LF   +F
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Q84MC0 Uncharacterized GPI-anchored protein At3g060351.8e-2234.18Show/hide
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        M +  L     ++  L L   VL D  + +I L  IN+YR +++L+ L+ N+NA CLA     + +++PC++         +E   A++ ++L KCH+  
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        + T DG ++PACVP L+   V  N+TKS     +N   FTG G+G  DDWIV+VL+TNT  G+++   + +   + G   GI +V +L +F+   F
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Q84VZ5 Uncharacterized GPI-anchored protein At5g192404.1e-1936.97Show/hide
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        +++ FL L   VL +     +L    N YR+S +L+NL  NKNA CLA   V +L+++PC++         ++  + +F  LL KC +  N T DG++L 
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Q8GUL8 Uncharacterized GPI-anchored protein At5g192303.4e-1331.31Show/hide
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        M +  L    +++ FL L   VL   D +D  +L   N YR   +L  LT N+NA CLA   V +L+++PC++ +      NS     +   LL KC + 
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             DG+++  C P  D      N+  S  +  +N    TG G+G+ D W+V++L+TNT       GG S L     G     V  L    F+ LLF
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G54860.1 Glycoprotein membrane precursor GPI-anchored1.7e-2029.9Show/hide
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        F+   +  F L+   V+ +  +  +L  +N+YR ++ +     N+ A C+A     KL D+PC++    H   ++         L ++  +L +C I  N
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        +T DG++LP C+P+  P     NYT++    Y+N   + GAGVG+  +W+V+VL+T+T  G+F  G      +S  V+A  G +G++   L LF
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AT3G06035.1 Glycoprotein membrane precursor GPI-anchored1.3e-2334.18Show/hide
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        M +  L     ++  L L   VL D  + +I L  IN+YR +++L+ L+ N+NA CLA     + +++PC++         +E   A++ ++L KCH+  
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        + T DG ++PACVP L+   V  N+TKS     +N   FTG G+G  DDWIV+VL+TNT  G+++   + +   + G   GI +V +L +F+   F
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AT5G19230.1 Glycoprotein membrane precursor GPI-anchored2.4e-1431.31Show/hide
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        M +  L    +++ FL L   VL   D +D  +L   N YR   +L  LT N+NA CLA   V +L+++PC++ +      NS     +   LL KC + 
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             DG+++  C P  D      N+  S  +  +N    TG G+G+ D W+V++L+TNT       GG S L     G     V  L    F+ LLF
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AT5G19240.1 Glycoprotein membrane precursor GPI-anchored2.9e-2036.97Show/hide
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        +++ FL L   VL +     +L    N YR+S +L+NL  NKNA CLA   V +L+++PC++         ++  + +F  LL KC +  N T DG++L 
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         C P  H  P   S A+  TK+     +N   FTGAGVG   D  W+V VL+TNT  G+++N G+
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AT5G19250.1 Glycoprotein membrane precursor GPI-anchored9.7e-2435.03Show/hide
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        M +  L    +++ FL L   VL D  D E  +L  IN+YR S +L+ L HN NA CLA     + +++PC++         +     +   LL KC + 
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Query:  YNSTVDGIMLPACVPHLDPKSVADNYTKSHDVDYINSKNFTGAGVGTSDDWIVLVLSTNTSTGNFANGGSS-SLVVARGGCIGIMVGFLGLFVLLLF
           T DG +LPACVP+LDP  V  N+T S     +N   FTG G+G+ D+WIV+VL+T+T  G+++   +S +      G +   + FL LF   +F
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGAGTGTTTGCTTTGTTCTTCTTTGCTGTCATCGCCACCTTCCTCCTTCTGCCCAATGCTGTTCTTTGTGACGTGAAAGATACAGAGATTCTAAACGCCATCAACAA
TTACAGACAATCAAAGCACCTATCTAATCTTACTCATAACAAAAATGCAGCATGTTTAGCAAGCAGGTTCGTTTATAAGCTAAGAGATGAGCCTTGTTCAAGTCCAGATG
ATTTCCACAAAGAAATCAACTCTGAAAATACCCTTGCAGATTTTCTTAAGCTCTTGAAGAAGTGTCACATAGCCTACAACTCGACCGTTGATGGCATCATGCTCCCCGCT
TGCGTCCCCCACCTCGATCCCAAGTCCGTCGCCGATAACTATACCAAATCCCATGACGTCGATTATATTAACAGTAAGAACTTTACGGGTGCTGGGGTCGGGACGTCTGA
CGATTGGATCGTCCTCGTTCTTAGCACCAATACGTCGACGGGGAACTTTGCTAACGGTGGATCTTCGTCTTTGGTTGTCGCCCGGGGTGGTTGCATTGGTATCATGGTTG
GTTTCTTAGGGTTGTTTGTTCTTTTGTTATTTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TATGTTCTTCGCCTCTTTTTATTGCTTTGGGTTCGCAGTTCATTTGTGAATTGTTTCCCACAAATATGAGAGTGTTTGCTTTGTTCTTCTTTGCTGTCATCGCCACCTTC
CTCCTTCTGCCCAATGCTGTTCTTTGTGACGTGAAAGATACAGAGATTCTAAACGCCATCAACAATTACAGACAATCAAAGCACCTATCTAATCTTACTCATAACAAAAA
TGCAGCATGTTTAGCAAGCAGGTTCGTTTATAAGCTAAGAGATGAGCCTTGTTCAAGTCCAGATGATTTCCACAAAGAAATCAACTCTGAAAATACCCTTGCAGATTTTC
TTAAGCTCTTGAAGAAGTGTCACATAGCCTACAACTCGACCGTTGATGGCATCATGCTCCCCGCTTGCGTCCCCCACCTCGATCCCAAGTCCGTCGCCGATAACTATACC
AAATCCCATGACGTCGATTATATTAACAGTAAGAACTTTACGGGTGCTGGGGTCGGGACGTCTGACGATTGGATCGTCCTCGTTCTTAGCACCAATACGTCGACGGGGAA
CTTTGCTAACGGTGGATCTTCGTCTTTGGTTGTCGCCCGGGGTGGTTGCATTGGTATCATGGTTGGTTTCTTAGGGTTGTTTGTTCTTTTGTTATTTTGATGAGGTGAGG
GAAAAGGCTTTTGGGTTTGGGTTTAAAGCATTGGTAACCTAAATAACACAATTGTTTTACAACTCGATCCTACTTAACCCTATCGGGTTGGATTGAATTAGGTTGTTTTT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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